《遗传密码表》以及《氨基酸详表》.docx
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《遗传密码表》以及《氨基酸详表》
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-
第二位碱基
第二位碱基
第二位碱基
第二位碱基
-
-
U
C
A
G
第
一
位
碱
基
U
UUU(Phe/F)苯丙氨酸
UUC(Phe/F)苯丙氨酸
UUA(Leu/L)亮氨酸
UUG(Leu/L)亮氨酸
UCU(Ser/S)丝氨酸
UCC(Ser/S)丝氨酸
UCA(Ser/S)丝氨酸
UCG(Ser/S)丝氨酸
UAU(Tyr/Y)酪氨酸
UAC(Tyr/Y)酪氨酸
UAA(终止)
UAG(终止)
UGU(Cys/C)半胱氨酸
UGC(Cys/C)半胱氨酸
UGA(终止)
UGG(Trp/W)色氨酸
第
一
位
碱
基
C
CUU(Leu/L)亮氨酸
CUC(Leu/L)亮氨酸
CUA(Leu/L)亮氨酸
CUG(Leu/L)亮氨酸
CCU(Pro/P)脯氨酸
CCC(Pro/P)脯氨酸
CCA(Pro/P)脯氨酸
CCG(Pro/P)脯氨酸
CAU(His/H)组氨酸
CAC(His/H)组氨酸
CAA(Gln/Q)谷氨酰胺
CAG(Gln/Q)谷氨酰胺
CGU(Arg/R)精氨酸
CGC(Arg/R)精氨酸
CGA(Arg/R)精氨酸
CGG(Arg/R)精氨酸
第
一
位
碱
基
A
AUU(Ile/I)异亮氨酸
AUC(Ile/I)异亮氨酸
AUA(Ile/I)异亮氨酸
AUG(Met/M)甲硫氨酸(起始)
ACU(Thr/T)苏氨酸
ACC(Thr/T)苏氨酸
ACA(Thr/T)苏氨酸
ACG(Thr/T)苏氨酸
AAU(Asn/N)天冬酰胺
AAC(Asn/N)天冬酰胺
AAA(Lys/K)赖氨酸
AAG(Lys/K)赖氨酸
AGU(Ser/S)丝氨酸
AGC(Ser/S)丝氨酸
AGA(Arg/R)精氨酸
AGG(Arg/R)精氨酸
第
一
位
碱
基
G
GUU(Val/V)缬氨酸
GUC(Val/V)缬氨酸
GUA(Val/V)缬氨酸
GUG(Val/V)缬氨酸
GCU(Ala/A)丙氨酸
GCC(Ala/A)丙氨酸
GCA(Ala/A)丙氨酸
GCG(Ala/A)丙氨酸
GAU(Asp/D)天冬氨酸
GAC(Asp/D)天冬氨酸
GAA(Glu/E)谷氨酸
GAG(Glu/E)谷氨酸
GGU(Gly/G)甘氨酸
GGC(Gly/G)甘氨酸
GGA(Gly/G)甘氨酸
GGG(Gly/G)甘氨酸
密码子反表
Ala
A
GCU,GCC,GCA,GCG
Leu
L
UUA,UUG,CUU,CUC,CUA,CUG
Arg
R
CGU,CGC,CGA,CGG,AGA,AGG
Lys
K
AAA,AAG
Asn
N
AAU,AAC
Met
M
AUG
Asp
D
GAU,GAC
Phe
F
UUU,UUC
Cys
C
UGU,UGC
Pro
P
CCU,CCC,CCA,CCG
Gln
Q
CAA,CAG
Ser
S
UCU,UCC,UCA,UCG,AGU,AGC
Glu
E
GAA,GAG
Thr
T
ACU,ACC,ACA,ACG
Gly
G
GGU,GGC,GGA,GGG
Trp
W
UGG
His
H
CAU,CAC
Tyr
Y
UAU,UAC
Ile
I
AUU,AUC,AUA
Val
V
GUU,GUC,GUA,GUG
起始
AUG
终止
UAG,UGA,UAA
中文名称
英文名称
短写
缩写
缬氨酸
Valine
V
Val
酪氨酸
Tyrosine
Y
Tyr
色氨酸
Tryptophan
W
Trp
苏氨酸
Threonine
T
Thr
丝氨酸
Serine
S
Ser
硒半胱氨酸*
Selenocysteine
U
Sec
吡咯赖氨酸*
Pyrrolysine
O
Pyl
脯氨酸
Proline
P
Pro
苯丙氨酸
Phenylalanine
F
Phe
蛋氨酸
Methionine
M
Met
赖氨酸
Lysine
K
Lys
亮氨酸
Leucine
L
Leu
异亮氨酸
Isoleucine
I
Ile
组氨酸
Histidine
H
His
甘氨酸
Glycine
G
Gly
谷氨酰胺
Glutamine
Q
Gln
谷氨酸
Glutamicacid/Glutamate
E
Glu
半胱氨酸
Cysteine
C
Cys
天冬氨酸
Asparticacid/Aspartate
D
Asp
天冬酰胺
Asparagine
N
Asn
精氨酸
Arginine
R
Arg
丙氨酸
Alanine
A
Ala
除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:
∙Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。
∙Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。
∙Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。
∙Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。
结构[编辑]
以下是标准遗传密码所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。
∙
L-丙氨酸
(Ala?
/?
A)
∙
L-精氨酸
(Arg?
/?
R)
∙
L-天冬酰胺
(Asn?
/?
N)
∙
L-天冬氨酸
(Asp?
/?
D)
∙
L-半胱氨酸
(Cys?
/?
C)
∙
L-谷氨酸
(Glu?
/?
E)
∙
L-谷氨酰胺
(Gln?
/?
Q)
∙
甘氨酸
(Gly?
/?
G)
∙
L-组氨酸
(His?
/?
H)
∙
L-异亮氨酸
(Ile?
/?
I)
∙
L-亮氨酸
(Leu?
/?
L)
∙
L-赖氨酸
(Lys?
/?
K)
∙
L-蛋氨酸
(Met?
/?
M)
∙
L-苯丙氨酸
(Phe?
/?
F)
∙
L-脯氨酸
(Pro?
/?
P)
∙
L-丝氨酸
(Ser?
/?
S)
∙
L-苏氨酸
(Thr?
/?
T)
∙
L-色氨酸
(Trp?
/?
W)
∙
L-酪氨酸
(Tyr?
/?
Y)
∙
L-缬氨酸
(Val?
/?
V)
∙
L-硒半胱氨酸
(Sec?
/?
U)
∙
L-吡咯赖氨酸
(Pyl?
/?
O)
主要化学性质[编辑]
以下的分子量是根据各元素的同位素在自然界的丰度所做的平均值。
此外由于形成肽键时,会减少一个水分子,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了18.01524Da。
氨基酸
分子量(Da)
pI
pK1(α-COOH)
pK2(α-+NH3)
丙氨酸
89.09404
6.01
2.35
9.87
半胱氨酸
121.15404
5.05
1.92
10.70
硒半胱氨酸
169.06
天冬氨酸
133.10384
2.85
1.99
9.90
谷氨酸
147.13074
3.15
2.10
9.47
苯丙氨酸
165.19184
5.49
2.20
9.31
甘氨酸
75.06714
6.06
2.35
9.78
组氨酸
155.15634
7.60
1.80
9.33
异亮氨酸
131.17464
6.05
2.32
9.76
赖氨酸
146.18934
9.60
2.16
9.06
吡咯赖氨酸
255.31
亮氨酸
131.17464
6.01
2.33
9.74
蛋氨酸
149.20784
5.74
2.13
9.28
天冬酰胺
132.11904
5.41
2.14
8.72
脯氨酸
115.13194
6.30
1.95
10.64
谷氨酰胺
146.14594
5.65
2.17
9.13
精氨酸
174.20274
10.76
1.82
8.99
丝氨酸
105.09344
5.68
2.19
9.21
苏氨酸
119.12034
5.60
2.09
9.10
缬氨酸
117.14784
6.00
2.39
9.74
色氨酸
204.22844
5.89
2.46
9.41
酪氨酸
181.19124
5.64
2.20
9.21
支链性质[编辑]
以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。
氨基酸
支链
疏水性
pKa
极性
电荷
芳香族
或脂肪族
范德瓦尔斯半径
丙氨酸
-CH3
X
-
-
-
-
67
半胱氨酸
-CH2SH
X
8.18
-
酸性
-
86
硒半胱氨酸
-CH2SeH
X
5.73
-
-
-
天冬氨酸
-CH2COOH
-
3.90
X
酸性
-
91
谷氨酸
-CH2CH2COOH
-
4.07
X
酸性
-
109
苯丙氨酸
-CH2C6H5
X
-
-
-
芳香性
135
甘氨酸
-H
-
-
-
-
-
48
组氨酸
-CH2-C3H3N2
-
6.04
X
弱碱性
芳香性
118
异亮氨酸
-CH(CH3)CH2CH3
X
-
-
-
脂肪性
124
赖氨酸
-(CH2)4NH2
-
10.54
X
碱性
-
135
吡咯赖氨酸
-C12H21N3O3
亮氨酸
-CH2CH(CH3)2
X
-
-
-
脂肪性
124
蛋氨酸
-CH2CH2SCH3
X
-
-
-
-
124
天冬酰胺
-CH2CONH2
-
-
X
-
-
96
脯氨酸
-CH2CH2CH2-
X
-
-
-
-
90
谷氨酰胺
-CH2CH2CONH2
-
-
X
-
-
114
精氨酸
-(CH2)3NH-C(NH)NH2
-
12.48
X
碱性
-
148
丝氨酸
-CH2OH
-
-
X
-
-
73
苏氨酸
-CH(OH)CH3
-
-
X
弱酸性
-
93
缬氨酸
-CH(CH3)2
X
-
-
-
脂肪性
105
色氨酸
-CH2-C8H6N
X
-
-
-
芳香性
163
酪氨酸
-CH2-C6H4OH
X
10.46
X
-
芳香性
141
基因表达与生物化学[编辑]
氨基酸
短写
缩写
密码子
在蛋白质中
出现频率(%)
对人类的必需性
丙氨酸
A
Ala
GCU,GCC,GCA,GCG
7.8
-
半胱氨酸
C
Cys
UGU,UGC
1.9
-
硒半胱氨酸
U
Sec
UGA
-
天冬氨酸
D
Asp
GAU,GAC
5.3
-
谷氨酸
E
Glu
GAA,GAG
6.3
-
苯丙氨酸
F
Phe
UUU,UUC
3.9
X
甘氨酸
G
Gly
GGU,GGC,GGA,GGG
7.2
-
组氨酸
H
His
CAU,CAC
2.3
-
异亮氨酸
I
Ile
AUU,AUC,AUA
5.3
X
赖氨酸
K
Lys
AAA,AAG
5.9
X
吡咯赖氨酸
O
Pyl
UAG
亮氨酸
L
Leu
UUA,UUG,CUU,CUC,CUA,CUG
9.1
X
蛋氨酸
M
Met
AUG
2.3
X
天冬酰胺
N
Asn
AAU,AAC
4.3
-
脯氨酸
P
Pro
CCU,CCC,CCA,CCG
5.2
-
谷氨酰胺
Q
Gln
CAA,CAG
4.2
-
精氨酸
R
Arg
CGU,CGC,CGA,CGG,AGA,AGG
5.1
-
丝氨酸
S
Ser
UCU,UCC,UCA,UCG,AGU,AGC
6.8
-
苏氨酸
T
Thr
ACU,ACC,ACA,ACG
5.9
X
缬氨酸
V
Val
GUU,GUC,GUA,GUG
6.6
X
色氨酸
W
Trp
UGG
1.4
X
酪氨酸
Y
Tyr
UAU,UAC
3.2
-
终止编码
-
Term
UAA,UAG,UGA
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