细菌分类表.docx
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细菌分类表
细菌分类表
本表以LPSN网站的分类为基础（当前版本2008年1月7日），本分类代表原核生物分类的权威杂志IJSEM的分类系统，同时参考NCBITaxonomy，但目前其它中文维基分类表可能依照其它标准，请注意其区别。
中文名称采用惯例（包括网上搜索途径）以及拉丁名直接意译，部分参考《细菌名称》第二版，拉丁文意译参考原核生物名称（英文）网站。
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本表列到属级。
后面带*者为尚未被IJSEM杂志确认的分类。
∙1酸杆菌门（Acidobacteria）
1.1酸杆菌纲（Acidobacteria）
1.2全噬菌纲（Holophagae）
∙2放线菌门（Actinobacteria）（高G+C革兰氏阳性菌）
2.1放线菌纲（Actinobacteria）
∙3产水菌门（Aquificae）
3.1产水菌纲（Aquificae）
∙4拟杆菌门（Bacteroidetes）
4.1拟杆菌纲（Bacteroidetes）
4.2黄杆菌纲（Flavobacteria）
4.3鞘脂杆菌纲（Sphingobacteria）
4.4纲未定
∙5衣原体门（Chlamydiae）
5.1衣原体纲（Chlamydiae）
∙6绿菌门（Chlorobi）
6.1绿菌纲（Chlorobia）
∙7绿弯菌门（Chloroflexi）
7.1厌氧绳菌纲（Anaerolineae）
7.2暖绳菌纲（Caldilineae）
7.3绿弯菌纲（Chloroflexi）
∙8产金菌门（Chrysiogenetes）
8.1产金菌纲（Chrysiogenetes）
∙9蓝藻门（Cyanobacteria）
9.1蓝藻纲（Cyanobacteria）
∙10脱铁杆菌门（Deferribacteres）
10.1脱铁杆菌纲（Deferribacteres）
∙11异常球菌-栖热菌门（Deinococcus-Thermus）
11.1异常球菌纲（Deinococci）
∙12网团菌门（Dictyoglomi）
12.1网团菌纲（Dictyoglomi）
∙13纤维杆菌门（Fibrobacteres）
13.1纤维杆菌纲（Fibrobacteres）
∙14厚壁菌门（Firmicutes）（低G+C革兰氏阳性菌）
14.1芽孢杆菌纲（Bacilli）
14.2梭菌纲（Clostridia）
14.3热石杆菌纲（Thermolithobacteria）
∙15梭杆菌门（Fusobacteria）
15.1梭杆菌纲（Fusobacteria）
∙16芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）
16.1芽单胞菌纲（Gemmatimonadetes）
∙17黏胶球形菌门（Lentisphaerae）
17.1黏胶球形菌纲（Lentisphaerae）
∙18硝化螺旋菌门（Nitrospirae）
18.1硝化螺旋菌纲（Nitrospira）
∙19浮霉菌门（Planctomycetes）
19.1浮霉菌纲（Planctomycetacia）
∙20海绵杆菌门（Poribacteria）*
∙21变形菌门（Proteobacteria）
21.1α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）
21.2β-变形菌纲（Betaproteobacteria）
21.3δ-变形菌纲（Deltaproteobacteria）
21.4ε-变形菌纲（Epsilonproteobacteria）
21.5γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）
∙22螺旋体门（Spirochaetes）
22.1螺旋体纲（Spirochaetes）
∙23柔膜菌门（Tenericutes）
23.1柔膜菌纲（Mollicutes）
∙24热脱硫杆菌门（Thermodesulfobacteria）
24.1热脱硫杆菌纲（Thermodesulfobacteria）
∙25热微菌门（Thermomicrobia）
25.1热微菌纲（Thermomicrobia）
∙26热袍菌门（Thermotogae）
26.1热袍菌纲（Thermotogae）
∙27疣微菌门（Verrucomicrobia）
27.1丰祐菌纲（Opitutae）
27.2疣微菌纲（Verrucomicrobiae）
∙28门未定
28.1纤线杆菌纲（Ktedonobacteria）
酸杆菌门（Acidobacteria）
酸杆菌纲（Acidobacteria）
1.酸杆菌目（Acidobacteriales）
1.酸杆菌科（Acidobacteriaceae）
1.酸杆菌属（Acidobacterium）
2.（Edaphobacter）
3.（Terriglobus）
全噬菌纲（Holophagae）
1.石鳖杆菌目（Acanthopleuribacterales）
1.石鳖杆菌科（Acanthopleuribacteraceae）
1.石鳖杆菌属（Acanthopleuribacter）
2.全噬菌目（Holophagales）
1.全噬菌科（Holophagaceae）
1.地发菌属（Geothrix）
2.全噬菌属（Holophaga）
放线菌门（Actinobacteria）（高G+C革兰氏阳性菌）
放线菌纲（Actinobacteria）
1.酸微菌亚纲（Acidimicrobidae）
1.酸微菌目（Acidimicrobiales）
1.酸微菌亚目（Acidimicrobineae）
1.酸微菌科（Acidimicrobiaceae）
1.酸微菌属（Acidimicrobium）
2.（Iamiaceae）
1.（Iamia）
2.放线菌亚纲（Actinobacteridae）
1.放线菌目（Actinomycetales）
1.放线菌亚目（Actinomycineae）
1.放线菌科（Actinomycetaceae）
1.放线棒菌属（Actinobaculum）
2.放线菌属（Actinomyces）
3.隐秘杆菌属（Arcanobacterium）
4.（Falcivibrio）
5.动弯杆菌属（Mobiluncus）
6.（Varibaculum）
2.（Actinopolysporineae）
1.（Actinopolysporaceae）
1.（Actinopolyspora）
3.（Catenulisporineae）
1.（Actinospicaceae）
1.（Actinospica）
2.（Catenulisporaceae）
1.（Catenulispora）
4.棒杆菌亚目（Corynebacterineae）
1.棒杆菌科（Corynebacteriaceae）
1.（Bacterionema）
2.（Caseobacter）
3.棒杆菌属（Corynebacterium）
4.（Turicella）
2.迪茨氏菌科（Dietziaceae）
1.迪茨氏菌属（Dietzia）
3.分枝杆菌科（Mycobacteriaceae）
1.分枝杆菌属（Mycobacterium）（含结核杆菌）
4.诺卡氏菌科（Nocardiaceae）
1.戈登氏菌属（Gordonia）
2.（Micropolyspora）
3.（Millisia）
4.诺卡氏菌属（Nocardia）
5.红球菌属（Rhodococcus）
6.斯科曼氏菌属（Skermania）
7.（Williamsia）
8.（Smaragdicoccus）
5.（Segniliparaceae）
1.（Segniliparus）
6.束村氏菌科（Tsukamurellaceae）
1.束村氏菌属（Tsukamurella）
5.弗兰克氏菌亚目（Frankineae）
1.酸热菌科（Acidothermaceae）
1.酸热菌属（Acidothermus）
2.弗兰克氏菌科（Frankiaceae）
1.弗兰克氏菌属（Frankia）
3.地嗜皮菌科（Geodermatophilaceae）
1.芽球菌属（Blastococcus）
2.地嗜皮菌属（Geodermatophilus）
3.（Modestobacter）
4.（Kineosporiaceae）
1.（Cryptosporangium）
2.（Kineococcus）
3.（Kineosporia）
5.（Nakamurellaceae）
1.（Humicoccus）
2.（Nakamurella）
3.（Quadrisphaera）
6.孢鱼菌科（Sporichthyaceae）
1.孢鱼菌属（Sporichthya）
6.糖霉菌亚目（Glycomycineae）
1.糖霉菌科（Glycomycetaceae）
1.糖霉菌属（Glycomyces）
2.（Stackerbrandtia）
7.微球菌亚目（Micrococcineae）
1.获山氏菌科（Beutenbergiaceae）
1.获山氏菌属（Beutenbergia）
2.乔治菌属（Georgenia）
3.萨勒河菌属（Salana）
2.博戈里亚湖菌科（Bogoriellaceae）
1.博戈里亚湖菌属（Bogoriella）
3.短杆菌科（Brevibacteriaceae）
1.短杆菌属（Brevibacterium）
4.纤维素单胞菌科（Cellulomonadaceae）
1.纤维素单胞菌属（Cellulomonas）
2.厄氏菌属（Oerskovia）
3.（Tropheryma）
5.（Dermabacteraceae）
1.（Brachybacterium）
2.（Dermabacter）
6.（Dermacoccaceae）
1.（Demetria）
2.（Dermacoccus）
3.（Kytococcus）
7.（Dermatophilaceae）
1.（Dermatophilus）
2.（Kineosphaera）
8.（Intrasporangiaceae）
1.（Arsenicicoccus）
2.（Humihabitans）
3.（Intrasporangium）
4.（Janibacter）
5.（Knoellia）
6.（Kribbia）
7.（Lapillicoccus）
8.（Ornithinicoccus）
9.（Ornithinimicrobium）
10.（Oryzihumus）
11.（Serinicoccus）
12.（Terrabacter）
13.（Terracoccus）
14.（Tetrasphaera）
9.（Jonesiaceae）
1.（Jonesia）
10.（Microbacteriaceae）
1.（Agreia）
2.（Agrococcus）
3.（Agromyces）
4.（Aureobacterium）
5.（Clavibacter）
6.（Cryobacterium）
7.（Curtobacterium）
8.（Frigoribacterium）
9.（Frondicola）
10.（Gulosibacter）
11.（Labedella）
12.（Leifsonia）
13.（Leucobacter）
14.（Microbacterium）
15.（Microcella）
16.（Mycetocola）
17.（Okibacterium）
18.（Plantibacter）
19.（Pseudoclavibacter）
20.（Rathayibacter）
21.（Rhodoglobus）
22.（Salinibacterium）
23.（Subtercola）
24.（Yonghaparkia）
25.（Zimmermannella）
11.微球菌科（Micrococcaceae）
1.（Acaricomes）
2.节杆菌属（Arthrobacter）
3.（Citricoccus）
4.（Kocuria）
5.微球菌属（Micrococcus）
6.（Nesterenkonia）
7.（Renibacterium）
8.罗氏菌属（Rothia）
9.口腔球菌属（Stomatococcus）
10.刘志恒菌属（Zhihengliuella）
12.（Promicromonosporaceae）
1.（Cellulosimicrobium）
2.（Isoptericola）
3.（Myceligenerans）
4.（Promicromonospora）
5.（Xylanibacterium）
6.（Xylanimonas）
13.（Rarobacteraceae）
1.（Rarobacter）
14.（Sanguibacteraceae）
1.血杆菌属（Sanguibacter）
15.（Yaniaceae）
1.（Yania）
16.科未定
1.（Actinotalea）
2.（Demequina）
3.（Phycicoccus）
4.（Ruania）
8.微单孢菌亚目（Micromonosporineae）
1.微单孢菌科（Micromonosporaceae）
1.（Actinocatenispora）
2.（Actinoplanes）
3.（Amorphosporangium）
4.（Ampullariella）
5.（Asanoa）
6.（Catellatospora）
7.（Catenuloplanes）
8.（Couchiolanes）
9.（Dactylosporangium）
10.（Krasilnikovia）
11.（Longispora）
12.（Luedemannella）
13.微单孢菌属（Micromonospora）
14.（Pilimelia）
15.（Planopolyspora）
16.（Polymorphospora）
17.（Salinispora）
18.（Spirilliplanes）
19.（Verrucosispora）
20.（Virgisporangium）
9.丙酸杆菌亚目（Propionibacterineae）
1.（Nocardioidaceae）
1.（Actinopolymorpha）
2.（Aeromicrobium）
3.（Friedmanniella）
4.（Hongia）
5.（Kribbella）
6.（Marmoricola）
7.（Micropruina）
8.（Nocardioides）
9.（Pimelobacter）
10.（Propionicicella）
11.（Propionicimonas）
2.丙酸杆菌科（Propionibacteriaceae）
1.河口微菌属（Aestuariimicrobium）
2.（Arachnia）
3.（Brooklawnia）
4.（Granulicoccus）
5.江氏菌属（Jiangella）
6.（Luteococcus）
7.（Microlunatus）
8.丙酸杆菌属（Propionibacterium）
9.（Propioniferax）
10.（Propionimicrobium）
11.（Tessaracocccus）
10.（Pseudonocardineae）
1.（Actinosynnemataceae）
1.（Actinokineospora）
2.（Actinosynnema）
3.（Lechevalieria）
4.（Lentzea）
5.（Saccharothrix）
6.（Umezawaea）
2.（Pseudonocardiaceae）
1.（Actinoalloteichus）
2.（Actinobispora）
3.（Amycolata）
4.（Amycolatopsis）
5.（Crossiella）
6.（Faenia）
7.（Goodfellowia）
8.（Kibdelosporangium）
9.（Kutzneria）
10.（Prauserella）
11.（Pseudoamycolata）
12.（Pseudonocardia）
13.（Saccharomonospora）
14.（Saccharopolyspora）
15.（Streptoalloteichus）
16.（Thermobispora）
17.（Thermocrispum）
11.链霉菌亚目（Streptomycineae）
1.链霉菌科（Sterptomycetaceae）
1.（Actinopycnidium）
2.（Actinosporangium）
3.（Chainia）
4.（Elytrosporangium）
5.北里菌属（Kitasatoa）
6.北里孢菌属（Kitasatospora）
7.（Microellobosporia）
8.（Streptacidiphilus）
9.链霉菌属（Streptomyces）
10.（Streptoverticillium）
12.（Streptosporangineae）
1.（Nocardiopsaceae）
1.（Nocardiopsis）
2.（Streptomonospora）
3.（Thermobifida）
2.（Streptosporangiaceae）
1.（Acrocarpospora）
2.（Herbidospora）
3.（Microbispora）
4.（Microtetraspora）
5.（Nonomuraea）
6.（Planobispora）
7.（Planomonospora）
8.（Planotetraspora）
9.（Sphaerisporangium）
10.（Streptosporangium）
11.（Thermopolyspora）
3.（Thermomonosporaceae）
1.珊瑚状放线菌属（Actinocorallia）
2.（Actinomadura）
3.（Excellospora）
4.（Spirillospora）
5.（Thermomonospora）
2.双歧杆菌目（Bifidobacteriales）
1.双歧杆菌科（Bifidobacteriaceae）
1.（Aeriscardovia）
2.（Alloscardovia）
3.双歧杆菌属（Bifidobacterium）
4.（Gardnerella）
5.（Metascardovia）
6.（Parascardovia）
7.（Scardovia）
2.科未定
3.（Coriobacteridae）
1.（Coriobacteriales）
1.（Coriobacterineae）
1.（Coriobacteriaceae）
1.奇异菌属（Atopobium）
2.（Collinsella）
3.（Coriobacterium）
4.（Cryptobacterium）
5.（Denitrobacterium）
6.（Eggerthella）
7.（Olsenella）
8.（Slackia）
4.红色杆菌亚纲（Rubrobacteridae）
1.红色杆菌目（Rubrobacterales）
1.红色杆菌亚目（Rubrobacterineae）
1.（Conexibacteraceae）
1.（Conexibacter）
2.（Patulibacteraceae）
1.（Patulibacter）
3.红色杆菌科（Rubrobacteraceae）
1.红色杆菌属（Rubrobacter）
4.（Solirubrobacteraceae）
1.（Solirubrobacter）
5.（Thermoleophilaceae）
1.（Thermoleophilum）
5.球形杆菌亚纲（Sphaerobacteridae）
1.球形杆菌目（Sphaerobacterales）
1.球形杆菌亚目（Sphaerobacterineae）
1.球形杆菌科（Sphaerobacteraceae）
1.球形杆菌属（Sphaerobacter）
产水菌门（Aquificae）
产水菌纲（Aquificae）
1.产水菌目（Aquificales）
1.产水菌科（Aquificaceae）
1.产水菌属（Aquifex）
2.（Calderobacterium）
3.（Hydrogenivirga）
4.（Hydrogenobacter）
5.（Hydrogenobaculum）
6.（Thermocrinis）
2.除硫杆菌科（Desulfurobacteriaceae）
1.（Balnearium）
2.除硫杆菌属（Desulfurobacterium）
3.热弧菌属（Thermovibrio）
3.（Hydrogenothermaceae）
1.（Hydrogenothermus）
2.（Persephonella）
3.（Sulfurihydrogenibium）
拟杆菌门（Bacteroidetes）
拟杆菌纲（Bacteroidetes）
1.拟杆菌目（Bacteroidales）
1.拟杆菌科（Bacteroidaceae）
1.（Acetomicrobium）
2.（Anaerophaga）
3.（Anaerorhabdus）
4.拟杆菌属（Bacteroides）
5.（Pontibacter）
2.紫单胞菌科（Porphyromonadaceae）
1.（Barnesiella）
2.（Capsularis）
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