提取细胞RNA的步骤.doc

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提取细胞RNA的步骤

提取细胞RNA的步骤：

1）  六孔板每孔细胞中加入1mlTrizol，冰上放置5min，枪头吹打。

2）  将各孔裂解液吸到1.5mlEP管中，加入氯仿0.2ml/管，用力振摇15s。

15－30℃下孵育2-3min，离心（4℃，12，000g，15min）。

3）  离心后液体分为三层（上层－无色水样层为RNA，中层白色为DNA和底层红色为蛋白质），小心吸取上层无色液体移入一新的EP管中。

4）  加入等体积异丙醇，0.4－0.5ml，混匀，15-30℃下孵育10－30min，离心（4℃，12，000g，10min）。

其中如果加入等体积异丙醇后，置于试管架上用PE手套密封后，放于4℃冰箱中，沉淀30min效果更好。

5）  去上清，沉淀加入75％乙醇1ml，漩涡振荡30s，离心（4℃，7，500g，5min）。

6）  小心去上清，管内沉淀在超净台中鼓风静置干燥3-5min。

最好是用枪头吸取上清，尽量除去。

7）  加入20ulDEPC水溶解，分装5ul/管，-70℃冰箱保存。

8）  细胞总RNA的鉴定：

0.9-1.2％琼脂糖电泳鉴定细胞总RNA，观察出现条带及各条带亮度。

紫外分光光度计测定：

分别测定细胞总RNA在260nm和280nm处的光密度值（OD）,并计算RNA的含量和纯度。

1、实验目的

提取人体细胞的总RNA和mRNA。

2、本实验所需试剂

1）、CNE-2细胞及培养细胞的一系列条件，

2）、PBS缓冲液，TRIZOL试剂，

3）、DEPC处理过的水、大、中、小Tip及1.5mlEP管,

4）、新的氯仿、异丙醇和乙醇，

5）、mRNA分离试剂盒：

OligotexmRNAMiniKit,Cat.no.:

70022,QIAGEN。

6）、新配的电泳缓冲液，专跑RNA的琼脂糖（Agarose）。

3、实验流程

3.1细胞总RNA的提取

1）、6孔板细胞（CNE-2）汇合度为90-100%时，取出无菌室，去其上清，用PBS洗两次后，每孔加TRIZOL试剂（Gibco公司）1ml，摇匀，无菌罩内消化3-5分钟（观察：

液体变粘稠，细胞脱壁）。

2）、将各孔内消化好的细胞裂解液吸到一DEPC处理过的1.5mlEP管中，加新开的氯仿0.2ml，轻摇15秒。

3）、室温静置2-3分钟后，12000rpm，15min，4℃，离心。

然后取上清无色水相（约0.6ml）到EP管（DEPC处理过），加0.5ml新开的异丙醇，室温下静置10分钟。

4）、12000rpm，10分钟，4℃，离心。

观察总RNA在管底的白色沉淀，弃去上清（小心别丢了沉淀），75%乙醇1.0ml洗涤（用DEPC水新配制）后，7500rpm，5min，4℃离心。

5）、去上清，点离，用小Tip吸干液体。

气干沉淀5-10分钟，DEPC处理水20-30ul加入，中枪打匀，55-60℃水浴10分钟溶解总RNA，测OD值。

6）、电泳。

3.2从总RNA中分离mRNA（OligotexmRNAMiniKit,Cat.no.:

70022,QIAGEN）

1）、取上述提取的总RNA若干（少于0.25mg）到一个新的无RNase的EP管中，用无RNase的水定容到250ul。

2）、加入BufferOBB250ul,OligotexSuspension15ul。

用Tip打匀或用手弹匀。

3）、70℃水浴，3分钟（裂解RNA的二级结构）。

4）、20-30℃条件下，静置10分钟（让Oligotex与mRNA结合）。

5）、高速离心2分钟，小心吸走上清（该上清要保留），留下约50ul的上清在原管里。

6）、用BufferOW2400ul重悬含Oligotex/mRNA复合物的沉淀，然后将这些加到套有1.5mlEP管的SPIN柱子上，高速离心1分钟。

7）、将SPIN柱子移到一个新的EP管上，加BufferOW2400ul到柱子，高速离心1分钟，丢掉滤过液。

8）、将SPIN柱子移到一个新的EP管上，加20-100ul热的（70℃）BufferOEB到柱子上，用Tip来回吸打3-4次，高速离心1分钟。

9）、为保证最大的mRNA产量，可再次重复第8步。

10）、电泳。

4、mRNA的应用：

RT-PCR,Northern杂交，cDNA文库构建,mRNA末端快速扩增（RACE），差异表达（DDRT-PCR），引物延伸反应（PrimerExtension），体外转录（InVitroRNATranscription）,RNA标记（RNAlabeling），RNA酶保护试验（RNaseandS1NucleaseProtectionAssay），RNA微注射（RNAMicroinjection）