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分子生物学重要概念解释

分子生物学重要概念解释

A

Abundance(mRNA丰度):

指每个细胞中mRNA分子的数目。

AbundantmRNA(高丰度mRNA):

由少量不同种类mRNA组成,每一种在细胞中出现大量拷贝。

Acceptorsplicingsite(受体剪切位点):

内含子右末端和相邻外显子左末端的边界。

Acentricfragment(无着丝粒片段):

(由打断产生的)染色体无着丝粒片段缺少中心粒,从而在细胞分化中被丢失。

Activesite(活性位点):

蛋白质上一个底物结合的有限区域。

Allele(等位基因):

在染色体上占据给定位点基因的不同形式。

Allelicexclusion(等位基因排斥):

形容在特殊淋巴细胞中只有一个等位基因来表达编码的免疫球蛋白质。

Allostericcontrol(别构调控):

指蛋白质一个位点上的反应能够影响另一个位点活性的能力。

Alu-equivalentfamily(Alu相当序列基因):

哺乳动物基因组上一组序列,它们与人类Alu家族相关。

Alufamily(Alu家族):

人类基因组中一系列分散的相关序列,每个约300bp长。

每个成员其两端有Alu切割位点(名字的由来)。

α-Amanitin(鹅膏覃碱):

是来自毒蘑菇Amanitaphalloides二环八肽,能抑制真核RNA聚合酶,特别是聚合酶II转录。

Ambercodon(琥珀密码子):

核苷酸三联体UAG,引起蛋白质合成终止的三个密码子之一。

Ambermutation(琥珀突变):

指代表蛋白质中氨基酸密码子占据的位点上突变成琥珀密码子的任何DNA改变。

Ambersuppressors(琥珀抑制子):

编码tRNA的基因突变使其反密码子被改变,从而能识别UAG密码子和之前的密码子。

Aminoacyl-tRNA(氨酰-tRNA):

是携带氨基酸的转运RNA,共价连接位在氨基酸的NH2基团和tRNA终止碱基的3`或者2`-OH基团上。

Aminoacyl-tRNAsynthetases(氨酰-tRNA合成酶):

催化氨基酸与tRNA3`或者2`-OH基团共价连接的酶。

Amphipathicstructure(两亲结构):

具有两个表面,一个亲水,一个疏水。

脂类是两亲结构,一个蛋白质结构域能够形成两亲螺旋,拥有一个带电的表面和中性表面。

Amplification(扩增):

指产生一个染色体序列额外拷贝,以染色体内或者染色体外DNA形式簇存在。

Anchoragedependence(贴壁依赖):

指正常的真核细胞需要吸附表面才能在培养基上生长。

Aneuploid(非整倍体):

组成与通常的多倍体结构不同,染色体或者染色体片段或成倍丢失。

Annealing(退火):

两条互补单链配对形成双螺旋结构。

Anterograde(顺式转运):

蛋白质质从内质网沿着高尔基体向质膜转运。

Antibody(抗体):

由B淋巴细胞产生的蛋白质(免疫球蛋白质),它能识别特殊的外源“抗原”,从而引起免疫应答。

Anticodingstrand(反编码链):

DNA双链中作为膜板指导与之互补的RNA合成的链。

Antigen(抗原):

进入基体后能引起抗体(免疫球蛋白质)合成的物质。

Antiparallel(反式平行):

DNA双螺旋以相反的方向组织,因此一条链的5`端与另一条链的3`端相连。

Antiterminationprotein(抗终止蛋白质):

能够使RNA聚合酶通过一定的终止位点的蛋白质。

APendonucleases(AP核酸内切酶):

剪切掉DNA5`端脱嘌呤和脱嘧啶位点的酶

Apoptosis(细胞凋亡):

细胞进行程序性死亡的能力;对刺激应答使通过一系列特定反应摧毁细胞的途径发生。

Archeae(古细菌):

进化中与原核和真核不同的一个分支。

Ascue(子囊):

真菌的子囊包含四个或八个(单一的)孢子,表示一次减数分裂的产物。

Attsites(Att位点):

在噬菌体和细菌染色体中将噬菌体插入或切除细菌染色体的位点。

Attenuation(衰减):

控制一些细菌启动子表达中涉及的转录终止调控。

Attenuator(衰减子):

衰减发生处的一种内部终止子序列。

Autogenouscontrol(自体调控):

基因产物减弱(负自体调控)或者激活(正自体调控)其编码基因表达的作用。

Autonomouscontrollingelement(自主控制元件):

玉米中一种具有转座能力的转座元件。

Autoradiography(放射性子显影):

通过放射性标记分子在胶卷上留下图像检测分子的方法。

Autosomes(常染色体):

除性染色体外的所有染色体。

二倍体细胞拥有两套常染色体。

B

BlymphocytesorBcell(B淋巴细胞或B细胞):

合成抗体的细胞。

Backcross(回交):

杂交检测的另一种(早期的)说法。

Backmutation(回复突变):

逆转产生基因失活效果突变的突变,从而使细胞恢复野生型。

Bacteriophage(细菌噬菌体):

侵染细菌的病毒,通常简称为噬菌体。

Balbianiring(B环):

多线染色体条带中一个很大的泡状环。

Normalchromosomes(常染色体):

相对较大,一定区域内在特定化学处理下保持着色。

Basepair(碱基对):

是DNA双链中一对A和T或G和C。

在RNA中特定条件下也能形成其它的配对。

Bidirectinalreplication(双向复制):

当两个复制叉在同一起始点以不同的方向移动时形成。

Bivalent(二价染色体):

在减数分裂初期一种包括四条染色单体的结构(两个染色单体代表同源染色体)。

Blastoderm(囊胚层):

昆虫胚胎发育的一个阶段,其中胚胎周围的一层细胞核或细胞围绕着中央的卵黄。

Blockedreadingframe(闭锁读框):

由于被终止密码子打断而不能被翻译成蛋白质的读码框。

Blunt-endligation(平端连接):

直接在末端连接两个DNA双链分子的反应。

bp:

是碱基对的简称,表示DNA之间的距离。

Branchmigration(分支迁移):

指双链中与其互补链部分配对的DNA链通过延伸与其同源的固定链配对的能力。

Breakageandreunion(断裂与重连):

指一种遗传重组的模式,其中两个DNA双链分子在相应的位置打断并十字交叉重新连接(涉及在连接位点异源双链的形成)。

Buoyantdensity(漂浮密度):

衡量一种物质漂浮在一些标准液体上的能力,如CsCl。

C

Cbanding:

在着丝粒附近产生着色区域的染色体分带技术。

Cgene(C基因):

编码免疫球蛋白质链恒定区域的基因。

Cvalue(C值):

单倍体基因组中DNA的总量。

CAATbox(CAAT盒):

真核生物转录单位起始点上游的保守序列,被一组转录因子识别。

Cap(帽):

是真核生物mRNA5`端的结构,在转录后通过末端5`GTP的磷酸基团和mRNA的末端碱基而引入。

增加的G(有时是其它碱基)是甲基化的,产生了MeG5`pppNp…的结构。

CAP(CRP):

由cAMP激活的正调控蛋白质。

对RNA聚合酶起始E.coli中一些操纵子(分解代谢—敏感)是必须的。

Capsid(衣壳):

是病毒微粒外部的蛋白质衣壳。

Caspases:

一个蛋白质酶家族,其成员在调亡(细胞程序性死亡)中起作用。

Cataboliterepression(分解代谢物阻碍):

由于葡萄糖增加引起一些细菌操纵子表达降低。

cAMP水平降低使CAP调控蛋白质失活所导致。

cDNA:

与RNA互补的单链DNA,通过体内RNA逆转录而合成。

cDNAclone(cDNA克隆):

代表一个RNA的双链DNA进入一个克隆载体。

Cellcycle(细胞周期):

一次细胞分裂到另一次分裂的时期。

Cellhybrid(细胞杂交):

包含来自不同种属亲本细胞染色体的体细胞(如人-鼠融合细胞杂交),通过融合细胞形成融合的异型核而产生。

Centrioles(中心粒):

在减数分裂期聚集在中轴附近、由微管组成的小空圆柱体,位于着丝粒上。

Centromere(着丝粒):

染色体聚集区域,包含减数分裂或有丝分裂纺锤体结合位点。

Centrosomes(中心体):

减数分裂细胞微管组织的区域。

在动物细胞中,每一个中心体包括一对由微管附接的、高密度不定型区域围绕的中心粒构成。

Chaperone(分子伴侣):

使一些蛋白质装备或者恰当折叠所需的蛋白质,但是这种蛋白质并不是目标复合物的成分。

Chemicalcomplexity(化学复杂度):

化学分析测量的DNA成分量。

Chisequemce(Chi序列):

一个提供E.coli中RecA介导遗传重组热点的八聚体序列。

Chistructure(Chi结构):

两个双链DNA之间的接头通过去掉两个连在一起的环而使每个环产生线形末端暴露出来。

它类似于希腊文chi,从而得此名字。

Chiasma(交叉):

两个同源染色体在减数分裂中交换物质的位点。

Chromatids(染色单体):

复制时产生的染色体拷贝。

此名字通常用来形容处于随后的细胞分裂期它们分开的之前的染色体。

Chromatin(染色质):

是细胞中期核内DNA和蛋白质复合体。

个别的染色体不能区分开。

它只能通过与DNA特异性作用的染料而识别。

Chromatinremodeling(染色体重建):

指发生在基因活化转录时核小体能量-依赖型的排列或重排。

Chromocenter(染色中心):

来自不同染色体的异染色质聚集。

Chromomeres(染色粒):

在某一时的期染色体中,特别是减数分裂初期,染色很深的可见小颗粒,此时染色体可能表现为一系列的染色粒。

Chromosome(染色体):

携带很多基因的基因组的分离单位。

每一条染色体包含长的双链DNA分子以及等量的蛋白质。

只在细胞分裂中才为可见的形态单位。

Chromosomewalking(染色体步移):

连续分离携带重叠DNA序列的克隆,使染色体大部分被覆盖。

步移通常用于获得某个感兴趣的位点。

cis-actinglocus(顺式作用位点):

只影响处于同一DNA分子上的DNA序列,此性质通常暗示该位点不编码蛋白质。

cis-actingprotein(顺式作用蛋白质):

不同寻常的、只作用于表达它的DNA序列上的蛋白质质。

cisconfiguration(顺势构型):

指在同一个DNA分子上的两个位点。

cis/transassays(顺/反测验):

分析两个突变相对构型对表达的影响,双杂合体中,同一基因上的两个突变在反式构型中表现出突变表型,顺势构型中表现出野生表型。

Ciston(顺反子):

是由顺/反测验定义的遗传单位,与基因等同,都是代表一个蛋白质质的DNA单位组成。

Classswitching(类别转换):

在淋巴细胞分化过程中免疫球蛋白质重链C区表达的转换。

Clone(克隆):

指大量与祖先细胞和分子相同的细胞和分子。

Cloningvector(克隆载体):

携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。

Closedreadingframe(关闭读框):

包含阻碍它翻译成蛋白质的终止密码子。

Coatedvesicles(包被膜泡):

膜表面有一层蛋白质,如网格蛋白质、COP-1、COP-II的膜泡。

Coconversion(共转变):

在基因转换中两个位点的同时修改。

Codingstrand(编码链):

与mRNA有相同序列的DNA链。

Codominantalleles(共显性等位基因):

两个都对表型有贡献,谁也不占优势。

Codon(密码子):

三连体核苷酸,代表一个氨基酸或者终止信号。

Coevolution(共进化):

见协同进化。

CognatetRNAs(同功tRNA):

能够被一个特殊的氨酰基-tRNA合成酶识别的tRNA。

Coincidentalevolution(重合进化):

见协同进化。

Cointegratestructure(共合结构):

两个复制子融合产生的结构,一个复制子带有一个转座子,另外一个缺少,但是整合体中出现两个在复制子汇合处的转座子,方向是正向复制。

Cold-sensitive(冷敏):

这种突变在低温下是缺陷型的,但是在高温下正常。

Colonhybridization(菌落杂交):

使用原位杂交来确定携带一个特定同源序列的插入DNA

片段载体的技术。

Compatibilitygroup(相容组):

含有不能同时存在一个细菌细胞内的质粒。

Complementation(互补):

不同的(非等位)基因提供扩散型产物,从而使含有两个反式突变的杂合体产生野生表型的能力。

Complementationassay(互补测验):

见体内互补测验。

Complementationgroup(互补群):

互相反式重组时不互补的一系列突变,它定义了一个遗传单位(顺反子)。

Complexlocus(复合基因座):

果蝇中拥有与代表单个蛋白质的基因功能不一致的遗传性质。

在分子水平上复合基因座通常很大(>100kb)。

Complexity(复杂度):

在给定样本中不同DNA序列的总长度。

Compositetransposons(复合转座子):

两个插入序列包围着一段中央区域,这两个序列中的一个或者两个可能使整个元件转座。

Concatemer(多联体DNA):

包含一系列一前一后重复的基因组单位。

(Con)catenatedcircle(多联环):

DNA环如同链上的环一样连接起来。

Concertedevolution(协同进化):

两个相关基因如同组成一个等位基因那样共同进化。

Condensationreaction(缩合反应):

由于失去水分子使共价键形成,例如往多肽链中加入氨基酸的反应。

Conditionallethalmutations(条件致死突变):

在特定的(非许可的)条件下杀死一个细胞或病毒的突变,但是在其它(许可的)条件下使其存活。

Conjugation(接合):

指两个细菌之间的杂交,部分染色体从一个细胞转入另一个细胞。

Consensussequemce(共有序列):

当许多实际序列比较时,每个位点上的碱基能够代表最常出现的碱基理想序列。

Conservativerecombination(保守重组):

在没有任何新DNA链形成情况下,已经存在DNA链的打断和重新连接。

Conservativetransposition(保守转座):

即大的序列移动,原认为是转座子,现在认为是附加体。

这种机制类似于噬菌体λ位点。

Constantregions(恒定区):

免疫球蛋白质的保守区由C基因编码,是变化很少的链的一部分。

重链的恒定区决定免疫球蛋白质的类型。

Constitutivegenes(结构基因):

由于RNA聚合酶与启动子作用而表达的基因,不需要额外的调控。

有时候也被称为看家基因,因为它在所有细胞中都有低水平表达。

Constitutiveheterochromatin(组成型异染色质):

指永久不表达序列的钝化状态,通常是卫星DNA。

Constitutivemutations(组成型突变):

引起需要调控的基因在不被调控的状态下持续表达。

Contractilering(收缩环):

在有丝分裂后期中轴附近形成的激动蛋白质纤维环,负责将子代细胞分开。

Controllingelements(控制元件):

玉米中的控制元件是最初由其遗传性质确认的转座单位。

分自主(能够独立转座)或者非自主(只有在一个自主元件存在下转座)两类。

Coordinateregulation(协同调控):

即对一组基因的调控。

Cordycepin(蛹虫草菌素):

是3`脱氧腺苷,是RNA聚腺苷化的阻扼子。

CoreDNA(核心DNA):

核心颗粒中包含的146bpDNA。

Coreparticle(核心颗粒):

核小体的消化产物,包含组蛋白质八聚体和146bpDNA,其结构与核小体本身相似。

Corepressor(共阻碍物):

是一个小分子,通过结合到调控蛋白质上抑制转录。

Cosmid(粘粒):

包含l噬菌体cos位点的质粒,因此,质粒DNA能够在体内被噬菌体衣壳包裹。

Cot(浓度时间常数):

在复性反应中DNA浓度和反应时间的乘积。

Cot1/2(半变Cot值):

反应完成一半时所需的Cot值,它直接与复性DNA成正比。

Cotransfection(共转染):

两个标记的共同转染。

Crossing-over(交换):

发生在减数分裂中染色体间互相交换物质,引起遗传重组。

Crossoverfixtion(交换固定):

不均等交换的一种可能结果,能使前后连接簇中一个成员的突变延伸到每一簇。

Cruciform(十字架):

在同一链中插入其互补链(而不是与双链中另一条链中的互补片段)配对的DNA重复序列所形成的结构。

Crypticsatellite(隐蔽卫星):

不能通过密度梯度上的峰值分离的卫星,即隐藏在主带中。

ctDNA:

即叶绿体DNA。

cAMP:

磷酸基团连接核糖3¢和5¢位置的AMP分子,其结合可激活CAP,原核生物转录中的正调控因子。

Cyclins(细胞周期蛋白质):

在细胞周期中连续积累的蛋白质,随后在减数分裂中被蛋白质水解作用消除。

Cytokinesis(胞质分裂):

在减数分裂中涉及子代细胞分裂和离开的最终过程。

Cytologicalhybridization(细胞学杂交):

见原位杂交。

Cytoplasm(细胞质):

指质膜和核之间的物质。

Cytoplasmicinheritance(胞质遗传):

定位在线粒体或者叶绿体(也可能是其它细胞器)的基因性质。

Cytoplasmicproteinsynthesis(胞质蛋白质合成):

代表核基因mRNA的翻译,通过附加在细胞骨架上的核糖体进行。

Cytoskeleton(细胞骨架):

真核细胞质中纤维组成的网络。

Cytosol(胞质溶胶):

容纳细胞器(如线粒体)的胞质容积。

D

Dloop(D环):

线粒体DNA上的一个区域,其上一小段RNA与DNA的一条链配对,使DNA原始配对链在此区域闲置。

也用来描述在RecA蛋白质催化的反应中单链“入侵者”的进入,使双链DNA中的一条被闲置。

Degeneracy(简并性):

指密码子的第三个碱基上的变化不会改变它所代表的氨基酸。

Deletion(缺失):

一段DNA序列被删除,两边的区域连接起来产生的。

DenaturationofDNAorRNA(DNA或RNA变性):

指它们从双链转变成单链状态,双链分开一般因加热产生。

Denaturationofprotein(蛋白质变性):

指蛋白质的物理结构向另一结构(不活泼的)转变。

Depressedstate(抑制状态):

指关闭的基因。

当描述一个基因的一般状态时,它与“诱导”同义。

在描述突变的效果时,它与“组成型”同义。

Dicentricchromosome(双着丝粒染色体):

两个染色体片段融合的产物,每一片段都有一个着丝粒。

通常稳定,在减数分裂中当两个中心粒向两极运动时被拉断。

Diploid(二倍体):

二倍体染色体包括两个拷贝的常染色体和两个性染色体。

Directrepeat(同向重复):

在同一个DNA分子中,相同的(或者相近的)序列以相同的方向出现两次或多次,但并不一定相邻。

Discontinuousreplication(不连续复制):

指DNA以小片段(岗崎片段)合成然后连接起来。

Disjuction(间断分布):

指在细胞分裂中染色体成分向两极运动。

在减数分裂和有丝分裂II期,分裂的是姊妹染色单体,在有丝I期分裂的是姊妹染色单体对。

Divergence(差异百分率):

两个相关DNA的核苷酸序列或者两个蛋白质氨基酸序列间差异百分率。

Divergenttranscription(异向转录):

相反方向两个启动子之间的转录起始,因此转录从中央区域开始向两边进行。

dnamutant(dna突变):

这种突变的细菌是温度敏感型的,它们不能在42℃下合成DNA,但是能在37℃合成。

DNAase(DNA酶):

攻击DNA之间化学键的酶。

DNAaseIhypersensitive(DNA酶I超敏位点):

由于对DNA酶I和其它核酸酶切割高度敏

感而被发现的染色单体上一小段区域。

可能由不包括核小体的区域构成。

DNA-drivenhybridization(DNA驱动杂交):

涉及到额外DNA与RNA反应的杂交。

DNApoymerase(DNA聚合酶):

合成子代DNA链(在DNA模板的指导下)的酶。

可能在修复或复制中涉及。

DNAreplicase(DNA复制酶):

在复制中特异性需要的一种DNA合成酶。

Domainofachromasome(染色体结构域):

指一个连续的结构整体,其中超螺旋结构独立于其它结构域。

也可指包含表达基因的一个广泛区域,这个基因对DNAaseI有高度敏感性。

Domainofaprotein(蛋白质结构域):

氨基酸序列的一个整体连续的部分,具有某种具体的功能。

Dominantallele(显性等位基因):

决定杂合中表型的等位基因。

Donorsplicingsite(供体剪接位点):

见左剪切点。

Dosagecompensation(剂量补偿效应):

补偿一个性别中出现两条X染色体和另一个性别中出现一条X染色体偏差的机制。

Downpromotermutation(启动子下降突变):

减少转录起始频率的突变。

Dowmstream(下游):

沿着表达方向的序列。

例如,编码区是在起始区的下游。

E

Earlydevelopment(早期发育):

指噬菌体侵染中在DNA复制起始前的一段时期。

Ectopicexpression(异位表达):

基因在它通常不表达的组织中的表达,例如,在转基因动物中或感染进入胚胎中不常见的位置。

Elongationfactors(延伸因子):

原核中为EF,真核中为eEF),在每一个氨基酸加入多肽链的过程中周期性作用于核糖体的蛋白质。

Endlabeling(末端标记):

指在链5¢或者3¢端加上放射性标记的DNA分子。

End-productinhibition(终产物抑制):

代谢过程中的一个产物能够抑制途径中前些阶段所需酶活性的能力。

Endocyticvesicle(内吞膜泡):

通过内吞运输蛋白质的包被膜泡,也称为网格膜泡。

Endocytosis(内吞作用):

细胞表面的蛋白质内聚,在包被膜泡中转移到细胞内部的过程。

Endonucleases(内切核酸酶):

切割核酸链内的化学键。

可能特异性的切割RNA或者单链或双链DNA。

Endoplasmicreticulum

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