如何进行医学文献检索.ppt

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,医学信息检索与利用,为什么要学习文献信息检索？

科学研究的一般工作流程：

检索相关的研究分析现有的研究结果发现问题提出假说,制订试验方案定义试验步骤试验数据汇总,数据可视化数据验证调整试验重新校验假说,写作研究论文发表研究论文,一个科研人员的时间分配表,写报告9%,信息社会,信息资源日益庞大出版速度加快载体形式多样化网络信息的大量涌现,学习文献信息检索的目的,面对日益增长的信息资源，如何通过一种有效的方法，以最少的时间与精力来获取自己所要的信息这就是学习信息检索所要解决的问题,概论主要内容,一、绪论二、文献信息概述三、文献信息检索途径四、文献信息检索技术和策略五、文献信息检索语言六、图书馆资源介绍,一、绪论,1.课程的目标和任务课程的目标：

医学文献信息检索旨在培养学生的信息意识、信息能力和信息道德，掌握文献信息检索的基本理论、基本知识和基本技能，培养学生的检索、筛选、分析、评价、管理和综合利用文献信息的能力、创新能力和终身学习能力。

一、绪论,课程的任务：

通过学习信息检索的基础知识和基本技能，了解医学及相关专业文献信息的基本知识，掌握常用医学信息资源数据库的使用方法，能够快速地从各种医学信息资源中获取自己所需要的信息，并进行分析、评价和有效利用。

一、绪论,2.信息素养信息素养的定义：

信息素养常被称作信息文化、信息能力、咨询素养，从各种信息源中检索、评价和使用信息的能力，是信息社会劳动者必须掌握的终身技能。

具备信息素养的人能认识到何时需要信息，并能检索、评价和有效地利用所需要的信息。

一、绪论,信息素养包含的内容：

信息意识：

主观上对信息具有强烈的知情愿望和高度敏感。

信息道德：

个体在信息活动中应遵循的道德规范。

信息能力：

是信息素养的核心，培养医学生的信息能力至关重要。

包括信息活动能力、信息积累能力、信息表达能力、信息甄别能力、信息利用能力。

二、文献信息概述,1.文献、知识和信息2.文献类型3.科技文献信息的特点4.科技文献信息的社会职能5.文献信息数据库,文献信息知识了解文献、信息和知识的概念以及三者的关系是我们有效利用现有文献信息资源的基础。

1.文献、信息和知识,1.文献、信息和知识,信息（information）信息是物质存在的一种方式、形态或运动状态，是事物的一种普遍属性。

信息的基本属性：

客观性；可知性；传递性。

生物信息,自然信息,机器信息,社会信息,1.文献、信息和知识,知识（knowledge）定义：

是人类通过对信息的感知、获取、选择、处理、加工等一系列思维过程，形成的对客观事物的本质和规律的认识。

信息论角度定义：

知识是人类大脑中重新组合形成的序列化信息。

1.文献、信息和知识,文献（literature，document）文献是记录有知识的一切载体。

四个基本要素：

记录知识的具体内容；记录知识的手段；如文字，符号，图像，音频，视频等。

记录知识的物质载体；如纸张，光盘，磁盘，硬盘等。

记录知识的表现形态；如图书，期刊，专利说明书等。

1.文献、信息和知识,信息、知识、文献的形成：

事物,产生,信息,大脑加工,知识,记录,文献,1.文献、信息和知识,信息、知识、文献的相容关系：

信息,知识,文献,2.文献的类型,按载体的不同：

印刷型：

传统的图书、期刊等。

电子型：

电子图书、电子期刊及和各种类型数据库等声像型和缩微型：

唱片、录像带录音带、光盘；缩微胶卷和胶片,印刷型文献,纸张,阅读方便,存储密度低不易保存,缩微型文献,胶片、平片,存储密度较高易复制,不宜阅读,声像型文献,磁带、录像带,载体,特点,形象、直观,电子型文献,硬盘、光盘,存储密度高、可控性好、形象、易复制、易交流,文献类型,不方便,2.文献的类型,2.文献的类型,按出版形式：

图书：

教科书、专著、参考工具书期刊WHO出版物会议文献学位论文:

学士、硕士和博士学位论文科技报告专利文献,2.文献的类型,按获取的难易程度：

白色文献：

完全公开黑色文献：

完全不公开灰色文献：

内部交流,2.文献的类型,根据文献中信息量的多少、内容的加工程度，以及功能的不同：

一次文献二次文献三次文献零次文献,2.文献的类型,一次文献（PrimaryDocument）是指著者以其本人的研究成果（如实验、观察、调查报告等的结果）为基本素材写成的原始创作。

如专著、期刊论文、科技报告、学位论文等。

特点：

所记录的是著者的最新发现或发明，以及新的见解、新的理论、新的方法等新颖，具体而详尽的知识，但由于其信息量大、分散而无序，给读者的查找与利用带来极大的不便。

2.文献的类型,二次文献（SecondaryDocument）就是将大量无序、分散的一次文献收集、整理、加工、著录其特征如著者、篇名、分类、主题、出处等，并按一定的顺序加以编排，形成供读者检索所需一次文献线索的新的文献的形式如索引、文摘、目录及相应的数据库。

2.文献的类型,三次文献（TertiaryDocument）科技人员围绕某一专题，利用二次文献的检索，在吸取一次文献内容的基础上，即经过阅读、分析、归纳、概括，撰写而成的新的文献，或综述已取得的成果进展，或加评论、或预测发展趋势。

如：

综述、述评、进展、现状、发展趋势等期刊文献和百科全书、年鉴、手册等参考工具书。

特点：

信息含量大、综合性强和参考价值大等。

2.文献的类型,零次文献（ZeroDocument）未经信息加工，直接记录在载体上的原始信息，如实验数据、观测记录、调查材料等。

研究活动（实验、观察、思考）,信息的直接记录或传递,零次文献（创造知识的素材）,将知识以文字等形式固化,一次文献（初始的知识产品）,将分散的文献序列化,二次文献（一次文献的替代品）,将知识重新组合，使知识序列化,三次文献（浓缩的新的信息产品）,各级文献的形成及相互关系,3.科技文献信息的特点,数量庞大，增长迅速文种繁多，但呈明显的英文化趋势文献分布既集中又分散，但呈专题化或专集化趋势知识老化加快，文献寿命（半衰期）缩短交流传播及变化速度加快,4.科技文献信息的社会职能,是科学表现的存在形式，是创造人类财富的智慧源泉是衡量科学技术水平的重要依据是传播科学知识的最基本、最主要的手段是确认科学发现与技术发明优先权的认证记录,5.文献信息数据库的类型,1.书目数据库（BibliographyDatabase）2.事实数据库（FactDatabase）3.数值数据库（NumericDatabase）4.全文数据库（Full-textDatabase）5.多媒体数据库（MultimediaDatabase）6.知识库（KnowledgeBase）,书目数据库,提供文献的特征，如篇名、著者、文献来源、摘要、文献收藏单位等，提供“文献线索”的数据库。

中国生物医学文献数据库，pubmed，WebofScience,EMBase,CA等。

事实数据库,提供问题的答案，如医学术语、疾病的诊治方法、药物的用法和不良反应、化合物的结构与化学反应等。

PhysicianDataQuery,电子版的词典、百科全书、年鉴等。

数值数据库,提供数据信息，包括统计数据、科学实验数据、化合物理化数据、人口数据、疾病发生和死亡数据、各种测量数据等。

美国疾控中心CDC的DataandStatistics、ISI的JCR等。

全文数据库,中文全文数据库：

中国知网CNKI、中文科技期刊数据库、万方系统的数字化期刊全文库常用英文全文数据库有SpringerLink、Proquest、Wiley、ScienceDirect、OVID。

题录,篇名、著者、出处这三个字段构成题录。

例：

黄伟，金远平.形式概念分析在本体构建中的应用.微机发展，2005

（2）:

28-31,三、文献信息数据库的检索途径,1.自由词检索2.主题词检索3.分类检索4.著者检索5.题名检索,6.引文检索7.机构检索8.刊名检索9.序号检索,自由词检索,自由词又称文本词TextWord，包括：

标题词TitleWord，关键词Keyword，文摘词AbstractWord，全文词FulltextWord。

通过从文献篇名、正文或摘要中抽取出来的能表达文献主要内容的单词或词组查找文献的检索途径。

主题词检索,美国国立医学图书馆医学主题词表,主题词检索,分类检索,中国图书馆分类法,著者检索,著者检索,姓前名后，姓用全称，名缩写,题名检索,引文检索,以被引用文献（文章后面的参考文献）为检索起点来查找引用文献的过程,机构检索,刊名检索,序号检索,利用文献特有序号作为检索入口查找文献的途径。

主要包括ISSN、ISBN、专利号、公开号、合同号、化学物质登记号等。

四、基本检索技术与检索策略,1.文献检索的定义和作用2.文献信息检索技术3.文献检索策略,1.文献检索的定义和作用,文献检索定义：

根据用户需要，利用检索工具和检索系统，查找出符合用户特定需要的过程。

（1）常用法（工具法）：

顺查法，倒查法，抽查法

（2）追溯法（3）分段法（4）浏览法,1.文献检索的定义和作用,文献检索的意义和作用：

（1）获取科学知识的最佳捷径

（2）避免科研工作重复、少走弯路。

（3）提高科研、生产效率，节省时间。

（4）提高信息素养。

2.文献信息检索技术,

（1）布尔逻辑检索

（2）截词检索（3）邻近检索（4）限定检索（5）扩展检索（6）加权检索（7）精确检索和模糊检索（8）跨库检索（9）相关信息反馈检索（10）智能检索（11）其他网络检索技术,

（1）布尔逻辑检索技术,布尔运算符AND、OR、NOT，分别表示逻辑与、逻辑或、逻辑非三种逻辑运算关系，如下图所示。

布尔逻辑运算示意图,AANDB,AORB,ANOTB,

（1）布尔逻辑检索技术,逻辑“与”,检索表达式为“AandB”数据库中同时含有检索词A和B的文献为命中文献；作用是缩小检索范围，提高查准率；例如，查找“胰岛素治疗糖尿病”的文献，检索式为insulinanddiabetes。

（1）布尔逻辑检索技术,逻辑“或”,检索表达式为“AorB”数据库中的文献中含有检索词A或B的文献为命中文献；作用是扩大检索范围；例如，查找“肿瘤”的文献，检索式为cancer（癌）ortumor（瘤）orcarcinoma（癌）orneoplasm（新生物）。

（1）布尔逻辑检索技术,逻辑“非”，检索表达式为“AnotB”数据库中凡含有检索词A而不含B的文献为命中文献；作用是缩小检索范围，提高查准率；例如，查“动物的乙肝病毒（不要人的）”的文献，检索式为hepatitisBvirus（乙肝病毒）nothuman（人类）。

（1）布尔逻辑检索技术,布尔逻辑运算的优先顺序当一个检索表达式含有多个布尔算符时，执行的顺序为notandor可用圆括号改变运算顺序，将需要优先运算者置于（）中。

例如，查找“维生素C或维生素E对糖尿病患者肾脏的保护作用”，检索式为：

（维生素Cor维生素E）and糖尿病and肾。

（2）截词检索,截词检索：

把检索词截断，取其中的一部分片段，再加上截词符号一起输入检索，系统按照词的片段与数据库里的索引词对比匹配，凡是包含这些词的片段的文献均被检索出来。

主要用于检索词的单复数、词性的词尾变化、词根相同的一类词，以及同一词的拼法变异等。

（2）截词检索,常用的截词符号有“*”、“？

”*可代替0-n个字母？

可代替0-1个字母,

（2）截词检索,根据被截断部位的不同：

左截断，*hydroxy右截断，hyperten*中截断，h*ophilia,

（2）截词检索,（3）邻近检索,邻近检索（proximitysearching）是用来表示检索词与检索词之间位置关系的检索技术，通常用位置算符来实现。

采用的位置算符有near，with。

“near”，表示检索词位置相邻，检索词出现的顺序可前可后，如geneNEARapoptosis；“with”，表示检索词位置相邻，且两词出现的顺序与输入顺序一致，如liverWITHcancer。

（4）限定检索,限定检索（limitSearching）又称限定字段检索（limitFieldSearching），是利用检索词出现的字段进行的检索；用户可以指定检索某一字段或某几个字段以使检索结果更为准确，减少误检；会采用缩写形式的字段标识符；如PubMed中AU著者、AD作者机构等。

（5）扩展检索,扩展检索（expandsearching）是同时对多个相关检索词执行逻辑或检索的技术；即当用户输入一个检索词后，系统不仅能检出该检索词的文献，还能检出与该检索词同属于一个概念的同义词或下位词的文献，如PubMed中主题词的扩展检索。

（6）加权检索,加权检索（weighingsearching）不仅检索提问词是否存在，而且计算提问词的权值，当权值之和超过阈值的记录才能在数据库中被检出来。

在某些数据库中表现为仅检索主要概念主题词，如pubmed；而有些数据库表现为词频检索，如中国学术期刊全文数据库。

（7）精确检索和模糊检索,精确检索（exactsearching）是指所检信息与输入的词组完全一致的匹配检索技术；在许多系统中用引号来表示，如检索“AcutePancreatitis”；模糊检索（fuzzysearching）允许所检信息与检索提问之间存在一定的差异。

如检索AcutePancreatitis，可检索出Pancreatitis、AcutePancreatitis等。

（8）跨库检索,跨库检索（crossdatabasesearching）是一次对多个数据库同时进行检索的技术。

能为用户提供统一的检索接口，将用户检索需求转化为不同数据库的检索表达式，并发地检索本地和广域网上的多个分布式异构数据库，并对检索结果加以整合，以统一的格式将结果呈现给用户。

（8）跨库检索,（9）相关信息反馈检索,是将与已检结果存在某种程度相关的信息检索出来的检索技术，多由检索系统自动进行检索。

如PubMed的“RelatedArticles”。

CNKI的相似文献,（9）相关信息反馈检索,（10）智能检索,自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索。

如中国生物医学文献服务系统（SinoMed）的智能检索。

PubMed的“自动词语匹配检索”属于智能检索。

（11）其他网络检索技术,其他网络检索技术1）包含或排除检索技术2）检索结果翻译与多语种检索,3.文献检索步骤：

检索策略的调整,

（1）扩大检索范围的方法：

增加同义词或近义词，用OR组配；主题词扩展检索（有下位词）或使用上位主题词进行检索；检索相关主题词；使用截词符或通配符；减少检索的字段限定；横向检索；检索引文。

检索策略的调整,

（2）缩小检索范围的方法：

使用逻辑运算符“and”或“not”;选择专指性的检索词；使用副主题词；主题词加权检索；限制字段检索。

检索效果的评价,查全率（recall）：

指系统在进行某一检索时，检出的相关文献量占系统文献库中相关文献量的比率，它反映该系统文献库中实有的相关文献量在多大程度上被检索出来。

R（检出相关文献量/系统文献库中相关文献总量）100%查准率（precision）:

指系统在进行某一检索时，检出的相关文献量占检出的文献总量的比率，它反映每次从该系统文献库中实际检出的全部文献中有多少是相关的。

P=（检出相关文献量/检出文献总量）100%,五、文献信息检索语言,文献检索语言：

用以描述文献信息特征,表达检索需求的一种专门的人工语言，是联系信息生产者、管理者与使用者之间的桥梁。

检索语言的种类,规范性非规范性：

标题、关键词规范性：

分类、叙词（主题词）描述信息特征外部特征：

标题、著者、序号、引文内部特征：

分类、主题、代码（分子式）,检索语言的类型,外部特征的检索语言,著者索引题名索引文献序号索引引文索引,以文献著者姓名字顺为标识的检索语言。

著者包括译者、编者、文摘人、专利权人、学会和机关团体名、学术会议名等。

外部特征的检索语言,著者索引题名索引文献序号索引引文索引,以文献发表时的题目（篇名）、刊名或书名字顺为标识的检索语言。

包括书名目录（索引）、刊名目录（索引）、篇名索引等。

外部特征的检索语言,著者索引题名索引文献序号索引引文索引,以文献所特有的序号为检索标识的检索语言。

专利号索引、科技报告序号索引、技术标准号、国际标准书号（ISSN）索引等。

外部特征的检索语言,著者索引题名索引文献序号索引引文索引,以文献所附注的参考文献为检索标识的检索语言。

利用文献的引用和被引用关系建立起来的文献检索系统称为引文索引。

参考文献指著者在文献末尾附加的用来表明论据或数据来源出处的文献资料。

内部特征的检索语言,分类检索语言主题检索语言,以分类号和类目名称作为标识符号，按学科、专业集中文献。

典型代表：

中图法,以名词术语为标识符号，从主题概念的角度来集中文献。

典型代表：

MeSH,中国图书馆分类法,中国图书馆分类法（简称中图法）是我国各类图书馆应用最广泛的分类法1.图书馆进行馆藏文献的分类排架和编制分类目录。

2.图书发行、数据库的科学论文标引、以及网络信息资源组织与检索等。

目前中图法的最新版是2010年出版的第五版。

中国图书馆分类法,http:

/,1.基本大类（22个）,2.R医药、卫生大类下设17个二级类目,3.层累标记制,中图法的分类号采用字母与阿拉伯数字相结合的混合制编码，用一个字母标志一个大类，以字母的顺序反映大类的序列，在字母后用数字表示大类下的类目的划分。

数字的编号制度，使用小数制，即首先顺序字母后第一位数字，然后顺序第二位，以下类推。

数字的位置，基本上遵从层累制原则，即尽可能使号码的位数代表类目的等级数。

当一个分类号的数字超过三位时，为了醒目而加上小圆点“.”，并无其他意义。

3.层累标记制,类目按概念间的逻辑隶属关系，由上至下逐级展开，划分出更专指、更具体的类目。

如“R323.123静脉”的上下级类目从上至下依次是：

4.复分号,复分是增强类目的细分化程度，提高类目专指度的分类措施，是图书馆分类法的重要组成部分。

中图法的复分表主要有通用复分表和专类复分表两种，这些复分表的号码不能单独使用，只能加在主分类号后面作为共性区分的标识。

通用复分表,如总论、地理、时代、民族复分表等8个。

总论复分表中的描述图书的外部特征如教材、工具书等的复分号及其含义举例如下表：

列如：

R28中药学R28-61中药学辞典R28-64中药学图谱,专类复分表,专类复分表专供某些类目的进一步细分之用。

例如，专供R5-R8（临床医学各类）的复分表如上：

例如：

R581甲状腺疾病R512.6病毒性肝炎R581.04甲状腺疾病诊断R512.603病毒性肝炎免疫学,主题描述语言及其应用,主题词法特点：

（1）采用指定的词语“主题词”，来专指或网罗相应的概念，也就是适当归并某个概念的同义词、近义词、拼法变异词及缩写等，以保证这个“主题词”与这个概念唯一对应；

（2）采用参照系统；（3）主题词分类索引和等级索引，轮排索引；（4）主题词表，增删修订定期更新。

医学主题词表,医学主题词表（MedicalSubjectHeadings，简称MeSH表），美国国立医学图书馆（NLM）研制的用于标引、编目和检索生物医学文献的英文受控词表。

MeSH表汇集了由著名的医学专家、医学编辑和医学图书馆专家推荐的、在生物医学领域里使用频繁且使用者认可的主题词2.5万多个，副主题词83个。

概念体系,MeSH表的概念体系主题词限定词补充概念款目词,1主题词（mainheadings）,又称叙词（Descriptors），是用于描述主题事物或内容的规范化词汇。

（1）主题词的形式：

以名词为主，可数名词多采用复数形式，如BloodCells；不可数名词或表示抽象概念的名词采用单数形式，如BrainStem；可以是单个词，也可以是词组词组形式的主题词一般按自然语序采用顺置形，如LungAbscess、HepaticComa等。

但是为了使概念相近的族性主题词集中在一起，有些复合主题词采用倒置形式，将复合主题目词中被修饰的名词放在前面，起修饰限定的形容词放在名词之后，并用“，”分开。

例如：

Shock,Cardiogenic（心源性休克）Shock,Hemorrhagic（出血性休克）Shock,Septic（败血性休克）倒置后，凡有关休克的文献都相应集中在“Shock”这个主题词下，为检索者提供了族性选词的方便。

（2）主题词的单一性：

一个词语只表达一个概念，一个概念只用一个词语表达，有利于提高文献的查全率。

（3）主题词的动态性：

MeSH表是医学常用规范化词汇的浓缩，必然随着医学科学的不断发展而不断的增删、调整，以便及时反映医学科学的最新发展、新主题和新事物，有一定的动态性。

2.树状结构号,根据每个主题词的词义范畴和学科属性，可将全部主题词归入16个大类（以大写字母A-N，V，Z表示），每个大类又细分为100多个二级类目，二级类目再层层划分，逐级展开，使同一概念范围的主题词成族展示它们之间的并列、隶属等相互关系，每一个主题词均给予一个相应的树状结构号，最多可达11级，形成主题词的状结构体系，少数主题词按其属性须跨两个或多个类，这样的主题词被同时给予多个树状结构号。

概念体系-树状结构号,概念体系-树状结构号,3限定词（qualifiers）,又称副主题词（subheadings），是对文献主题起限定作用，构成主题的一些通用性概念，本身无独立检索意义。

限定词的数量及其可组配的主题词的范围均有严格规定。

到2009年，MeSH表规定使用的限定词有83个。

4补充概念（supplementconcept）,又称补充化学物质名称，用于标引MEDLINE中出现的化学物质和毒品等并在PubMed中可用化学物质名称字段NM进行检索的概念。

目前MeSH表收录有455000多个补充概念。

又称见参照（seereferences），是主题词的同义词或相关词，作用是将自由词引见到主题词。

5款目词（entryterms）,应用与获取,NLM提供4种方式联机免费获取其电子版及相关信息：

一是MeSHBrowser；二是UMLSMetathesaurus（超级叙词表）；三是MeSH网（http:

/www.nlm.nih.gov/mesh）；四是MeSHdatabases,MeSHBrowser,MeSHBrowser（医学主题词浏览器，http:

/www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html）是MeSH表的网络版，旨在帮助用户迅速查询相关主题词并显示主题词的等级结构体系。

MeSHBrowser提供了2种查询方式：

输词查询（Entertermorthebeginningofanyrootfragments树形结构导航查询（Navigatefromtreetop）,输词查询,树形结构导航查询,六、图书馆资源介绍,图书馆概况馆内文明我馆资源我馆服务网上自助开放时间,师哥师姐们说,图书馆所特有的书卷气将永远成为最能抚慰我心的一缕清香。

她是心灵的归宿，想起她，内心安宁！

在图书馆，我学会了真正的“独立之人格，自由之思想”。

毕业了才知道图书馆的资源这么多，师弟师妹要好好珍惜呀！

机构设置,馆长室办公室采编部流通部期刊部网络信息部参考咨询部,我馆分布图,正门,109西文过期期刊阅览室,饮水处,传达室,208中文专业书借阅处（第一书库）,201电子阅览室,206中文专业书借阅处（第一书库）,204查新工作站,308社科文艺书借阅处（第三书库）,306中文现期期刊阅览室,301中文过期期刊阅览室,408西文专业书借阅处（第二书库）,406西文现期期刊阅览室,401社科期刊阅览室,501工具书阅览室,508中文专业书阅览室,506自习室,一,二,三,四,五,共享空间,凭本人校园一卡通进入图书馆,馆内文明,举止文明礼貌，注重个人仪表，请勿穿背心、拖鞋入馆；注意防火安全，严禁携带易燃、易爆品入馆，馆内严禁吸烟和使用明火；,馆内文明,保持馆内安静