CovarisM220DNAShearing用户培训手册pdfdoc.docx

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CovarisM220高性能样品处理系统

培训手册

 

基因有限公司生命科学组

二o一二年三月

 

一、CovarisM220高性能样品处理系统技术特点二、系统安装条件

 

三、培训所需试剂设备及样品

 

四、安装及调试安排

 

五、培训程序及时间安排

 

六、仪器及试剂系统介绍

 

七、实验操作流程

 

八、仪器使用注意事项

 

九、常见问题处理

 

十、附录

 

一.Covaris高性能样品处理系统技术特点

Covaris高性能样品处理系统是在专利技术——自动声波聚焦(AFA)技术的基础上建

立起来的样品处理平台。

该技术整合了非线性、高强度、汇聚性声学冲击波和高级计算机控

制系统,其圆盘状传感器可将声波能量聚焦在样品上,通过等温、非接触的方式对样品进行

声学匀浆、分解和混匀。

而且,此系统的聚焦声能是可控,可根据应用范围和样品量选择波频率和波形,以控制聚焦带的尺寸和声波强度,且声学优化的样品容器也可根据声波聚焦带

进行调整。

另外,系统处理的水浴环境可维持均一的处理温度,适用于对温度敏感的生物样

本。

 

技术原理

 

介于20Hz~20kHz的机械波振动在弹性介质中的传播就形成声波,介于20kHz~

500MHz的称为超声波,超声波的传播速度就是声波的传播速度,而超声波具有波长短,

易于定向发射和会聚等优点。

AFA技术利用几何聚焦声波能量,通过0.5MHz的球面固态超声传感器可将波长为1mm的声波能量聚焦在样品上,不仅可以控制波形,而且自动聚焦的能量无损失,且可直接作用于管内样品上。

 

系统特点:

1.非接触式样品处理,无污染和交叉反应,且不用清洁探头

2.等温处理,不会产生过热现象而破坏样本的生物活性

3.可精确控制样本处理过程,重复性高

4.自动聚焦的能量无损失,直接作用于管内样品上

 

应用领域

 

适用100bp-3kb大小的DNA目的片段剪切

 

二.系统安装条件

1.位置要求:

稳定水平的操作平台放置设备,远离热源,避免阳光直射

2.空间及载重要求:

操作平台尺寸(长×宽×高):

12”Wx17”Dx10”H(30cm43cmxx25cm)(平台下预留空间放置环路冷却/加热装置),仪器周围要留出至少3cm空隙,以方便散热。

 

操作平台载重:

10kg

3.温度要求:

15-30℃

4.水浴要求:

双蒸水或去离子水,仪器操作温度范围6-40℃(要求水浴范围2-55℃)

用户如自备水浴,需要准备冷却/加热循环装置所需的软管;

建议采用covaris水环境系统(WCS)来维持高通量应用过程的水纯度。

5.电源:

100-240VAC500VA,50-60Hz。

6.电脑:

操作系统要求MicrosoftWindows7

7.其它:

通用插头接线板

 

三.培训所需试剂设备及样品

尊敬的用户,培训实验以DNAShearingwithmicroTUBEs(<1.5kbfragments)为例,请提前准备以下物品,我公司培训人员将使用以下物品进行仪器使用的培训工作。

 

1.所需样品和试剂

λDNA或基因组DNA(全长>50kb,浓度20-35ng/ul,体积130ul,A260/A280=1.8-2.0):

将λDNA用TrisEDTA(pH8.0)buffer稀释到20ng/ul,使用前可用核酸测定仪进行浓度及

纯度核对,注意保证完全溶解。

500bp及2kb的ladder(DL2000),TrisEDTA(pH8.0)buffer,1×TAE电泳缓冲液,DNA上样缓冲液(溴酚兰),1%琼脂糖胶,溴化乙锭(EB)。

 

2.耗材

(1)holder(PartNo.500114)一个;

(2)(6x16mm)100μltubewithAFAfiber&snap-caps(PartNo.520045)若干;

(3)PrepStation(PartNo.500142)一个。

或者准备一个试剂盒DNAShearingKITSsnap-cap(PartNo.500117),其中包括了以上三种耗材。

 

3.所需其他设备和耗材

凝胶成像议,离心机,核酸电泳相关设备,核酸测定仪(分光光度机),200ul移液枪及

Tip头若干,离心管,冰盒,乳胶手套。

 

四、安装及调试安排

1.根据合同开箱验货,并明示到货情况

2.系统安装

 

3.系统调试及校准

 

五、培训程序及时间安排

请安排2-4名实验室长期工作人员参加培训,培训时间预计为一天

1.基本原理讲解及讨论(1小时)

2.软件基本功能综述及使用培训(2小时)

3.用户实际操作及实验培训(4小时)

4.软件和仪器操作问题答疑(1小时)

 

六.仪器及试剂系统介绍

1.基本原理讲解

2.仪器系统组成和工作原理讲解

3.仪器基本注意事项

 

七.实验操作流程

以下是关于使用Covaris高性能样品处理系统的快速操作指南,便于初学者能快速掌

握软件的主要功能。

关于软件应用的进一步的深入,请参见随机所带的英文操作使用手册。

 

1.开机检查

1)检查固定在机器顶部的电脑与机器的线路连接妥当

2)确认水盘(DripTray)放置机器下方

3)插入操作管支架(TubeHolder)

 

2.水浴设置

将操作管支架(TubeHolder)顶部的滑行砝码(SlidingWeight)拉起并旋转90°C,用随机水瓶(washbottle)将约15ml蒸馏水或去离子水加入支架中心,水位到达或超过运行标记(“RUN”marker)为宜。

 

3.样品放置

1)将操作管支架(TubeHolder)顶部的滑行砝码(SlidingWeight)拉起并旋转90°C

 

2)放入样品管,旋转并放下滑行砝码,使之压住样品管,然后关闭安全门

 

4.开机

先打开仪器主机,然后开启电脑和软件。

 

5.软件主界面

点击软件,出现以下界面:

 

主菜单:

Run–编辑或选择运行方法

History–查看系统操作历史

Setup–用户系统设置

Maintenance–厂家或维修人员的仪器参数设定

Help–用户操作指南

About–系统配置信息

 

6.Run界面参数设置

点击Method,下拉菜单显示编辑过的Method信息,可进行Method选择,新建和编辑

 

编辑界面如下:

 

操作按钮:

AddStepInsertStepEditStepRemoveRemoveAllDuplicateGroupStepsMoveUpMoveDown

在操作方法末尾添加步骤

在选定的步骤前后添加新步骤

编辑选定的步骤

删除选定的步骤

删除所有步骤

复制选定的步骤

新建一个包含多个选定步骤的步骤集。

可设定重复操作的次数。

将选定步骤上移

将选定步骤下移

 

AddStep

步骤,有以下几项需要选择:

 

Duration持续时间:

操作样品的时间,设置范围0-3600sec

PeakIncidentPower最高入射功率:

作用在样品上瞬时超声波功率,设置范围

2.5到50瓦。

DutyFactor工作系数:

超声波作用于样品的时间占总时间段的百分数,

设置范围0.1%-50%。

CyclesperBurst超声波作用于样品过程中超声波能量传递的数目,设置范围

50-1000。

 

点Delay步骤,设定操作的延迟时间,有利于两次不同操作间的样品沉降

 

点Prompt步骤,编辑特定操作信息,可供操作者暂停操作,确认下一步是否继续

 

点Group步骤,可设定重复操作的次数

 

7.启动程序

1)在参数设置界面新建或修改一个操作

点击软件Run界面的Method,点击New新建或在列表中选择一个已有的操作方法后点

Edit。

按照实际需要设置相关参数(具体参数见附录)。

2)Run界面中运行程序

在Run界面点击“Run”按钮,运行程序。

8.关闭软件和机器

1)用配套注射器清空水浴;若水盘(DripTray)有水,需倒掉并用绒布擦干。

2)关闭软件,然后关闭仪器主机,最后关闭电脑。

 

八.仪器使用注意事项

1.实验室的室温应保持在15-30℃,不宜过冷。

2.在没有水浴的情况下,禁止运转程序,以免损坏传感器。

3.水浴只能使用除双蒸水或去离子水。

4.每天使用完毕,必须清空水浴,擦干水盘,以防藻类等微生物滋生。

5.操作时关闭安全门。

九.常见问题处理

故障

可能原因

可能解决方案

1.

安全门没关好;

重新关闭前部安全门;

门的状态和水位状态不是

2.

1.

水位太低;

将水加至满刻度线;

绿色

3.

2.

操作管支架放偏,导致水位

确认操作管支架放好

3.

过低

仪器连接不上,软件不识

1.

1.

检查USB连接;

电缆松了或坏了;

重启机器和软件;到Setup

2.

2.

软件无法通过USB识别机器

界面手动重连

1.关闭其他软件

软件系统不响应Windows资源被其他软件占用2.重启计算机;

3.重启系统

 

水加满仍显示水位过低水位感应器受阻清理水位检测通道

 

十、附录

一、仪器相关耗材:

 

S-series

E-series

PartNo.

Product

Description

Holder

Rack

520045

microTUBEsnap-cap(100ul)

Glasstubewithsnap-cap

500111

For<1.5kbDNAfragments

500114

Glasstubewithcrimp-cap

500182(24)

520052

microTUBEcrimp-cap(100ul)

For<1.5kbDNAfragments

500143(96)

520064

miniTUBE-CLEAR(200ul)

PlastictubewithAFAsurface

For2.0kbDNAfragments

500206

500205

PlastictubewithAFAsurface

520065

miniTUBE-Blue(200ul)

For3.0kbDNAfragments

 

二、操作参数

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