《遗传密码表》以及《氨基酸详表》.docx

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《遗传密码表》以及《氨基酸详表》

-

-

第二位碱基

第二位碱基

第二位碱基

第二位碱基

-

-

U

C

A

G

U

UUU(Phe/F)苯丙氨酸

UUC(Phe/F)苯丙氨酸

UUA(Leu/L)亮氨酸

UUG(Leu/L)亮氨酸

UCU(Ser/S)丝氨酸

UCC(Ser/S)丝氨酸

UCA(Ser/S)丝氨酸

UCG(Ser/S)丝氨酸

UAU(Tyr/Y)酪氨酸

UAC(Tyr/Y)酪氨酸

UAA(终止)

UAG(终止)

UGU(Cys/C)半胱氨酸

UGC(Cys/C)半胱氨酸

UGA(终止)

UGG(Trp/W)色氨酸

C

CUU(Leu/L)亮氨酸

CUC(Leu/L)亮氨酸

CUA(Leu/L)亮氨酸

CUG(Leu/L)亮氨酸

CCU(Pro/P)脯氨酸

CCC(Pro/P)脯氨酸

CCA(Pro/P)脯氨酸

CCG(Pro/P)脯氨酸

CAU(His/H)组氨酸

CAC(His/H)组氨酸

CAA(Gln/Q)谷氨酰胺

CAG(Gln/Q)谷氨酰胺

CGU(Arg/R)精氨酸

CGC(Arg/R)精氨酸

CGA(Arg/R)精氨酸

CGG(Arg/R)精氨酸

A

AUU(Ile/I)异亮氨酸

AUC(Ile/I)异亮氨酸

AUA(Ile/I)异亮氨酸

AUG(Met/M)甲硫氨酸(起始)

ACU(Thr/T)苏氨酸

ACC(Thr/T)苏氨酸

ACA(Thr/T)苏氨酸

ACG(Thr/T)苏氨酸

AAU(Asn/N)天冬酰胺

AAC(Asn/N)天冬酰胺

AAA(Lys/K)赖氨酸

AAG(Lys/K)赖氨酸

AGU(Ser/S)丝氨酸

AGC(Ser/S)丝氨酸

AGA(Arg/R)精氨酸

AGG(Arg/R)精氨酸

G

GUU(Val/V)缬氨酸

GUC(Val/V)缬氨酸

GUA(Val/V)缬氨酸

GUG(Val/V)缬氨酸

GCU(Ala/A)丙氨酸

GCC(Ala/A)丙氨酸

GCA(Ala/A)丙氨酸

GCG(Ala/A)丙氨酸

GAU(Asp/D)天冬氨酸

GAC(Asp/D)天冬氨酸

GAA(Glu/E)谷氨酸

GAG(Glu/E)谷氨酸

GGU(Gly/G)甘氨酸

GGC(Gly/G)甘氨酸

GGA(Gly/G)甘氨酸

GGG(Gly/G)甘氨酸

密码子反表

Ala

A

GCU,GCC,GCA,GCG

Leu

L

UUA,UUG,CUU,CUC,CUA,CUG

Arg

R

CGU,CGC,CGA,CGG,AGA,AGG

Lys

K

AAA,AAG

Asn

N

AAU,AAC

Met

M

AUG

Asp

D

GAU,GAC

Phe

F

UUU,UUC

Cys

C

UGU,UGC

Pro

P

CCU,CCC,CCA,CCG

Gln

Q

CAA,CAG

Ser

S

UCU,UCC,UCA,UCG,AGU,AGC

Glu

E

GAA,GAG

Thr

T

ACU,ACC,ACA,ACG

Gly

G

GGU,GGC,GGA,GGG

Trp

W

UGG

His

H

CAU,CAC

Tyr

Y

UAU,UAC

Ile

I

AUU,AUC,AUA

Val

V

GUU,GUC,GUA,GUG

起始

AUG

终止

UAG,UGA,UAA

中文名称

英文名称

短写

缩写

缬氨酸

Valine

V

Val

酪氨酸

Tyrosine

Y

Tyr

色氨酸

Tryptophan

W

Trp

苏氨酸

Threonine

T

Thr

丝氨酸

Serine

S

Ser

硒半胱氨酸*

Selenocysteine

U

Sec

吡咯赖氨酸*

Pyrrolysine

O

Pyl

脯氨酸

Proline

P

Pro

苯丙氨酸

Phenylalanine

F

Phe

蛋氨酸

Methionine

M

Met

赖氨酸

Lysine

K

Lys

亮氨酸

Leucine

L

Leu

异亮氨酸

Isoleucine

I

Ile

组氨酸

Histidine

H

His

甘氨酸

Glycine

G

Gly

谷氨酰胺

Glutamine

Q

Gln

谷氨酸

Glutamicacid/Glutamate

E

Glu

半胱氨酸

Cysteine

C

Cys

天冬氨酸

Asparticacid/Aspartate

D

Asp

天冬酰胺

Asparagine

N

Asn

精氨酸

Arginine

R

Arg

丙氨酸

Alanine

A

Ala

除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:

∙Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。

∙Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。

∙Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。

∙Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。

结构[编辑]

以下是标准遗传密码所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。

L-丙氨酸

(Ala?

/?

A)

L-精氨酸

(Arg?

/?

R)

L-天冬酰胺

(Asn?

/?

N)

L-天冬氨酸

(Asp?

/?

D)

L-半胱氨酸

(Cys?

/?

C)

L-谷氨酸

(Glu?

/?

E)

L-谷氨酰胺

(Gln?

/?

Q)

甘氨酸

(Gly?

/?

G)

L-组氨酸

(His?

/?

H)

L-异亮氨酸

(Ile?

/?

I)

L-亮氨酸

(Leu?

/?

L)

L-赖氨酸

(Lys?

/?

K)

L-蛋氨酸

(Met?

/?

M)

L-苯丙氨酸

(Phe?

/?

F)

L-脯氨酸

(Pro?

/?

P)

L-丝氨酸

(Ser?

/?

S)

L-苏氨酸

(Thr?

/?

T)

L-色氨酸

(Trp?

/?

W)

L-酪氨酸

(Tyr?

/?

Y)

L-缬氨酸

(Val?

/?

V)

L-硒半胱氨酸

(Sec?

/?

U)

L-吡咯赖氨酸

(Pyl?

/?

O)

主要化学性质[编辑]

以下的分子量是根据各元素的同位素在自然界的丰度所做的平均值。

此外由于形成肽键时,会减少一个水分子,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了18.01524Da。

氨基酸

分子量(Da)

pI

pK1(α-COOH)

pK2(α-+NH3)

丙氨酸

89.09404

6.01

2.35

9.87

半胱氨酸

121.15404

5.05

1.92

10.70

硒半胱氨酸

169.06

天冬氨酸

133.10384

2.85

1.99

9.90

谷氨酸

147.13074

3.15

2.10

9.47

苯丙氨酸

165.19184

5.49

2.20

9.31

甘氨酸

75.06714

6.06

2.35

9.78

组氨酸

155.15634

7.60

1.80

9.33

异亮氨酸

131.17464

6.05

2.32

9.76

赖氨酸

146.18934

9.60

2.16

9.06

吡咯赖氨酸

255.31

亮氨酸

131.17464

6.01

2.33

9.74

蛋氨酸

149.20784

5.74

2.13

9.28

天冬酰胺

132.11904

5.41

2.14

8.72

脯氨酸

115.13194

6.30

1.95

10.64

谷氨酰胺

146.14594

5.65

2.17

9.13

精氨酸

174.20274

10.76

1.82

8.99

丝氨酸

105.09344

5.68

2.19

9.21

苏氨酸

119.12034

5.60

2.09

9.10

缬氨酸

117.14784

6.00

2.39

9.74

色氨酸

204.22844

5.89

2.46

9.41

酪氨酸

181.19124

5.64

2.20

9.21

支链性质[编辑]

以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。

氨基酸

支链

疏水性

pKa

极性

电荷

芳香族

或脂肪族

范德瓦尔斯半径

丙氨酸

-CH3

X

-

-

-

-

67

半胱氨酸

-CH2SH

X

8.18

-

酸性

-

86

硒半胱氨酸

-CH2SeH

X

5.73

-

-

-

天冬氨酸

-CH2COOH

-

3.90

X

酸性

-

91

谷氨酸

-CH2CH2COOH

-

4.07

X

酸性

-

109

苯丙氨酸

-CH2C6H5

X

-

-

-

芳香性

135

甘氨酸

-H

-

-

-

-

-

48

组氨酸

-CH2-C3H3N2

-

6.04

X

弱碱性

芳香性

118

异亮氨酸

-CH(CH3)CH2CH3

X

-

-

-

脂肪性

124

赖氨酸

-(CH2)4NH2

-

10.54

X

碱性

-

135

吡咯赖氨酸

-C12H21N3O3

亮氨酸

-CH2CH(CH3)2

X

-

-

-

脂肪性

124

蛋氨酸

-CH2CH2SCH3

X

-

-

-

-

124

天冬酰胺

-CH2CONH2

-

-

X

-

-

96

脯氨酸

-CH2CH2CH2-

X

-

-

-

-

90

谷氨酰胺

-CH2CH2CONH2

-

-

X

-

-

114

精氨酸

-(CH2)3NH-C(NH)NH2

-

12.48

X

碱性

-

148

丝氨酸

-CH2OH

-

-

X

-

-

73

苏氨酸

-CH(OH)CH3

-

-

X

弱酸性

-

93

缬氨酸

-CH(CH3)2

X

-

-

-

脂肪性

105

色氨酸

-CH2-C8H6N

X

-

-

-

芳香性

163

酪氨酸

-CH2-C6H4OH

X

10.46

X

-

芳香性

141

基因表达与生物化学[编辑]

氨基酸

短写

缩写

密码子

在蛋白质中

出现频率(%)

对人类的必需性

丙氨酸

A

Ala

GCU,GCC,GCA,GCG

7.8

-

半胱氨酸

C

Cys

UGU,UGC

1.9

-

硒半胱氨酸

U

Sec

UGA

-

天冬氨酸

D

Asp

GAU,GAC

5.3

-

谷氨酸

E

Glu

GAA,GAG

6.3

-

苯丙氨酸

F

Phe

UUU,UUC

3.9

X

甘氨酸

G

Gly

GGU,GGC,GGA,GGG

7.2

-

组氨酸

H

His

CAU,CAC

2.3

-

异亮氨酸

I

Ile

AUU,AUC,AUA

5.3

X

赖氨酸

K

Lys

AAA,AAG

5.9

X

吡咯赖氨酸

O

Pyl

UAG

亮氨酸

L

Leu

UUA,UUG,CUU,CUC,CUA,CUG

9.1

X

蛋氨酸

M

Met

AUG

2.3

X

天冬酰胺

N

Asn

AAU,AAC

4.3

-

脯氨酸

P

Pro

CCU,CCC,CCA,CCG

5.2

-

谷氨酰胺

Q

Gln

CAA,CAG

4.2

-

精氨酸

R

Arg

CGU,CGC,CGA,CGG,AGA,AGG

5.1

-

丝氨酸

S

Ser

UCU,UCC,UCA,UCG,AGU,AGC

6.8

-

苏氨酸

T

Thr

ACU,ACC,ACA,ACG

5.9

X

缬氨酸

V

Val

GUU,GUC,GUA,GUG

6.6

X

色氨酸

W

Trp

UGG

1.4

X

酪氨酸

Y

Tyr

UAU,UAC

3.2

-

终止编码

-

Term

UAA,UAG,UGA

-

-

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