植物分子生物学实验技术.docx

上传人:b****6 文档编号:15735610 上传时间:2023-07-07 格式:DOCX 页数:37 大小:68.46KB
下载 相关 举报
植物分子生物学实验技术.docx_第1页
第1页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第2页
第2页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第3页
第3页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第4页
第4页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第5页
第5页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第6页
第6页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第7页
第7页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第8页
第8页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第9页
第9页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第10页
第10页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第11页
第11页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第12页
第12页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第13页
第13页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第14页
第14页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第15页
第15页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第16页
第16页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第17页
第17页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第18页
第18页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第19页
第19页 / 共37页
植物分子生物学实验技术.docx_第20页
第20页 / 共37页
亲,该文档总共37页,到这儿已超出免费预览范围,如果喜欢就下载吧!
下载资源
资源描述

植物分子生物学实验技术.docx

《植物分子生物学实验技术.docx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《植物分子生物学实验技术.docx(37页珍藏版)》请在冰点文库上搜索。

植物分子生物学实验技术.docx

植物分子生物学实验技术

 

植物分子生物学实验技术

 

班级:

研122班

专业:

作物生物技术

姓名:

陕建国

学号:

20122419

授课教师:

红英老师

 

实验一:

植物DNA和RNA提取方法的讨论

一、提取植物DNA和RNA的用处

提取植物组织的DNA和RNA,分析其序列,了解序列的排列顺序可以更好的从分子水平上进行研究,从分子水平上改良植物或者说农作物的一些性状、品质等。

(一)提取植物DNA的用处

DNA的提取在植物基因工程以及植物分子生物学研究中占有重要地位,DNA的提取效率直接决定着后续实验的成败。

另外,提取植物DNA在分子育种方面也有很重要的用处。

(二)提取植物RNA的用处

提取RNA可以进行Northern杂交、原位杂交、RT-PCR以及cDNA文库构建等很多分子生物学实验。

提取RNA也是进行基因表达分析及基因克隆等分子生物学研究的基础。

二、植物组织DNA的提取方法

提取植物DNA的试验原理:

脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid,DNA)是一切生物细胞的重要组成成分,主要存在于细胞核中,盐溶法是提取DNA的常规技术之一。

从细胞中分离得到的DNA是与蛋白质结合的DNA,其中还含有大量RNA,即核糖核蛋白。

如何有效地将这两种核蛋白分开是技术的关键。

DNA不溶于0.14mol/L的NaCl溶液中,而RNA则能溶于0.14mol/L的NaCl溶液之中,利用这一性质就可以将二者从破碎细胞浆液中分开。

制备过程中,细胞破碎的同时就有Dnase释放到提取液中,使DNA因被降解而影响得率,在提取缓冲液中加入适量的柠檬酸盐和EDTA,既可抑制酶的活性又可使蛋白质变性而与核酸分离,再加入阴离子去垢剂0.15%的SDS,经过2h搅拌,或用氯仿-异醇除去蛋白,通过离心使蛋白质沉淀而除去,得到的是含有核酸的上清液。

然后用95%的预冷乙醇即可把DNA从除去蛋白质的提取液中沉淀出来。

(一)植物DNA的SDS提取法:

(来自Youaresolate的新浪空间)

试验试剂:

1、研磨缓冲液:

称取59.63gNaCl,13.25g柠檬酸三钠,37.2gEDTA-Na分别溶解后合并为一,用0.2mol/L的NaOH调至pH7.0,并定容至1000ml。

2、10×SSC溶液:

称取87.66gNaCl和44.12g柠檬酸三钠,分别溶解,一起定容至1000ml。

3、1×SSC溶液:

用10×SSC溶液稀释10倍。

4、0.1×SSC溶液:

用1×SSC溶液稀释10倍。

5、Rnase溶液:

用0.14mol/LNaCl溶液配制成25mg/ml的酶液,用1mol/LHCl,pH至5.0,使用前经80℃水浴处理5min(以破坏可能存在的Dnase)。

6氯仿-异戊醇:

按24ml氯仿和1ml异戊醇混合。

7、5mol/L高氯酸钠溶液:

称取NaClO4.H2O70.23g,先加入少量蒸馏水溶解再容至100ml。

8、SDS(十二烷基硫酸钠)化学试剂的重结晶:

将SDS放入无水酒精中达到饱和为止,然后在70~80℃的水浴中溶解,趁热过滤,冷却之后即将滤液放入冰箱,待结晶出现再置室温下凉干待用。

9、1mol/LHCl。

10、0.2mol/LNaOH。

11、二苯胺乙醛试剂:

1.5g二苯胺溶于100ml冰醋酸中,添加1.5ml浓硫酸,装入棕色瓶,贮存暗处,使用时加0.1ml乙醛液[浓乙醛:

H2O=1:

50(V/V)]。

12.1.0mol/L高酸溶液(HClO4)。

13、高氯酸溶液。

14、0.05mol/LNaOH。

15、DNA标准液:

取标准DNA25mg溶于少量0.05mol.L-1NaOH中,再用0.05mol/LNaOH定容至25ml,后用移溶管吸取此液5ml至50ml容量瓶中,加5.0ml1mol/LHClO4,混合冷却后用0.5mol/LHClO4定容至刻度,则得100μg/ml的标准溶液。

实验步骤:

1、称取植物幼嫩组织10g剪碎置研钵中,加10ml预冷研磨缓冲液并加入0.1g左右的SDS,置冰浴上研磨成糊状。

2、将匀浆无损转入25ml刻度试管中加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,加上塞子,剧烈振荡30s,转入离心管,静置片刻以脱除组织蛋白质。

以4000rpm离心5min。

3、离心形成三层,小心地吸取上层清液至刻度试管中,弃去中间层的细胞碎片、变性蛋白质及下层的氯仿。

4、将试管置72℃水浴中保温3min(不超过4min),以灭活组织的DNA酶,然后迅速取出试管置冰水浴中冷却到室温,加5mol/L高氯酸钠溶液[提取液:

高氯酸钠溶液=4:

1(V/V)],使溶液中高氯酸钠的最终浓度为1mol/L。

5、再次加入等体积氯仿-异戊醇混合液至大试管中,振荡1min,静置后在室温下离心(4000rpm)5min,取上清液置小烧杯中。

6、用滴管吸95%的预冷乙醇,慢慢地加入烧杯中上清液的表面上,直至乙醇的体积为上清液的两倍,用玻璃棒轻轻搅动。

此时核酸迅速以纤维状沉淀缠绕在玻璃棒上。

7、然后加入0.5ml左右的10×SSC,使最终浓度为1×SSC。

8、重复第6步骤和第7步骤即得到DNA的粗制品。

9、加入已处理的Rnase溶液,使其最后的作用浓度为50~70μg/ml,并在37℃水浴中保温30min,以除去RNA。

10、加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,在三角瓶中振荡1min,再除去残留蛋白质及所加Rnase蛋白,室温下以4000rpm离心5min,收集上层水溶液。

11、再按6、7步骤处理即可得到纯化的DNA液。

(二)植物DNA的CTAB提取法:

(来自Youaresolate的新浪空间)

试验步骤:

1、称取新鲜叶片2-3g,剪碎放入研钵中,在液氮中研磨成粉末。

2、将粉末转移到加有7ml经预热的15×CTAB提取缓冲液15ml离心管中,迅速混匀后置于65℃水浴中,温育30min。

3、取出离心管,冷却至室温,加入氯仿/异戊醇(24:

1),充分混匀,室温下2300转离心20min。

4、将上清转移至另一新的15ml离心管中,加入1/10体积10%的CTAB和等体积的氯仿/异戊醇。

充分混匀,2300rpm离心20min。

5、转移上清至另一新的15ml离心管中,加入等体积1%的CTAB沉淀缓冲液,轻轻摇晃至形成DNA絮状沉淀。

1000rpm离心10min,使DNA沉淀于管底。

6、加入1.5-2ml的1mol/LNaCl及5μlRNase置于56℃水浴中过夜。

7、待DNA完全溶解后,加2-3ml4℃预冷的95%的冰乙醇使DNA沉淀,挑出DNA,置于15ml离心管中,用70%乙醇清洗30min。

8、离心机甩5s,倒出70%乙醇,再用95%乙醇浸泡5min,倒出95%乙醇,在超净工作台上吹干。

9、将风干的DNA直接在4℃保存备用或溶于100μlTE溶液中于-20℃保存.

(三)植物叶片DNA的提取步骤(来自 b04a 43e2 bbfc d1e1a002dc21)

实验步骤

1、在50ml带盖离心管(放在-20度预冷)中加入20ml提取缓冲液I,60℃水浴预热。

2、水稻幼苗或叶子5~10g,剪碎,在研钵中加液氮磨成粉状后立即倒入预热的离心管中,剧烈摇动混匀,60℃水浴保温30~60分钟(时间长,DNA产量高),不时摇动。

3、加入20ml氯仿/戊醇/乙醇溶液,颠倒混匀(需带手套,防止损伤皮肤),室温下静止5~10分钟,使水相和有机相分层(必要时可重新混匀)。

4、室温下5000rpm离心5分钟。

5、仔细移取上清液至另一50ml离心管,加入一倍体积异丙醇,混匀,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。

6、在1.5mleppendorf管中加入1mlTE。

用钩状玻璃棒捞出DNA絮团,在干净吸水纸上吸干,转入含TE的离心管中,DNA很快溶解于TE。

7、如DNA不形成絮状沉淀,则可用5000rpm离心5分钟,再将沉淀移入TE管中。

这样收集的沉淀,往往难溶解于TE,可在60℃水浴放置15分钟以上,以帮助溶解。

8、将DNA溶液3000rpm离心5分钟,上清液倒入干净的5ml离心管。

9、加入5μlRNaseA(10μg/μl),37℃10分钟,除去RNA(RNA对DNA的操作、分析一般无影响,可省略该步骤)。

10、加入1/10体积的3mol/LNaAc及2×体积的冰乙醇,混匀,-20℃放置20分钟左右,使DNA形成絮状沉淀。

11、用玻璃捞出DNA沉淀,70%乙醇漂洗,再在干净吸水纸上吸干。

12、将DNA重新溶解于1mlTE中,-20℃贮存。

三、植物RNA的提取

植物细胞含有细胞质RNA、细胞核RNA和细胞器RNA。

细胞质RNA包括mRNA、rRNA、tRNA。

细胞核RNA主要有细胞质RNA的前体及小分子细胞核RNA(snRNA)、染色质RNA(chRNA)等。

细胞器RNA主要指线粒体RNA及叶绿体RNA。

这些RNA统称细胞总RNA,其中大量的是rRNA,占80%左右。

基因转录产物mRNA在总RNA中只占1%~5%。

不同的mRNA在分子大小、核苷酸序列,以及在细胞转录水平等方面各不相同,但真核细胞mRNA3ˊ末端都具有20~200个不等的多聚腺苷酸的尾,称为poly(A)结构。

利用poly(A)结构可以把mRNA从总RNA中分离出来。

对于Northern杂交可以使用植物细胞总RNA,也可以使用由总RNA中分离出的mRNA。

植物细胞RNA提取中的主要问题是防止RNA酶的降解作用。

RNA酶是一类水解核糖核酸的切酶,它与一般作用于核酸的酶类有着显著的不同,不仅生物活性十分稳定,耐热、耐酸、耐碱,作用时不需要任何辅助因子,而且它的存在非常广泛,除细胞含有丰富的RNA酶外,在实验环境中,如各种器皿、试剂、人的皮肤、汗液、甚至灰尘中都有RNA酶的存在。

因而,生物体源、外源RNA酶的降解作用是导致RNA提取失败的致命因素。

源RNA酶来源于材料的组织细胞,提取自始至终都应对RNase活性进行有效抑制。

RNA提取过程中将蛋白质变性剂与RNase抑制剂联合使用效果较理想。

蛋白质变性剂包括酚、氯仿、SDS、Sarkosyl(十二烷酰肌氨酸钠)、DOC(脱氧胆酸钠)、盐酸胍、异硫氰酸胍、4—氨基水酸钠、三异丙基萘磺酸钠等;RNA酶抑制剂有RNasin(RNase阻抑蛋白)、氧钒核糖核苷复合物等。

外源RNA酶的抑制主要是使用DEPC(焦碳酸二乙酯C2HsOCOOCOOCxH5),它能与RNase分子中的必需基团组氨酸残基上的咪唑环结合而抑制酶活性,用于水、试剂及器皿的RNase灭活。

DEPC与肝素合用效果增强,值得注意的是DEPC在Tris溶液中很不稳定,很快分解成CO2及C2H5OH,因而不能用于Tirs溶液的RNase灭活。

水及其它溶液的灭活一般使用0.05%~0.1%DEPC,37℃处理过夜,也有人采用磁搅0.5小时以上的做法。

DEPC处理后的溶液还需高压灭菌,以去除残存的DEPC。

若DEPC去除不净,会破坏mRNA活性。

不能高压灭菌的试剂要使用经过DEPC处理的灭菌蒸馏水配制,然后用0.22μm滤膜过滤。

含有Tris的试剂用经DEPC处理过的水配制,再经高压消毒。

玻璃器皿可以在180℃烘烤8小时以上,不能烘烤的器皿用0.1%的DEPC水处理过夜后再高压灭菌。

提取全过程必须在清洁无尘的环境中进行。

操作人员要使用一次性的手套拿取物品,尽可能避免一切污染机会。

提取时使用的器皿应经过硅烷化处理,以防止RNA被吸附在器皿壁上,造成损失。

RNA电泳使用的电泳槽需用去污剂洗涤,水冲洗,乙醇干燥。

再浸入3%H202溶液中,室温下放置10分钟以上,再用DEPC溶液处理过的水冲洗干净。

总之,实验中所用的试剂、器皿都要经过RNase灭活处理。

尽管如此,有时还会出现在提取的后期RNA被降解的问题。

这是因为RNase活性的抑制只是一个暂时的现象,一旦抑制剂浓度下降RNase就有可能恢复活性。

对于RNA提取来说,这是一个潜伏的危险。

在提取的前阶段,提取液中无疑是有足够的抑制剂,但到了提取后期,抑制成分逐渐减少,残存的RNase就会复活而引起RNA降解。

另外,提取后期发生的RNase污染,那怕是极轻微的,也会使到手的产品降解,因而提取后期要更加小心。

影响植物RNA提取的另一个问题是水溶性的细胞代谢物如酚、多糖等易与RNA结合成胶冻状的不溶物或有色的复合物,它们能影响RNA的质量及产量。

人们采用了多种处理方法来解决这个问题,如对组织提取液进行高速离心去除多糖;采用低pH值的提取缓冲液抑制酚的解离及氧化;或用β—巯基乙醇、PVP来抑制酚类的干扰等。

(一)小麦叶片及不同时期种子的RNA的提取(双宜,吴耀荣,夏光敏.介绍一种简单高效的植物总RNA提取方法大学生命科学学院,)

1、取510g材料放入研钵中,加入过量液氮,迅速研磨成均匀的粉末(在研磨过程中,保证材料始终浸在液氮中,研磨约30min左右)。

2、待液氮自然挥发干净后,将材料转入100ml的离心管中,加入68倍体积的裂解缓冲液Ⅰ,轻轻搅拌后,0℃冰浴20min。

3、12000r/min,4℃离心15min。

4、取上清液,加1/3体积的3mol/L醋酸钠(pH5.3),1/5体积的氯仿-异戊醇(24:

1),轻轻混匀,0℃冰浴20min(加5倍体积裂解缓冲液Ⅱ溶解沉淀以提取DNA)。

5、12000r/min,4℃离心15min。

6、取上清,加入等体积冰浴冷却的异丙醇,混匀且冰浴10min。

7、5000r/min,4℃离心10min。

将沉淀溶于5ml含有0.1%的SDS缓冲液中,加入8mil/LLiCl使终浓度至2.5mol/L,冰浴4℃过夜。

8、12000r/min,4℃离心10min。

9、70%乙醇洗涤沉淀两次,空气干燥10min后,溶于DE-PC处理的TE或水中。

加入1/10体积10%重复第四、六步进一步除去蛋白质。

-70℃冰箱保存。

裂解缓冲液Ⅰ成分:

7mol/L尿素,50mmol/LTris-ClpH8.0,10mmol/LNa2EDTA,pH8.0,3.5mol/LNaCl,6.25%Tris饱和酚pH8.0,0.1%SDS+0.1%LDS。

裂解缓冲液Ⅱ成分:

7mol/L尿素,50mmol/LTris-ClpH8.0,10mmol/LNa2EDTA,pH8.0,3.5mol/LNaCl,6.25%Tris饱和酚pH8.0,0.1%SDS+1%LDS。

(二)植物总RNA的提取(XX文库)

Trizol试剂是由苯酚和硫氰酸胍配制而成的单相的快速抽提总RNA的试剂,在匀浆和裂解过程中,能在破碎细胞、降解蛋白质和其它成分,使蛋白质与核酸分离,失活RNA酶,同时能保持RNA的完整性。

在氯仿抽提、离心分离后,RNA处于水相中,将水相转管后用异丙醇沉淀RNA。

Trizol试剂配制

苯酚饱和液(38%)-380ml/l、硫氰酸胍盐(0.8M-118.16g)、硫氰酸铵(0.4M)--76.12g、醋酸钠pH5(0.1M)-33.4ml、甘油–50ml,加水至1L

实验试剂

1、无RNA酶的无菌水:

用将高温烘烤的玻璃瓶(180℃2小时)装蒸馏水,然后加入0.01%的DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。

2、75%乙醇:

用DEPC处理水配制75%乙醇,(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。

3、氯仿:

异戊醇[24:

1(v/v)]、氯仿。

4、异丙醇、无水乙醇、70%乙醇。

5、Trizol试剂。

操作步骤

1、取植物嫩叶,液氮研磨,每1.5mltube分装0.1克样品;

2. 每管加入0.5mlTrizol液,迅速混匀,注意样品总体积不能超过所用Trizol体积的10%。

3、室温下静置5~10分钟以利于核酸蛋白质复合体的解离

4、加入0.5ml的氯仿,盖紧离心管,用手剧烈摇荡离心管15秒,室温静置5分钟

5、10000r/min离心10分钟

6、取上清液(水相)转入一新的离心管,加入等体积异丙醇,室温放置10分钟,10000r/min离心10分钟。

7、弃去上清液,加入至少1ml的70%乙醇,涡旋混匀,4℃下7500r/min离心5分钟。

8、小心弃去上清液,然后室温或真空干燥5-10分钟,注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度。

然后将RNA溶于TE或DEPC处理过的水中,必要时可55℃-60℃水溶10分钟。

RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70℃

(三)CTAB方法提取植物叶片RNA(XX文库)

操作步骤

1、取叶片材料两克,液氮中研磨成细粉末。

2、每管加入10ml65℃预热的CTAB提取液和500µlβ-巯基乙醇,剧烈涡旋匀浆,65℃水浴温育30min。

3、每管加入10ml氯仿:

异戊醇(24:

1),涡旋混匀,冰浴10min。

4℃,12000rpm离心10min。

4、取上清,加入1∕3体积的8MLiCl和500µlβ-巯基乙醇,-20℃沉淀过夜。

5、4℃,12000rpm离心20min。

6、弃上清,沉淀用4ml异硫氰酸胍变性液溶解,加入120µlβ-巯基乙醇和880µl2MNaAc(pH4.0),混匀后加入5ml的酚:

氯仿:

异戊醇(25:

24:

1),涡旋混匀,冰浴5min。

4℃,12000rpm离心10min。

7、取上清,加入等体积酚:

氯仿:

异戊醇(25:

24:

1),涡旋混匀,冰浴5min。

4℃,12000rpm离心10min。

8、取上清,加入等体积氯仿:

异戊醇(24:

1),涡旋混匀,冰浴5min。

4℃,12000rpm离心10min。

9、取上清,加入1∕10体积的3MNaAc(pH5.2)和2.5倍体积的无水乙醇,-20℃放置过夜。

10、4℃,14000rpm离心20min。

弃上清,沉淀用预冷的75%乙醇漂洗2次,每次洗涤后,14000rpm离心10min,弃上清。

冰上干燥RNA沉淀。

11、加入100µlRNase-free-ddH2O溶解沉淀。

取10µl稀释200倍检测UVλ230、260、280下的OD值,检测RNA样品的纯度与浓度。

取5μg进行RNA样品的电泳检测,以检测rRNA的完整性,其余样品加入3倍体积的无水乙醇于-70℃下保存。

(四)硅藻土-苯酚法(一种广泛适用的RNA提取方法)(来自晓宇的方法)

利用硅藻土能够有效吸附RNA酶的特性,结合高盐、PVP及乙二醇丁醚沉淀等过程,建立了高效高质量RNA提取方法.该方法适应性广,可以从富含RNase及多糖、多酚等代谢产物提取RNA困难的动、植物及微生物材料中提取高质量总RNA植物组织RNA提取的难点及对策。

具体步骤:

(全过程均在冰上操作,保持样品温度在0~4℃)

1、样品液氮速冻,于研钵中研磨成细微粉末并转入预冷的离心管;

2、按照4ml/g的比例加入硅藻土提取缓冲液,充分震荡后加入1/2体积的水饱和酚和1/2体积的氯仿∶异戊醇(24∶1),震荡混匀;

3、4℃12000g离心10min,取上清加入等体积5mol/LKAc(pH4.8),混匀后冰浴10min;

4、4℃13000g离心10min,液相转入新管,重复上述酚仿抽提,直至界面清亮;

5、上清移入新管,加入等体积乙二醇丁醚,混合均匀后,冰上放置1h;

6、4℃14000g离心15min,沉淀用75%乙醇洗2次,空气干燥后用适量DEPC-H2O溶解,-70℃保存。

硅藻土提取缓冲液:

20mmol/L柠檬酸钠(pH7.0),10mmol/LEDTA,0.5%SDS,1%β-巯基乙醇,100mmol/LNaCl,1.9g/L处理过的硅藻土。

(121℃高压灭菌20min,冷却后再加入1%β-巯基乙醇,4℃保存)。

硅藻土的处理:

5g硅藻土用50ml50mmol/LTris-HCl(pH7.6)溶解,于100℃放置5min。

室温2500g离心5min。

弃上清,沉淀用40ml50mmol/LTris-HCl(pH7.6)重悬。

重复离心和重悬的步骤两次。

超声1min。

室温3500g离心15min.。

沉淀用30ml50mmol/LTris-HCl(pH7.6)重悬。

4℃储存。

 

实验二:

PCR及QPCR

普通的PCR是进行定性分析的,而QPCR是进行定量分析的,是检测初始量的,并且在进行PCR是标准曲线的制作是非常重要的。

一、PCR

PCR(PolymeraseChainReaction)即聚合酶链式反应,是指在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以特定引物为延伸起点,通过变性、退火、延伸等步骤,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA的过程。

是一项DNA体外合成放大技术,能快速特异地在体外扩增任何目的DNA。

可用于基因分离克隆,序列分析,基因表达调控,基因多态性研究等许多方面。

(一)PCR的原理

DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。

双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子挎贝。

在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。

因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。

PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。

(二)PCR反应体系(XX文库)

10×扩增缓冲液

10μl

4种dNTP混合物

200μl

引物

10~100μl

模板DNA

0.1~2μg

TaqDNA聚合酶

2.5μl

Mg2+

1.5mmol/L

加双或三蒸水

100μl

1、无Mg2buffer:

由纯水、kcl、Tris组成。

Tris用于调节反应体系pH值,使Taq酶在偏碱性环境中反挥活性。

kcl可降低退火温度,但不能超过50mmol/L,否则会抑制DNA聚合酶活性。

2、Mg2:

终浓度为1.5~2.0mmol/L,其对应dNTP为200μmol/L,注意Mg2与dNTPs之间的浓度关系,由于dNTP与Taq酶竟争Mg2,当dNTP浓度达到1mmol/L时会抑制Taq酶的活性。

其浓度越小,酶的特异性就越高。

3、BSA:

一般用乙酰化的BSA,起着减少PCR管对Taq酶的吸附作用,对Taq酶有保护作用。

4、底物(dNTPs):

dNTPs具有较强酸性,其储存液用NaOH调pH值至7.0~7.5,一般存储浓度为10mmol/L,各成份以等当量配制,反应终浓度为20~200μmol/L。

高浓度可加速反应,但同时增加错误掺入和实验成本;低浓度可提高精确性,而反应速度会降低。

5、Taq酶:

能耐95℃高温而不失活,其最适pH值为8.3~8.5,最适温度为75~80℃,一般用72℃。

能催化以DNA单链为模板,以碱基互补原则为基础,按5’→3’方向逐个将dNTP分子连接到引物的3’端,合成一条与模板DNA互补的新的DNA子链。

6、模板:

不含有对PCR反应有抑制作用的杂质存在,如蛋白酶、核酸酶、TqaDNA聚合酶抑制剂、能与DNA结合的蛋白质。

模板DNA的量不能太高,否则扩增可能不会成功,在此情况下可适当稀释模板。

7、引物:

引物浓度一般为

展开阅读全文
相关资源
猜你喜欢
相关搜索
资源标签

当前位置:首页 > 农林牧渔 > 林学

copyright@ 2008-2023 冰点文库 网站版权所有

经营许可证编号:鄂ICP备19020893号-2