信息检索与利用综合检索报告.docx

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信息检索与利用综合检索报告

信息检索与利用

综合检索报告

课题名称：

水稻干旱和盐胁迫相关天然反义RNA的初步鉴定

学院：

化学与生命科学学院

专业：

化学132班

学号：

13240211

姓名：

李敏

2014年4月

1、分析课题

课题涉及生物化学、无机化学、生物技术领域，技术要点多，要求检索近十年来的中外文专刊、期刊、学位论文等。

最好采用主题途径，检索词有水稻、干旱、盐、天然反义RNA、转录、遗传；英文单词是paddy、dry、salt、NaturalantisenseRNA、transcription、genetic。

2、选择的主要检索工具

选择读秀数据库、CNKI、sciencedirect、webofscience、万方学位论文数据库、PQDT博硕士论文全文数据库等国内外主要的数据库，并利用Google进行了补充查找。

中文科技期刊数据库的检索式：

m=（水稻*干旱*盐*（天然反义RNA+转录+遗传））。

外文数据基本检索式：

paddyanddryandsaltand（“NaturalantisenseRNA”or“transcription”or“genetic”。

3、检出文献

用上述检索工具检索，经筛选，列出与课题最密切相关的5条文献。

独秀数据库：

检出文献篇数732篇，经筛选列出如下5篇相关文献

（1）毕延震，黄捷，姜黎.天然反义RNA（NATs）:

基因表达的重要调控分子.中国生物化学与分子生物学报.ISSN：

1007-7626.

（2）周玲艳，姜大刚等.水稻蜡质合成相关基因OsCER4自身启动子驱动的反义RNA转化植株获得.华南农业大学学报.ISSN：

1001-411X.

摘要：

（3）陈坚，连肖华等.水稻转录因子基因SUSIRI的过表达及RNA干扰对水稻分子及表型效应的分析.分子植物育种  ISSN：

1672-416X

摘要：

在克隆到水稻转录因子基因SUSIRI的基础上,构建其过表达及RNA干扰载体进行水稻的遗传转化.由潮霉素筛选及分子检测得到的T0代植株经大田栽植,共有34株过表达及46株RNA干扰植株获得T1代转基因种子.继续种植T1植株收获T2代种子,同时用半定量RT-PCR分析苗期及穗期野生型水稻中SUSIRI基因的时空表达谱并比较过表达及RNA干扰植株的SUSIRI基因在叶片及幼穗中的表达状况,发现过表达植株与野生型对照的基因表达基本相同,但RNA干扰植株的表达受到明显抑制.对过表达及RNA干扰植株稻穗性状考察表明:

与野生型对照相比,无论是过表达还是RNA干扰,转基因植株的穗粒数、结实率降低,RNA干扰植株表现得尤为严重（P<0.05）,但对水稻谷粒粒重的影响并不显著（P>0.05）.SUSIRI基因的过表达未出现使稻穗性状明显改良的株系,而RNA干扰会导致水稻的结实能力严重降低.

（4）玉晓红，晁丽等.利用RNA干涉研究水稻锌指蛋白基因OsZRL的功能.中国水稻科学  ISSN：

1001-7216  

（5）马廷臣，陈荣军.渗透胁迫下水稻根系核仁小分子RNA转录本变化的全基因组表达分析.中国水稻科学  ISSN：

1001-7216

CNKI：

检出文献篇数634篇，经筛选列出如下5篇相关文献

（1）毕延震.天然反义RNA（NATs）:

基因表达的重要调控分子.中国生物化学与分子生物学报.

（2）宋莉芸.一个水稻DEAD盒RNA解旋酶基因OsBIRH1的克隆鉴定及其蛋白纯化.浙江农业学报

（3）刘红美.用RNA干涉对几个水稻WD结构域基因的功能研究.华南农业大学学报.

（4）王海燕.磷脂酶Ds在植物干旱胁迫反应中的功能与作用机理.中国农业科学院.

（5）许凤莲.一个具有S位点的水稻类受体激酶OsSRL参与干旱胁迫反应.植物学报.

Sciencedirect：

检出文献篇数679篇，经筛选列出如下5篇相关文献

（1）MarcoMagistri,MohammadAliFaghihi等RegulationofchromatinstructurebylongnoncodingRNAs:

focusonnaturalantisensetranscripts

（2）YuWang,Wei-JunPang等，Identification,stabilityandexpressionofSirt1antisenselongnon-codingRNA，

（3）ClaesWahlestedt，NaturalantisenseandnoncodingRNAtranscriptsaspotentialdrugtargets

（4）Jin-huaHe,Yu-guangLi，CharacteristicsofAntisenseNon-codingRNAintheINK4LocusandItsRolesinDisease

（6）KinjiKurihara,NobuoNakanishi，ExpressionofNa+/K+-ATPaseαsubunitisoformsinratsalivaryglands:

OccurrenceofsenseandantisenseRNAsoftheα3isoforminthesublingualgland

webofscience：

检出文献篇数571篇，经筛选列出如下5篇相关文献

（1）Wang,Yu;Pang,Wei-Jun;Wei,Ning;等，Identification,stabilityandexpressionofSirt1antisenselongnon-codingRNA.

（2）Saldana-Meyer,Ricardo等，CTCFregulatesthehumanp53genethroughdirectinteractionwithitsnaturalantisensetranscript,Wrap53.

（3）Wang,Huan;Chung,PilJoong;Liu,Jun;等，Genome-wideidentificationoflongnoncodingnaturalantisensetranscriptsandtheirresponsestolightinArabidopsis.

（4）Isobe,Hiroyuki;Fujino,Tomoko，Triazole-LinkedAnaloguesofDNAandRNA（（TL）DNAand（TL）RNA）:

SynthesisandFunctions

（5）Watanabe,Takeshi;Asakawa,Susumu;Nakamura,Asumi;等，DGGEmethodforanalyzing16SrDNAofmethanogenicarchaealcommunityinpaddyfieldsoil.

万方学位论文数据库：

检出文献篇数309篇，经筛选列出如下5篇相关文献

（1）谢兆辉.天然反义转录物及其调控基因的表达机制.遗传HEREDITAS（BEIJING）

（2）Morris,R.T.等，RiceRBP:

adatabaseofexperimentallyidentifiedRNA-bindingproteinsin<i>Oryzasativa</i>L.，《PlantScience》

（3）中国医学科学院基础医学研究所.应用RNA酶保护法高通量筛选天然存在的正义-反义转录物 .CN200510075065.3

注：

发明制造类

（4）马廷臣等.渗透胁迫下水稻根系核仁小分子RNA转录本变化的全基因组表达分析.《中国水稻科学》

（5）李大红、刘卉等.转反义OsRACK1基因增强水稻抗旱能力.《植物学通报》

PQDT博硕士论文全文数据库：

检出文献篇数571篇，经筛选列出如下5篇相关文献

（1）Sabatino,David.，Expandingthesizeandshapeofnucleicacids:

Studiesonbranchedandheptosebasednucleicacids.，DissertationAbstractsInternational，ISBN：

9780494386415

（2）Vitins,AlexaP.，RNAsilencingpathwaysandribosomalRNAgeneinactivationinArabidopsis.，DissertationAbstractsInternational，ISBN：

9781109712612

（3）Chatterjee,Anushree等，Abistablegeneticswitchcontrolsantibioticresistancetransferinenterococcusfaecalis.，DissertationAbstractsInternational,ISBN:

9781124916224

（3）Steil,BenjaminPeter.等，Proteinprimersandatelomerase-likemechanismofpoliovirusRNAreplicationmaintainthe3'endoftheRNAgenome.，DissertationAbstractsInternational，ISBN9780549765400

（5）Ebhardt,HolgerAlexander，CharacterizationofexogenousandendogenousplantsmallRNAs:

Discoveryofaubiquitousterminalmodification.，DissertationAbstractsInternational，ISBN：

9780494381762

Google:

（1）标题：

水稻逆境相关基因的遗传转化和功能鉴定

网址：

（2）标题：

天然反义转录物及其调控基因的表达机制

网址：

（3）标题：

一个水稻逆境诱导启动子kt619p的鉴定和应用

网址：

（4）标题：

反义rca水稻光合特性及其Rubisco和Rubisco活化酶的亚细胞定位

网址：

（5）标题：

OsRACK1在水稻种子萌发期响应干旱和盐胁迫的功能分析及其融合蛋白的表达和纯化

网址：

4.文献分析

对比分析，结论如下。

（1）我们可以通过基因组及高通量表达数据，鉴定出水稻干旱胁迫及盐胁迫天然顺式反义RNA。

（2）我们可以实时荧光定量PCR检测1个干旱胁迫及1个盐胁相关天然反义RNA表达。

（3）本课题研究具有创新性和新颖性，具有继续研究的价值。