最新western blot步骤实验蛋白提取及定量相关试剂配制电泳转膜及显色过程全 1复习课程Word下载.docx
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4.每20微升细胞沉淀加入200微升添加了PMSF的细胞浆蛋白抽提试剂A。
(对于二百万Hela细胞,其细胞沉淀的体积大约为20微升或40毫克。
)
5.最高速剧烈涡旋震荡5秒,把细胞沉淀完全悬浮并分散开。
(如果细胞沉淀没有完全悬浮并分散开,可以适当延长震荡时间。
)(时间可稍长,保证细胞破碎)
6.冰浴10-15分钟。
7.加入细胞浆蛋白抽提试剂B
10微升。
最高速剧烈Vortex5秒,冰浴1分钟。
8.最高速剧烈Vortex5秒,4℃12,000-16,000g离心5分钟。
9.立即吸取上清至一预冷的塑料管中,即为抽提得到的细胞浆蛋白。
可以立即使用,也可以冻存。
(千万不要触及沉淀,可以在沉淀上方保留极小体积的上清,以免触及沉淀。
10.对于沉淀,完全吸尽残余的上清,加入50微升添加了PMSF的细胞核蛋白抽提试剂。
(不吸尽上清会带来细胞浆蛋白的污染。
11.最高速剧烈Vortex15-30秒,把细胞沉淀完全悬浮并分散开。
然后放回冰浴中,每隔1-2分钟再高速剧烈Vortex15-30秒,共30分钟。
12.4℃12,000-16,000g离心10分钟。
13.立即吸取上清至一预冷的塑料管中,即为抽提得到的细胞核蛋白。
可以立即使用,也可以-70℃冻存。
14.对于新鲜组织:
A.把组织尽可能切成非常细小的碎片。
按照20:
1的比例混合适当量的细胞浆蛋白抽提试剂A和B(例如200微升细胞浆蛋白抽提试剂A中加入10微升抽提试剂B)。
并加入PMSF至最终浓度为1mM配制成组织匀浆液。
按照每60mg组织加入200微升组织匀浆液的比例混合组织和组织匀浆液,并在玻璃匀浆器内充分匀浆。
匀浆需在冰浴或4℃进行。
B.匀浆后把匀浆液转移到塑料离心管内,冰浴放置15分钟。
C.4℃1,500g离心5分钟。
把上清转移至一预冷的塑料管中,为抽提得到的部分细胞浆蛋白。
(吸上清时千万不要触及沉淀。
D.对于沉淀,到了这一步已经充分匀浆,但很多细胞还没有破碎。
接下去按照使用说明的步骤4开始操作,即把沉淀当做已经离心收集好的细胞沉淀操作,按照步骤4至步骤13抽提得到细胞浆蛋白和细胞核蛋白。
抽提得到的细胞浆蛋白可以和步骤14C中抽提得到的细胞浆蛋白合并。
第二部分
蛋白定量-BCA法(南京建成试剂盒)
一、实验仪器:
试管、微量移液器、旋涡混匀器、37℃水浴箱(气浴箱)、可见分光光度计(562nm)
二、适用范围:
本试剂盒可测各种动物血清(浆)、组织、培养细胞、细胞培养上清及植物等样本中的蛋白含量。
三、试剂组成及配制
试剂一:
粉剂2支、稀释液12.5ml2瓶
试剂一应用液的配制:
取试剂一粉剂1支与试剂一稀释液1瓶混匀,溶解完全后4度待用。
试剂二:
250μl2支
工作液的配制:
按试剂一应用液:
试剂二=50:
1的比例配制,混匀后待用,用多少配多少。
试剂三:
终止剂储备液20ml1瓶
终止剂应用液:
取终止剂储备液用双蒸水5倍稀释后备用,4度冷藏
试剂四:
563ug/ml蛋白标准液0.2ml1支,4度保存1个月(可分装-20冷冻)
四、操作步骤:
1、样本前处理:
①、动物组织样本:
准确称取组织重量,按重量(g):
体积(ml)=1:
9的比例,加入9倍体积的生理盐水,冰水浴条件下机械匀浆,2500转/分,离心10分钟,取上清液,待测。
②、植物组织样本:
9的比例,加入9倍体积的匀浆介质,冰水浴条件下机械匀浆,3500转/分,离心10分钟,取上清液,待测。
③、血清(浆)样本:
按血清(浆)︰生理盐水=1︰49的比例稀释,待测。
④、其它液体样本:
按比例稀释,测定范围为20~2000μg/ml,(不同的样本稀释度不一样),请在批量测试前先做1~2个样本的预实验。
2、操作表:
空白管
标准管
测定管
双蒸水(μl)
20
563μg/ml标准品(μl)
待测样本(μl)
工作液(μl)
250
漩涡混匀,37℃孵育30分钟
终止剂应用液(μl)
750
漩涡混匀,静置5分钟,562nm波长,水调零,0.5cm光径测各管OD值
五、计算公式:
六、测定原理:
碱性条件下,蛋白将Cu2+还原为Cu+,Cu+与BCA试剂形成紫色的络合物,562nm处有最大吸收峰,依据吸光度与浓度成比例,通过测吸光度即可计算待测蛋白的浓度。
七、检测范围
检测浓度下限达到20μg/ml,最小检测蛋白量达到0.5μg,在20~2000μg/ml浓度范围内有良好的线性关系。
标准曲线范围:
标准品浓度(μg/ml)
绝对OD值
0~2500
0~0.499
第三部分
Westernblot相关试剂配制
A.30%聚丙烯酰胺储备液(Acr/Bis):
丙烯酰胺(Acr),29g;
N,N-亚甲基双丙烯酰胺(Bis),1g,去离子水溶解,37℃水浴助溶,定容至100mL。
0.45μm滤器过滤,棕色瓶4℃避光保存。
B.10%十二烷基硫酸钠(SDS):
SDS,10g;
H2O,80mL。
68℃加热溶解,浓HCl调pH至7.2,定容至100mL,室温保存。
C.10%过硫酸铵(AP):
AP,1g;
H2O,10mL。
避光,4℃保存。
(4℃2周)
D.分离胶缓冲液(1.5MTris-HClpH8.8):
Tris,18.17g;
H2O80mL。
用浓HCl调pH至8.8,定容至100mL,4℃保存。
E.浓缩胶缓冲液(1.0MTris-HClpH6.8):
Tris,12.11g;
用浓HCl调pH至6.8,定容至100mL,4℃保存。
F.电泳缓冲液(10×
):
甘氨酸(Glycine),188g;
Tris30.2g;
H2O,800mL。
调节pH至8.3,定容至1L,4℃保存(用时稀释为1×
)。
G.5×
SDS-PAGEloadingBuffer(5mL):
1MTris-HCl(pH6.8),1.25mL;
SDS,0.5g;
溴酚蓝(BPB),25mg;
甘油,2.5mL;
加去离子水定容至5mL。
充分混匀,分装成500μL/份,室温保存。
使用前每份加入25μLβ-巯基乙醇(2-ME),
加入2-ME的loadingbuffer可在室温下保存一个月左右。
H.考马斯亮蓝染色固定液:
40%双蒸水,10%醋酸,50%甲醇,室温保存
I.考马斯亮蓝染色液:
考马斯亮蓝R-250,250mg;
甲醇,45ml;
冰醋酸,10ml;
H2O,定容至100ml。
室温保存。
J.考马斯亮蓝染色脱色液:
醋酸,100ml;
乙醇,50ml;
dH2O850ml,充分混合,室温保存
K.膜转移缓冲液:
甘氨酸,2.9g;
Tris,5.8g;
SDS,0.37g;
加H2O600mL充分溶解,加200mL甲醇,混匀,定容至1L,室温保存。
L.TBS缓冲液:
NaCl,8.8g;
1MTis-HCL(pH8.0),20ml,加入约800H2O搅拌溶解,定容至1L,4℃保存。
M.TBST缓冲液:
1MTis-HCL(pH8.0),20ml,加入约800H2O搅拌溶解,加入0.5mlTween20后充分混匀,去离子水定容至1L,4℃保存。
N.1MTis-HCL(pH8.0):
Tris121.1g置于1L烧杯,加入约800ml去离子水,充分搅拌,加入浓HCL约42ml,定容至1L,高压灭菌,室温保存。
第四部分
Westernblot电泳、转膜及显色过程
1、清洗
将玻璃板洗净,用ddH2O冲洗,然后晾干。
封板时保证支架与底座胶条契合,固定时两边同时均匀用力旋动齿轮把手,固定即可,不要用力过大以免压碎玻璃。
封好后可装ddH2O试试,确定不漏后再灌胶。
2、制胶
①SDS-PAGE分离胶配方表(12%Gel)
各种组分名称
各种凝胶体积对应的各种组分的取样量(ml)
10ml
15ml
20ml
H2O
3.3
4.9
6.6
30%Acrylamide
4.0
6.0
8.0
1.5MTris-Hcl(pH8.8)
2.5
3.8
5.0
10%SDS
0.1
0.15
0.2
10%过硫酸铵(AP)
TEMED
0.004
0.006
0.008
②SDS-PAGE浓缩胶(5%Acrylamide)配方表
4ml
5ml
6ml
2.7
3.4
4.1
0.67
0.83
1.0
1.0MTris-Hcl(pH6.8)
0.5
0.63
0.75
0.04
0.05
0.06
0.005
3、封胶
①按前面方法配分离胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。
灌入2/3的分离胶后应立即封胶,胶上加一层水,液封后的胶凝的更快。
(灌胶时开始可快一些,胶面快到所需高度时要放慢速度。
操作时胶一定要沿玻璃板流下,这样胶中才不会有气泡。
加水液封时要很慢,否则胶会被冲变型。
②当水和胶之间有一条折射线时,说明胶已凝了(至少等30-40min)。
再等3min使胶充分凝固就可倒去胶上层水并用吸水纸将水吸干。
③按前面方法配5%的浓缩胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。
将剩余空间灌满浓缩胶然后将梳子插入浓缩胶中。
灌胶时也要使胶沿玻璃板流下以免胶中有气泡产生。
插梳子时要使梳子保持水平。
由于胶凝固时体积会收缩减小,从而使加样孔的上样体积减小,所以在浓缩胶凝固的过程中要经常在两边补胶。
4、拔梳子
灌好浓缩胶,约40-60min凝胶后均匀用力拔除梳子,若上样孔有变形,可用适当粗细的针头拨正。
5、上样
①测完蛋白浓度后,计算含20-40μg蛋白的溶液体积即为上样量。
取出上样样品至0.5ml离心管中,加入5×
SDS上样缓冲液至终浓度为1×
。
将加入loadingbuffer的蛋白样品放沸水中煮5-10分钟,高速离心30s即可上样。
上样总体积一般不超过15μl,加样孔的最大限度可加30μl体积。
②加足够的电泳液后开始准备上样,电泳液至少要漫过内测的小玻璃板,外侧漠过底部。
所有蛋白样品调至等浓度后上样,样品两侧的泳道用等体积的1×
loadingbuffer上样。
非预染蛋白Maker准备:
1MDTT2μl与5×
loadingbuffer20μl混合成稀释液22μl,然后再加入proteinMWmaker(LOW)5μl、灭菌蒸馏水73μl,混合成蛋白Maker,混合均匀后,煮沸处理5min,分装-20℃保存,取5μl进行10%-15%凝胶电泳。
6、电泳
先稳流30mA电泳至上下胶分界时改稳流45mA。
当loadingbuffer泳动到胶下缘时结束。
电泳时间较长时,应用冰块放电泳槽两边防止溶胶。
7、转膜
①剥胶:
轻启玻璃板,将胶卸下,切除浓缩胶及无用胶,右上切角标记,在冷的电转液中平衡20-60min。
②材料准备:
转一张膜需要2张滤纸(伯乐专用滤纸)和1张0.45umPVDF膜,切滤纸和膜时一定要戴手套,因为手上的蛋白会污染膜。
将切好的硝酸纤维素膜置于水上浸2h才可使用。
用镊子捏住膜的一边轻轻置于有超纯水的平皿里,要使膜浮于水上,只有下层才与水接触。
这样由于毛细管作用可使整个膜浸湿。
若膜沉入水里,膜与水之间形成一层空气膜,这样会阻止膜吸水。
③处理:
将与胶同样大小的滤纸放在转移液中浸泡片刻,PVDF膜需浸泡甲醇1-2min,再孵育于冰的电转液中5min。
④电转仪转膜:
A、打开保护罩,按照如下准备凝胶三明治:
B、从底部铂金正极开始放置:
●预湿-滤纸
●预湿-膜
●已平衡的胶
注意:
每层之间赶走气泡
C、连接顶部不锈钢阴极,盖上保护罩
D、不同蛋白需要不同优化的条件:
参考范围:
小胶10V30min或者15V15min
大胶25V30min或者15V60min
当前不要超过25V,且大胶不要超过3mA/cm2、小胶不要超过5.5mA/cm2
E、关闭电源,拔掉电极,移除胶
注:
为了防止溶胶,可将转移缓冲液提前放4℃冰箱预冷过夜
⑤膜上蛋白检测:
丽春红
2%的丽春红储备液(10×
0.4g丽春红、6g三氯乙酸、6g磺基水杨酸溶于20ml。
丽春红染色工作液:
2%的丽春红储备液1:
10稀释,即加9倍的ddH2O
染色方法:
将膜放入TBST洗一次,再置于丽春红染色工作液中,在室温下摇动染色5分钟,大量的水洗膜直至水变清无色,marker条带处用铅笔做好标记。
PVDF膜需用甲醇再活化后用TBST洗后进行封闭。
8、膜的封闭
膜用TBST洗完后,移至含有封闭液的平皿中,室温下脱色摇床上摇动封闭1h。
再用TBST洗5秒,进入下一步抗体的孵育。
配制5%脱脂奶粉或BSA溶液:
每100mlTBST中加入5g脱脂奶粉或BSA,混匀后过滤,如不过滤会导致膜污染上细微黑颗粒。
9、一抗的孵育
一抗的准备:
将一抗按适当的比例用抗体稀释液稀释。
孵育buffer:
按抗体说明书建议的稀释倍数,用TBST稀释一抗。
一般参考推荐的稀释倍数1:
100-1:
3000,一抗浓度过高会导致产生非特异性条带。
将PVDF膜浸没于含有一抗的抗体稀释液中室温(25℃左右)轻摇3小时或放4℃冰箱过夜。
若放入4℃冰箱过夜则第二天还应放室温缓慢摇荡1小时。
10、洗涤:
一抗孵育结束后,用TBST漂洗膜后再浸洗三次(漂洗后应换容器浸洗),每次10min,以去除残留的一抗。
洗涤结束后进行二抗的孵育。
11、二抗的孵育
孵育buffer和稀释倍数:
用TBST按说明书推荐的倍数稀释二抗。
常规稀释倍数1:
1000-1:
20,000,二抗的浓度过高也会导致非特异性条带。
根据一抗来源选择合适的二抗(HRP标记),按相应比例用抗体稀释液稀释,室温轻摇1-2小时。
12、洗涤:
二抗孵育结束后,用TBST漂洗膜后再浸洗三次(漂洗后应换容器),每次10min,最后用TBS清洗一次。
抗体稀释液稀释的一抗或二抗可回收重复利用数次,抗体稀释液稀释后的抗体可4℃保存约半个月时间。
13、显色-DAB辣根过氧化物酶显色试剂盒(生工)
①溶液A在使用之前,37℃温育10分钟,以免产生沉淀。
②在免疫印迹实验中,先将相应的HRP(辣根过氧化物酶)标记的二抗覆盖膜后,在37℃的情况下,于震荡器上,震荡一个半小时左右,再用TBST洗涤膜3~4次,最后一次用TBS洗涤膜,再将膜转移到阴暗处。
③显色前在干净棕色瓶子中配制显色工作液,充分混匀。
反应液
溶液A
200μl
溶液B
100μl
溶液C
20μl
④在阴暗处,将显色液加入膜上,将膜覆盖,在37℃的情况下,震荡反应5min左右即可,这时棕褐的条带出现
⑤倒掉反应液,双蒸水冲洗条带3~4次,自然干燥
⑥照相记录实验结果
小数加减法的混合运算
一、填空。
1、0.8里面有()个0.1;
0.025里面有()个0.001。
2、在()里填上合适的数。
6.5千克=()克46厘米=()米456克=()千克
6米90厘米=()米2千克600克=()千克7元4角8分=()元
3、6.8元与6.80元的大小(),计数单位()。
二、判断题。
(对的在括号里画“√”,错的画“×
”)。
1、0.23里有23个0.01。
()
2、小数都比整数小。
3、在8.7的末尾填上2个0,这个数的大小不变。
三、选择题。
1、下面的小数中,最接近1的是()。
A、1.03B、0.95C、0.98
2、千分之一是()。
A、整数部分的数位B、小数部分的数位C、计数单位
四、计算。
5.6-4.34+7.34685.7-(15.3-4.8)9.5+4.85-6.13
25.4-(15.3+7.7)3.6-1.28+3.093.8-0.46-1.723
25.6-(0.23+5.6)-1.77
13.75-(4.75+6.48)
7.83+2.34-0.83+6.66
3.82+2.9+0.18+9.1
25.48-((9.4-0.52)
35.6-1.8-15.6-7.2
5.93+0.19+2.81
7.3+2.7-7.3+2.7
48.4+2.78+51.6-0.78
23.4+0.8-13.4-7.2
4.8+8.63+5.2+0.37
3.07-0.38-1.62
1.27+3.9+0.73+15.1
5.84-1.8-3.2
132.44-(58.74+19.44)
7.5+4.8-6.5