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(c)仅仅当两配对区段中所有的碱基均互补时才会发生

(d)同样包括有像G-U这样的不规则碱基配对

(e)允许存在几个只有提供过量的自由能才能形成碱基对的碱基

7.DNA分子中的超螺旋:

(a)仅发生于环状DNA中。

如果双螺旋在围绕其自身的轴缠绕后(即增加缠绕数)才闭合,则双螺旋在扭转力的作用下,处于静止

(b)在线性和环状DNA中均有发生。

缠绕数的增加可被碱基配对的改变和氢键的增加所抑制

(c)可在一个闭合的DNA分子中形成一个左手双螺旋。

负超螺旋是DNA修饰的前提,为酶接触DNA提供了条件

(d)是真核生物DNA有丝分裂过程中固缩的原因

(e)是双螺旋中一条链绕另一条链的旋转数和双螺旋轴的回转数的总和

8.DNA在10nm纤丝中压缩多少倍(长度)?

(a)6倍(b)1O倍(c)40倍(d)240倍(e)1000倍(f)100000倍

9.DNA在3nm纤丝中压缩多少倍?

(a)6倍(b)10倍(c)40倍(d)240倍(e)1000倍(f)100000倍

10.DNA在染色体的常染色质区压缩多少倍?

()

(a)6倍(b)10倍(c)40倍(d)240倍(e)1000倍(f)100000倍

l1.DNA在中期染色体中压缩多少倍?

(a)6倍(b)10倍(c)40倍(d)240倍(e)1000倍(f)1000O0倍

12.组蛋白的净电荷是:

(a)正(b)中性(c)负

13.核小体的电性是:

(a)正(b)中性(C)负

14.当新的核小体在体外形成时,会出现以下哪些过程?

(a)核心组蛋白与DNA结合时,一次只结合一个

(b)一个H32-H42核形成,并与DNA结合,随后按顺序加上两个H2A—H2B二聚体

(c)核心八聚体完全形成后,再与DNA结合

15.当一个基因具有活性时:

(a)启动子一般是不带有核小体的

(b)整个基因一般是不带有核小体的

(C)基因被核小体遮盖,但染色质结构已发生改变以致于整个基因对核酸酶降解更加敏感

二、判断题

1.在高盐和低温条件下由DNA单链杂交形成的双螺旋表现出几乎完全的互补性,这一过程可看作是一个复性(退火)反应。

2.在核酸双螺旋(如DNA)中形成发夹环结构的频率比单链分子低。

发夹结构的产生需要回文序列使双链形成对称的发夹,呈十字结构。

3.B型双螺旋是DNA的普遍构型,而Z型则被确定为仅存在于某些低等真核细胞中。

4.病毒的遗传因子可包括l到300个基因。

与生命有机体不同,病毒的遗传因子可能是DNA或RNA(但不可能同时兼有!

),因此DNA不是完全通用的遗传物质。

5.Cot1/2与基因组大小相关。

6.C0C1/2与基因组复杂性相关。

7.非组蛋白染色体蛋白负责30nm纤丝高度有序的压缩。

三、简答题

1.碱基对间在生化和信息方面有什么区别?

2.在何种情况下有可能预测某一给定的核苷酸链中“G”的百分含量?

3.真核基因组的哪些参数影响Cot1/2值?

4.请问哪些条件可促使DNA复性(退火)?

5.为什么DNA双螺旋中维持特定的沟很重要?

6.大肠杆菌染色体的分子量大约是2.5×

109Da1),核苷酸的平均分子量是330Da,两个邻近核苷酸对之间的距离是0.34mn;

双螺旋每一转的高度(即螺距)是3.4nm,请问:

(l)该分子有多长?

(2)该DNA有多少转?

7.曾经有一段时间认为,DNA无论来源如何,都是4个核甘酸的规则重复排列(如,ATCG.ATCG.ATCG.ATCG…),所以DNA缺乏作为遗传物质的特异性。

第一个直接推翻该四核苷酸定理的证据是什么?

8.为什么在DNA中通常只发现A—T和C—G碱基配对?

9.列出最先证实是DNA(或RNA)而不是蛋白质是遗传物质的一些证据。

10.为什么只有DNA适合作为遗传物质?

ll.什么是连锁群?

举一个属于连锁基因座的例子。

12.什么是顺反子?

用“互补”和“等位基因”说明“基因”这个概念。

四、实验设计与分析

1.假定你在25℃条件下用如下浓度的DNaseI:

0,0.1,1.0及10.0mg/ml,对鸡红细胞细胞核的染色质进行酶切20分钟。

将这些样品与分子量标记一起上样于6%变性聚丙烯酚胺凝胶,下图是凝胶电泳的结果。

但由于你混淆了样品,因此弄不清每个泳道对应的样品是什么。

惟一可以确信的是分子量标记上样于左边的泳道,但忘记了各带对应的分子量大小(图1.1)。

(l)请回忆起在各泳道分别使用的是哪一浓度的DNaseI?

(2)请指出分子量标记泳道(用M表示)各带的大约分子量。

(3)描述各泳道所显示的染色质结构特征,证实所记忆的数字是正确的。

图1.1DNaseⅠ消化鸡红细胞细胞核染色质后的电泳图

2.从4种不同的物种分离出的核酸中各种碱基的比率(%)如下:

A

T

U

G

C

A+T(或A+U)

A+U

G+C

C+T(或C+U)

1

17

33

0.5

1.0

2

29

19

22

30

0.97

3

24

16

36

0.66

1.5

4

34

2.1

(1)对于每个物种,回答以下问题:

①核酸是DNA还是RNA?

②它是双链还是单链?

(2)填充物种4中缺少的碱基百分比。

3.假定你从一新发现的病毒中提取了核酸。

请用最简单的方法确定:

(1)它是DNA还是RNA?

(2)它是单链还是双链?

第二章RNA与核酶

一、填空题

l.RNA是由核糖核苷酸通过键连接而成的一种。

几乎所有的RNA都是由DNA而来,因此,序列和其中一条链。

2.多数类型的RNA是由加工产生的,真核生物前体tRNA的包

括的切除和的拼接。

随着和端的序列切除,3’端加上了序列。

在四膜虫中,前体tRNA的切除和的拼接是通过机制进行的。

3.RNaseP是一种,含有作为它的活性部位,这种酶在序列的切割。

4.Cot1/2实验测定的是。

5.假定摆动假说是正确的,那么最少需要种tRNA来翻译61种氨基酸密码子。

6.写出两种合成后不被切割或拼接的RNA:

和。

二、选择题(单选或多选)

1.原核细胞信使RNA含有几个其功能所必需的特征区段,它们是:

(a)启动子,SD序列,起始密码子,终止密码子,茎环结构

(b)启动子,转录起始位点,前导序列,由顺反子间区序列隔开的SD序列和ORF,

尾部序列,茎环结构

(c)转录起始位点,尾部序列,由顺反子间区序列隔开的SD序列和ORF,茎环结构

(d)转录起始位点,前导序列,由顺反子间区序列隔开的SD序列和ORF,尾部序列

2.tRNA参与的反应有:

(a)转录

(b)反转录

(C)翻译

(d)前体mRNA的剪接

(e)复制

3.氨酚tRNA的作用由()决定

(a)其氨基酸

(b)其反密码子

(c)其固定的碱基区

(d)氨基酸与反密码子的距离,越近越好

(e)氨酰tRNA合成酶的活性

4.Ⅰ型内含子能利用多种形式的鸟嘌呤,如:

(a)GMP(b)GDP(c)GTP(d)dGDP(e)ddGMP(2’,3’-双脱氧GMP)

5.Ⅰ型内含子折叠成的复杂二级结构:

(a)有长9bp的核苷酸配对

(b)对突变有很大的耐受性

(c)形成可结合外来G和金属离子的“口袋”

(d)使内含子的所有末端都在一起

(e)在剪接过程中发生构象重组

(f)利用Pl和P9螺旋产生催化中心

6.RNaseP:

(a)其外切核酸酶活性催化产生tRNA成熟的5’末端

(b)含有RNA和蛋白组分

(c)体内切割需要两个组分

(d)体外切割需要两个组分

(e)采用复杂的二级与三级结构形成催化位点

7.锤头型核酶:

(a)是一种具有催化活性的小RNA

(b)需要仅含有17个保守核苷酸的二级结构

(c)不需要Mg2+协助

(d)可用两个独立的RNA创建锤头型核酶

8.Ⅰ型剪接需要()

(a)单价阳离子

(b)二价阳离子

(c)四价阳离子

(d)UlsnRNP

(e)一个腺苷酸分支点

(f)一个鸟膘呤核苷酸作为辅助因子

9.在Ⅰ型剪接的过程中,()

(a)游离的G被共价加到内含子的5’端

(b)GTP被水解

(c)内含子形成套马索结构

(d)在第一步,G的结合位点被外来的G占据,而在第二步时,被3’剪接位点的G所取代

(e)被切除的内含子继续发生反应,包括两个环化反应

三、简答题

1.对于所有具有催化能力的内含子,金属离子很重要。

请举例说明金属离于是如何作用的。

2.列出真核生物mRNA与原核生物mRNA的区别。

3.列出各种况tRNA所有相同的反应及个别tRNA的特有反应。

4.在体内,rRNA和tRNA都具有代谢的稳定性,而mRNA的寿命却很短原因何在?

5.为什么真核生物核糖体RNA基因具有很多拷贝?

6.为什么说信使RNA的命名源自对真核基因表达的研究,比说源自对原核基因表达的研究更为恰当?

7.说明为什么mRNA仅占细胞RNA总量的一小部分(3%一5%)。

8.为何况rRNA和tRNA分子比mRNA稳定?

9.起始tRNA具有哪两种与其他tRNA不同的特性?

10.区别rRNA和mRNA在翻译中的作用。

11.氨基酸分子如何与正确的tRNA分子连接?

12.简要说明证明信使的存在及其本质为RNA的证据。

13.列举4种天然存在的具有催化活性的RNA。

14.Ⅰ型内含子发生改变后,可以产生其他酶的活性吗?

如果可以,是哪些活性?

这意昧着Ⅰ型内含子的催化中心有什么特点?

15.某些自剪接的内含子具有可读框,它们编码何种蛋白?

这与内含子的移动有什么关系?

四、分析题

`1.有一个被认为是mRNA的核苷酸序列,长300个碱基,你怎样才能:

(1)证明此RNA是mRNA而不是tRNA或rRNA。

(2)确定它是真核还是原核mRNA。

2.如果两个RNA分子具有适当的序列以及配对恰当,就可以利用它们构建锤头型核酶。

其中,“底物链”必须含有5’—GUN-3’(N代表任一种核苷酸)序列,而“酶链”则必须具有核酶催化中心的序列,同时与底物链配对。

这样,酶链在N核苷酸的3’端对底物链进行切割。

提供适当的酶链,可以降解细胞中不能被锤头型核酶切割的RNA,这为把酶链作为阻断某些基因表达的治疗试剂提供了可能。

例如,一些研究小组正在设计可以切割HIVRNA的酶链,将如何设计这种核酶的酶链?

如何选择HIVRNA中的靶序列?

该酶链应具有什么特点?

另外,以RNA作为药物,将会碰到什么问题?

第三章DNA复制

一、填空题

1.在DNA合成中负责复制和修复的酶是。

2.染色体中参与复制的活性区呈Y型结构,称为。

3.在DNA复制和修复过程中修补DNA螺旋上缺口的酶称为。

4.在DNA复制过程中,连续合成的子链称,另一条非连续合成的子链称为。

5.如果DNA聚合酶把一个不正确的核苷酸加到3’末端,—个含3’→5’活性的独立催化区会将这个错配碱基切去。

这个催化区称为酶。

6.DNA后随链合成的起始要一段短的,它是由以核糖核苷酸为底物合成的。

7.复制叉上DNA双螺旋的解旋作用由催化的,它利用来源于ATP水解产生的能量沿DNA链单向移动。

8.帮助DNA解旋的与单链DNA结合,使碱基仍可参与模板反应。

9.DNA引发酶分子与DNA解旋酶直接结合形成一个单位,它可在复制叉上沿后随链下移,随着后随链的延伸合成RNA引物。

10.如果DNA聚合酶出现错误,会产生一对错配碱基,这种错误可以被一个通过甲基化作用来区别新链和旧链的特别系统进行校正。

11.对酵母、细菌以及几种生活在真核生物细胞中的病毒来说,都可在DNA独特序列

处观察到复制泡的形成。

12.可被看成一种可形成暂时单链缺口(Ⅰ型)或暂时双链缺口(Ⅱ型)的可逆核酸酶。

二、选择题(单选或多选)

1.DNA的复制:

(a)包括一个双螺旋中两条子链的合成

(b)遵循新的子链与其亲本链相配对的原则

(c)依赖于物种特异的遗传密码

(d)是碱基错配最主要的来源

(e)是一个描述基因表达的过程

2.一个复制子是:

(a)细胞分裂期间复制产物被分离之后的DNA片段

(b)复制的DNA片段和在此过程中所需的酶和蛋白

(c)任何自发复制的DNA序列(它与复制起始点相连)

(d)任何给定的复制机制的产物(如:

单环)

(e)复制起点和复制叉之间的DNA片段

3.真核生物复制子有下列特征,它们:

(a)比原核生物复制子短得多,因为有末端序列的存在

(b)比原核生物复制子长得多,因为有较大的基因组

(c)通常是双向复制且能融合

(d)全部立即启动,以确保染色体在S期完成复制

(e)不是全部立即启动,在任何给定的时间只有大约15%是有活性的

4.下述特征是所有(原核生物、真核生物和病毒)复制起始位点都共有的是:

(a)起始位点是包括多个短重复序列的独特DNA片段

(b)起始位点是形成稳定二级结构的回文序列

(c)多聚体DNA结合蛋白专一性识别这些短的重复序列

(d)起始位点旁侧序列是A-T丰富的,能使DNA螺旋解开

(e)起始位点旁侧序列是G—C丰富的,能稳定起始复合物

5.下列关于DNA复制的说法是正确的有:

(a)按全保留机制进行

(b)接3’→5’方向进行

(c)需要4种dNMP的参与

(d)需要DNA连接酶的作用

(e)涉及RNA引物的形成

(f)需要DNA聚合酶Ⅰ

6.滚环复制:

(a)是细菌DNA的主要复制方式

(b)可以使复制子大量扩增

(c)产生的复制子总是双链环状拷贝

(d)是噬菌体DNA在细菌中最通常的—种复制方式

(e)复制子中编码切口蛋白的基因的表达是自动调节的

7.标出下列所有正确的答案:

(a)转录是以半保留的方式获得两条相同的DNA链的过程

(b)DNA依赖的DNA聚合酶是负责DNA复制的多亚基酶

(c)细菌转录物(mRNA)是多基因的

(d)σ因子指导真核生物的hnRNA到mRNA的转录后修饰

(e)促旋酶(拓扑异构酶Ⅱ)决定靠切开模板链而进行的复制的起始和终止

8.哺乳动物线粒体和植物叶绿体基因组是靠D环复制的。

下面哪一种叙述准确地描述了这个过程?

(a)两条链都是从oriD开始复制的,这是一个独特的二级结构,由DNA聚合酶复合体识别

(b)两条链的复制都是从两个独立的起点同时起始的

(c)两条链的复制都是从两个独立的起点先后起始的

(d)复制的起始是由一条或两条(链)替代环促使的

(e)ter基因座延迟一条链的复制完成直到两个复制过程同步

9.DNA多聚体的形成要求有模板和一个自由3’—OH端的存在。

这个末端的形成是靠:

()

(a)在起点或冈崎片段起始位点(3’—GTC)上的一个RNA引发体的合成

(b)随着链替换切开双链DNA的一条链

(c)自由的脱氧核糖核营酸和模板一起随机按Watson-Crick致原则进行配对

(d)靠在3’末端形成环(自我引发)

(e)一种末端核苷酸结合蛋白结合到模板的3’末端

10.对于一个特定的起点,引发体的组成包括:

(a)在起始位点与DnaG引发酶相西作用的一个寡聚酶

(b)一个防止DNA降解的单链结合蛋白

(c)DnaB解旋酶和附加的DnaC,DnaT,PriA等蛋白

(d)DnaB,单链结合蛋白,DnaC,DnaT,PriA蛋白和DnaG引发酶

(e)DnaB解旋酶,DnaG引发酶和DNA聚合酶Ⅲ

11.在原核生物复制子中以下哪种酶除去RNA引发体并加入脱氧核糖核苷酸?

(a)DNA聚合酶Ⅲ

(b)DNA聚合酶Ⅱ

(c)DNA聚合酶Ⅰ

(d)外切核酸酶MFl

(e)DNA连接酶

三、判断题

1.大肠杆菌中,复制叉以每秒5O0个碱基对的速度向前移动,复制叉前的DNA以大约3000r/min的速度旋转。

2.所谓半保留复制就是以DNA亲本链作为合成新子链DNA的模板,这样产生的新的双链DNA分子由一条旧链和一条新链组成。

3.“模板”或“反义”DNA链可定义为:

模板链是被RNA聚合酶识别并合成一个互补的mRNA,这一mRNA是蛋白质合成的模板。

4.在DNA复制中,假定都从5’→3’同样方向读序时,新合成DNA链中的核苷酸序列同模板链一样。

5.DNA的5’→3’合成意昧着当在裸露3’-OH的基团中添加dNTP时,除去无机焦磷酸DNA链就会伸长。

6.在先导链上DNA沿5’→3’方向合成,在后随链上则沿3’→5’方向合成。

7.如果DNA沿3’→5’合成,那它则需以5’三磷酸或3’脱氧核苷三磷酸为末端的链作为前体。

8.大肠杆菌DNA聚合酶缺失3’→5’校正外切核酸酶活性时会降低DNA合成的速率但不影响它的可靠性。

9.DNA的复制需要DNA聚合酶和RNA聚合酶。

10.复制叉上的单链结合蛋白通过覆盖碱基使DNA的两条单链分开,这样就避免了碱基配对。

11.只要子链和亲本链中的一条或两条被甲基化,大肠杆菌中的错配校正系统就可以把它们区别开来,但如果两条链都没有甲基化则不行。

12.大肠杆菌、酵母和真核生物病毒DNA的新一轮复制是在一个特定的位点起始的,这个位点由几个短的序列构成,可用于结合起始蛋白复合体。

13.拓扑异构酶Ⅰ之所以不需要ATP来断裂和重接DNA链,是因为磷酸二酯键的能量被暂时贮存在酶活性位点的磷酸酪氨酸连接处。

14.酵母中的拓扑异构酶Ⅱ突变体能够进行DNA复制,但是在有丝分裂过程中它们的染色体不能分开。

15.靠依赖于DNA的DNA聚合酶所进行的DNA复制要求有作为一个引发物的游离3’—OH的存在。

游离的3’—OH可以通过以下三种途径获得:

合成一个RNA引物、DNA自我引发的或者一个末端蛋白通过磷酸二酷键共价结合到一个核苦酸。

16.当DNA两条链的复制同时发生时,它是由一个酶复合物:

DNA聚合酶Ⅲ负责的真核生物的复制利用3个独立作用的DNA聚合酶,Polα的一个拷贝(为了起始)和Po1δ的两个拷贝(DNA多聚体化,当MFl将RNA引发体移去之后填入)。

17.从oriλ开始的噬菌体复制的起始是被两个噬菌体蛋白O和P所控制的,在大肠杆菌E.coli中O和P是DnaA和DnaC蛋白的类似物。

基于这种比较,O蛋白代表一个解旋酶而P蛋白调节解旋酶和引发酶结合。

四、简答题

1.描述Meselson-Stahl试验,说明这一实验加深我们对遗传理解的重要性。

2.请列举可以在线性染色体的末端建立线性复制的三种方式。

3.为什么一些细菌完成分裂的时间比细菌基因组的复制所需的时间要少?

为什么在选择营养条件下,E.coli中可以存在多叉的染色体或多达4个以上的开环染色体拷贝,而正常情况下染色体是单拷贝的?

4.在DNA聚合酶Ⅲ催化新链合成以前发生了什么反应?

5.DNA复制起始过程如何受DNA甲基化状态影响?

6.请指出在oriC或фX型起点起始的DNA复制之间存在的重要差异。

7.大肠杆菌被T2噬菌体感染,当它的DNA复制开始后提取噬菌体的DNA,发现一些RNA与DNA紧紧结合在一起,为什么?

8.DNA连接酶对于DNA的复制是很重要的,但RNA的合成一般却不需要连接酶。

解释这个现象的原因。

9.曾经认为DNA的复制是全保留复制,每个双螺旋分子都作为新的子代双螺旋分子的模板。

如果真是这样,在Meselson和Stahl的实验中他们将得到什么结果?

10.描述Matthew和Franklin所做的证明DNA半保留复制的实验。

11.解释在DNA复制过程中,后随链是怎样合成的。

12.描述滚环复制过程及其特征。

五、分析题

1.E.coliOH157生长得特别快。

在正常(较差的环境)条件下,这些菌60-70分钟后分裂表明复制和细胞的分裂是连续的过程,一个仅在另一个完成后才起始。

假如有机会生长在一个多汁的暖和的牛肉饼上,加倍的时间接近20分钟,这比复制过程所需的标准时间快l倍。

请解释原因。

详细描述原核生物中DNA的复制过程(如:

结构和功能特征及一系列过程)。

涉及多基因组拷贝的复制却没有发生碰撞,其复制机制如何?

2.图3.1中的DNA片段两端为双链,中间为单链,上面一条链的极性已标出。

图3.1一个具有单链缺口的双链DNA分子

(1)下面一条链中所示的磷酸所连的是片段的5’端还是3’端?

(2)你能设想在细胞中这个缺口怎样在DNA修复过程中被修复的?

(3)如果缺口在含有脱氧核营三磷酸和DNA聚合酶的无细胞系统中被修复

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