超级感受态细胞的制备方法文档格式.docx
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将冰冻的细菌融化,铂丝在冻存细菌原种的表面划过时,已带上足量的细菌,因此一管冻存细菌原种可使用多次。
2)将4-5个分隔良好的菌落转移到1ml含20mmol/LMgSo4的SOB中,菌落直径为1-2mm。
中速振荡使细菌分散,然后在1L锥瓶中用30-100ml含20mmol/LMgSO4的SOB稀释培养物。
3)于37℃将细菌培养0.5-3.0小时,为达到高效转化,活细胞数务必少于108细胞/ml,可每隔20-30分钟测定OD600值来检测培养物的生长情况。
在菌株与菌株之间,OD600值和每毫升中活细胞数间的关系变化很大,因此有必要通过测量特定大肠杆菌菌株的生长培养物在生长周期的不同时相的OD600值,并将各稀释度的培养物铺于无抗生素的LB琼脂平皿以计算每时相的活细胞数,从而使分光光度读数得到标化。
4)在无菌条件下将细菌转移到一个无菌、一次性使用的、用冰预冷的50ml聚丙烯管(Falcon2070)中,在冰上放置10分钟,使培养物冷却至0℃。
切记:
下述所有步骤均需无菌操作。
5)于4℃用SorvallGS3转头(或与其相当的转头)以4000转/分离心10分钟,回收细胞。
6)倒出培养液,将管倒置1分钟以使最后残留的痕量培养液流尽。
7)用约20ml(每个50ml管)用冰预冷的转化缓冲液(对于TFB,见表1.3;
对于FSB,可参见表1,4)轻轻振荡,重悬沉淀(若制备需立即使用的感受态细胞可用TFB:
若制备需要贮存于-70℃的感受态细胞则用FSB),将重悬细胞冰浴10分钟。
8)于4℃用SorvallGS3转头或与其相当的转头)以4000转.分离心10分钟,回收细胞。
9)倒出培养液,将管倒置1分钟以使最后残留的痕量培养液流尽。
10)用4ml(每个50ml管)用冰预冷的TFB或FSB轻轻振荡重悬沉淀。
按步骤11)a给出的操作程序制备立即使用的感受态细胞,而步骤11)b制德贮存于-70℃留待以后使用的感受态细胞。
11)a.新鲜感受态细胞的制备a)将140μlDnD溶液加到每一悬液的中心,立即轻轻旋转以混匀悬液,然后在冰上放置15分钟。
DnD溶液二硫苏糖醇(DTT)1.53gDMSO9.0ML1mol/L乙酸钾(pH78.5)100μl水至10MLDnD溶液作可耐受人机溶剂的MillexSR膜(Millipore)过滤除菌,将DnD溶液分装成160μl小份放入0.5ml的无菌微量离心管中,密封管口,贮存于-20℃。
DMSO的氧化产物,据推测可能是二甲硫醚,是转化的掏物。
为避免这个问题,应购买质量最好的DMSO。
应将所购试剂分装成10ml小份,放入无菌试管,密封管口,贮存于-70℃。
每小份只用1次,用后弃去。
1mol/L乙酸钾(pH7.5)的配法。
b)每管再加140μlDnD溶液,轻轻旋转混匀之,将悬液置于冰上,再放15分钟。
c)将小份悬液分装到冷却的无菌聚丙烯管(Falcon2059,17x100mm)中,将管置于冰上。
就大多数克隆方面的用途来说,50μl感受细胞悬液已绰绰有余。
然而,如需要更大量的转化菌落(如构建cDNA文库),每小份感受态细胞的量可能需要加大些.加入DNA后[步骤12)],于42℃短暂加热感受态细胞[步骤13)],这是一个关键步骤,务必以正确的升温速度使细胞加温到正确的温度。
下面给出的所有时间和温度是用Falcon2059型管获得的数据,其他类型的管未必可产生相同的结果。
b.冻存的感受态细胞的制备a)每4ml重悬细胞加140μlDMSO,轻轻旋转混匀之,将悬液置冰上15分钟。
b)每份悬液再加140μlDMSO,轻轻旋转混匀之,重新放入冰浴中。
c)迅速将悬液分装到冷却的无菌的微时离心管中,封紧管口,没入液氮中快速冰冻感受态细胞。
贮存于-70℃备用。
就大多数克隆方面的用途来说,50μl感受态细胞悬液已绰绰有余。
然而,如需要更大量的转化菌落(如构建cDNA文库),每小份感受态细胞的量可能需要加大些。
d)需要时,从-70℃冰箱中取出一管感受态细胞,把管握于手民主,融化细胞。
细胞一经融化,立即把管转移至冰浴中,在冰上放置10分钟。
e)用一冷却的无菌吸头把感受态细胞转移到冷却的无菌聚丙烯管中(Falcon2059,17x100mm)中,放置在冰浴上。
加入DNA后[步骤12)],于42℃短暂加热感受态细胞[步骤3)],这是一个关链步骤,务必以正确的升温速度使细胞如温到正确的温度。
下面给出的所有时间和温度是用Falcon2059试管获者的数据,其他类型的管未必可产生相同的结果。
12)将DNA加入到感受态细胞中,轻轻旋转几认混匀内容物。
在冰上放置30分钟。
为得到最佳结果,DNA溶液的体积不应超过感受态细胞体积的5%。
转化体的数量相对于所加入的DNA量近妣例地增加,直至系统达到饱和,尽管感受态细胞在不同批次之间有一些差异,50μl感受态细胞通常可被约lng超粒DNA所饱和。
虽然再加DNA也不影响转化体的总产量,但使用过多的DNA将降低系统的效率(以每微克DNA所获转化体的数量来衡量)。
当所转化的DNA很难得时(如用从相对难得的样品中提取mRNA而合成的cDNA),这就显得格外重要。
为最大限度地提高转化菌落的数目,可把现有DNA分置于几小份感受态细胞中,以期系统不致饱和。
试验中一定包括下面的对照:
a.加入已知量的标准超螺旋质粒DNA制品的感受态细胞。
b.完全不加质粒DNA的感受态细菌。
13)将管放入预加温到42℃的循环水浴中放好的试管加架上,恰恰放置90秒,不要摇动试管。
14)快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却1-2分钟。
15)每管加800μlSOC培养基(见附录A)。
用水浴将培养基加温至37℃,然后将管转移到37℃摇床上,温育43分钏使细菌复苏并表达质粒编码的抗生素抗性标记基因。
为最大限度地提高转化效率,复苏期中应温放地摇动细胞(转速225转/分)。
16)将适当体积(每个90m平板达200μl)已转化的感受态细胞转移到含20mmol/LMgSO4和相应抗生素的SOB琼脂培养基上。
如培养物体积太小(〈10μl),可再加肉汤培养基,用一无菌的弯头玻棒轻轻地将转化的细胞涂到琼脂平表面。
如在一个90mm平板上铺200μl以上的感受态细胞,应离心浓缩细胞(于室温用SorvallSS34转头(或与其相当的转头)以4000转/分离心10分钟),然后用适量SOC轻轻重悬细胞。
如用四环素抗性作为选择标记,全部的转化混合物可以铺在一个单独的平皿上(或铺在软琼脂中)。
然而如选用氨苄青霉素抗性,则只能将一部分培养物(根据实验决定)铺在单独的平皿上,氨苄青霉素抗性菌落数的曾加与平皿上所加细菌数的增加并无线性比例关系,这可能是因为被抗生素杀死的细胞可释放生长抑制物质的缘故。
\par17)将平板置于室温直至液体被吸收。
18)倒置平皿,于37℃培养,12-16小时后可出现菌落。
如检查氨苄青霉素抗性,用转化细胞铺平板时密度应较低(每个90mm平板不超过104菌落),于37℃培养平板时不应超过20小时。
氨苄青霉素抗性的转化体可将β-内酰胺酶分泌到培养基中,迅速灭活菌落周围区域中的抗生素。
这样,铺平板时菌浓度太高或培养时间太长都会导致出现对氨苄青霉敏感的卫星菌落。
在培养基中不用氨苄青霉素而改用羧苄青霉素,以及将抗生素浓度从60μg/ml增至100μg/ml,可使情况有所改善,但不能彻底根除之。
用氯化钙制备新鲜的大肠杆菌感受态细胞
下面的简单方案是Clhen等(1972)所用方法的变通方案,常用于成批制备感受态细菌,这些细菌可使每微克螺旋质粒DNA产生5x106-2x107个转化菌落,这样的转化效率足以满足所有在质粒中进行的常规克隆的需要。
该方法完全适用于大多数大肠杆菌菌株,并且比方案I快速,重复性更好。
该法制备的感受态细胞可贮存于-70℃,但保存时间过长会使转化效率在一定程度上受到影响。
1)从于37℃培养16-20小时的新鲜平板中挑取一个单菌落(直径2-3mm),转到一个含有100mlLB或SOB培养基的1L烧瓶中。
于37℃剧烈振摇培养约3小时(旋转摇床,300转/分)。
为得到有效转化,活细胞数不应超过108细胞ml,可每隔20-30分种测量OD600值来监测培养物的生长情况。
在菌株与菌株之间,OD600值和每毫升中活细胞数间的关系变化很大,因此有必要通过测量特定大肠杆菌菌株的生长增减物在生长周期的不同时相的OD600值,并将各黧度的增减物铺于无抗生素的LB琼脂平皿以计算每一时相的活细胞数,从而使分光光度读数得到标化。
2)在无菌条件下将细菌转移到一个无菌、一次性使用的、用冰预冷的50ml聚丙烯管(Falcon2070)中,在冰上放置10分钟,使培养物冷却至0℃。
3)于4℃用SorvallGS3转头(或与其相当的转头)以4000转/分离心10分钟,以回收细胞。
4)倒出培养液,将管倒置1分钏以使最后残留的痕量培养液流尽。
5)以10ml用冰预冷的0.1mol/LCaCl2重悬每份沉淀,放置于冰浴上。
我们发现将1mol/LCaCl2贮存液[用纯水(Mille-Q级或与其相当的级别)配制]以10ml小份贮存于-20℃煞是方便。
制备感受态细胞时,取一小份融化,用纯水稀释至100mlk,用Nalgene滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,然后骤冷到0℃即可。
对于大多数大肠肝菌菌株(除MC1061外),在这一步采用TFB(见表1.3)代替氯化钙可得到相同的或更好的结果。
6)于4℃以4000转/分离心10分钟,以回收细胞。
7)倒出培养液,将管倒置1分钟以使最后残留的痕量培养液流尽。
8)每50ml初始培养物用2ml用冰预冷的0.1mol/LCaCl2[或TFB,见表1.3和步骤5)注]重悬每份细胞沉淀。
此时,可将细胞分成小份,放于-70℃冻存[有关讨论请参见53页本节
(二)步骤11)b.c)]。
在这些条件下,尽管长期保存后转化效率会稍有下降,但细胞仍可保持处于感受态。
Dagert和Ehrlich(1979)曾表明细胞可以于4℃在CaCl2溶液中保存24-48小时,在贮存的最初12-24小时内,转化效率增加3-5倍,然后降低到初始水平。
9)用冷却的无菌吸头从每种感受态细胞悬液中各取200μl转移到无菌的微量离心管中,每管加DNA(体积∞10μl,DNA∞50ng),轻轻旋转以混匀内容物,在冰中放置30分钟。
10)将管放到预加温到42℃的循环水浴中放好的试管回上,恰恰放置90秒,不要摇动试管。
11)快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却1-2分钟。
12)每管加800μlSOC培养基(见附录A)。
用水溶将培养基加温至37℃,然后将管转移到37℃摇床上,温育45分钟细菌复苏,并且表达质粒编码的抗生素抗性标记基因。
如果要求更高的转化效率,在复苏期中,应温和地摇动细胞(转速不超过225转/分)。
13)将适当体积(每个90mm平板可达200μl)已转化的感受态细胞转移到含20mmol/LMgSO4和相应抗生素的SOB琼脂培养基上。
如培养物体积太小(〈10μl)。
可再加肉汤培养基,用一无菌的弯头玻棒轻轻地将转化的细胞涂到琼脂平板表面。
如在一个90mm平板上铺200μl以上的感受态细胞,应离心浓缩细胞,然后用适量SOC轻轻重悬细胞。
然而如选用氨苄青霉素抗性,则只能将一部分培养物(根据实验决定)铺在单独的平皿上。
氨苄青霉素抗性功的增加与平皿上所加细菌数的增加并无线性比例关系,这可能是因为被抗生素杀死的细胞可释放生长掏物质的缘故。
14)将平板置于室温直至液体被吸收。
15)倒置平皿,于37℃培养,12-16小时后可出现菌落。
如检查氨苄青霉素抗性,用转化细胞铺增板时密度较低(每个90mm平板不超过104菌落),于37℃培养平板时不应超过20小时。
氨苄青霉素抗性的转化可将β-内酰胺酶分泌到培养基中,迅速灭活菌落周围区域中的抗生素。
这样,铺平板时密度太高或培养时间太长都会导致出现对氨苄青霉素敏感的卫星菌落。
在选择培养基中不用氨苄青霉素而改用羧苄青霉素,以及将抗生素浓度从60μg/ml增至100μg/ml,可使情况有所改善,但不能彻底根除之。
实验步骤:
1、InoculatefromanovernightgrowninLB.从培养过夜的LB平板上挑取单菌落。
2、Growin250ml"
SOB"
at18℃untilOD600=0.6.(0.3)接种于250mlSOB,18度培养至OD=0.6。
3、Onicefor10minutes.菌液置冰上10分钟。
4、Spinat2500xg(5000rpminaSorvallGSAor3000rpminaBeckmanJ-6Bcentrifuge)for10min.at4℃.b684度2500g离心10分钟。
5、Resuspendcellsgentlyin80mloficecold"
TB"
.小心用80ml预冷TB重悬细胞。
6、Onicefor10minutes.(30min)菌液置冰上10分钟。
7、Spinat2500xg(5000rpminaSorvallGSA,5500rpminaSorvallSS-34,or3000rpminaBeckmanJ-6Bcentrifuge)for10min.at4℃.4度2500g离心10分钟。
8、Resuspendcellsgentlyin20mloficecold"
.小心用20ml预冷TB重悬细胞。
9、AddDMSOtoafinalconcentrationof7%.加入DMSO至终浓度7%。
10、Placeonicefor10minutes.置冰上10分钟。
11、Aliquotinto1-2mlandfreezeinliquidnitrogen.分装,液氮速冻。
12、Storeinliquidnitrogen.冻存。
SOBMediumandTB(TransformationBuffer)
SOB
2%(w/v)bactotryptone
TB
0.5%(w/v)yeastextract
10mMPipes
10mMNaCl
55mMMnCl2
2.5mMKCl
15mMCaCl2
10mMMgCl2
250mMKCl
10mMMgSO4
在加入MnCl2之前先用5NKOH调pH值到6.7,adjustpHto6.7with5NKOHpriortoaddingtheMnCl2
thankstoMarkusSchneemannforthetip!
pH6.7-7.0
Note:
Competentcellsarefragile(cellwallisthoughttobeweakened),thereforetreatthecellsgentlywhenpreparingthesecells.Donotvortexorpippetteupanddowntoresuspendthecells.Donotspinthecellsattoogreataspeed(spinningdownat5000gwillcausesomecellstolyse).
Alwayskeepthecellschilledwhenmakingcompetentcell.Donotletthemwarmup.
Freezingthecellsappeartomakecellsmorecompetent.
Somecellstrainsmayworkbetterthanothers(DH5alphaworkswellinmyhand).Notealsothatsomecells(e.g.HB101)hasgreaterrecombinationactivitythanothers.
Thismethoddoesn'
tappeartoworkwithBL21,sojustgrowthecellsat30or37℃whenmakingBL21competentcells.However,ithb68asbeensuggestedthattheefficiencyofBL21preparedusingInouemethodmaybeimprovedbytreatingitwithDTTbeforefreezing(addto3.5%v/vofa2.2MDTT,10mMKAcpH6solutionandincubate10minutesonice).
Heatshocktimeshouldbedeterminedfordifferentstrainsofcell.ForDH5alphaorJM109use30-45sec.ForBL21use120sec.
Deactivateligasepriortotransformation.Ligasemayreducetransformationefficiency.
Dilutingtheligationmixture(~5x)canalsoincreasetransformationefficiecybyreducingtheamountofreagents/contaminantsthatmayaffecttransformation.Likewiseithasbeensuggestedthatphenol/chloroformtreatmentmayalsoincreaseefficiency,butitisprobablytoomuchtroubletobothertrying.
TheDNAaddedshouldnotbemorethen5%ofthevolumeofcompetentcellsused.ThefinalDNAconcentrationshouldnotexceed5ng/μl.
Themethodaboveshouldgiveatransformationefficiencyofmorethan108cfuperμgofplasmidDNA(pUCorpBluescripts)withover109cfupossible.
Transformationefficiencyhasaroughlyinverserelationshipwiththesizeofplasmids.CellswithdeoRmutaion(e.g.DH5alpha)canimprovedthetransformationoflargeplasmid.Relaxedplasmidshas~3/4ofthetransformationefficiencyofsupercoiledplasmid.
2differentplasmidscanbetransformedatthesametime,oroneafteranother.Buttheymustbecompatible(theycannothavethesamereplicon).
Forroutinetransformationwherebyefficiencyoftransformationisofnoimport,someofthestepsmaybeshortenoromitted.Forexample,heat-shockstepmaybeunnecessaryandrecoveryincubationtimeat37℃canbereducedoromitted(butdonotethatthismaydependsontheantibioticusedforselection-forampicillin-typeantibioticstheincubationtimeisnotreallythatimportant,thereforeyoucanplatethecellsstraightafterheat-shockifyouwish.forotherantibiotics,however,theincubationtimemaybeessential).
Platingcells-dry1.5%agarplates(exposedupsidedown)at37℃for2-4hoursjustbeforeuse,theplateshould