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深度学习中的内存管理问题研究综述

1引言

互联网规模的迅速扩张促使全球数据呈现爆炸式增长、海量聚集的特点,社交媒体、物联网等技术的迅速发展导致了大量非结构化数据的出现,从海量数据中提取有价值的信息的难度越来越大。

在大数据时代,深度神经网络(deepneuralnetwork,DNN)借助大规模数据的训练取得了极高的准确率,深度学习得以快速发展,并逐渐应用于人们生活的方方面面。

近年来,人们见证了深度神经网络在许多领域取得的成功,如计算机视觉、语音识别、自然语言处理等。

这些成功是由深度神经网络新架构的创新带来的。

卷积神经网络(convolutionalneuralnetwork,CNN)对空间模式进行建模,在计算机视觉任务中能够达到当前最优的预测结果;循环神经网络(recurrentneuralnetwork,RNN)在序列建模和结构预测方面也取得了令人备受鼓舞的结果。

深度和宽度是构建深度神经网络最重要和有效的两个因素。

神经网络的深度越深、功能层越多,越能有效地降低超参数选择的复杂性,提高模型的鲁棒性。

与深度相比,宽度是构建网络的另一个重要因素,它通过不同大小的卷积积累了更多的特征图。

深度学习应用是一种计算密集型和内存密集型的任务。

图形处理器(graphicprocessingunit,GPU)、专用集成电路(applicationspecificintegratedcircuit,ASIC)、可编程逻辑门阵列(fieldprogrammablegatearray,FPGA)、张量处理器(tensorprocessingunit,TPU)等各种专用加速设备为深度神经网络的发展提供了强大的算力支撑。

设计更深层次的深度神经网络可以达到更高的精度,但是这也给各种加速设备带来了极大的挑战。

例如,谷歌公司提出的基于转换器的双向编码表征(bidirectionalencoderrepresentationsfromtransformers,BERT)模型在训练中使用了768个隐藏层,占用了73GB的内存(批处理大小为64)。

然而,高带宽的GPU内存是一种稀缺资源,目前比较强大的NVIDIAGPUV100内存最多只有32GB,而主流商用云计算GPU类型(如P100)只有16GB内存。

这一限制阻碍了深度学习研究者去探索更先进的模型架构。

目前,有一些工作探讨了大数据环境下新型存储系统的相关内容,从存储系统的角度来解决大数据时代的内存瓶颈问题。

王孝远等人从体系结构、系统软件等多方面对当前面向大数据的异构内存系统进行了分析研究,提出了一系列异构内存系统的优化方法;陈游旻等人详细阐述了构建大数据环境下的存储系统所面临的挑战、当前的研究方向以及未来的发展趋势;李鑫等人则从大数据应用的角度对混合存储架构进行了深入的探讨。

本文从深度学习应用的角度,侧重于探讨深度学习系统中的内存管理问题,与之前的工作有本质的不同。

内存管理是大规模深度学习发展的一个重要挑战。

深度学习中的内存管理已经成为当前深度学习系统研究的重要问题。

本文将介绍深度神经网络的基本特征以及训练过程,分析深度学习中内存管理的问题,从技术的角度对一些代表性工作进行分类阐述,对比它们的优缺点,并对深度学习中内存管理的未来发展趋势进行展望。

2背景介绍

2.1DNN的结构及训练过程

DNN是由多种不同类型的层组成的层次结构模型,例如,用于计算机视觉任务的卷积神经网络、用于自然语言处理的循环神经网络都可以被称为深度神经网络。

笔者将通过一个典型的卷积神经网络对DNN的模型结构进行具体说明,如图1所示。

神经网络需要经过训练才能用于推理或分类任务。

训练通过执行正向传播(forwardpropagation)算法和反向传播(backwardpropagation)算法,学习和更新神经网络各层的权值。

对于正向传播和反向传播来说,遍历的方向以及必须执行的操作是不同的。

正向传播从第一层执行到最后一层,而反向传播从相反的方向执行(从最后一层到第一层)。

正向传播遍历了整个神经网络层,并针对给定的输入执行特征提取和分类任务,从而完成图像分类。

在正向传播过程中,每一层的数学操作应用于其输入特征图X,将计算结果进行保存,并作为输出特征图Y。

对于线性神经网络来说,第N−1层的输出结果Y直接用作第N层的输入X,如图1所示。

因此正向传播的计算是一个序列化的过程,第N层只有在第N−1层完成计算并将其输出结果Y传递到第N层的输入X时,才能开始相应的操作。

对于未经充分训练的DNN来说,推断的图像类别可能是不准确的。

因此,笔者使用一个损失函数来推导正向传播结束时推理误差的大小。

具体来说,损失函数的梯度是根据最后一层的输出值推导出来的:

由式

(1)可以得到最后一层的输出结果的梯度dY,进而根据链式法则,能够得到最后一层输入的梯度dX:

由式

(2)可以看出,计算第N层的输入X的梯度值dX需要的内存空间包括输入/输出梯度映射(dY和dX)的内存空间和该层的输入/输出特征映射(X和Y)的内存空间。

对于线性网络,将计算得到的第N层的dX直接传递到第N−1层,作为第N−1层dX推导的dY。

类似地,这个链式法则被用来推导权值的梯度,从而更新网络模型。

与正向传播类似,反向传播也对各个梯度映射按层执行。

当反向传播到达第一层时,利用权值梯度调整权值,以减少下一个分类任务的预测误差。

2.2深度学习中的内存管理问题

近年来,机器学习框架如雨后春笋般蓬勃发展,如TensorFlow、Theano、PyTorch和MxNet等。

这些框架提供了丰富的特性来帮助开发者快速设计各种各样的神经网络,并且使用各种加速设备来加速DNN的训练和推理,极大地简化了神经网络的实现过程,成为帮助研究者开展研究的利器。

但是这些机器学习框架在内存管理方面受到严重的限制。

图1   CNN模型的训练过程

现有的机器学习框架在训练DNN时,DNN所有层所需的内存空间必须能够被放在加速设备的内存中,以此来获得性能上的优势。

由于层与层之间存在数据依赖关系,加速设备在任何给定时间都只能处理单层的计算。

因此,不管神经网络的结构如何,神经网络在训练过程中的计算都是分层进行的。

整个神经网络的内存分配策略没有考虑到DNN分层训练的特点,这对内存资源造成了极大的浪费。

训练一个神经网络需要经过数百万甚至数亿次的迭代才能达到理想的训练效果。

由于基于随机梯度下降(stochasticgradient-descent,SGD)的反向传播算法具有随机性,神经网络的输入通常成批地训练数据,这也将显著增加内存占用,但是有助于网络模型更好地收敛到最优解。

随着DNN的网络结构向着更深、更广的方向发展,训练DNN时所需的内存空间越来越大,单个加速设备的内存已经不能满足训练的需求。

包括DistBelief等在内的一些系统试图分割神经网络模型,从而在多个GPU上进行分布式训练。

这种类型的训练方式通常被称为模型并行,其可以显著地缓解单个加速设备的内存压力。

然而,由于多GPU之间需要频繁地通信来更新模型参数,导致它的性能较差。

因此,需要通过内存管理解决现有内存分配策略带来的内存浪费问题,使得深度学习系统能够充分利用加速设备的算力和有限的内存资源,保证大规模神经网络在单个加速设备中能够快速训练。

在训练过程中,加速设备的内存主要被3个部分消耗:

存储正向传播中产生的特征映射、存储反向传播中的梯度映射以及卷积算法需要的额外内存空间。

与之相比,模型的权值消耗的内存非常少,并且其通常在加速设备内存中长期存在,可以持续更新。

在这3个部分中,后两个部分是临时内存,可以在当前计算完成后立即释放。

正向传播和反向传播的计算都需要特征映射,只有在反向传播计算完成后,对应层的特征映射占用的内存空间才能够被释放。

参考文献[18]中也指出特征映射和卷积算法所需的缓存空间占据着主要的内存空间。

因此,降低特征映射的内存消耗成为目前大多数工作的主要目标,而特征映射在正向传播和反向传播中参与的两次计算之间存在很大的时间间隔,这也为内存管理带来很多可能。

经过训练的神经网络模型常常被部署在边缘计算设备中。

在边缘计算设备中执行神经网络模型的推理阶段具有隐私保护和实时处理的优势,但是边缘计算设备往往具备更少的计算和内存资源,并且部分设备的能源是有限的,对应用能耗的要求很高。

与训练阶段不同,在推理阶段,神经网络模型只执行正向传播的计算过程。

因为没有反向传播过程来更新模型权值,所以正向计算过程中的中间结果不需要保存。

因此,在推理阶段,计算设备的内存主要被模型的权值以及计算时所需的临时内存空间消耗。

而这些内存需求已经给边缘计算设备带来了较大的内存开销。

因此,在推理阶段进行内存管理也是必要的。

优化模型结构是当前研究的主要方向。

优化模型结构一方面能够通过剔除一些不必要的模型权值来降低模型的大小;另一方面能够优化层与层之间的连接,从而减少计算过程。

通过优化模型结构能够有效地降低推理过程中的内存消耗。

3深度学习中内存管理的关键技术

目前已经有很多工作致力于降低单个设备训练神经网络时的内存消耗。

笔者从深度学习中内存管理用到的技术的角度对当前一些代表性工作进行分类阐述,并对其优缺点进行分析。

3.1内存交换

内存交换技术是指在加速设备内存和主存之间交换数据,通过在不使用变量时将其从加速设备的内存交换到主存的方式来降低加速设备的内存消耗,并在下一次访问变量之前将其交换回加速设备内存。

加速设备的内存容量相对于主存来说要小很多。

例如,目前比较新的NVIDIAGPUV100最大只有32GB的内存,而服务器中主存的大小通常在100GB左右,甚至更大。

内存交换能够交换几乎所有的设备内存数据,因此其能够大幅度地降低设备内存的占用率。

在理想情况下,数据在主存和设备内存之间的通信可以隐藏在计算之下,从而最小化数据传输开销。

Rhu等人提出了一个运行时内存管理解决方案,并将其称为虚拟深度神经网络(virtualizeddeepneuralnetwork,vDNN)。

vDNN在主存和GPU内存之间虚拟化了神经网络的内存使用。

特征映射作为中间数据结构长期驻留在GPU内存中,并且消耗了大量的GPU内存。

因此,vDNN在正向传播时,将特征提取层的输出结果特征映射交换至主存中,从而降低GPU内存的占用;在反向传播时,及时地将其交换至GPU内存中参与梯度计算。

为了减少传输时间,vDNN将计算与数据传输并发进行,以此隐藏数据传输的时间。

但是,vDNN在每一层的末端同步数据计算和数据传输,也就是说,只有在计算和传输都完成之后,它才会继续下一层的计算。

这可能导致GPU在开始下一层计算之前必须等待数据传输完成。

数据在主存和GPU内存之间的传输时间并不能完全与GPU的计算时间重叠,笔者还观察到,卷积(CONV)层相对于激活(ACTV)层和池化(POOL)层有更长的计算时间。

为了降低内存交换带来的性能损失,vDNN也提供了只将CONV层的特征映射交换至主存的策略,这样就有更多的时间来隐藏由交换内存带来的通信时延。

vDNN仅适用于分层的卷积神经网络。

TensorFlow使用一个统一的数据流图来表示一个模型训练任务。

图中的节点表示计算。

在节点之间的边则保存张量信息。

每个节点都由执行程序调度执行。

可以将这个图看作训练任务的中间表示,因此对于模型来说,对这个图的优化是通用的和透明的。

Chen等人通过修改数据流图的方式实现了内存交换的策略。

根据对数据流图的分析,选择生命周期较长的特征映射作为交换到主机内存的目标,这有助于降低通信带来的开销。

此外,过早地将其交换进来会加剧GPU内存的占用,而过晚地将其交换进来又会带来性能开销,因此需要选择合适的触发器来将交换出去的特征映射交换至GPU内存中。

Chen等人评估了数据流图中每个节点的计算时间,以此为基础为每一个目标特征映射选择合适的触发器。

优化后的数据流图可以直接在TensorFlow中运行。

该方法适用于所有的神经网络模型。

Chen等人应用数据卸载和数据预取的思想,使用启发式的调度算法完成数据传输。

此外作者提到不同的CONV算法计算所需的内存空间大小不同,因此提出了动态选择CONV算法,根据当前设备内存的占用情况选择合适的CONV算法,最终使得内存占用和性能都得到优化。

Jin等人提出了一种基于CPU-GPU数据迁移的层间内存复用策略,作者记录了在GPU中每一层数据的内存访问顺序,并跟踪被其他层引用的数据的引用计数。

通过这种方式,可以建立训练过程的细粒度内存访问序列,以确定何时迁移数据。

作者提出的方法能够有效地降低内存交换带来的性能损失。

Wang等人创建了一个统一的张量池,实现了对张量的分配和释放,同时能够将一些张量交换至主存中,以降低GPU内存的占用。

此外,运行时系统会尽可能地将通信与计算重叠,以保证训练性能。

然而,计算的时间是固定的,因此这种重叠的机会是有限的。

作者在GPU内存上创建了一个张量缓存,通过张量复用来最小化总通信开销。

Peng等人提出了基于张量的GPU内存管理(tensor-basedGPUmemorymanagement)方案——Capuchin。

作者观察到,所有机器学习框架都基于数据流图执行DNN模型,其中处理过程是基于张量的运算。

深度学习训练中的张量访问表现出数据重用和固定访问模式的特征。

此外,一次训练过程通常由数百万次的迭代组成。

作者还观察到,张量访问模式具有跨迭代的规律和重复访问的特点,通过分析时序和张量访问模式可以实现高效的内存管理。

Capuchin通过动态分析模型训练时的张量访问特征,在主存和GPU内存之间精确地执行张量的卸载和预取操作,在保证训练性能的同时大幅降低了DNN模型训练时的内存占用。

通过对神经网络训练过程中一些特征的观察,许多工作采用内存交换的方式进行训练时的内存管理,使得有限的GPU内存能够充分发挥作用,满足更深、更广的神经网络模型的训练需要。

但是如何降低内存交换产生的性能损失还激励着研究者们不断探索新的内存交换策略,最终实现在保证训练性能的同时大幅降低设备内存占用的目的。

3.2重计算

重计算技术的思想是将特征映射这样的中间结果在正向传播过程中及时地释放,在反向传播的计算需要用到特征映射时,再通过重新计算的方式生成,进而参与到当前计算中。

这是一种利用计算来换取内存空间的思想。

目前有一些工作采用这种方式进行神经网络训练时的内存管理,他们通常将计算成本低的中间结果作为重计算的目标,在保证训练性能的同时尽可能地减少内存消耗。

Chen等人提出了一种GradientCheckpoint算法。

具体地说,作者将神经网络划分成几个部分,算法只保留每部分的输出结果,删除了所有中间结果。

在反向传播期间,如果需要用到被删除的结果,则根据每一部分保留的信息重新进行计算。

该算法需要的内存空间包括存储每一部分输出结果的内存空间和每一部分反向传播计算时所需的最大内存空间,其通过一次额外的正向计算降低占用的内存。

作者在该算法的基础上,对如何进行神经网络的划分以及选取重计算的目标数据做了进一步的探讨,最终实现了通过为每层增加一个额外的正向计算,即可训练一个只有

内存开销的N层线性深度神经网络的目的。

Gruslys等人将重计算的思想与基于时间的反向传播(backpropagationthroughtime)算法结合,提出了一种在训练RNN时减少内存消耗的方法。

该方法通过动态编程来平衡中间结果的缓存和重计算,能够在用户指定的任何内存约束下完成神经网络的训练。

但是Chen等人和Gruslys等人提出的方案都基于对线性计算图的一个强力假设:

计算图中所有中间变量的内存开销都是相同的,因此他们的工作都局限于一些特定的神经网络中。

通常,有以速度为中心和以内存为中心的重计算策略。

以速度为中心的策略保留了重新计算的张量,以便反向计算时其他层也可以直接重用它们。

以内存为中心的策略总是重新计算每个反向计算层依赖的张量,与以速度为中心的策略不同,它会释放重新计算的中间结果,充分利用了节省内存的机会。

Wang等人提出的CostAware重计算方法充分利用了这两种策略的优势,确保最高的内存占用情况与以内存为中心的策略保持一致,而额外的计算开销则与以速度为中心的策略相当。

Kusumoto等人提出了一种新的有效的重计算方法,该方法可以应用于更广泛的神经网络模型。

作者使用图论的语言将在固定的内存大小约束下最小化计算开销的一般重计算问题形式化,并提供了一种动态规划的解决方案。

基于对张量访问模式的分析,Capuchin能够根据当前内存的占用情况动态地选取重计算的张量,并决定张量的重计算时间,有效地降低了重计算带来的性能开销。

Chen等人提出的Checkpointing方案假设计算图中所有节点的内存开销是相同的,并且梯度是无法被重构的。

Jain等人注意到这些假设限制了先前方法的效率和通用性,因此,他们提出了Checkmate方案,将DNN训练时间与训练时内存需求之间的权衡问题抽象为张量重构的优化问题,并将其形式化为混合整数线性规划问题,根据求得的结果选择可用于重构的张量,进而制定高效的重计算策略。

Checkmate是对Checkpointing策略的一般化,适用于任意类型的深度神经网络。

任何重计算方法的有效性都取决于其定义的规则:

缓存哪些变量以及如何重计算其他变量。

目前的研究者围绕这一问题不断提出新的方法,以期望用最小的性能开销换取最大的内存空间。

3.3内存共享

内存共享技术指的是通过对不同变量生命周期的分析,在不同变量之间重复使用同一块内存空间。

在机器学习框架中有两种类型的内存共享方式:

置换操作和内存复用。

置换操作是将输出结果直接存储在输入数据的物理地址上。

例如,当计算y=sigmod(a)时,y可以直接存储在a的内存中。

内存复用则是指在生命周期不重叠的变量之间共享同一块内存。

Chen等人也应用了内存共享的思想。

作者构造了以每个变量为节点的冲突图,然后按拓扑顺序遍历整个图,并使用计数器来表示节点的生命周期。

如果当前操作的输入变量没有被其他操作引用,那么当前操作的输出变量就可以使用置换操作。

当节点的生命周期没有重叠时,节点之间就会发生内存复用。

此外作者使用静态内存分配算法,在训练开始之前将内存分配给每个节点,以避免运行时的垃圾回收开销。

Jin等人在层内以及层间应用了内存复用的策略。

作者提出了一种层内内存复用策略,该策略根据每一层内正向传播和反向传播之间的独立性来复用它们的内存空间,即节点的梯度能够重用节点数据的内存空间。

这种策略能够使得当前层的内存占用降低50%,适用于层的范围较宽的神经网络。

此外作者还观察到:

深度神经网络中的计算和内存占用都遵循逐层的方式。

因此,对于来自不同层的独立和顺序操作而言,可以重复地使用相同的内存空间。

Wang等人通过对张量生命周期进行分析,实现了不同的张量在不同的时间复用同一块内存空间的目的。

生命周期分析经常在一个训练迭代中动态地保存和释放张量,而一个典型的训练阶段包含数百万个迭代,如果使用cudaMalloc和cudaFree,这种高强度的内存操作会带来巨大的性能开销。

为了解决这个问题,作者实现了一个基于堆的GPU内存池,提前分配一个大的GPU内存作为共享内存池。

内存共享一直以来都是优化内存占用的常见思想。

通过对数据结构生命周期的分析,可以较好地应用内存共享策略。

目前主流的机器学习框架应用了内存共享的策略。

3.4压缩

压缩在深度学习中的应用有多种方式。

在深度学习的训练阶段,通过压缩算法对变量进行压缩,能够有效降低变量占据的内存空间,减少加速设备内存的占用;而在深度学习的推理阶段,为了能够将训练好的模型部署在内存受限的边缘设备上,研究者提出了模型剪枝、量化等方法,通过优化模型结构、减少模型参数占用的内存空间等方式对神经网络模型进行压缩。

vDNN的工作能够较好地解决深度神经网络在训练时GPU内存占用高的问题,使得更深层次的神经网络模型能够在单个GPU中进行训练。

然而,由于PCIe带宽的限制,当数据移入和移出CPU内存所需的时间比计算DNN的反向传播算法所需的时间长时,vDNN就会产生不可忽略的性能开销。

为了解决这个问题,Rhu等人[28]实现了一个压缩直接内存访问(compressingdirect-memory-access,cDMA)引擎,它通过降低交换的数据结构的大小来减小PCIe带宽较低带来的性能损失。

作者注意到,被广泛用于DNN的ReLU层产生的可交换的数据具有显著的稀疏性和高度可压缩的特征。

cDMA引擎利用交换的数据固有的稀疏性,实现了平均提供2.6倍(最大13.8倍)的压缩比,将vDNN的性能平均提高了53%(最高79%)。

由于ReLU层被广泛应用于CNN模型,所以cDMA在CNN模型中有较好的性能,在其他类型的神经网络中效果一般。

Jain等人针对训练过程中的特征映射,提出了一种高效的分层编码机制,以减少训练内存的占用。

作者注意到在POOL层后的ReLU层的输出结果能够用1bit的数据来代替之前32bit的数据,通过这种编码方式能够实现32倍的压缩率;此外CONV层后的ReLU层的输出结果具有高度稀疏性的特征,作者实现了对这种类型的特征映射高效稀疏格式的存储,利用稀疏性减少内存占用。

这两种编码方式没有造成对网络模型进行训练时的精度损失。

作者对DNN的数据流图进行静态分析,识别出适用的编码方式,并通过插入相关的编码和解码函数创建了一个新的数据流图。

Han等人介绍了“深度压缩方法”,包括模型剪枝、参数量化和哈夫曼编码3个阶段,这3个阶段共同作用,减少了神经网络的存储需求,从而使得神经网络模型能够被部署在内存受限的嵌入式设备中。

首先是模型剪枝,作者通过正常的网络训练来学习连接性,修剪小权重的连接:

所有权值低于阈值的连接都将从网络中删除;然后,对网络进行再训练,以获取剩下的稀疏连接的最终权值;接着是参数量化,作者通过减少表示每个权值所需的比特数来进一步压缩修剪后的网络,此外作者还通过权值共享让多个连接共享相同的权值,减少了需要存储的有效权值的数量,并且对这些共享的权值进行微调,保证训练精度不受损失;最后,利用哈夫曼编码对网络模型进行进一步的压缩。

通过应用“深度压缩方法”,作者成功将AlexNet的网络模型大小从240MB降至6.9MB,VGG16的模型大小从552MB降至11.3MB,使得这些神经网络能够部署在智能手机等边缘设备中。

Rhu等人和Jain等人提出的方案都可用于降低DNN在训练过程的内存占用。

适用于压缩技术的数据需要具有高度稀疏性的特征,这使得该技术仅能应用于部分数据结构,往往需要与其他技术配合才能发挥较好的效果。

而Han等人的工作则致力于降低DNN在部署时的内存占用,使得DNN模型能够被应用到边缘计算设备中。

模型剪枝、参数量化等方法会造成模型训练精度的损失,在保持较高精度的同时减小模型占用的内存空间一直以来都是研究的热点。

这些解决方案应用了不同的内存管理技术,各有优点和缺点,具体见表1。

4结束语

本文介绍了深度神经网络的一些基本特征,分析了深度学习训练过程中的内存瓶颈,讨论了在深度学习中内存管理面临的挑战。

深度神经网络正朝着更深、更广的方向发展,训练和部署这些深度神经网络需要更大的内存空间,这对深度学习系统中的内存管理提出了新的挑战。

如何在深度学习系统中进行高效的内存管理,从而满足更深、更广层次的神经网络模型的训练需求,是当前深度学习系统研究的重要问题。

为了分析现有的深度学习中内存管理的解决方案,笔者根据其所应用技术的不同对这些解决方案进行分类。

内存管理方案主要应用的技术包括内存交换、重计算、内存共享和压缩。

通过对现有的一些代表性工作的分析,笔者发现大多数工作通过观察、分析DNN模型训练过程中的一些特征,从数据流图、层以及张量等不同的维度,应用上述的一种或多种技术方案,充分发挥各技术的优势,实现有效的内存管理。

从顶层的角度来看,许多工作是类似的,只是它们的实现细节不同。

最后,笔者对在深度学习中进行内存管理的一些新的挑战和机会做如下总结。

●基于虚拟内存实现

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