QIAxcel全自动毛细管核酸分析系统培训手册DNA版.docx

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QIAxcel全自动毛细管核酸分析系统培训手册DNA版

 

QIAxcel全自动毛细管核酸分析系统培训手册

DNA版

 

 

基因有限公司生命科学组

 

一、QIAxcel全自动毛细管核酸分析系统简介

二、QIAxcel全自动毛细管核酸分析系统安装和维护

三、氮气瓶的安装及使用

四、GelCartridege凝胶卡夹的安装及校正

五、培训所需试剂、仪器及耗材

六、DNA样品演示实验

七、BioCalculatorTM软件基本功能及数据分析

八、常见问题解答

 

一.QIAxcel全自动毛细管核酸分析系统介绍

QIAGEN是全球核酸、蛋白质分离纯化试剂和新技术的权威供应商,总部设在德国。

其主打产品是QIAxcel,用于高通量DNA/RNA分离分析,这个产品广泛用于遗传分析,疾病检测以及食品鉴定等方面。

相比其它同类产品而言,其特点是高效,省时,安全,适用于标准化。

(一)产品介绍:

技术参数:

1. 自动加样全自动化96孔加样;

2. 高通量12通道上样,96孔板连续检测;

3. 无需制胶更换式凝胶试剂盒;

4. 快速分析1-1.3小时/96个样品;

5. 高灵敏度PCR产物检测最低DNA浓度为0.1ng/ul;

6. 高分辨率500bp以下达2-5个bp;

7. 数据显示电泳图谱和峰图

8. 体积小便于搬运;

9. 污染小无敞开式EB污染。

10.重量23kg

(二)BioCalculatorTM软件

1.操作简单,多种分离方法可供选择

2.多种内嵌式方法模板适用各种用途

3.数据分析界面友好:

既可用于定性分析也可用于定量分析,一次完成多组数据分析

4.数字化实验数据采集:

●实验数据以电泳峰图和胶图两种形式显示

●可适时电泳峰图和胶图

●电子化实验数据方便储存和传递

 

二.QIAxcel全自动毛细管核酸分析系统安装和维护

(一)安装条件

1.位置要求:

稳定水平的操作平台放置设备,远离震荡设备。

2.温度要求:

25℃

3.湿度要求:

40%-95%

4.电源:

100-230V~,50-60Hz,360W(VA)

5.电脑要求:

●Processor处理器:

PentiumIV1.8或更高

●硬盘:

40GB

●内存:

512MBRAM

●显示器:

800x600

●操作系统:

Microsoft®Windows®XP

6.氮气要求:

纯度为99.999%的高纯氮气

7.

(二)维护

用湿布清洁仪器的外表面。

不能灭菌,不需要用化学物质清洁仪器外表面,否则可能会引起表面损坏。

如果矿物油偶尔滴在样品支架或溢出到样品支架时,用热水和肥皂水清洗(和新的卡夹第一次使用时清洗的过程相同)。

凝胶卡夹的储存温度推荐为10℃-30℃,相对湿度为40%-95%。

 

三.氮气瓶的安装及使用

关于氮气瓶的安装,将由工程师完成或请在工程师指导下完成此工作

1.先将减压阀安装到氮气瓶上

2.

请选择如下图所示规格的转接头,将氮气瓶和仪器连接起来。

安装完成后要确保不能漏气。

 

3.仪器打开前,先打开氮气瓶总阀,并将减压阀压力调到40psi左右,再开始实验。

4.实验完成后,将减压阀和氮气瓶总阀关闭

四.GelCartridege凝胶卡夹的安装及校正

(一)凝胶卡夹的安装

1.使用前将卡夹中的所有试剂室温平衡,并将卡夹置于盛有DNAWashingSolution的catridegestand中平衡20min.

2.用温和的去污剂清洗盛溶液的盘子,然后用去离子水彻底冲洗干净

3.加8ml的DNAWashingSolution到盛溶液的盘子的WP和WI槽

4.加16ml的SeparationBufferSolution到盛溶液的盘子的BUF槽

5.然后加2ml的矿物油到WP和WI槽,加4ml的矿物油到BUF槽,防治洗液和分离液挥发(图1)

图1

6.加15ul的AlignmentMarker到0.2ml的连管中,每孔加一滴矿物油,然后插入到盛溶液的盘子的MARKER1的位置(图2)

7.加15ul的IntensityCalibrationMarker到彩色的0.2ml的连管中,然后插入到盛溶液的盘子的MARKER2的位置(图2)

图2

8.点击上的按钮,仔细将盛满溶液的盘子放到仪器的对应支架上

9.去掉凝胶卡夹后面的封胶带,打开仪器上的卡夹门,将凝胶卡夹正面朝前插入仪器卡夹内,凝胶卡夹上的加密钥匙插入仪器相应的适配器中,关上卡夹门,凝胶卡夹的ID号将会在仪器的控制面板上显示(图3)。

图3

(二)凝胶卡夹的浓度校正

1.双击

快捷图标,进入软件操作,在下选中(图4)

图4

2.点击按钮(图5A)

图5

3.打开文件,点击(图6)

图6

4.点击绿色的按钮,运行程序,程序结束后,在仪器的控制面板,下选择(图7)

图7

5.校正过程结束后,(Cal)会出现凝胶卡夹的ID的后面(图8C)。

图8

6.去掉仪器控制面板列表中的和方法,保留方法,并且重新命名样品的名字,双击控制面板上绿色的按钮

7.程序运行完成后,确认所有通道只有一个峰。

8.在下选择Parameters(图9)

图9

9.不要选中(图10)

图10

10.在结果图表中检查na(normalizedarea)值,所有的通道na值应该在4.500E-003和5.500-003之间,如果超出这个范围,那么必须进行重新校正(图11)

图11

 

五.培训所需试剂、仪器及耗材

(一)试剂

1.DNAGelCartridge(GC-5000-4)

2.去离子水

(二)仪器及耗材

1.台式离心机

2.移液器

3.0.2mlPCR反应管,Tip头,手套等

以上物品请用户提前准备妥当,我公司培训人员将使用以上物品进行仪器使用的培训工作。

如不具备请及时与培训技术人员联系。

 

六.DNA样品演示实验

(一)样品准备

PCR样品

提示:

有些PCR的反应kit盐的含量过高,适当稀释能得到更好的结果

(二)实验操作步骤

1.双击

快捷图标,进入软件操作,在下选中

2.点击按钮,将加有样品的PCR管放在仪器96孔板载物台上,最少上样体积10ul

3.选择合适的分离方法,如:

OM500(图12A)

4.输入样品类型、位置和分离重复次数(图12B)

5.点击按钮,输入和样品孔对应的样品名称(图12F)

6.确认所用到的通道均已选中(图12G)

7.检查仪器的状态,Pres1:

OK;Pres2:

OK;SD:

Closed;CD:

Closed。

8.点击,运行程序(图12J)

图12

七.BioculatorTM软件基本功能及数据分析

(一)软件的基本功能

图13InstumentControl

显示序列列表,列出了仪器所有的功能

显示当前凝胶卡夹可以使用的方法

分离样品的类型

分离样品的位置

仪器的吸样时间,可以在0-60s之间选择

样品分离的重复次数

如果选中,仪器将自动从A行加样品,依次到B、C、D、E、F、G和H行

输入和样品孔对应的每个样品的名字

锁住仪器内的凝胶卡夹

去除仪器内的凝胶卡夹

定位凝胶卡夹到盛溶液的盘子的WP槽

移动盛溶液的盘子和支架,方便更好溶液和放置样品

 上传分离实验中使用的Referencemarker

(二)软件数据分析

1.实验运行结束后,打开,点击(图14)

图14

2.检查已经打“√”,作为默认设置。

然后点击(图15)

图15

3.打开,点击

4.以Alignmentmarker条带为基础,出现重排结果(图16)。

图16

5.确定DNA样品的大小和浓度

(1)双击Marker通道上面的彩色条带,放大实验结果,确认所有的峰均在对照阈值之上

(2)打开,点击,然后点击,显示Qiaxcel内置的ReferenceMarkers列表。

选中目的Marker,显示目的Marker的条带(图17)

图17

(3)输入第一条和最后一条Alignmentmarker的大小,如第一条为15pb,最后一条为5000bp(图18,图19)。

图18

图19

(4)点击按钮,将结果图表中的“Reltime”“NA”的数据复制到referencemarker图表中对应的位置(图20)。

图20

(5)点击,结合marker名字和实验方法重新命名referencemarker,点击按钮(图21)

图21

(6)打开,点击,条带的大小和浓度出现在实验结果的图表上(图22)。

图22

 

八.常见问题解答

Q:

仪器不能打开?

A:

1.检查电源是否连接好

2.保险丝断了,更换保险丝

Q:

仪器不能运行?

A:

1.检查样品门和卡夹门是否关闭

2.没有检测到凝胶卡夹的加密钥匙

3.氮气瓶压力太低

4.USB软件key丢失或破裂,重连USB软件key或更换key

Q:

某些通道的峰迁移慢?

A:

通道中有气泡,用Purge方法去除气泡或更换分离buffer。

Q:

不同通道之间Calibrationmarker的信号有差异?

A:

检查新的凝胶卡夹是否进行校正

Q:

Alignmentmarker信号太弱?

A:

Alignmentmarker降解,更换marker

Q:

运行时不产生信号?

A:

1.样品的体积太少,最少10ul

2.毛细管堵塞,用Purge的方法疏通毛细管,如果不行,更换凝胶卡夹

Q:

电泳条带太宽?

A:

1.DNA样品浓度太高,TEbuffer稀释样品,或减少上样的时间,或选用高浓度分离方法(OH500)

2.通道破裂产生高背景,更好凝胶卡夹

Q:

DNA信号太低?

A:

1.DNA样品浓度太低,增加上样的时间,或选用低浓度分离方法(OL500)

2.样品盐浓度太高,去盐或稀释样品

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