已测序植物基因组汇总.docx

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已测序植物基因组汇总

NCBIAssemblyID

GCA_000467755.1

GCA_000347335.1

GCA_000411095.1

GCA_000753965.1

GCA_000180655.1

GCF_000471905.1

GCF_000471905.2

GCA_001661175.1

GCA_001540865.1

GCA_000696445.1

GCA_000523005.1

GCF_000004255.1

GCA_000524985.1

GCA_000222365.1

GCF_000001735.3

GCA_000222345.1

已测序植物基因组大全

拉丁名

中文名

Actinidiachinensis（eudicots）

猕猴桃

Aegilopstauschii（monocots）

粗山羊草

Aethionemaarabicum（eudicots）

阿拉伯岩芥菜

Amaranthushypochondriacus（grai

千穗谷

namaranth）

Amaranthustuberculatus（eudicots）

长芒苋

Amborellatrichopoda（floweringpl

无油樟

ants）

Amborellatrichopoda（floweringpl

无油樟

ants）

Ananascomosus（pineapple）

菠萝

Ananascomosus（pineapple）

菠萝

Aquilariaagallochum（eudicots）

沉香

Arabidopsishallerisubsp.gemmifer

鼠耳芥

a（eudicots）

Arabidopsislyratasubsp.lyrata（lyr

玉山筷子芥

aterockcress）

Arabidopsislyratasubsp.petraea（ly

玉山筷子芥

raterockcress）

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

组装水平

Contig

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Contig

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Chromosome

Scaffold

GCA_000211275.1Arabidopsisthaliana（thalecress）

GCA_000222385.1Arabidopsisthaliana（thalecress）

GCF_000001735.1Arabidopsisthaliana（thalecress）

GCF_000001735.2Arabidopsisthaliana（thalecress）

GCA_000835945.1Arabidopsisthaliana（thalecress）

GCA_000222325.1Arabidopsisthaliana（thalecress）

GCA_001651475.1Arabidopsisthaliana（thalecress）

GCA_000612745.1Arabisalpina（grayrockcress）

GCA_000733195.1Arabisalpina（grayrockcress）

GCA_001484125.1Arabismontbretiana（eudicots）

GCA_001484925.1Arabisnordmanniana（eudicots）

GCF_000817695.1Arachisduranensis（eudicots）

GCA_001687015.1Arachisduranensis（eudicots）

GCF_000816755.1Arachisipaensis（eudicots）

GCA_000439995.1Azadirachtaindica（eudicots）

GCA_000439995.2Azadirachtaindica（eudicots）

GCA_000439995.3Azadirachtaindica（eudicots）

GCA_000397105.1Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

GCA_000511025.2Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

拟南芥

拟南芥

拟南芥

拟南芥

拟南芥

拟南芥

拟南芥

小花南芥

小花南芥

南芥菜花

南芥菜花

蔓花生A亚基因组

蔓花生A亚基因组

蔓花生B亚基因组

印度苦楝树

印度苦楝树

印度苦楝树

甜菜

甜菜

Chromosome

Scaffold

CompleteGenome

Chromosome

Contig

Scaffold

Chromosome

Contig

Chromosome

Contig

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Chromosome

Contig

Contig

Contig

Scaffold

Chromosome

GCA_000510975.1

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GCA_000510465.1

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GCA_000340665.1

GCA_000230855.1

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Betulanana（alpinebirch）

高山桦木

Brachypodiumdistachyon（stiffbro

二穗短柄草

me）

Brachypodiumdistachyon（stiffbro

二穗短柄草

me）

Brassicanapus（rape）

油菜

Brassicanapus（rape）

油菜

Brassicanigra（blackmustard）

黑芥

Brassicaoleraceavar.capitata（cabb

卷心菜

age）

Brassicaoleraceavar.oleracea（eudi

卷心菜

cots）

Brassicarapa（fieldmustard）

荠菜

Cajanuscajan（pigeonpea）

木豆

Cajanuscajan（pigeonpea）

木豆

Chromosome

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Contig

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Chromosome

Chromosome

Chromosome

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Chromosome

Chromosome

Chromosome

Contig

GCF_000633955.1

Camelinasativa（falseflax）

GCA_000496875.1

Camelinasativa（falseflax）

GCA_001509995.1

Cannabissativa（hemp）

GCA_000230575.1

Cannabissativa（hemp）

GCA_001510005.1

Cannabissativasubsp.indica（hem

p）

GCF_000375325.1

Capsellarubella（eudicots）

GCF_000710875.1

Capsicumannuum（eudicots）

GCA_000512255.1

Capsicumannuum（eudicots）

GCA_000950795.1

Capsicumannuumvar.glabriusculu

m（eudicots）

GCA_000150535.1

Caricapapaya（papaya）

GCA_001310045.1

Caricapapaya（papaya）

GCA_001633085.1

Carthamustinctorius（safflower）

GCA_000763605.1

Castaneamollissima（Chinesechest

nut）

GCA_001292525.1

Catharanthusroseus（Madagascarp

eriwinkle）

GCA_001292565.1

Catharanthusroseus（Madagascarp

eriwinkle）

GCA_000949345.1

Catharanthusroseus（Madagascarp

eriwinkle）

GCA_001687005.1

Chenopodiumpallidicaule（eudicot

s）

GCA_001683475.1

Chenopodiumquinoa（quinoa）

亚麻荠

亚麻荠

亚麻荠

亚麻荠

亚麻荠

拟南芥近缘种

辣椒

辣椒

野生辣椒

木瓜

木瓜

红花素

板栗

长春花

长春花

长春花

苍白茎藜

奎奴亚藜

Chromosome

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Contig

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Scaffold

Contig

Contig

Scaffold

Scaffold

Scaffold

GCA_001687025.1

GCA_000347275.2

GCF_000331145.1

GCA_000347275.1

GCA_000238415.1

GCF_000493195.1

GCA_000695605.1

GCF_000317415.1

GCA_000775935.1

GCF_000313045.1

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GCA_001483825.1

GCF_000004075.2

GCF_001625215.1

GCA_001605985.1GCA_000512335.1

GCA_001633215.1

GCA_000774125.1

GCA_001598015.1

Chenopodiumsuecicum（eudicots）

Cicerarietinum（chickpea）

Cicerarietinum（chickpea）

Cicerarietinum（chickpea）

Citrulluslanatus（wildmelon）

Citrusclementina（eudicots）

Citrussinensis（sweetorange）

Citrussinensis（sweetorange）

Conyzacanadensis（horseweed）

Cucumismelo（muskmelon）

Cucumissativus（cucumber）

Cucumissativus（cucumber）

Cucumissativus（cucumber）

Cucumissativus（cucumber）

Daucuscarotasubsp.sativus（carrot）

Dendrobiumcatenatum（monocots）

Dianthuscaryophyllus（clovepink）

Dichantheliumoligosanthes（monocots）

Diospyroslotus（eudicots）

Dorcocerashygrometricum（eudicots）

藜

鹰嘴豆

鹰嘴豆

鹰嘴豆

野生甜瓜

柑橘

甜橙

甜橙

小蓬草

甜瓜

黄瓜

黄瓜

黄瓜

黄瓜

胡萝卜

石斛兰

香石竹

*

莲花

旋蒴苣苔

Scaffold

Chromosom

e

Chromosom

e

Scaffold

Contig

Scaffold

Scaffold

Chromosom

e

Contig

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Contig

Chromosom

e

Chromosom

e

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

GCA_001647135.1

GCF_000442705.1

GCA_001672495.1GCA_000441515.1

GCA_000818735.1

GCA_000331365.2

GCA_000818735.2

GCA_000331365.1

GCA_000970635.1

GCF_000504015.1

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GCA_000325905.1GCF_000478725.1

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GCA_000511975.1

GCA_000512025.1

GCA_000511995.1

Eichhorniapaniculata（monocots）

Elaeisguineensis（Africanoilpalm）

Elaeisguineensis（Africanoilpalm）

Elaeisoleifera（Americanoilpalm）

Enseteventricosum（monocots）

Enseteventricosum（monocots）

Enseteventricosum（monocots）

Enseteventricosum（monocots）

Eragrostistef（tef）

Erythrantheguttata（spottedmonkeyflower）

Eucalyptuscamaldulensis（Murrayredgum）

Eucalyptusgrandis（rosegum）

Eutremasalsugineum（eudicots）

Eutremasalsugineum（eudicots）

Eutremasalsugineum（eudicots）

Fagopyrumesculentum（commonbuckwheat）

Fragariaiinumae（eudicots）

Fragarianipponica（eudicots）

Fragarianubicola（eudicots）

凤眼蓝

油棕榈

油棕榈

美国油棕

阿比西尼亚红脉蕉

阿比西尼亚红脉蕉

阿比西尼亚红脉蕉

阿比西尼亚红脉蕉

抗旱粮食作物

地黄猴面花

赤桉

巨桉

山嵛菜

山嵛菜

山嵛菜

普通荞麦

古二倍体草莓

日本草莓

西藏草莓

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

GCA_000517285.1

GCF_000184155.1

GCA_000511835.1

GCA_000511695.1

GCA_000576895.1

GCA_000441915.1

GCF_000004515.3

GCF_000004515.4

GCF_000004515.2

GCA_001269945.1GCA_001269945.2

GCF_000004515.1

GCA_000722935.1GCA_000722935.2

GCF_000612285.1

GCA_000787975.1GCA_000612285.1

GCF_000987745.1

GCA_000331045.1GCF_000327365.1

Fragariaorientalis（eudicots）

东方草莓

Fragariavescasubsp.vesca（wildst

野生草莓

rawberry）

Fragariaxananassa（strawberry）

草莓

Fragariaxananassa（strawberry）

草莓

Fraxinusexcelsior（Europeanash）

欧洲草莓

Genliseaaurea（eudicots）

螺旋狸藻

Glycinemax（soybean）

大豆

Glycinemax（soybean）

大豆

Glycinemax（soybean）

大豆

Glycinemax（soybean）

大豆

Glycinemax（soybean）

大豆

Glycinemax（soybean）

大豆

Glycinesoja（wildsoybean）

野生大豆

Glycinesoja（wildsoybean）

野生大豆

Gossypiumarboreum（treecotton）

树棉

Gossypiumarboreum（treecotton）

树棉

Gossypiumarboreum（treecotton）

树棉

Gossypiumhirsutum（eudicots）

陆地棉

Gossypiumraimondii（eudicots）

雷蒙德氏棉

Gossypiumraimondii（eudicots）

雷蒙德氏棉

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Scaffold

Chromosome

Chromosome

Chromosome

Contig

Contig

Chromosome

Scaffold

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Scaffold

Chromosome

Scaffold

Chromosom

GCA_001654055.1

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GCA_000830395.1

GCA_000831365.1