已测序植物基因组汇总.docx

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已测序植物基因组汇总

已测序植物基因组大全

NCBIAssemblyID

拉丁名

中文名

组装水平

GCA_000467755.1

Actinidiachinensis（eudicots）

猫猴桃

Contig

GCA_000347335.1

Aegilopstauschii（monocots）

粗山羊草

Scaffold

GCA_000411095.1

Aethionemaarabicum（eudicots）

阿拉伯岩芥菜

Scaffold

GCA_000753965.1

Amaranthushypochondriacus（grainamaranth）

千穗谷

Scaffold

GCA_000180655.1

Amaranthustuberculatus（eudicots）

长芒尼

Contig

GCF_000471905.1

Amborellatrichopoda（floweringplants）

无油樟

Scaffold

GCF_000471905.2

Amborellatrichopoda（floweringplants）

无油樟

Scaffold

GCA001661175.1

Ananascomosus（pineapple）

菠萝

Scaffold

GCA_001540865.1

Ananascomosus（pineapple）

菠萝

Chromosome

GCA_000696445.1

Aquilariaagallochum（eudicots）

沉香

Scaffold

GCA_000523005.1

Arabidopsishallerisubsp.gemmifera（eudicots）

鼠耳芥

Scaffold

GCF_000004255.1

Arabidopsislyratasubsp.lyrata（lyraterockcress）

玉山筷子芥

Scaffold

GCA_000524985.1

Arabidopsislyratasubsp.petraea（lyraterockcress）

玉山筷子芥

Scaffold

GCA000222365.1

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

Scaffold

GCF_000001735.3

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

Chromosome

GCA000222345.1

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

Scaffold

Chromosom

GCA_000211275.1

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

e

GCA_000222385.1

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

Scaffold

GCF_000001735.1

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

CompleteGenome

GCF_000001735.2

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

Chromosome

GCA_000835945.1

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

Contig

GCA_000222325.1

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

Scaffold

GCA_001651475.1

Arabidopsisthaliana（thalecress）

拟南芥

Chromosome

GCA_000612745.1

Arabisalpina（grayrockcress）

小花南芥

Contig

GCA_000733195.1

Arabisalpina（grayrockcress）

小花南芥

Chromosome

GCA001484125.1

Arabismontbretiana（eudicots）

南芥菜花

Contig

GCA001484925.1

Arabisnordmanniana（eudicots）

南芥菜花

Scaffold

GCF_000817695.1

Arachisduranensis（eudicots）

曼花生A亚基因组

Chromosome

GCA_001687015.1

Arachisduranensis（eudicots）

曼花生A亚基因

组

Scaffold

GCF_000816755.1

Arachisipaensis（eudicots）

曼花生B亚基因组

Chromosome

GCA000439995.1

Azadirachtaindica（eudicots）

印度苦楝树

Contig

GCA000439995.2

Azadirachtaindica（eudicots）

印度苦楝树

Contig

GCA000439995.3

Azadirachtaindica（eudicots）

印度苦楝树

Contig1

GCA000397105.1

\/

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Scaffold

GCA_000511025.2

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Chromosom

__e

GCA_000510975.1

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Chromosome

GCA_000510485.1

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Scaffold

GCA_000510875.1

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Scaffold

GCA_000510465.1

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Scaffold

GCA_000729925.1

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Contig

GCA_000510365.1

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Scaffold

GCF_000511025.1

Betavulgarissubsp.vulgaris（beet）

甜菜

Chromosome

GCA_000327005.1

Betulanana（alpinebirch）

高山桦木

Scaffold

GCF_000005505.1

Brachypodiumdistachyon（stiffbrome）

二穗短柄草

Chromosome

GCF_000005505.2

Brachypodiumdistachyon（stiffbrome）

二穗短柄草

Chromosome

GCF_000686985.1

Brassicanapus（rape）

油菜

Chromosome

GCA000751015.1

Brassicanapus（rape）

油菜

Scaffold

GCA_001682895.1

Brassicanigra（blackmustard）

黑芥

Chromosome

GCA_000604025.1

Brassicaoleraceavar.capitata（cabbage）

卷心菜

Scaffold

GCF_000695525.1

Brassicaoleraceavar.oleracea（eudcots）

卷心菜

Chromosome

GCF_000309985.1

Brassicarapa（fieldmustard）

芥菜

Chromosome

GCA_000340665.1

Cajanuscajan（pigeonpea）

木豆

Chromosome

GCA000230855.1

Cajanuscajan（pigeonpea）

木豆

Contig

GCF_000633955.1

Camelinasativa（falseflax）

亚麻葬

Chromosome

GCA_000496875.1

Camelinasativa（falseflax）

亚麻葬

Scaffold

GCA_001509995.1

Cannabissativa（hemp）

亚麻葬

Scaffold

GCA_000230575.1

Cannabissativa（hemp）

亚麻葬

Scaffold

GCA_001510005.1

Cannabissativasubsp.indica（hem

P）

亚麻葬

Contig

GCF_000375325.1

Capsellarubella（eudicots）

拟南芥近缘种

Scaffold

GCF_000710875.1

Capsicumannuum（eudicots）

辣椒

Chromosome

GCA_000512255.1

Capsicumannuum（eudicots）

辣椒

Scaffold

GCA_000950795.1

Capsicumannuumvar.glabriusculum（eudicots）

野生辣椒

Chromosome

GCA000150535.1

Caricapapaya（papaya）

木瓜

Scaffold

GCA_001310045.1

Caricapapaya（papaya）

木瓜

Chromosome

GCA001633085.1

Carthamustinctorius（safflower）

红花素

Scaffold

GCA_000763605.1

Castaneamollissima（Chinesechestnut）

板栗

Scaffold

GCA_001292525.1

Catharanthusroseus（Madagascarperiwinkle）

长春花

Contig

GCA_001292565.1

Catharanthusroseus（Madagascarperiwinkle）

长春花

Contig

GCA_000949345.1

Catharanthusroseus（Madagascarperiwinkle）

长春花

Scaffold

GCA_001687005.1

Chenopodiumpallidicaule（eudicots）

苍白茎藜

Scaffold

GCA001683475.1

Chenopodiumquinoa（quinoa）

奎奴亚藜

Scaffold

GCA_001687025.1

Chenopodiumsuecicum（eudicots）

藜

Scaffold

GCA_000347275.2

Cicerarietinum（chickpea）

鹰嘴豆

Chromosome

GCF_000331145.1

Cicerarietinum（chickpea）

鹰嘴豆

Chromosome

GCA_000347275.1

Cicerarietinum（chickpea）

鹰嘴豆

Scaffold

GCA_000238415.1

CitrullusIanatus（wildmelon）

野生甜瓜

Contig

GCF_000493195.1

Citrusclementina（eudicots）

柑橘

Scaffold

GCA_000695605.1

Citrussinensis（sweetorange）

甜橙

Scaffold

GCF_000317415.1

Citrussinensis（sweetorange）

甜橙

Chromosome

GCA000775935.1

Conyzacanadensis（horseweed）

小蓬草

Contig

GCF000313045.1

Cucumismelo（muskmelon）

甜瓜

Scaffold

GCF000004075.1

Cucumissativus（cucumber）

黄瓜

Scaffold

GCF000224045.1

Cucumissativus（cucumber）

黄瓜

Scaffold

GCA001483825.1

Cucumissativus（cucumber）

黄瓜

Contig

GCF_000004075.2

Cucumissativus（cucumber）

黄瓜

Chromosome

GCF_001625215.1

Daucuscarotasubsp.sativus（carrot）

胡萝卜

Chromosome

GCA001605985.1

Dendrobiumcatenatum（monocots）

石斛兰

Scaffold

GCA000512335.1

Dianthuscaryophyllus（clovepink）

香石竹

Scaffold

GCA_001633215.1

J1JV17

Dichantheliumoligosanthes（monocots）

*

Scaffold

GCA000774125.1

Diospyroslotus（eudicots）

莲花

Scaffold

GCA_001598015.1

Dorcocerashygrometricum（eudicots）

旋明苣苔

Scaffold

GCA_001647135.1

Eichhorniapaniculata（monocots）

凤眼篮

Scaffold

GCF_000442705.1

Elaeisguineensis（Africanoilpalm）

油棕桐

Chromosome

GCA_001672495.1

Elaeisguineensis（Africanoilpalm）

油棕桐

Scaffold

GCA_000441515.1

Elaeisoleifera（Americanoilpalm）

美国油棕

Scaffold

GCA_000818735.1

Enseteventricosum（monocots）

阿比西尼亚红脉

莅

八、、

八、、

Scaffold

GCA_000331365.2

Enseteventricosum（monocots）

阿比西尼亚红脉

莅

八、、

八、、

Scaffold

GCA_000818735.2

Enseteventricosum（monocots）

阿比西尼亚红脉

莅

八、、

八、、

Scaffold

GCA_000331365.1

Enseteventricosum（monocots）

阿比西尼亚红脉

莅

八、、

八、、

Scaffold

GCA_000970635.1

Eragrostistef（tef）

抗旱粮食作物

Scaffold

GCF_000504015.1

Erythrantheguttata（spottedmonkeyflower）

地黄猴面花

Scaffold

GCA_000260855.1

Eucalyptuscamaldulensis（Murrayredgum）

赤楼

Scaffold

GCF000612305.1

Eucalyptusgrandis（rosegum）

巨校

Scaffold

GCA_000325905.2

Eutremasalsugineum（eudicots）

山奇菜

Chromosome

GCA000325905.1

Eutremasalsugineum（eudicots）

山奇菜

Scaffold

GCF000478725.1

Eutremasalsugineum（eudicots）

山奇菜

Scaffold

GCA_001661195.1

Fagopyrumesculentum（commonbuckwheat）

普通养麦

Scaffold

GCA000511975.1

Fragariaiinumae（eudicots）

古二倍体草库

Scaffold

GCA000512025.1

Fragarianipponica（eudicots）

日本草莓

Scaffold

GCA000511995.1

Fragarianubicola（eudicots）

西臧卓蕾

Scaffold

GCA_000517285.1

Fragariaorientalis（eudicots）

东方草莓

Scaffold

GCF_000184155.1

Fragariavescasubsp.vesca（wildstrawberry）

野生草莓

Chromosome

GCA_000511835.1

Fragariaxananassa（strawberry）

草莓

Scaffold

GCA_000511695.1

Fragariaxananassa（strawberry）

草莓

Scaffold

GCA_000576895.1

Fraxinusexcelsior（Europeanash）

欧洲草莓

Scaffold

GCA_000441915.1

Genliseaaurea（eudicots）

螺旋狸藻

Scaffold

GCF_000004515.3

Glycinemax（soybean）

大豆

Chromosome

GCF_000004515.4

Glycinemax（soybean）

大豆

Chromosome

GCF_000004515.2

Glycinemax（soybean）

大豆

Chromosome

GCA001269945.1

Glycinemax（soybean）

大豆

Contig

GCA001269945.2

Glycinemax（soybean）

大豆

Contig

GCF_000004515.1

Glycinemax（soybean）

大豆

Chromosome

GCA000722935.1

Glycinesoja（wildsoybean）

野生大豆

Scaffold

GCA000722935.2

Glycinesoja（wildsoybean）

野生大豆

Scaffold

GCF_000612285.1

Gossypiumarboreum（treecotton）

树棉

Chromosome

GCA000787975.1

Gossypiumarboreum（treecotton）

树棉

Scaffold

GCA000612285.1

1\z

Gossypiumarboreum（treecotton）

树棉

Scaffold

GCF_000987745.1

Gossypiumhirsutum（eudicots）

陆地棉

Chromosome

GCA000331045.1

Gossypiumraimondii（eudicots）

雷家德氏棉

Scaffold

GCF000327365.1

Gossypiumraimondii（eudicots）

雷家德氏棉

Chromosom

e

GCA_001654055.1

Heveabrasiliensis（eudicots）

橡胶树

Scaffold

GCA_000340545.1

Heveabrasiliensis（eudicots）

橡胶树

Scaffold

GCA_001696755.1

Hibiscussyriacus（Rose-of-Sharon）

木槿

Scaffold

GCA_000582825.1

Hordeumpubiflorum（monocots）

大麦

Scaffold

GCA_000947855.1

Hordeumvulgare（barley）

大麦

Contig

GCA_000227425.1

Hordeumvulgaresubsp.vulgare（domesticatedbarley）

驯化大麦

Contig

GCA_001077415.1

Hordeumvulgaresubsp.vulgare（domesticatedbarley）

驯化大麦

Scaffold

GCA_000326125.1

Hordeumvulgaresubsp.vulgare（domesticatedbarley）

驯化大麦

Scaffold

GCA_000326085.1

Hordeumvulgaresubsp.vulgare（domesticatedbarley）

驯化大麦

Scaffold

GCA_000830395.1

Humuluslupulusvar.cordifolius（Europeanhop）

律草

Scaffold

GCA_000831365.1

Humuluslupulusvar.lupulus（Europeanhop）

律草

Scaffold

GCA000978395.1

Ipomoeatrifida（eudicots）

甘薯近缘野生种

Scaffold

GCA000981105.1

Ipomoeatrifida（eudicots）

甘薯近缘野生种

Scaffold

GCA000208675.1

Jatrophacurcas（eudicots）

麻风树

Contig

GCF000696525.1

1\/

Jatrophacurcas（eudicots）

麻风树

Scaffold

GCA000208675.2

Jatrophacurcas（eudicots）

麻风树

Scaffold

GCA001411555.1

Juglansregia（Englishwalnut）

英国胡桃木

Scaffold

GCA000227445.1

Lactucasativa（eudicots）

离苣

Contig

GCA_000466325.1

\/

Lagenariasiceraria（white-floweredgourd）

葫卢

Scaffold

GCA_000411055.1

Leavenworthiaalabamica（eudicots）

*

Scaffold

GCA_000325765.3

Leersiaperrieri（monocots）

*

Chromosome

GCA_000325765.1

Leersiaperrieri（monocots）

*

Contig

GCA_000325765.2

Leersiaperrieri（monocots）

*

Scaffold

GCA_000224295.1

Linumusitatissimum（flax）

亚麻

Contig

GCA_000181115.2

Lotusjaponicus（eudicots）

百脉根

Cont