医学信息检索基础ppt课件.ppt
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医学信息检索,2,事后查明，早在十多年前，就有人研究出来了，方法非常简单，只需在甲醇中加入2%的水即可，检索这篇文献的时间是10多分钟。
两个小故事,美国在实施“阿波罗登月计划”中，对阿波罗飞船的燃料箱进行压力实验时，发现甲醇会引起钛应力腐蚀，为此付出了数百万美元来研究解决这一问题。
3,南方医院曾经有位老主任，为了“通过测定羊水中氨基酸成分鉴别胎儿性别”的课题，几乎查遍了图书馆收藏的所有书刊而毫无头绪。
原因：
没有掌握文献检索技能，不知道查文献也有一套科学的方法。
？
4,信息检索在科研活动中所占的比例,5,信息检索的概念P8,广义的信息检索是指将信息按一定的方式组织和存储起来，并根据用户的需要找到有关信息的过程和技术；狭义的信息检索是指从信息集合中找到所需信息的过程。
6,本课程主要采用以问题为基础的教学方法（Problem-basedLearning,PBL），使大家掌握信息检索的基础知识，熟练掌握基础医学及临床医学的检索技能，能够灵活运用检索工具（如光盘数据库、网络数据库）进行文献、数据、网络资源等信息的检索及查新咨询服务，并能对检索系统进行评价和优选。
7,第一章概论,8,1.掌握信息、知识、文献的基本概念；2.掌握信息素质、信息意识、信息能力、信息道德的基本概念；3.熟悉文献的不同划分类型4.掌握信息检索的概念5.掌握零、一、二、三次文献的概念,本章要求,信息、情报、知识、文献,第一节信息、信息社会与信息素质,10,一、信息（information）,英文information（信息）一词源于拉丁文“Informatio”，是指一种陈述或一种解释、理解等。
辞海中将信息定义为音信、消息。
现代汉语词典的解释是：
对信息接受者来说事先不知道的报道。
11,信息概念的发展,今天人们对信息的理解所处的时代，好比牛顿之前人们对力的理解所处的时代一样。
那时侯动能、位能的动量、冲量等等概念统统称之为力，到了牛顿才把这种概念科学地区分开来，并给予严密的数学形式描述。
佩特利,12,香农（1948年）（美国数学家、信息论创始人）,香农（Shannon）认为，信息是通信的内容，是“用来消除未来的某种不确定性的东西”，信息的多少反映了消除了的不确定性的大小。
不确定性：
对客观事物的不了解、不肯定。
13,维纳（1950）（美国数学家、控制论创始人）,维纳（N.Wiener）将人与外部环境交换信息的过程看成是一种广义的通信过程，认为信息是人们在适应客观世界的过程中与客观世界进行交换的内容的名称，是人与外部世界的中介。
14,具有广泛影响的定义,信息是事物存在方式、运动状态及其特征的反映，是事物发出的信号、消息。
信息具有共享性、存储性和传递性、价值性、时效性。
15,二、情报（information）,辞源：
“定敌情如何，而报于上官者”为情报。
辞海：
“战时关于敌情之报告，曰情报。
情报是指运用一定的形式，传递给用户，并产生效益的知识或信息。
三个属性：
知识性、传递性、效用性。
16,三、知识（knowledge）,汉语词典中解释为：
人们在改造世界的实践中所获得的认识和经验的总和。
知识是人类对自然界、人类社会中各种现象、规律的信息反映进行思维分析，加工提炼，经过系统化、理论化的结果。
因此，知识是优化、理论化的信息集合。
17,四、文献（document）,是指记录有知识的一切载体。
也就是说用文字、图形、符号、声频、视频等手段记录下来的人类知识都可以称之为文献。
四个要素：
知识载体文字、图形、符号、视频、声频记录,18,信息、知识、情报、文献四者的关系认识激活信息知识情报检索记录文献,19,信息素质（informationliteracy）是指判断何时、何地需要信息，并有效的定位、获取、评价和利用信息的一系列能力的总和。
信息素质,体现在信息意识、信息能力、信息道德三个方面。
20,信息意识：
是个体对信息重要性认识程度和对信息是否具有特殊的、敏锐的感受力和持久的注意力，即对信息的捕捉、分析、判断和吸收的敏感性。
信息能力：
是对信息的搜集获取能力、分析鉴别能力和综合利用能力。
信息道德：
是指在整个信息活动中，信息创建者、信息服务提供者和信息使用者所必须要遵守的伦理规范。
21,第二节文献的类型,一、按文献载体划分手写型文献（HandWritingDocument）人工书写或抄写而成的文献。
例如，写在竹简、帛或纸张上的古代文献、书法作品、原始记录等。
印刷型文献（PrintedDocument）指以纸张为载体，通过胶印、铅印、油印等手段形成的纸质出版物。
如书、刊等。
22,缩微型文献（MicroFormDocument）以感光材料为载体，以照相为记录手段把文献缩小形成的复制文献，如缩微平片、缩微胶卷。
缺点是使用时要借助缩微阅读器，使用不方便。
视听型文献（Audio-visualDocument）又称声像型，载体是感光材料或磁性材料，如录像带、录音带、科技电影、幻灯片等。
电子型文献（ElectronicDocument）是指以数字化技术将文献存储在光、磁载体上，通过计算机或网络进行阅读的文献。
例如，数据库文献和网络文献信息。
23,二、按文献的加工程度划分零次文献是指未公开出版的实验记录、原始录音（像）、书信、手稿、口头交流的信息或实物等。
一次文献是指作者直接以自己的工作、科研、社会活动等实践经验为依据而撰写，并公开发行进入社会流通的专著、学术论文、专利说明书、科技报告等。
24,二次文献是根据一次文献外表或内容特征按照一定的规则和方法进行整理、加工、浓缩，按一定顺序编排形成的有序化文献。
如各种目录、索引、文摘和各种书目型数据库。
三次文献是为了一定的目的和需求，对大量一次文献信息中的有关内容进行综合、分析、提炼、重新组合而形成的再生性文献。
如专题评述、综述、百科全书、参考工具书等。
25,三、按文献出版形式划分图书（Book）期刊（Journal）特种文献（SpecialDocument）科技报告专利文献会议文献学位论文政府出版物标准文献技术档案产品资料等,26,第二章信息检索基础,27,本章要求,1.理解信息检索的基本原理；2.理解分类语言和主题语言；3.掌握各种检索途径的利用及其区别；4.掌握信息检索的基本步骤；5.理解并掌握查全率、查准率的概念与利用,28,第一节信息检索系统及检索语言,一、信息检索系统是根据特定的信息需求而建立起来的一种有关信息搜集、加工、存储和检索的服务系统。
可分为手工检索系统计算机检索系统,29,二、信息检索的原理是将描述特定用户所需信息的提问特征，与信息存储的检索表示进行一同的比较，从中找出与提问特征一致或基本一致的信息。
本质是用户的信息需求与存储在信息集合中的信息进行比较和选择，即匹配的过程。
30,文献的信息内容,主题概念,检索者的信息需要,信息检索语言,标识,检索系统,检索结果,主题分析,主题分析,标引,标引,输入,检索,输出,信息存贮,信息检索,主题概念,标识,31,三、信息检索语言,是检索信息所使用的语言。
是信息检索系统存储和检索信息时共同使用的一种约定性语言，以达到信息存储和检索的一致性，提高检索效率。
又称标引语言、索引语言、概念标识系统等。
32,检索语言,分类语言,主题语言,标题词语言元词语言叙词语言关键词语言,描述信息内容特征的语言,描述信息外表特征的语言,书/刊名,著者/团体著者,出版事项,代码/序号,33,我国古代第一部成型的图书分类法是西汉刘向、刘歆父子编制的七略。
西晋，荀勖（xu）创立了四部分类法，即甲、乙、丙、丁四大部。
从隋唐起，图书的四部分类法已经基本定型。
皇家图书馆及秘书省、翰林院等重要典藏图书之所，都是按照经、史、子、集分四库贮藏图书的，名为四库书。
辑略六艺略诸子略诗赋略兵书略数术略方技略,1.分类语言,34,分类语言是建立在科学分类的基础上，运用概念划分与概括的方法，进行层层划分，每次划分，就产生若干类目。
逐级划分，就产生了不同级别的类目，这些类目层层隶属，形成一个严格有序的等级体系。
常用分类号或分类词表示。
35,中国图书馆图书分类法是我国建国后编制出版的一部具有代表性的大型综合性分类法，简称中图法。
自1999年第四版起更名为中国图书馆分类法，简称不变，英文译名为ChineseLibraryClassification,英文缩写为CLC。
36,体系结构,37,R医药、卫生,R1预防医学、卫生学2中国医学3基础医学4临床医学5内科学6外科学71妇产科学72儿科学73肿瘤学,R74神经病学与精神病学75皮肤病学与性病学76耳鼻咽喉科学77眼科学78口腔科学79外国民族医学8特种医学9药学,38,39,优势：
类目体系展开比较系统，便于从学科门类出发，进行族性检索。
将概念逐级划分，具有等级结构，便于扩大和缩小检索范围。
以分类号作为检索标识，不存在文种限制。
标记简明，适用于分类排架，也可用于组织分类检索工具。
40,不足：
不能充分揭示信息资源中大量存在的细小专深主题。
分类表中的类目不能随时更改，因而不能及时反映新的科学技术。
按照直线序列设置类目，对边缘学科课题只能标引在一门学科的类目之下，检索时可能漏检。
41,2.主题语言,是用自然语言中具有高度概括性的名词、名词性词组描述事物概念，用参照系统等表达概念之间的相互关系的一种检索语言。
特点：
直观性强，专指度高。
根据抽词原则、编制方法及使用规则不同，可分为标题词语言、元词语言、叙词语言、关键词语言。
42,
（1）叙词语言,所谓叙词，是指从自然语言中优选出来并经过规范化处理的术语，又称主题词。
叙词语言是采用表示单元概念的规范化词语的组合来对信息主题或内容进行描述的标识系统。
特点：
专指性、直观性等。
如汉语主题词表（1980出版）,43,
（2）关键词语言,是指从记录信息的文献题名、摘要和正文中提取出来的具有实际意义、能够表达信息主题内容的、未经规范化的自然语言。
特点:
一般不建立关键词表，通常使用禁用词表来淘汰不具有检索意义的词。
在标引阶段只进行少量控制或不作控制，尤其适用于电子计算机处理和自动标引，能及时反映新事物概念。
在检索阶段通过对同义控制和相关词推荐等方式提供帮助。
缺点：
检索质量难以保证。
44,1.分类检索,根据文献内容在学科分类体系中的位置作为文献信息的检索途径，它的检索标识是分类号，是一种族性检索。
我国按中国图书资料分类法进行分类。
如，R医药卫生、R28中药学、R5内科学、R9药学国外有国际十进分类法，；杜威法，。
2.2.3信息检索途径,45,2.主题途径主题词：
是以自然语言为基础，以概念组配为基本原理，并经过规范化处理，表达主题的最小概念单元，作为信息存储和检索依据的一种检索语言。
特点：
a.词义、词类、词形规范保证词语与概念的唯一对应关系，具有专指性；,46,b.采用参照系统显示词语之间的相关关系参照:
见see代X如：
艾滋病见获得性免疫缺陷综合征获得性免疫缺陷综合征代艾滋病CancerseeNeoplasmsNeoplasmsXCancer相关参照：
参seerelated被参XR,47,c.采用主题词分类索引（范畴表或树状结构）显示词语之间的等级（从属）关系，增强了族性检索能力。
如：
MetabolicDiseases（代谢疾病）Acid-BaseImbalance（酸碱失衡）Achlorhydria（胃酸缺乏）Acidosis（酸中毒）Acidosis,Lactic（酸中毒，乳酸性）,48,d.组成主题词表：
如简称（MeSH）汉语主题词表CMeSH,49,e.具有组配（组合）功能：
概念相交组配:
胃溃疡+消化性溃疡出血出血性胃溃疡概念限定组配:
卡托普利/治疗应用概念并列组配:
胃溃疡+十二脂肠溃疡消化道溃疡,50,检索举例：
冠心病的治疗,自由词,冠心病,冠状动脉疾病,冠状动脉粥样硬化性心脏病,冠状动脉心脏病,冠状动脉疾病,主题词,文献,治疗,治疗,51,3.关键词途径关键词：
来自于文献的标题、文摘或正文，是一种没有规范化的自然语言。
如：
医学词汇的简称（乙肝、心衰），生活常用语（打摆子、拉肚子）。
特点：
没有严格的语法规范，个人使用的爱好不同自由词选择不同（乙肝、乙型肝炎，病毒性乙型肝炎、HB等）缺点：
要查出所有的有关乙肝的文献，需要把各种可能的用词都列出来分别查询。
52,4.著者检索,用文献的著者、编者、译者的姓名或机构团体名称编制而成的索引。
按著者姓名字顺编排书写格式姓前（全称）、名后（缩写，即用首字母）如：
WillianHenryHarrisonHarrisonWHRenShuMinRenSM,53,5.机构检索以机构名称为检索词，来查该机构学者发表的文献。
（排除同名同姓）6.题名检索按书名、刊名或文章篇名的字顺进行检索。
检索限定刊物上发表的文献。
7.号码途径利用文献代码、序号编排成的号码索引检索文献。
如ISBN、ISSN等。
8、引文检索是以被引用文献为检索起点来查找引用文献的过程。
54,9.默认检索又称缺省检索、隐含检索，是指在检索系统预先设定的多个字段中进行检索。
10.限定检索常用的有语种（LA）、文献类型（PT）、出版日期（PD）、仅要含全文的记录（fulltextonly）等。
11.其他检索途径化学物质登记号检索、分子式检索等。
2.3.1检索步骤,1.分析检索课题，明确目的和要求用户的检索需求大致分为3类：
新：
及时获得最新的内容，对查全没有过高要求。
准：
要解决研究中的具体问题，要求检出的文献有针对性，对查准要求较高。
全：
要全面了解某一特定领域的发生、发展和现状，是一种回溯性检索，对查全有较高要求。
2.3信息检索步骤及检索效果评价,56,2.选择合适的检索工具根据课题的学科专业范围、主题内容，选择合适的数据库。
3.选择检索途径，确定检索标识。
根据数据库的词表，把主题内容转换成检索系统采用的检索标识和检索词，并准备若干自由词。
4.查找文献线索。
5.浏览检索结果，获取原始文献。
57,索取原文的方法：
（1）检索网上全文数据库
（2）利用网上出版社、杂志（3）利用图书馆馆藏目录（馆藏联合目录）（4）利用“网上全文传递服务”（5）向著者索取,58,2.3.2检索效果评价,检索要领是为实现检索结果的全和准：
所以检索结果主要通过查全率、查准率两个指标来进行评价。
查全率：
系统进行检索时，检出的相关文献量与系统文献库中相关文献总量的比率。
查准率：
系统中检出的相关文献量与检出的文献总量的比率。
59,思考：
如某数据库中共有探讨“吸烟与肺癌关系”的相关文章1000篇，而你在这个数据库中只检索出900篇，而且其检索出的结果中还有100篇是不相关的，那么你这次检索的查全率和查准率各是多少？
查全率80%查准率88.9%,60,第三章计算机信息检索概述,61,3.1.3数据库（P24）,数据库的定义计算机把大量相关的数据项有机地集中起来存放在数据文件中，构成一个存放数据的整体，即数据库。
62,字段1,字段2,字段3,记录1,记录2,记录3,文档1,文档2,文档3,一、数据库结构,63,记录与字段,记录（Record）是构成数据库的信息单元，每条记录都描述了一原始信息的外表和内容特征。
字段（Field）是记录的下级数据单位，用来描述实体的某一属性。
64,记录与字段,65,顺序文档（Sequentialfile）以文献记录作为信息存储单元，按文献记录入藏的存取号从小到大顺序排列而形成的目录式文档，由于它存储有关于每篇文献的最完整信息，所以通常又把它称为主文档（MasterFile），相当于印刷型检索工具的正文部分。
倒排文档（Invertedfile）就是把记录中一切可检字段或属性值抽出,按某种顺序重新加以组织后所得到的一种文档.倒排档从主文档中派生出来,所以,又叫做辅助文档.,66,001专家系统在情报检索中的应用（标引词：
专家系统；智能检索系统）002一种新的倒排档溢出处理算法（标引词：
倒排档；溢出处理）003情报检索专家系统的特点与发展（标引词：
专家系统；智能检索系统）004提问式中的位置算符（标引词：
提问逻辑式；位置算符）005提问式准波兰变换算法的研究（标引词：
提问逻辑式；准波兰变换）006智能检索系统的设计与开发（标引词：
智能检索系统）,67,001专家系统在情报检索中的应用#002一种新的倒排档溢出处理算法#003情报检索专家系统的特点与发展#004提问式中的位置算符#005提问式准波兰变换算法的研究#006智能检索系统的设计与开发#,倒排档002提问逻辑式004，005位置算符004溢出处理002智能检索系统001，003，006专家系统001，003准波兰变换005,主文档,倒排档,68,二、数据库类型（按内容分型）,
（一）书目数据库（BibliographicDatabases）：
存储文摘、题录、目录等书目数据的一类数据库，又称为二次文献数据库。
（二）事实数据库（NumericDatabases）：
存储描述人物、机构、事物的等非文献信息源的数据库。
（三）数值数据库（FactDatabases）：
为用户提供能够直接使用的数值类信息，无需再追查原文。
69,（四）全文数据库（FullTextDatabases）：
存储文献全文或节选其中主要部分的数据库。
可以直接获取原始资料。
（五）图像数据库（ImageDatabases）:
以图像为信息主体，配有文字解释。
70,3.4计算机检索基本技术与检索策略（P36）,检索式是检索策略的逻辑表达式，也称检索提问式。
是指计算机信息检索中用来表达用户检索提问的逻辑表达式，由检索词和各种布尔逻辑算符、位置算符以及系统规定的其他组配连接符号组成,71,一、运算符又称逻辑算符，是表达检索词之间逻辑关系和限制关系的运算符号，是复合检索式不可缺少的构件。
72,
（一）布尔算符1.“and”称为逻辑“与”，文字表示为“and”，符号表示为“*”。
检索词A与检索词B用and组配，提问式可写为：
AandB或者A*B表示：
检索结果中每条记录必须同时含有A和B检索词，增强检索的专指性，缩小检索范围，提高了查准率。
73,举例：
逻辑运算AND,74,2.“or”称为逻辑“或”，文字表示为“or”，用符号表示为“+”。
检索词A与B用or组配，提问式可写为：
AorB或者A+B表示：
包含检索词A的文献或包含检索词B的文献或同时包含检索词A和检索词B的文献均为命中文献，逻辑“或”扩大了检索范围，提高查全率。
75,举例：
逻辑运算OR,76,3.“not”称为逻辑“非”，用文字表示为“not”，用符号表示为“-”。
检索词A与检索词B用not组配，提问式可写为：
AnotB或者AB表示：
检索结果中每条记录必须包含检索词A，但不包含检索词B。
排除了不希望出现的检索词，缩小了检索范围，提高查准率。
77,举例：
逻辑运算NOT,78,1、一般性检索有关老年痴呆的文献,检索式：
老年痴呆,检索式：
老年痴呆OR早老性痴呆OR阿尔茨海姆氏病,2、全面检索有关老年痴呆的文献,79,3、一般性检索头针治疗老年痴呆的文献,检索式：
头针AND老年痴呆,4、全面检索有关头针治疗老年痴呆的文献,检索式：
头针AND（老年痴呆OR早老性痴呆OR阿尔茨海姆氏病）,80,5、检索非更年期妇女内源性雌激素减少与冠心病发病的关系的文献,检索式:
（雌激素减少AND冠心病）NOT更年期妇女,81,
（二）截词符“*”和“？
”,截词检索：
用截词符号“？
”、“*”加在检索词的前后或中间，以检索一组概念相关或同一词根的词。
其中“？
”代表有限截断，即一个“？
”代表一个字符。
“*”代表无限截断，一个“*”可代表多个字符。
82,后截断，将截词符号放在一个字符串的右方。
例如：
librar*library,libraries,librarian,涉及到词的单复数、作者、年代、同根词等方面的检索时，选用后截断技术。
前截断，将截词符号放在一个字符串的左方。
例如：
*sighted，可查到farsighted与nearsighted。
前截断只检索后缀相同的一类词，常用于检索化学化工文献与复合词较多的文献。
83,（三）位置算符near、with,位置算符：
表示所连接的各个检索词之间位置关系的符号，在不同的系统中往往以不同的符号表示。
常用的位置算符有near、with等。
near算符表示此算符两侧的检索词出现在同一句子中。
Anear（n）B表示命中记录中左右两个检索词出现在同一句子中。
84,with算符表示此算符两侧的检索词在命中记录中必须出现在同一字段中。
Awith（n）B表示同时出现于篇名或文摘中，但前后位置可以颠倒。
以上运算符的优先次序是NOTNEARWITHANDOR如果有（），则先运行（）,85,（四）字段限制符“in”、“=”检索系统中，缩小或约束检索结果的方法成为限制检索。
常用的有特定字段的限制检索，限制符为“in”和“=”。
例如：
“in”对某一指定数据项进行检索如：
肝炎inTI“=”用于限定性字段的检索（精确限定）如：
LA=ENGLISH限制符还有其他形式：
py2000表示检索2000年前发表的文献记录。
86,二、检索式编写,检索式的定义概括地说，检索式是检索策略的逻辑表达式，是指计算机信息检索中用来表达用户检索提问的逻辑表达式，由检索词和各种布尔逻辑算符、位置算符以及系统规定的其他组配连接符号组成。
87,查找有关肿瘤引起的贫血的非英文文献,首先确定检索词：
neoplasms/complications（并发症）anemia/etiology（病因学）English#11687NEOPLASMS/complications#2179ANEMIA/etiology#323867EnglishinLA（LA=English）#420（#1and#2）not#3,88,调整检索策略提高查全率和查准率提高查全率的方法：
降低检索词的专指度，选出一些上位词和相关词补充到检索式中。
调节检索式的网罗度，减少逻辑“与”的组配面。
进行族性检索，可采用分类检索，或用一组同义词、近义词和相关词，用“或”连接在检索式中。
采用截词技术，取消某些限制过严的限制符。
89,提高查准率的方法：
提高检索词的专指度，换用专指度较强的规范词或自由词。
增加“与”连接，进一步限定主题概念。
限定检索词所在的可检字段，用位置算符控制检索词的词间顺序与位置。
限制输出文献的外部特征，如限制年限、语种、文献类型等。
用逻辑“非”限制与提问不相关的文献的输出。
用主题词检索，不用或少用自由词检索。
90,提高查准率的方法：
提高检索词的专指度，换用专指度较强的规范词或自由词。
增加“与”连接，进一步限定主题概念。
限定检索词所在的可检字段，用位置算符控制检索词的词间顺序与位置。
限制输出文献的外部特征，如限制年限、语种、文献类型等。
用逻辑“非”限制与提问不相关的文献的输出。
用主题词检索，不用或少用自由词检索。
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