1、1234567TimeTMBV010.5810H2O2163264、实验,密码为 5 个1、打开酶标仪(开关在仪器后部,若仪器没反应,请检查电源是否接通)0,按 Enter 键进入系统。电脑开机,密码为 mby-nano ,双击酶标仪软件图标,出现登录框,直接点 击“登 录”,进入酶标仪 控制界 面选择“铁动力学” (波长为 650nm)板1,若底物为 TMB ,选择模打开电脑内置时钟若 底 物 为 ABTS , 则 检 验 项 目 选 择 “ gg ”( 波 长 为 405nm )新建一个 word 文档,以日期命名,打开。2、加样 :96 孔板从左至右编号为 1-12,自上而下编号为 A-
2、H 。以 TMB 为例,从第 1 列加样:1从 A1 至 H1 ,每孔加 200L NaAc/HAc Buf ;2从 A1 至 H1 ,每孔加 10L 催化剂(每加一个孔,换一次枪头,加样时用枪头搅匀反 应体系);3从 A1 至 H1 ,每孔分别加不同体积( 0,0.5,1,2,4,6,8,10L)TMB (每加一 个孔,换一次枪头,加样时用枪头搅匀反应体系) ;4用排枪吸取 32L H2O2加入 A1至 H1,快速放入酶标仪中,点击“读板” ,记下读板 时间(如下表所示,假设第一次读板时间为 09:00: 00)003001:02:03:用排枪加 H2O2时, 注意检查枪头是否插紧 ,否则会
3、导致吸取 H2O2的量不足。亦可先 将 96 孔板放入酶标仪,再加 H2O2,这样可以节约时间。每次读板出来结果后,点击“结果 入库” “是” “确定”,按下“ PrintScreen ”键,点击“退出” ,打开 word 文档, ctrl+V 或者右击选“粘贴” ,保存结果,要留意下次读板的时间。若遗漏某个模板没有保存, 可点击“查询结果” ,下拉框中选择目的模板编号即可。 (现已可以直接拷吸光值读取数据,按 ctrl 键点击该处文字见方法 )3、第一组数据保存后,将第一组的反应液倒掉,用卷纸将边上的液体擦干。第二、三、 四组同第一组的操作。保存所有数据,拷贝到 U 盘里,整理实验台,关掉酶
4、标仪、空调和 电脑。4、若当天不再继续实验,将 24 孔板中剩余的 H2O2 倒掉,用清洁剂洗后,再用二次水 冲洗一次,放入烘箱中烘干。移液枪放回原处,催化剂、底物和 H2O2 放入冰箱中保存。三、数据处理1、打开 Origin6.1 ,点击右上角的“ Add New Column ”(箭头所指)2、输入数据:命名各列, X 列命名为时间,单位 s, 8 个 Y 列分别为 8 个孔的编号。 X 列时间从 0-180s,0 s对应微孔板编号 1的数据, 30 s对应 code2 的数据,以此类推,将所 读数据输入。点击“ file“ Save Project As”保存文件名为 “第一组”3、数
5、据输入完成后, 选择 X 和 Y 列, 点击左下角的 “点图” 标志(箭头所指)Fit Linear 作 线 性 拟 合在结果对话框里, 拟合的方程为 Y=A+B*X ,B 的值为拟合得出的斜率即反应的初速度 V同样方法得出不同 TMB 体积对应的反应初速度 V ,记录数据:0.007140.009020.011620.014250.015970.015470.017同样方法得出第二、三、四组的反应初速度 V ,记录数据。4、新建 New Project ,数据表 1中命名 X列为底物( TMB )浓度,列中数据为 A-H 对应的 孔中 TMB 的物质的量浓度(一般用 moL/L );挑选三组
6、比较好的初速度 V ,输入 Y 列选中初速度 V 的三列,右击Statistics on Rows,得出数据表 2,选定 Mean 和 sd 列中的值,右击复制,粘贴至数据表1中选定 X 列、 Mean 列和 sd 列,画点图点击 Analysis Non-linear Curve Fit ,作非线性拟合拟合的方程为米氏方程 y=P1*x/(P2+x) ,y 为反应初速度, x 为底物浓度, P1为 Vmax 值, P2 为米氏常数 Km 值(若软件中没有此方程,可点击 New 新建方程,之后也可点击 Edit可双击 X 或 Y 轴修改坐标轴名称点 击 Start Fiting , 得 出 对
7、 话 框点击图上方的“ T ”标志5、保存结果。6、计算 Kcat 值Kcat 表示每个酶分子在单位时间内催化底物的分子数,反应了酶催化能力的大小。根 据下面的公式计算:v 的单位为 Ms-1;vmax为非线性拟合得出的值,单位为 s-1;=39000M -1 cm-1;l为反 应体系的高度, 96 孔板每个孔的高度为 1cm,每个孔的容积为 300L,可根据反应体系的 平均体积占 300L 的比例来计算反应体系的高度; E为催化剂的浓度,单位为 M;m 为催 化剂的质量,可根据加入催化剂的体积和催化剂溶液的浓度计算得出; r 为催化剂粒子的半 径,以透射电镜测出的粒径计; 为催化剂的密度,单
8、位为 g/cm-3;N A 为阿伏伽德罗常数, 值为 6.021023; V 为反应体系的平均体积; Kcat 单位为 s-1。附:直接拷数据方法:1. 每次读板后,数据结果入库,待全面测完,按照当天的日期在桌面的 DATA 文件夹中 查找自己的数据, 格式为记事本, 如 20100825.txt ,该文件拷入自带 u 盘。2.选中该记事本文件,右击打开方式,选择用写字板打开,如图打开后如下:3.按 ctrl+A ,将写字板文件中全面数据选中,复制,新建一个 word 文档, 粘贴。4.选中某一列数据:先将鼠标指针放在该列数据的第一个数据前面,然后按住alt 键,向右下方拖动,直到黑色黑色区域将该列数据全面覆盖,注意不要覆盖其他数据,如图:5.选中之后先松开鼠标, 再松开 alt 键,选中后不要点击鼠标 (左右键都不要点) ,按 ctrl+c 复制该列数据。6.打开 origin 软件,选中某列, 按 ctrl+v 即可将该列数据拷入选中列, 如图:7.友情提示:在直接拷取数据时,如遇到不能直接拷入 origin 中时,可在 word 中插入 表格, 选中表格中一行或一列, 将从 txt 中复制的数据粘贴进去, 再在表格中重新选中数据, 复制,即可一一对应的拷入 origin 中的表格中。
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