pubmed检索方法与技巧.ppt

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刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部,PubMed生物医学数据库检索方法与技巧,主要内容,PubMed概况PubMed数据来源PubMed检索机制PubMed检索运算符PubMed检索方法结果的显示、打印、保存其他辅助功能,1.PubMed概况,创建机构:

美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)1997年6月开始向全球开放特色:

具有收录范围广(免费)、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点,部分文献还可在网上直接免费获得全文。

2.PubMed数据来源,MEDLINE:

pubmed-indexedformedlineInProcessCitations:

每天收录,尚未经规范处理的数据。

pubmed-inprocessPublisher-SuppliedCitations:

由出版商提供的电子文献,每条记录标有PubMed-assuppliedbyPublisher。

3.PubMed检索机制,自动转换匹配功能(AutomaticTermMapping)LeukemialeukaemiaAllFieldsORleukemiaMeSHTermsORleukemiaAllFields,对于输入的检索词,PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换,再进行检索。

词表匹配转换顺序是:

MeSH表期刊刊名表短语表作者索引如果在以上4个表中都找不到相匹配的词,PubMed将把短语分开,以单词为单位,分别重复以上的过程,检索时各个词之间是AND逻辑关系。

如果仍找不到相匹配的词,则用单个词在所有字段查找,各个词之间也是AND逻辑关系。

3.1自动转换匹配功能,人重组三叶因子(humanrecombinanttrefoilfactor),(humansMeSHTermsORhumansAllFieldsORhumanAllFields)ANDrecombinantAllFieldsAND(trefoilfactorSupplementaryConceptORtrefoilfactorAllFields),4.PubMed检索运算符,逻辑运算符,逻辑运算符,逻辑“与”运算AND:

检索式写成AandB,表示文献中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献。

AIDSandtherapy逻辑“或”运算OR:

检索式写成AorB,表示包含检索词A的文献或者包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。

AIDSorAcquiredImmunodeficiencySyndrome逻辑“非”运算NOT:

检索式写成AnotB,表示包含检索词A同时不包含检索词B的文献为命中文献。

HepatitisnotAnimal,IP地址:

http:

/pubmed.gov,PubMed网址,基本检索,高级检索,主题检索,临床咨询,临床实验,5.PubMed检索方法,5.1基本检索5.2高级检索5.3主题检索5.4临床咨询,5.1基本检索,默认检索字段为主题、作者、期刊,关键词、词(词组)或短语:

输入任意关键词:

livercancer、Lungcancer;带有双引号”作为短语检索:

”cancertherapy”;带有连接号”-”作为一个词组检索(英文可以,中文不行):

interleukin-6。

限制检索字段:

如livercancerti作者:

SmithJ、仅知道作者姓,则必须加上字段标识,如:

Smithau2002年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索如:

JoshuaLederberg,5.1基本检索,期刊刊名:

可用期刊全称:

GENETHERAPYTA;可用期刊简称:

JAMATA;(TheJournaloftheAmericanMedicalAssociation)复杂表达式:

livercancerANDtherapy带有摘要文献的检索:

livercancerANDhasabstract,5.1基本检索,分析该检索课题,包含两个方面:

肝癌:

livercancer;酒精:

alcohol两个主题之间的逻辑关系是AND,即livercancerANDalcohol,基本检索举例:

肝癌和酒精的关系,基本检索举例:

肝癌和酒精的关系,输入:

livercancerANDalcohol,“肝癌和酒精的关系”的基本检索结果,5.2高级检索,高级检索,5.2高级检索,5.2高级检索,分析该检索课题,包含两个方面:

作者为:

马大龙(madl);作者单位为:

北京大学(pekinguniversity)。

高级检索举例:

北京大学医学部马大龙教授发表的文献,高级检索举例:

北京大学医学部马大龙教授发表的文献,输入:

madl,输入:

pekinguniversity,高级检索举例:

北京大学医学部马大龙教授发表的文献,5.3主题检索,根据medline数据主题标引的规范性,利用主题词进行的研究,对提高查全率、查准率会有相当的帮助。

点击MeSHDatabase打开主题检索界面,高级检索,主题检索,基本检索,5.3主题检索,主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,分析该检索课题,有2个概念:

长春新碱(Vincristine)、白血病(leukemia):

对长春新碱来说是利用其治疗疾病,故其应组配副主题词“治疗应用(therapeuticuse)”;对白血病来说是利用药物来治疗,故其应组配副主题词“药物疗法(drugtherapy)”。

同时这两个概念之间是AND的关系。

主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,第1步:

检索长春新碱/治疗应用,主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,第1步:

检索长春新碱/治疗应用,主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,第1步:

检索长春新碱/治疗应用,副主题词,主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,第1步:

检索长春新碱/治疗应用,主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,第1步:

检索长春新碱/治疗应用,主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,第2步:

检索白血病/药物疗法,主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,第2步:

检索白血病/药物疗法,主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,第2步:

检索白血病/药物疗法,主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,第2步:

检索白血病/药物疗法,主题检索举例:

长春新碱(Vincristine)治疗白血病(leukemia)的文献,5.4临床咨询和系统评价,可以使用户方便快捷地检索到有关临床方面的文献,如临床疾病的诊断、治疗、病因和预后等;也可以用它来检索临床实践过程中遇到的一些具体问题,如系统性综述、元分析、临床试验、循证医学、实践指导以及有关遗传学方面的问题等。

5.4临床咨询和系统评价,临床咨询,系统评价,检索医学遗传学研究方面的文献,6.结果的显示、打印、保存,显示保存、打印,6.1结果的显示,显示格式:

系统提供的显示格式很多,一般较常用的有以下4种:

(1)Summary:

为默认显示格式。

显示的信息包括文献的标题、著者、出处、PMID、综述出版类型、非英文文献的原文语种等。

(2)Abstract:

显示信息除了文献标题、著者、出处等基本信息外,还包括摘要信息,以便用户了解文献详细内容。

(3)MEDLINE:

以MEDLINE数据库的记录格式来显示检索结果。

字段内容主要包括PMID、题目、摘要、作者、作者地址、语种、出版类型、出处、MeSH、文献ID、出版状态等。

6.1结果的显示,6.1结果的显示,6.1结果的显示,保存记录在“sendto”下拉菜单中选择“File”,可完成将记录保存为文件。

选择“E-mail”,则可将结果发送至邮箱。

在检索结果显示页面可将某一次检索的全部记录或标记记录保存;而“Clipboard”页面可用于保存一次或多次检索的结果记录。

6.2检索结果的保存,6.2检索结果的保存,6.2检索结果的保存,6.2检索结果的保存,7其他辅助功能,7.1检索策略的存储和调用7.2全文链接7.3相关文献链接,7.1检索策略的存储和调用,使用MyNCBI(Cubby)首先要登记注册保存检索策略(savesearch)定期浏览新的检索结果(注册时设置,自动按照检索式定期重新检索出文章),7.2全文链接-摘要格式显示,7.2全文链接-打开单篇详细页面,7.3相关文献链接,7.3相关文献链接,EstrogenReceptorsgenepolymorphismCardiovasculardisease,Oculartuberculosis(副主题词:

并发症)Blindness(副主题词:

并发症),检索有关“医院水净化管理”方面的总数文献ReviewWaterpurification(检索时两个关键词水净化和医院管理),检索练习,眼结核(OcularTuberculosis)引起失明(Blindness)的文献年代限定19992008年检索有关“医院水净化(WaterPurification)管理”方面的综述文献,Questions?

Thanks!

电话:

82801292-608,

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