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1、高级生物化学名词解释高级生物化学名词解释(总10页)高级生物化学名词解释(考试重点)1. 肽键(peptide bond)：一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基缩合，除去一分子水形成的酰氨键。2. 肽(peptide)：两个或两个以上氨基酸通过肽键共价连接形成的聚合物。通常，由10个氨基酸通过肽键连接在一起的线性序列叫寡肽；1040个氨基酸通过肽键连接在一起的线性序列叫多肽；40个氨基酸通过肽键连接在一起的线性序列叫蛋白质。但非绝对划分。3. 蛋白质的化学结构：肽链数目、端基组成、氨基酸残基序列和二硫键位置。4. 蛋白质一级结构(protein primary structure)：指蛋白质氨

2、基酸残基从N末端到C末端的排列顺序或氨基酸序列。5. 蛋白质二级结构(protein secondary structure)：指肽链主链不同肽段通过自身的相互作用，形成氢键，沿某一主轴盘旋折叠而形成的局部空间结构，是蛋白质结构的构象单元，通过骨架上的羰基和酰胺基团之间形成的氢键维持。常见的有-螺旋、-折叠、-转角、Q环和无规则卷曲等。6. 蛋白质三级结构(protein tertiary structure)：是指多肽链在二级结构的基础上，通过氨基酸侧链之间的疏水相互作用，借助氢键、范德华力和盐键维持力使-螺旋、-折叠、-转角等进一步盘旋、折叠形成特定的构象。7. 蛋白质四级结构(prote

3、in quaternary structure)：多亚基蛋白质的三维结构。实际上是具有三级结构多肽（亚基）以适当方式聚合所呈现的三维结构。8. 超二级结构(super-secondary structure)：也称为基元(motif)。在蛋白质特别是球状蛋白质中，由若干相邻的二级结构单元组合在一起，彼此相互作用，形成有规则的、在空间上能辨认的二级结构组合体，充当三级结构的构件单元。9. 结构域(domain)：对于较大的蛋白质分子或亚基，多肽链往往由多个相对独立的三维实体缔合成三级结构。这种相对独立的三维实体叫做结构域。包括：独立的结构单位、独立的功能单位和独立折叠单元。10.肌红蛋白(myo

4、globin)：是由一条肽链和一个血红素辅基组成的结合蛋白，是肌肉内储存氧的蛋白质。其氧饱和曲线为双曲线型。11.血红蛋白(hemoglobin)：由4条肽链(2个和2个链)组成的寡聚蛋白质，每条肽链都类似于肌红蛋白的肽链，都结合一个血红素。血红蛋白分子接近于一个球体，4个亚基占据四面体的四个角，辅基位于分子表面的空穴里，每个亚基一个。将氧由肺运输到外周组织，氧饱和曲线为S型。12.波尔效应(Bohr effect)：CO2浓度的增加降低细胞内的pH，引起红细胞内血红蛋白氧亲和力下降的现象。13.变性(denaturation)：在物理、化学因素影响下，DNA碱基对间的氢键断裂，双螺旋解开，这

5、是一个跃变的过程，伴有A260增加 (增色效应)，DNA的功能丧失的现象。14.复性(renaturation)：在一定条件下，变性DNA单链间碱基重新配对，恢复双螺旋结构，伴有A260减小(减色效应)，DNA的功能恢复的现象。15.蛋白质一级结构的测定战略原则：将大化小、逐段分析、片段重叠、确定全序 测序策略：(1)测定蛋白质分子中多肽链的数目 (2)拆分蛋白质分子的多肽链 (3)断开多肽链内的二硫桥 (4)分析每一多肽链的氨基酸组成 (5)鉴定多肽链的N末端和C末端残基 (6)裂解多肽链成较小的片段 (7)测定各肽段的氨基酸序列 (8)重建完整多肽链的一级结构 (9)确定半胱氨酸残基间形成

6、的SS交联桥的位置 测序步骤：(1)纯化蛋白质 (2)拆分多肽链、断开二硫桥 还原法：-巯基乙醇、碘乙酸；氧化法：过甲酸；变性剂：高浓度尿素溶液 (3) 测定多肽链的氨基酸组成 (4) N末端和C末端的氨基酸测定 N端：Sanger法，DNFB+氨基酸DNP(黄色)+HF；DNS(丹磺酰氯)法，产生强烈荧光；Edman法，PITC+氨基酸PTH-AA(能溶于有机溶剂)；氨肽酶法，就是用这类肽链外切酶从多肽链的N端逐个的向里切。C端：肼解法、还原法和羧肽酶法 (5)两种以上方法专一性的裂解成两套以上肽段 酶解法：胰蛋白酶(水解Arg、Lys)、胰凝乳蛋白酶(水解Phe、Tyr、Trp)；化学法：

7、溴化氢专一性的水解Met、羟胺法 (6) 分别将肽段纯化，测出其氨基酸顺序 Edman降解法、DNS- Edman降解法、蛋白质测序仪等 (7) 片段重叠法拼凑出整条多肽链氨基酸顺序 (8) 确定多肽链中SS交联桥的位置16.构型(configuration)：有机分子中各个原子特有的固定空间排列。这种排列不会随共价键的断裂和重新形成而改变。构型的改变往往使分子的光学活性发生变化。17.构象(conformation)：指一个分子中不改变共价键结构，仅单键周围的原子放置所产生的空间排布。一种构象改变为另一种构象时，不要求共价键的断裂和重新形成，且不改变分子的光学活性。18.二面角：两相邻酰胺平

8、面之间，能以共同的C为定点而旋转，绕C-N键旋转的角度叫角，绕C-C键旋转的角度叫角。角和角合称二面角，即构象角。19.蛋白质特定构象形成的驱动力：(1)R-侧链基团间的相互作用 (2)肽链与环境水分子的相互作用 (3)天然构象的形成过程是一个自发的过程(G0)20.分子伴侣(molecular chaperone)：一类可介导蛋白质正确折叠与装配，但本身不构成被介导的蛋白质组成部分的蛋白因子。功能：稳定多肽、阻止不正确的折叠；与天然构象的蛋白质相互作用，促使寡聚肽蛋白质结构重排；能识别并调节多肽折叠。21.限制性内切酶：原核生物中存在着一类能识别外源DNA双螺旋中48个碱基对所组成的特异的具

9、有二重旋转对称性的回文序列，并在此序列的某位点水解DNA链，产生粘性末端或平末端，这类酶称为限制性内切酶。22.层析(chromatography)：按照在移动相和固定相(可以是气体或液体)之间的分配比例，将混合成份分开的技术。23.离子交换层析(ion-exchange column)：使用带有固定的带电基团的聚合树脂或凝胶层析柱。24.透析(dialysis)：通过小分子经过半透膜扩散到水(或缓冲液)的原理，将小分子与生物大分子分开的一种分离纯化技术。25.凝胶过滤层析(gel filtration chromatography)：也叫分子排阻层析。一种利用带孔凝胶珠作基质，按照分子大小分

10、离蛋白质或其它分子混合物的层析技术。26.亲合层析(affinity chromatograph)：利用共价连接有特异配体的层析介质，分离蛋白质混合物中能特异结合配体的目的蛋白质或其它分子的层析技术。27.高压液相层析(HPLC)：使用颗粒极细的介质，在高压下分离蛋白质或其他分子混合物的层析技术。28.凝胶电泳(gel electrophoresis)：以凝胶为介质，在电场作用下分离蛋白质或核酸的分离纯化技术。29.SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳(SDS-PAGE)：在去污剂十二烷基硫酸钠存在下的聚丙烯酰氨凝胶电泳，SDS-PAGE只是按照分子的大小，而不是根据分子所带的电荷大小分离的。30.等电

11、聚胶电泳(IFE)：利用一种特殊的缓冲液(两性电解质)，在聚丙烯酰氨凝胶制造一个pH梯度，电泳时，每种蛋白质迁移到它的等电点(pI)处，即梯度的某一pH时，就不再带有净的正负电荷了。31.双向电泳(two-dimensional electrophorese)：等电聚胶电泳和SDS-PAGE的组合。即先进行等电聚胶电泳(按照pI)分离，然后再进行SDS-PAGE(按照分子大小分离)，经染色得到的电泳图是二维分布的蛋白质图。32.Edman降解（Edman degradation）：从多肽链游离的N末端测定氨基酸残基的序列的过程。N末端氨基酸残基被苯异硫氰酸酯修饰，然后从多肽链上切下修饰的残基，

12、再经层析鉴定，余下的多肽链(少了一个残基)被回收再进行下一轮降解循环。33.别构效应(allosteric effect)：又称为变构效应。是寡聚蛋白与配基结合改变蛋白质的构象导致蛋白质生物活性丧失的现象。34.比活(specific activity)：每分钟每毫克酶蛋白在25C下转化的底物微摩尔数。比活是酶纯度的测量。35.邻近效应(proximity effect)：非酶促反应或酶促反应速度的增加，是由于底物靠近活性部位，使得活性部位处反应剂有效浓度增大的结果。这将导致更频繁的形成过渡态。36.米氏常数(Michaelis constant)：对于一个给定的反应，是指酶促反应的起始速度(

13、V0)达到最大反应速度(Vmax)一半时的底物浓度。37.催化常数(catalytic number)(Kcat)：也称为转换数。是一个动力学常数，是对底物处于饱和状态下一个酶(或一个酶活性部位)催化一个反应有多快的测量。催化常数等于最大反应速度除以总的酶浓度(Vmax/Etotal)。或是每摩尔酶活性部位每秒钟转化为产物的底物的量。38.竞争性抑制作用(competitive inhibition)：通过增加底物浓度可以逆转的一种酶抑制类型。竞争性抑制剂通常与正常的底物或配体竞争同一个蛋白质的结合部位。这种抑制使Km增大而Vmax不变。39.非竞争性抑制作用(noncompetitive i

14、nhibition)：抑制剂不仅与游离酶结合，也可以与酶-底物复合物结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制使Km不变而Vmax变小。40.反竞争性抑制作用(uncompetitive inhibition)：抑制剂只与酶-底物复合物结合而不与游离的酶结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制使Km和Vmax都变小但Vmax/Km不变。41.自杀抑制作用(suicide substrate)：底物抑制物经酶催化生成的产物变成了该酶的抑制剂。例如别嘌呤醇对黄嘌呤氧化酶的抑制就属于这种类型。42.别构酶(allosteric enzyme)：分子表面既有活性中心又有调节位点的酶。43.同工酶(isoenzy

15、me isozyme)：催化同一化学反应而化学组成不同的一组酶。它们彼此在氨基酸序列、底物的亲和性等方面都存在着差异。44.主动转运(active transport)：通过该转运方式，溶质特异的结合于一个转运蛋白上被转运通过膜。与被动转运运输方式相反，主动转运是逆浓度梯度方向进行的，所以它需要能量的驱动。在原级主动转运过程中能源可以是光、ATP或电子传递；而第二级主动转运是在离子浓度梯度下进行的。45.协同运输(contransport)：两种不同溶质的跨膜偶联转运。可通过一个转运蛋白进行同一方向(同向转运)或反方向(反向转运)转运。46.胞吞(作用)(endocytosis)：物质被质膜吞

16、入并以膜衍生出的脂囊泡形成(物质在囊泡内)被带入到细胞内的过程。47.转化(作用)(transformation)：一个外源DNA 通过某种途径导入一个宿主菌，引起该宿主菌的遗传特性改变的作用。48.转导(作用)(transduction)：借助于病毒载体，遗传信息从一个细胞转移到另一个细胞。49.DNA超螺旋(DNAsupercoiling)：DNA本身的卷曲一般是DNA双螺旋的弯曲欠旋(负超螺旋)或过旋(正超螺旋)的结果。50.拓扑异构酶(topoisomerse)：通过切断DNA的一条或两条链中的磷酸二酯键，然后重新缠绕和封口来改变DNA连环数的酶。拓扑异构酶、通过切断DNA中的一条链减

17、少负超螺旋、增加一个连环数；某些拓扑异构酶也称为DNA促旋酶。51.熔解温度(melting temperature，Tm)：双链DNA熔解彻底变成单链DNA的温度范围的中点温度。52.增色效应(hyperchromic effect)：双螺旋DNA熔解(解链)，260nm处紫外吸收增加的现象。53.减色效应(hypochromic effect)：随着核酸复性，260nm处紫外吸收降低的现象。54.核酸内切酶(exonuclease)： 核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶中能够水解核酸分子内磷酸二酯键的酶。55.核酸外切酶(exonuclease)：从核酸链的一端逐个水解核甘酸的酶。56.限制性内切

18、酶(restriction endonuclease)：一种在特殊核甘酸序列处水解双链DNA的内切酶。型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化。又催化非甲基化的DNA的水解；而型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解。57.重组DNA技术(recombination DNA technology)：也称为基因工程(genomic engineering)。利用限制性内切酶和载体，按照预先设计的要求，将一种生物的某种目的基因和载体DNA重组后转入另一生物细胞中进行复制转录和表达的技术。58.氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)：电子从一个底物传递给分子氧的氧化与酶催

19、化的由ADP和Pi生成ATP与磷酸化相偶联的过程。59.光合磷酸化(photophosphorylation)：在叶绿体ATP合成酶的催化下依赖于光的由ADP 和Pi合成的ATP过程。60.化学渗透理论(chemiosnotic theory)：一种学说，主要论点是底物氧化期间建立的质子浓度梯度提供了驱动ADP和ATP和Pi形成ATP的能量。61. 激素受体(hormone receptor)：位于细胞表面或细胞内，结合特异激素并引发细胞响应的蛋白质。62.第二信使(second messenger)：响应外部信号(第一信使)，例如激素，而在细胞内合成的效应分子，例如cAMP、肌醇三磷酸或二酰

20、基甘油等。第二信使再去调节靶酶，引起细胞内各种效应。63.级联放大(cascade amplification)：在体内的不同部位，通过一系列酶的酶促反应来传递一个信息，并且初始信息在传递到系列反应的最后时，信号得到放大。这样的一个系列叫作级联系统。64.G蛋白(G protein)：地细胞内信号传导途径中起着重要作用的GTP结合蛋白。由。三个不同亚基组成。激素与激素受体结合诱导GTP跟G蛋白结合的GDP进行交换结果激活位于信号传导途径中下游的腺苷酸环化酶。G蛋白将细胞外的第一信使肾上腺素等激素和细胞内的腺苷酸环化酶催化的腺苷酸环化生成的第二信使cAMP联系起来。G蛋白具有内源GTP酶活性。6

21、5.半保留复制(semiconservative replication)：DNA复制的一种方式。每条链都可用作合成互补链的模板，合成出两分子的双链DNA。每个分子都由一条亲代链和一条新合成链组成。66.聚合酶链式反应(PCR)：扩增样品中的DNA量和富集众多DNA分子中的一个特定的DNA序列的一种技术。在该反应中，使用与目的DNA序列互补的寡核苷酸作为引物，进行多轮的DNA合成。其中包括DNA变性、引物退火和在Tap DNA聚合酶催化下的DNA合成。67.遗传学中心法则(genetic central dogma)：描述从一个基因到相应蛋白质的信息流的途径。遗传信息贮存在DNA中，DNA被复

22、制传给子代细胞，信息被拷贝或由DNA转录成RNA，然后RNA翻译成多肽。不过，由于逆转录酶的反应，也可以以RNA为模板合成DNA。68.启动子(promoter)：在DNA分子中，RNA聚合酶能够结合并导致转录起始的序列。69.终止因子(termination factor)：协助RNA聚合酶识别终止信号的辅助因子(蛋白质)。70.起始子(iniation codon)：指定蛋白质合成起始位点的MM子。最常见的是蛋氨酸AUG。71.终止子(termination codon)：任何tRNA分子都不能正常识别的，但可被特殊的蛋白结合并引起新合成的肽链从翻译机器上释放的MM子。存在三个终止MM子：UAG ，UAA和UGA。72.信号肽(signal peptide)：常指新合成多肽链中用于指导蛋白质跨膜转移(定位)的N-末端氨基酸序列(有时不一定在N端)。73.转录因子(transcription factor)：在转录起始复合物的组装过程中，与起动子区结合并与RNA聚合酶相互作用的一种蛋白质。某些转录因子在RNA延伸时一直维持着结合状态。74.操纵子(operon)：是由一个或多个相关基因以及调控他们转录的操纵因子启动子序列组成的基因表达单位。75.操纵因子(operator0：与特定阻遏蛋白相互作用调控一个基因或一组基因表达的DNA区。