CovarisM220DNAShearing用户培训手册pdfdoc.docx
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CovarisM220高性能样品处理系统
培训手册
基因有限公司生命科学组
二o一二年三月
一、CovarisM220高性能样品处理系统技术特点二、系统安装条件
三、培训所需试剂设备及样品
四、安装及调试安排
五、培训程序及时间安排
六、仪器及试剂系统介绍
七、实验操作流程
八、仪器使用注意事项
九、常见问题处理
十、附录
一.Covaris高性能样品处理系统技术特点
Covaris高性能样品处理系统是在专利技术——自动声波聚焦(AFA)技术的基础上建
立起来的样品处理平台。
该技术整合了非线性、高强度、汇聚性声学冲击波和高级计算机控
制系统,其圆盘状传感器可将声波能量聚焦在样品上,通过等温、非接触的方式对样品进行
声学匀浆、分解和混匀。
而且,此系统的聚焦声能是可控,可根据应用范围和样品量选择波频率和波形,以控制聚焦带的尺寸和声波强度,且声学优化的样品容器也可根据声波聚焦带
进行调整。
另外,系统处理的水浴环境可维持均一的处理温度,适用于对温度敏感的生物样
本。
技术原理
介于20Hz~20kHz的机械波振动在弹性介质中的传播就形成声波,介于20kHz~
500MHz的称为超声波,超声波的传播速度就是声波的传播速度,而超声波具有波长短,
易于定向发射和会聚等优点。
AFA技术利用几何聚焦声波能量,通过0.5MHz的球面固态超声传感器可将波长为1mm的声波能量聚焦在样品上,不仅可以控制波形,而且自动聚焦的能量无损失,且可直接作用于管内样品上。
系统特点:
1.非接触式样品处理,无污染和交叉反应,且不用清洁探头
2.等温处理,不会产生过热现象而破坏样本的生物活性
3.可精确控制样本处理过程,重复性高
4.自动聚焦的能量无损失,直接作用于管内样品上
应用领域
适用100bp-3kb大小的DNA目的片段剪切
二.系统安装条件
1.位置要求:
稳定水平的操作平台放置设备,远离热源,避免阳光直射
2.空间及载重要求:
操作平台尺寸(长×宽×高):
12”Wx17”Dx10”H(30cm43cmxx25cm)(平台下预留空间放置环路冷却/加热装置),仪器周围要留出至少3cm空隙,以方便散热。
操作平台载重:
10kg
3.温度要求:
15-30℃
4.水浴要求:
双蒸水或去离子水,仪器操作温度范围6-40℃(要求水浴范围2-55℃)
用户如自备水浴,需要准备冷却/加热循环装置所需的软管;
建议采用covaris水环境系统(WCS)来维持高通量应用过程的水纯度。
5.电源:
100-240VAC500VA,50-60Hz。
6.电脑:
操作系统要求MicrosoftWindows7
7.其它:
通用插头接线板
三.培训所需试剂设备及样品
尊敬的用户,培训实验以DNAShearingwithmicroTUBEs(<1.5kbfragments)为例,请提前准备以下物品,我公司培训人员将使用以下物品进行仪器使用的培训工作。
1.所需样品和试剂
λDNA或基因组DNA(全长>50kb,浓度20-35ng/ul,体积130ul,A260/A280=1.8-2.0):
将λDNA用TrisEDTA(pH8.0)buffer稀释到20ng/ul,使用前可用核酸测定仪进行浓度及
纯度核对,注意保证完全溶解。
500bp及2kb的ladder(DL2000),TrisEDTA(pH8.0)buffer,1×TAE电泳缓冲液,DNA上样缓冲液(溴酚兰),1%琼脂糖胶,溴化乙锭(EB)。
2.耗材
(1)holder(PartNo.500114)一个;
(2)(6x16mm)100μltubewithAFAfiber&snap-caps(PartNo.520045)若干;
(3)PrepStation(PartNo.500142)一个。
或者准备一个试剂盒DNAShearingKITSsnap-cap(PartNo.500117),其中包括了以上三种耗材。
3.所需其他设备和耗材
凝胶成像议,离心机,核酸电泳相关设备,核酸测定仪(分光光度机),200ul移液枪及
Tip头若干,离心管,冰盒,乳胶手套。
四、安装及调试安排
1.根据合同开箱验货,并明示到货情况
2.系统安装
3.系统调试及校准
五、培训程序及时间安排
请安排2-4名实验室长期工作人员参加培训,培训时间预计为一天
1.基本原理讲解及讨论(1小时)
2.软件基本功能综述及使用培训(2小时)
3.用户实际操作及实验培训(4小时)
4.软件和仪器操作问题答疑(1小时)
六.仪器及试剂系统介绍
1.基本原理讲解
2.仪器系统组成和工作原理讲解
3.仪器基本注意事项
七.实验操作流程
以下是关于使用Covaris高性能样品处理系统的快速操作指南,便于初学者能快速掌
握软件的主要功能。
关于软件应用的进一步的深入,请参见随机所带的英文操作使用手册。
1.开机检查
1)检查固定在机器顶部的电脑与机器的线路连接妥当
2)确认水盘(DripTray)放置机器下方
3)插入操作管支架(TubeHolder)
2.水浴设置
将操作管支架(TubeHolder)顶部的滑行砝码(SlidingWeight)拉起并旋转90°C,用随机水瓶(washbottle)将约15ml蒸馏水或去离子水加入支架中心,水位到达或超过运行标记(“RUN”marker)为宜。
3.样品放置
1)将操作管支架(TubeHolder)顶部的滑行砝码(SlidingWeight)拉起并旋转90°C
2)放入样品管,旋转并放下滑行砝码,使之压住样品管,然后关闭安全门
4.开机
先打开仪器主机,然后开启电脑和软件。
5.软件主界面
点击软件,出现以下界面:
主菜单:
Run–编辑或选择运行方法
History–查看系统操作历史
Setup–用户系统设置
Maintenance–厂家或维修人员的仪器参数设定
Help–用户操作指南
About–系统配置信息
6.Run界面参数设置
点击Method,下拉菜单显示编辑过的Method信息,可进行Method选择,新建和编辑
编辑界面如下:
操作按钮:
AddStepInsertStepEditStepRemoveRemoveAllDuplicateGroupStepsMoveUpMoveDown
在操作方法末尾添加步骤
在选定的步骤前后添加新步骤
编辑选定的步骤
删除选定的步骤
删除所有步骤
复制选定的步骤
新建一个包含多个选定步骤的步骤集。
可设定重复操作的次数。
将选定步骤上移
将选定步骤下移
点
AddStep
步骤,有以下几项需要选择:
Duration持续时间:
操作样品的时间,设置范围0-3600sec
PeakIncidentPower最高入射功率:
作用在样品上瞬时超声波功率,设置范围
2.5到50瓦。
DutyFactor工作系数:
超声波作用于样品的时间占总时间段的百分数,
设置范围0.1%-50%。
CyclesperBurst超声波作用于样品过程中超声波能量传递的数目,设置范围
50-1000。
点Delay步骤,设定操作的延迟时间,有利于两次不同操作间的样品沉降
点Prompt步骤,编辑特定操作信息,可供操作者暂停操作,确认下一步是否继续
点Group步骤,可设定重复操作的次数
7.启动程序
1)在参数设置界面新建或修改一个操作
点击软件Run界面的Method,点击New新建或在列表中选择一个已有的操作方法后点
Edit。
按照实际需要设置相关参数(具体参数见附录)。
2)Run界面中运行程序
在Run界面点击“Run”按钮,运行程序。
8.关闭软件和机器
1)用配套注射器清空水浴;若水盘(DripTray)有水,需倒掉并用绒布擦干。
2)关闭软件,然后关闭仪器主机,最后关闭电脑。
八.仪器使用注意事项
1.实验室的室温应保持在15-30℃,不宜过冷。
2.在没有水浴的情况下,禁止运转程序,以免损坏传感器。
3.水浴只能使用除双蒸水或去离子水。
4.每天使用完毕,必须清空水浴,擦干水盘,以防藻类等微生物滋生。
5.操作时关闭安全门。
九.常见问题处理
故障
可能原因
可能解决方案
1.
安全门没关好;
重新关闭前部安全门;
门的状态和水位状态不是
2.
1.
水位太低;
将水加至满刻度线;
绿色
3.
2.
操作管支架放偏,导致水位
确认操作管支架放好
3.
过低
仪器连接不上,软件不识
1.
1.
检查USB连接;
电缆松了或坏了;
重启机器和软件;到Setup
别
2.
2.
软件无法通过USB识别机器
界面手动重连
1.关闭其他软件
软件系统不响应Windows资源被其他软件占用2.重启计算机;
3.重启系统
水加满仍显示水位过低水位感应器受阻清理水位检测通道
十、附录
一、仪器相关耗材:
S-series
E-series
PartNo.
Product
Description
Holder
Rack
520045
microTUBEsnap-cap(100ul)
Glasstubewithsnap-cap
500111
For<1.5kbDNAfragments
500114
Glasstubewithcrimp-cap
500182(24)
520052
microTUBEcrimp-cap(100ul)
For<1.5kbDNAfragments
500143(96)
520064
miniTUBE-CLEAR(200ul)
PlastictubewithAFAsurface
For2.0kbDNAfragments
500206
500205
PlastictubewithAFAsurface
520065
miniTUBE-Blue(200ul)
For3.0kbDNAfragments
二、操作参数