一株异养硝化细菌的分离鉴定及其亚硝化作用研究讲解.docx
《一株异养硝化细菌的分离鉴定及其亚硝化作用研究讲解.docx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《一株异养硝化细菌的分离鉴定及其亚硝化作用研究讲解.docx(17页珍藏版)》请在冰点文库上搜索。
一株异养硝化细菌的分离鉴定及其亚硝化作用研究讲解
农业环境科学学报2008,27(3):
1146-1150
JournalofAgro-EnvironmentScience
一株异养硝化细菌的分离鉴定及其亚硝化作用研究
王成林1,2,周巧红1,王亚芬1,2,梁
威1,吴振斌1
(1.中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室,湖北武汉430072;2.中国科学院研究生院,北京100039)
摘要:
从复合垂直流人工湿地表层基质中分离出一株硝化活性较强的异养硝化细菌H-1,进行biolog菌种鉴定,鉴定系统中没有
与该菌株特性相似的数据记录。
16SrDNA的序列分析结果显示,菌株H-1与产碱杆菌属(Alcaligenes)粪产碱杆菌(A.faecalis)有98%相似性,认为分离菌株H-1可能为AlcaligenesA.faecalis。
通过4因素3水平的正交试验,结果显示,当温度为30℃,pH为7.5,接种量为107CFU,溶氧2.25mg・L-1时,该菌株亚硝化反应效果最佳;影响亚硝化反应效果的因素顺序为:
溶氧>温度>pH>接种量;温度和溶氧影响极显著,pH和接种量影响相对不显著。
关键词:
人工湿地;异养硝化细菌;16SrDNA;正交试验中图分类号:
X172
文献标识码:
A
文章编号:
1672-2043(2008)03-1146-05
StudiesontheIdentificationandNitrosificationofaHeterotrophicNitrifierBacterialStrain
WANGCheng-lin1,2,ZHOUQiao-hong1,WANGYa-fen1,2,LIANGWei1,WUZhen-bin1
(1.StateKeyLaboratoryofFreshwaterEcologyandBiotechnology,InstituteofHydrobiology,ChineseAcademyofSciences,Wuhan430072,China;2.GraduateSchooloftheChineseAcademyofSciences,Beijing100039,China)
Abstract:
Astrainofheterotrophicnitrifier,namedH-1,whichhadhighernitrificationpotential,wasisolatedfromthesurfacelayersoftheintegratedverticalflowconstructedwetland.TheidentificationresultofBiologMicrobialIdentificationSystemindicatedthattherewerenosimilarrecordsastheisolatedbacterialstraininthesystem.Thephylogeneticanalysisbasedon16SrDNAsuggestedthatthebacterialstrainwas98%homologyatthenucleotidelevelcomparedwith16SrDNAofAlcaligenesfaecalis.ItwasthoughtthatbacterialstrainH-1waspos-siblyAlcaligenesA.faecalis.Orthogonalexperimentsoffourfactorsandthreelevelsweredesignedtoscreenouttheoptimumnitrosificationcondition.Theexperimentresultsindicatedthatthenitrosificationeffectwasoptimalwhenthetemperature,pH,inoculationquantitiesand
・L-1,respectivly.SortingOrderofthefactorsonthenitrosificationeffectwasdissolveddissolvedoxygenwere30℃,7.5,107CFUand2.25mg
oxygen>temperature>pH>inoculationquantities;Theinfluencesoftemperatureanddissolvedoxygenonnitrosificationeffectwerehighlysignificant,buttheinfluencesofpHandinoculationquantitiesonnitrosificationeffectwererelativelyinsignificant.Keywords:
constructedwetland;heterotrophicnitrifier;16SrDNA;orthogonalexperiments
废水生物脱氮是目前水处理领域关注和研究的热点。
关于异养硝化作用,虽然目前仍有很多机理未得到解释,对一些现象的解释也不尽圆满,但异养硝化作用的重要性日益受到关注[1 ̄4]。
相对于自养硝化菌而言,异养硝化细菌的分解效率较低,但是由于它们在环境中的数量以及生长速率上往往远大于自养菌,
收稿日期:
2007-09-18
基金项目:
国家“十五”科技项目(2002AA601021);国家杰出青年基金
项目(39925007);湖北省科技攻关重大项目(2006AA305
因此在某些环境之中,异养硝化细菌作用的贡献可以与自养菌相当。
在人工湿地系统中,微生物的硝化、反硝化作用在氮的去除中有重要作用[5],根据Oost-
rom报道人工湿地系统对氮的去除,从贡献上看依次
为:
微生物降解>基质吸附>植物的吸收[6]。
硝化作用是指将NH3-N氧化为NOx--N的生物化学反应,包括
亚硝化反应和硝化反应两个步骤。
本试验拟从人工湿地系统中分离能进行异养硝化反应的菌株,并通过正交试验试图找出影响亚硝化反应效果的主要因素和最佳条件,从微生物角度来说,丰富了高效菌种库,为提高湿地处理效率和强化湿地的功能提供技术支持,
A03)
作者简介:
王成林(1979—),男,湖北浠水人,硕士研究生,研究方向为
环境微生物。
E-mail:
wclhznydx@tom.com
通讯作者:
吴振斌
E-mail:
wuzb@ihb.ac.cn
第27卷第3期农业环境科学学报1147
并为湿地人工强化技术提供了理论依据。
1材料和方法
1.1采样位点
取自中国科学院水生生物研究所复合垂直流人工湿地系统表层基质,采样方法采用梅花布点法,样品混合后立即置于4℃下保存。
AGACTTTGATCCTGGCTCAG;1492r:
CGGCTACTTGT
L,其中包括TACGACTTC。
PCR反应体系为25μ
0.5μLdNTP(2.5mmol・L-1),正反向引物各0.5μL
(2.5μ・缓冲液,MgCl21.5μmolL-1),2.5μL10×L(25m・・molL-1),0.5μLTaq聚合酶(2UμL-1),18μL无菌去
离子水,2μLDNA;各成分充分混合后,进行如下反应:
94℃预变性5min,再进行40个循环,94℃变性30s,50℃复性30s,72℃延伸120s,最后72℃延伸
1.2异养硝化细菌的分离筛选1.2.1选择性培养基组成
乙酰胺2g,NaOH1.6g,KH2PO48.2g,MgSO4・
10min。
PCR产物用1%琼脂糖进行电泳,EB染色,扫
描成像。
结果分析:
DNA序列同源性分析在NCBI(NationalCentreforBiotechnologyInformation)网站参(http:
//www.ncbi.nlm.nih.gov)采用Blast软件检索。
考序列取自Genbank,EMBL(EuropeanMolecular
7H2O0.5g,KCl0.5g,CuSO4・5H2O0.5mg,CaSO4・
・・2H2O0.5mg,ZnSO47H2O0.5mg,FeCl36H2O0.5mg,
用蒸馏水定容至1L,pH7.0。
1.2.2富集培养
取基质样品10g于盛有250mL灭菌选择性培养液的锥形瓶中,在恒温震荡培养箱中富集培养7d,・温度设置为30℃,转速100rmin-1。
BiologyLaboratory),DDBJ(DNADataBankofJapan)等
数据库。
并将搜寻到的同源序列用ClustalX[8]软件进
行序列排序,然后用Mega3.1[9]软件进行系统进化树构建和分析。
1.2.3细菌的分离与纯化
吸取富集培养液10mL加入到盛有100mL无菌蒸馏水的250mL锥形瓶中,于恒温振荡器上以100r・min-1转速,在30℃下振荡4h,进行稀释涂布,于
进行3次纯化与分离。
形成生化培养箱30℃下培养。
单菌落后,依据不同的形态、质地、边缘、光学特性和颜色,初选出21株纯菌株,斜面保存,用于进一步硝化活性检验。
1.4异养硝化细菌硝化效果的正交试验设计
1.4.1样品的配备
挑取一接种环H-1细菌菌苔于上述液体培养基中扩大培养7d,在无菌条件下取100mL处于对数生
・长期的实验菌液以3000rmin-1的转速离心8min,去
除上清液,用无菌水冲洗后再离心,重复3次,最后用无菌水配成5mL的菌悬液用于试验定量接种备用。
1.4.2正交试验营养溶液配方
为了研究纯化菌株在好氧条件下的亚硝化作用效果,进行亚硝态氮监测,实验中应用培养基的具体配比见表1。
1.2.4硝化活性验证
将斜面上生长的菌苔用接种环挑取适量接种用于硝化活性鉴定[7],将具有硝化活性的细菌用石蜡液封保藏备用。
1.4.3控制因素选择
本试验为了研究异养硝化细菌亚硝化作用效果,设计L9(34)正交试验,共4因素:
温度、接种量和pH、溶解氧,分别编号为A、B、C、D,取3个水平:
温度(T)取
1.3菌种鉴定
1.3.1biolog分析
采用美国产biolog微生物全自动分析仪,挑选一株硝化活性较强的细菌H-1进行biolog菌种鉴定。
1.3.216SrDNA序列分析
用CTAB方法提取该细菌H-1的DNA,并进行PCR扩增。
细菌通用引物27f-1492r序列:
27f:
20℃、25℃、30℃,pH取4.5、7.5、8.0,接种量取107CFU,
・108CFU,109CFU,溶氧(DO)1.16、2.25、3.76mgL-1。
1.4.4试验装置和监测方法
试验主体装置为3个可控温摇床,10个500mL
表1营养溶液成分配比列表
Table1theaverageconcentrationofsubstratesincultureinthebatchtest
1148王成林等:
一株异养硝化细菌的分离鉴定及其亚硝化作用研究
2008年5月
锥形瓶,编号0 ̄9,0为空白样品,用于亚硝化效果测定的营养溶液配方见表1,营养溶液在接种前为无菌。
按照正交试验设计方案要求,将9个样品分到3个可控温摇床中培养20d,NO2--N标按国家标准方法进行测定[10],亚硝化反应速率为单位时间NO2--N浓度的改变。
caligenes)有下列菌种:
粪产碱杆菌(A.faecalis);皮氏
产碱杆菌(A.piechaudii);木糖氧化产碱杆菌脱硝亚种
(A.xylosoxidanssubsp.denitrificans);木糖氧化产碱杆
菌木糖氧化亚种(A.xylosoxidanssubsp.xylosoxidans);真养产碱杆菌(A.eutrophus);广泛产碱杆菌(A.latus);从16SrDNA基因序列分争论产碱杆菌(A.paradoxus)。
析结果来看,作者从人工湿地中分离的一株异养硝化细菌H-1属于产碱杆菌属,一般认为凡是16SrDNA序列同源性大于97%的两株细菌即可确定为同一种,在本试验中测试的株菌H-1与粪产碱菌16SrRNA序列同源性大于97%,所以认为从人工湿地中分离的一株异养硝化细菌H-1属于产碱杆菌属粪产碱菌种。
2结果与讨论
2.1菌株分离与biolog微生物全自动分析仪鉴定结
果
从21株纯化菌株中检验出两株具有硝化活性的异养硝化菌,编号为H-1、H-2,通过硝化活检验中的显色反应,发现H-1活性较强。
biolog微生物全自动分析仪结果显示Biolog微生物鉴定系统中没有与菌株H-1特性相似的数据记录。
作者将GN2碳源利用情况建立指纹档案,进一步用分子手段进行分析以期找出更多该菌种的信息。
2.3正交试验结果分析
2.3.1温度的影响
从图2可看出,在亚硝化反应中,25℃是该菌株亚硝化速率趋势改变的分界点,当温度在30℃时,亚硝化效果达到最佳。
符合Hultman[12]提出硝化细菌的生长速率U和温度之间的关系,U=(Un,20)[100.03(T-20)]
2.216SrDNA基因序列分析
经NCBIBlast检索,所筛选菌株H-1和Alcali-genesfaecalis(DQ110882)有98%的同源性,因此作者初步认为本研究分离得到的一株异养硝化细菌H-1
属于产碱杆菌属粪产碱菌种,又选择了多种产碱杆菌属的16SrDNA全序列:
Alcaligeneslatus(D88007),
d-1大多数硝化细菌的合适生长温度在25 ̄30℃之间,低于25℃或高于30℃硝化细菌生长和硝化作用
减慢。
因此温度对硝化细菌生长和亚硝化反应速率有很大影响。
Alcaligenespiechaudii(AB010841),Alcaligenesaquatilis
(AJ937889),Alcaligenesxylosoxidans(Y14908)进行系统分析(见图1),结果也显示该菌株和产碱杆菌属粪产碱杆菌显示出更高的同源性。
Anderson等[11]报道粪
产碱杆菌为异养硝化细菌,该菌在低碳条件下进行硝化作用,也可以在有机环境中进行硝化作用。
根据伯杰鉴定细菌学手册介绍,产碱杆菌属(Al-
2.3.2pH的影响
从图2可看出,在亚硝化反应中,随着pH升高,亚硝化速率先升后降,当pH=7.5时,亚硝化反应效果达到最佳。
pH是影响亚硝化作用重要环境因素之一,在pH中性或微碱性下,亚硝化反应过程迅速,若pH进一步升高,从NH4-←→NH3平衡关系中知道,NH3浓度会迅速提高[14]。
由于硝化菌对氨很敏感,从而会
S1
100100
AlcalingenesfaecalisAlcalingenesaquatilisAlcalingenespiechaudii
100
AlcalingenesxylosoxidansAlcalingeneslatus
0.070.060.050.040.030.020.010.00
图1基于16SrDNA构建的系统发育树
Figure1Phylogenetictreebacedon16SrDNA
第27卷第3期
亚硝化反应速率/mg・・L-1d-10.001
农业环境科学学报1149
1.41.21.00.80.60.40.20
A1A2A3
B1B2B3
C1C2C3
D1D2D3
在1.5 ̄2.0mg・・L-1,低于0.5mgL-1,则硝化作用趋于停止,在DO远远大于2.0mg・L-1时,溶解氧浓度对亚硝化反应的影响不予考虑。
从图2可看出,溶解氧水平的变化对亚硝化反应速率的影响较大。
2.3.5亚硝化作用效果分析
由表2最优组合结果可看出:
当温度为30℃,pH为7.5,接种量为107CFU,溶氧2.25mg・L-1时,亚硝化反应效果最佳。
Kuenen[14]在他的研究基础上总结出了异养硝化菌在进行硝化作用时的代谢通式,包括无机氮硝化代谢途径(即NH4+→NH2OH→NO2-→NO3-)和有机氮硝化代谢途径(即RNH2→RNHOH→R-NO→
因素水平
图2亚硝化反应速率在4因素3水平条件下变化趋势图
Figure2Relationshipofnitrosificationconditionwith
differentfactors
影响到亚硝化作用速率。
RNO2→NO3),本试验异养硝化菌在进行硝化作用时
的代谢通式是NH4+→NH2OH→NO2-→NO3-,其中
2.3.3接种量的影响
从图2可看出,在亚硝化反应过程中,随着接种
量增加,亚硝化反应速率降低,硝化细菌繁殖的速率极大地受到营养条件和所处环境的影响,基数大,营养条件不同,不一定繁殖速度快。
本试验接种量较小时,亚硝化速率较大,接种量较大时,亚硝化速率较小,可能接种量刚好处在营养竞争限制的范围内。
接种量小反而利于异养硝化细菌生长,接种量大,由于营养竞争,不利于异养硝化细菌生长。
NH4+→NH2OH→NO2-途径反映了亚硝化作用,无机
态氮的形态转化由异养硝化菌在进行硝化作用时的代谢情况决定。
研究湿地菌株亚硝化反应效果最佳条件,进一步探索如何提高全程硝化反应效率,将对如何人为控制人工湿地运行条件及提高人工湿地高氨氮废水去除效果提供参考和理论依据。
由表2、表3可看出:
亚硝化反应中,溶氧对亚硝化反应效果影响最大,其次是温度和pH,而接种量影响较小,温度和溶氧影响高度显著,pH和接种量不显著。
一般的潜流湿地,污水主要经过厌氧环境,在处理氨氮含量高的污水时往往因为硝化作用不足,不能将氨氮充分转化为反硝化作用的原料硝酸盐氮和亚硝酸盐氮,从而限制了湿地的除氮能力[15]。
复合垂直流人工湿地的结构以及下行流至上行流的水流方式,形成了基质床内好氧-厌氧的溶解氧状态变化,从而保证了硝化作用-反硝化作用的充分进行,利于污水的高效脱氮,湿地的表层微生物具有较强的硝化作用,也是硝化作用作为氮素主要作用途径的基质[16]。
由影
2.3.4溶解氧的影响
从图2可看出,在亚硝化反应中,随着DO升高,
・亚硝化反应速率先升后降,当溶解氧为2.25mgL-1
时,亚硝化反应效果达到最佳。
硝化细菌为了获得足够的能量用于生长,必需氧化大量的NH4+和NO2-,环境中的溶解氧浓度大小会极大地影响亚硝化反应速度和硝化细菌的生长速率,溶解氧浓度与硝化细菌生长速率公式[13]为Un=(Unmax)(DO/DO+K0),从公式可知,当DO增大时,硝化细菌生长速率增大,当环境
DO!
K0时,Un=Unmax。
大多数学者认为溶氧应控制
表3试验结果方差分析
Table3TheVarianceanalysisofexperimentation
注:
**表示极显著,*表示相对不显著。
1150王成林等:
一株异养硝化细菌的分离鉴定及其亚硝化作用研究
境科学,2003,241(1):
80-83.
2008年5月
响因素排序和显著性可知,溶氧和温度对亚硝化反应的影响最大,提高湿地表层溶解氧和控制合适的温度,能够提高湿地的硝化效率和处理高含量氨氮污水的能力。
因此为了提高氨氮的去除率,可以考虑把主要影响因素选出,控制好条件,忽略次要影响因素,从而在强化人工湿地功能的条件选择上提供指导,避免造成浪费。
LIUChao-xiang,DONGChun-hong,etal.Studyonabilityofnitrifica-tioninasubsurfaceconstructedwetlandsystemtreatingsewage[J].En-vironmentalScience,2003,241(1):
80-83.
[6]JvanOostro.Nitrogenremovalinconstructedwetlandstreatingnitrifiedmeatprocessingeffluent[J].WaterScienceandTechnology,1995,3(32):
137-147.
[7]中国科学院南京土壤研究所微生物室编著.土壤微生物研究方
法[M].科学出版社出版,1985.
3结论
(1)用传统微生物方法从复合垂直流人工湿地中分离筛选出一株硝化活性较强的异养细菌H-1,进行
NanJinInstituteofsoilScience,ChineseAcademyofSciences,Book-making.Themethodsofsoilmicrobe[M].Sciencepublishingcompany,1985.
[8]ThompsonJD,GibsonTJ,PlewniakF,etal.TheClustalXwindowsin-terface:
4882.
[9]KumarS,TamuraK,NeiM.MEGA3:
Integratedsoftwareformolecularevolutionarygeneticsanalysisandsequencealignment[J].BriefingsinBioinformatics,2004,5:
150-163.
编委会,水和废水检测分析方法(第三[10]《水和废水监测分析方法》
版)[M].北京:
中国环境科学出版社,1997.
biolog菌种鉴定,鉴定系统中没有与该菌株特性相似
的数据记录,可能该菌株信息不在鉴定系统数据库中,进一步采用分子方法,16SrDNA扩增,经NCBI
flexiblestrategiesformultiplesequencealignmentaidedby
qualityanalysistools[J].NucleicAcidsResearch,1997,24(6):
4876-
Blast检索,该菌株和Alcaligenesfaecalis(DQ110882)
有98%的同源性,因此作者初步认为本研究分离得到的一株异养硝化细菌H-1属于产碱杆菌属粪产碱
菌种。
(2)通过正交试验结果显示当温度为30℃,pH为7.5,接种量为10CFU,溶氧2.25mg・L时,亚硝
7
-1
WaterandWasteWaterMonitorAnalysisMethod(Thirdedition)[M].ChineseEnvironmentalSciencepublishingcompanyInBeijin.1997.[11]AndersonIC,PothM,HomsteadJ,etal.DAcomparisonofNOandN2O
productionbytheautotrophicnitrifierNitorsomonaseuropaeaandtheheterotrophicnitrifierAlcaligenesfaecalis[J].ApplEnvironMicrobiol,1993,59(11):
3525-3533.
[12]李沛霖,李大平,何晓红.生物膜处理无机氨氮废水及其好氧反硝
化现象[J].水处理技术,2007,2(1):
78-81.
化反应效果最佳;亚硝化反应中,溶氧对亚硝化反应效果影响最大,其次是温度和pH,而接种量影响较小,温度和溶氧影响高度显著,pH和接种量影响相对不显著。
因此将影响异养硝化细菌代谢的因素控制在一定值,可以达到最佳亚硝化效果,控制好主要影响因素和条件,可以提高湿地的硝化效率和降低运行成本。
参考文献:
[1]BrierleyEDR,WoodM.Heterotrophicnitrificationinanacidforestsoil:
isolationandcharacterisationofanitrifyingbacterium[J].SoilBiolBiochem,2001,33:
1403-1409.
[2]LinY,KongHN,HeYL,etal.Simultaneousnitrificationanddenitri-ficationinamembranebioreactorandisolati