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医学文献检索课后复习.docx

1、医学文献检索课后复习医学信息资源检索与利用信息调研报告一、研究课题名称英文:The role of Expression of GPR30 in Breast Cancer研究课题的确立过程:登陆国家自然科学资金委员会查看最近的研究进展,在项目优秀成果中找到感兴趣的研究领域雌激素受体与乳腺癌,然后到CNKI搜索有关雌激素受体与乳腺癌的综述或进展,按时间排序,下载感兴趣的综述,再从综述中找到研究的热点GPR30,初步确立研究课题GPR30在乳腺癌中的表达与意义(附图如下)图1.2 CNKI搜索相关综述或进展图1.3 从综述中获取感兴趣课题二、 做本次课题调研达到的目的: 1) 探讨GPR30在乳

2、腺癌中的表达及作用的具体机制,以及其在乳腺癌耐药机制中可能的作用,以便为乳腺癌临床的药物的筛选研究,以及检查诊断及预后提供理论依据; 2)所检索到密切相关的全文至少不少于一个; 3) 学会如何用文献信息检索工具对研究课题进行检索,为以后的科研工作打下基础。 三、 围绕课题目的,选择相关资源(至少三个)并描述相关检索过程(可抓图)(一)资源名称本次调研拟采用文摘型数据库、引文数据库和全文数据库进行检索。具体如下:SinoMed、PubMed、Web of Science、CNKI(二)检索词 1. 检索词的确立过程根据研究课题,进行拆词以确定检索词。研究课题可拆成:GPR30/在/乳腺癌/中/表

3、达/的/作用/和/意义。首先,可去掉虚词和介词“在”,“中”,“的”,“和”。其次,去掉含义相近或者相包含的词:“表达”涵盖了“作用”和“意义”,因此去掉“作用”和“意义”;而GPR30作为一种雌激素受体,必须由细胞表达才能发挥作用,因此去掉“表达”。最后,只剩下“GPR30”及“乳腺癌”。GPR30作为一种比较新研究的蛋白,尚没有其对应的主题词,只有其全称G 蛋白偶联蛋白(G protein-coupled receptor 30),因此以GPR30、G 蛋白偶联蛋白和G protein-coupled receptor30作为关键词,而对“乳腺癌”的研究时间比较长,有其专门的主题词,因此以

4、“乳腺癌”作为主题词。2. 检索词的获取 利用SinoMed主题词检索获得“乳腺癌”中英文检索词(图3.2.1):图3.2.1 SinoMed主题词检索获取检索词 利用CNKI翻译助手获得“乳腺癌”的英文检索词(图3.2.2):图3.2.2 CNKI翻译助手获得“乳腺癌”的英文检索词 最终确定检索词为:1)中文检索词:G蛋白偶联受体30、GPR30、乳腺癌、乳腺肿瘤、乳腺瘤、乳腺癌症2)英文检索词:G protein-coupled receptor 30、GPR30、 breast cancer、breast neoplasm、breast tumor、cancer of breast、br

5、east carcinoma、carcinoma mammae、mastocarcinoma、mammary cancer(三)检索式1.基本检索:1)中文检索式:(G蛋白偶联受体30 OR GPR30) AND (乳腺癌 OR 乳腺肿瘤 OR 乳腺瘤 OR 乳腺癌症)2)英文检索式:PubMed:(gpr30 OR G protein-coupled receptor 30) AND (breast neoplasms OR (breast AND neoplasms) OR breast neoplasms OR (breast AND cancer) OR breast cancer)2

6、.高级检索1)SinoMed:在高级检索界面构建表达式:(GPR30常用字段:智能) OR G蛋白偶联受体30常用字段:智能) AND 乳腺癌常用字段:智能进行检索,得到详细检索表达式:(GPR30常用字段 OR G蛋白偶联受体30常用字段) AND (乳腺癌常用字段 OR 乳腺肿瘤常用字段 OR 乳腺癌症常用字段 OR 乳腺瘤常用字段 OR 乳腺肿瘤主题词);2)PubMed:选择“Advanced”检索入口进入高级检索界面,构建表达式:GPR30All fields AND “breast cancer” All fields进行检索。接着构建表达式:G protein-coupled r

7、eceptor 30All field AND “breast cancer” All fields进行检索。最后将两次检索结果用“OR”并起来进行检索。3)Web of Science:首先在检索界面构建表达式: GPR30主题 AND “breast cancer”主题进行检索,接着用G protein-coupled receptor 30All field AND “breast cancer” All fields进行检索。紧接着在高级检索界面检索历史处将两次检索用“AND”发送到检索框进行高级检索。4)CNKI:在高级检索界面构建表达式:(GPR30主题或含G protein-co

8、upled receptor 30精确)并含(乳腺癌主题模糊)进行检索。(四)检索途径及检索结果SinoMed1. 基本检索图3.4.1基本检索结果 直接在检索框内输入检索式子(G蛋白偶联受体30 OR GPR30) AND (乳腺癌 OR 乳腺肿瘤 OR 乳腺瘤 OR 乳腺癌症)即可进行检索。检索结果:所得检索记录为9条,其中核心期刊6条,中华医学会期刊2条,循证文献0条。有4篇题名不含“乳腺癌”但内容相关,1篇为英文文献。全部与主题相关。2. 高级检索图3.4.2高级检索 检索结果:与基本检索结果相同。所得检索记录为9条,其中核心期刊6条,中华医学会期刊2条,循证文献0条。有4篇题名不含“

9、乳腺癌”但内容相关,1篇为英文文献。全部与主题相关。3. 主题词检索3.4.3主题词检索结果由于GPR30没有主题词,所以先在主题词检索界面查找“乳腺癌”主题词,然后发送到检索框进行主题词检索,接着在检索结果框中输入“GPR30 OR G蛋白偶联受体30”进行二次检索。检索结果:所得检索记录为5条,其中核心期刊3条,中华医学会期刊1条,循证文献0条。有2篇题名不含“乳腺癌”但内容相关,1篇为英文文献。全部与主题相关。PubMed1. 基本检索 直接在检索框内输入检索式子(GPR30 OR G protein-coupled receptor 30) AND (breast neoplasms

10、OR (breast AND neoplasms) OR breast neoplasms OR (breast AND cancer) OR breast cancer)进行检索。图3.4.4 PubMed基本检索结果检索结果:所得检索记录为91条.其中有些文章只含“GPR30”不含“breast cancer”或者只含“cancer”,所得检索结果并非完全与主题相关2. 高级检索图3.4.5 PubMed高级检索界面 在高级检索界面,构建表达式:GPR30All fields AND “breast cancer” All fields进行检索。接着构建表达式:G protein-coup

11、led receptor 30All field AND “breast cancer” All fields进行检索。最后将两次检索结果用“OR”并起来进行检索。图3.4.6 PubMed高级检索结果 检索结果:与基本检索结果相同。所得检索记录为73条。大部分与主题相关.将检索结果限定在Title/Abstract后,得到检索结果为72条,相关性较好。3. 主题词检索3.4.6主题词检索结果在MeSH主题词检索界面输入“breast cancer”检索,浏览选词,确定“breast cancer”的规范化主题词为“Breast Neoplasms”,点击显示该主题词的详细信息,点选“Rest

12、riction Search to Major Topic headings only”,然后发送到检索框进行检索,最后在高级检索界面的检索历史中用布尔逻辑运算并上GPR30 OR G protein-coupled receptor 30(限定在标题或摘要)进行检索。检索结果:所得检索记录为51条,检索结果相对更加准确。Web of Science1. 高级检索图3.4.7 “breast cancer”及同义词检索 由于Web of Science不设主题词,因此在检索时要考虑同义词。首先在检索界面输入“breast cancer”,检索范围设定为“主题”,然后在提问框中逐个输入“brea

13、st cancer”的同义词,并用OR连接起来进行检索,具体如图3.4.7接着在检索界面输入“GPR30” OR G protein-coupled receptor 30,检索范围限定为主题进行检索。然后在高级检索界面的检索史中将两次检索策略用“AND”并起来发送到检索框进行检索。图3.4.8高级检索图3.4.8高级检索检索结果:所得检索记录为237条.其中有些文章只含“GPR30”不含“breast cancer”或者只含“cancer”,所得检索结果并非完全与主题相关.对检索进一步进行限制,把检索词限定在题目,最终得到的检索记录为31条,相关性高(图3.4.9)。图3.4.9高级检索(检

14、索词限定在标题)2、作者检索 首先对所得的31条检索结果按作者排序进行分析,发现MAGGIOLINI M发表的文章有6篇,相对比较多(图3.4.10)。因此以MAGGIOLINI M进行作者检索,限定为“仅限精确匹配”。图3.4.10 按作者排序分析结果图3.4.11 作者检索结果检索结果:所得检索记录为81条.其发表的文章大多集中在G蛋白偶联雌激素受体与肿瘤的关系这一研究领域。CNKI1. 基本检索 直接在检索框内输入检索式子(G蛋白偶联受体30 OR GPR30) AND (乳腺癌 OR 乳腺肿瘤 OR 乳腺瘤 OR 乳腺癌症),限定在主题范围,进行检索(图3.4.12)。检索结果:所得检

15、索记录为88条,但相关性不高。检索结果中亦包括了英文文献。图3.4.12基本检索结果2. 高级检索图3.4.13高级检索结果CNKI:在高级检索界面构建表达式:(GPR30主题或含G protein-coupled receptor 30精确)并含(乳腺癌主题模糊)进行检索(如图3.4.13)。 检索结果:所得检索记录为15条。13与主题相关,有两条内容并不是涉及GPR30与乳腺癌的关系。(六)记录数:基本检索高级检索主题词检索SinoMed995PubMed917251Web of Science-31-CNKI8815-(七)密切关系文献(1条):1)SinoMed:GPR30及其信号通路

16、在乳腺癌中的研究进展2)PubMed:Estrogen receptor GPR30/GPER1 and its role in breast cancer3)Web of Science:Role of GPR30 in endometrial pathology after tamoxifen for breast cancer4)CNKI:GPR30在原发及复发性乳腺癌中的表达和意义四、相关信息分析与管理1 对获取的信息如何进行有效的管理1) 前准备:将四个库由高级检索所获得的结果依次导入文献管理软件NoteExpress中新建的同一子目录,得到125条记录。首先对题录进行查找重复记录,

17、结果显示有七条题录重复,包括一条英文,6条中文。接着删除重复题录。删除后剩下118条重复题录.2) 标记文献:逐篇浏览题录信息,采用插旗子或者星标的方法为题录设置优先级,依次包括非常高、高、普通、低、非常低五个等级。3) 做笔记:在组织优先级目录下重点阅读“非常高、高、普通”的题录摘要信息,并做笔记4) 批量下载全文:下载优先级为“非常高、高、普通”的全文。英文题录选Elsecier、SpringerLink、Science、The Lancet等数据库下载,中文题录选CNKI、万方、维普等中文数据库下载。5) 题录统计:选中文件夹单击右键文件夹统计信息分别按年份、作者、期刊字段统计题录信息,

18、查看该研究领域的研究动态、高产作者、核心期刊,一遍进一步进行检索结果如图(3.4.14)。图4.1文件夹统计信息 6)文章撰写:当所有工作准备完毕后,就可以撰写文章,当需要引用文献的时候,将光标置于需插入引文处,利用word里的NE插件,将所需引用文献直接导入文章中。2 如何分析相关信息,满足调研的目标1) Web of Science中可对检索结果进行分析和创建引文报告。其中检索结果分析可选用多个字段进行分析,本研究课题采用“作者”字段进行分析以查看该研究领域的高产作者,结果如图3.4.10,然后进一步检索该作者出版的文章,丰富资料来源.引文报告结果如图3.4.14,从中可以看出哪些文章是比

19、较热门的。图4.2文件夹统计信息2)利用GoPubMed对PubMed的检索结果进行分析,可按出版年份、出版国家、核心期刊、高产作者、主题词、高产作者间的合作等进行分析。以便挖掘高产作者、核心期刊和热门主题词等,从而进一步进行检索,得到更多有用信息。对出版年份、出版国家进行分析 按主题词的研究情况排序 显示高产出作者间的合作关系显示相关研究的时间变化图4.3 对PubMed检索结果进行分析图4.4 SinoMed结果统计 3) SinoMed可以在检索结果右栏直接进行统计分析,分别查看主题、学科、期刊、作者、时间地区,以便我们深入了解这一研究领域的发展状况,进一步细化研究课题。4)CNKI可以在检索结果直接按被引次数进行排序,方便了解文章的热度。 图4.5 CNKI按被引次序进行排序

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