实验二CT重建实验报告.docx

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实验二CT重建实验报告

实验二CT图像重建实验

一、实验目的:

通过编写CT图像重建程序,进一步熟悉CT重建过程,同时加强图像处理程序的编程训练。

二、实验软件:

VC++

三、实验要求

1.递交整个程序的执行程序和源程序。

2.要求本小组承担部分的算法原理,列出主要程序段并给出相应说明,对实验结果进行分析。

四、算法原理及结果分析:

1.CT重建原理为:

在CT成像中,物体对X线的吸收起主要作用,在一均匀物体中,X线的衰减服从指数规律。

在X线穿透人体器官或组织时,由于人体器官或组织是由多种物质成分和不同的密度构成的,所以各点对X线的吸收系数是不同的。

将沿着X线束通过的物体分割成许多小单元体(体素),令每个体素的厚度相等(l)。

设l足够小,使得每个体素均匀,每个体素的吸收系数为常值,如果X线的入射强度I0、透射强度I和物体体素的厚度l均为已知,沿着X线通过路径上的吸收系数之和μ1+μ2+……+μn就可计算出来。

为了建立CT图像,必须先求出每个体素的吸收系数μ1、μ2、μ3……μn。

为求出n个吸收系数,需要建立如上式那样n个或n个以上的独立方程。

CT成像装置从不同方向上进行多次扫描,来获取足够的数据建立求解吸收系数的方程。

吸收系数是一个物理量,它是CT影像中每个像素所对应的物质对X线线性平均衰减量大小的表示。

再将图像面上各像素的CT值转换为灰度,就得到图像面上的灰度分布,就是CT影像。

CT重建过程可以采用直接反投影和卷积反投影来实现。

卷积反投影重建图像时,先把由检测器上获得的原始数据与一个滤波函数进行了卷积运算,得到各方向卷积的投影函数;然后再把它们从各方向进行反投影,即按其原路径平均分配到每一矩阵元上,进行叠加后得到每一矩阵元的CT值;再经过适当处理后就可以得到被扫描物体的断层图像,卷积反投影可消除单纯的反投影产生的边缘失锐效应,补偿投影中的高频成分和降低投影中心密度,并保证重建图像边缘清晰和内部分布均匀。

2.整个程序的结构为:

◆产生sleeplogan模型

◆产生反投影数据

◆卷积反投影

编程在photostar平台下进行。

编程过程中有三个坐标系:

◆坐标系1:

图像坐标系,坐标原点在图像的左上方,x轴水平向右,y轴水平向下,单位为一个“像素”。

◆坐标系2:

空间坐标系,坐标原点在图像中心,x轴水平向右,y轴水平向上,单位为一个“像素”。

◆坐标系3:

归一化空间坐标系,坐标原点在图像中心,x轴水平向右,y轴水平向上,归一化因子为x轴的一半,所以对于m*m大小的图像,xy轴的坐标范围为[-1,1]。

根据坐标系1和坐标系3,可以确定图像的采样率。

根据面向对象的思想,在photostar平台中创建CCTEmulate类来管理实现CT仿真操作。

3.产生sleeplogan模型

要产生一幅图像,对于DIB来说,需要有信息头、文件头、调色板、像素区等部分,为操作简洁,我们读入一幅空白图像(text.bmp),指针m_pImageObject指向这幅空白图像的像素区,直接对像素区进行操作。

值得注意的是,根据实验需求,读入图像为灰度图像即可。

用CCTEmulate类中的SheepLogan函数相应菜单消息,进行仿真头模型的产生。

需要解决一个问题:

如何确定一个像素在哪个椭圆中?

根据椭圆参数方程:

其中AB分别是椭圆的长轴和短轴,x0,y0分别是椭圆的中心坐标,a是椭圆旋转角度。

则根据上式便可以确定在坐标中的一点是否在某一椭圆中。

SheepLogan函数的思路为:

遍历图像,检测图像的每一个像素点是否依次在某一椭圆中,若在a外,则置为背景色,在其他任何椭圆中,则置为该椭圆对应的灰度值。

所有的操作均在归一化坐标系中进行。

代码如下:

voidCPhotoStarView:

:

OnCteCreatsheeplogan()

{

//TODO:

Addyourcommandhandlercodehere

CCTEmulateCCTE;

CCTE.m_pimageproject=m_pImageObject;

CCTE.SheepLogan();

CClientDCdc(this);

Invalidate();

UpdateWindow();

}

BOOLCCTEmulate:

:

SheepLogan()

{

//绘制Sheeplogan模型,坐标系参见高上凯《医学成像系统》附录II

//在此坐标系中,第(ij)个点的坐标(xy)为:

//x=(j-X)/Xy=(Y-i)/Y

//其中X=m_nWidth/2Y=m_nHeight/2

ASSERT(m_pimageproject!

=NULL);//声明m_pImageObject不得为空

CImageObject*pImageObject=m_pimageproject;//重新用一个变量来进行以下操作

//**********获取图像的像素区指针和各种参数****************

intnWidth=pImageObject->GetWidth();//取得图像的宽度

intnHeight=pImageObject->GetHeight();//取得图像的高度

intnNumBits=pImageObject->GetNumBits();//取得图像的位数

intnWidthBytes;//图像每行所占的字节数

char*pBuffer=(char*)pImageObject->GetDIBPointer(&nWidthBytes);

if(pBuffer==NULL)return(FALSE);

BITMAPFILEHEADER*pBFH;//图像文件头指针

BITMAPINFOHEADER*pBIH;//图像信息头指针

RGBQUAD*pRGBPalette;//图像调色板指针

unsignedchar*pBits;//像素区的首指针

intnNumColors=pImageObject->GetNumColors();

pBFH=(BITMAPFILEHEADER*)pBuffer;

pBIH=(BITMAPINFOHEADER*)&pBuffer[sizeof(BITMAPFILEHEADER)];

pRGBPalette=(RGBQUAD*)&pBuffer[sizeof(BITMAPFILEHEADER)

+sizeof(BITMAPINFOHEADER)];

pBits=(unsignedchar*)&pBuffer[sizeof(BITMAPFILEHEADER)

+sizeof(BITMAPINFOHEADER)+nNumColors*sizeof(RGBQUAD)];

for(inti=0;i

{

for(intj=0;j

{

intk=0;//对十个椭圆进行判断,在椭圆内,则置该像素为预定灰度,每次都从0开始

switch(k)

{

case0:

//椭圆a

if(EllipseCaculate(0,0,0.92,0.69,0,1,i,j)>1)//不在椭圆内

{

pBits[(nWidth-1-i)*nWidthBytes+j]=0*255;

break;

}

elsepBits[(nWidth-1-i)*nWidthBytes+j]=1*255;//在椭圆内

case1:

//椭圆b

if(EllipseCaculate(0,-0.0184,0.874,0.6624,0,1,i,j)>1)break;

elsepBits[(nWidth-1-i)*nWidthBytes+j]=0.5*255;

case2:

//椭圆c

if(EllipseCaculate(0.22,0,0.31,0.11,0.3090,0.9511,i,j)<=1)

{

pBits[(nWidth-1-i)*nWidthBytes+j]=int(0.3*255);

break;

……以下椭圆省略…..

inlinefloatCCTEmulate:

:

EllipseCaculate(floatcentX,floatcentY,floatlongaxes,floatshortaxes,floatcosangle,floatsinangle,inti,intj)

{

//返回(ij)在第n个椭圆公式中的计算值

intn=m_pimageproject->GetWidth();

floatX=n/2.0;

intm=m_pimageproject->GetHeight();

floatY=m/2.0;

floatx=(j-X)/X;

floaty=(Y-i)/Y;

return(pow((x-centX)*cosangle+(y-centY)*sinangle,2)/pow(longaxes,2)+pow((centX-x)*sinangle+(y-centY)*cosangle,2)/pow(shortaxes,2));

}

4.产生投影数据

在产生投影数据之前,要模拟投影数据的产生过程。

根据X射线对物体投影的过程,设定每10度投影一次,每次模拟产生过图像中心的13条直线。

要在图像上画线,本质上还是要在图像的像素区中进行操作,将图像中在指定直线上的像素置为255,则可以在图像上画线。

在每个角度产生了画了直线的图像之后,在画下一个角度的投影直线时,需要在原图像上进行操作,所以,每次进行操作之前,应该先保留原图像的像素区,每次画线操作完毕进行显示了之后,将原图像像素区放回到原图像中去。

这样可以进行下一次的有效操作。

对于每次的画线操作,在归一化空间坐标系中,根据直线方程

,角度r从0~180,每10度画线一次,

分别代表过原点的左右两边的直线。

每次画线

从0~0.6,每0.1画线一次。

对于图像坐标系中的点(m,n)经过坐标转换到归一化空间坐标系中为(x,y),当xy满足fabs(x*cos

+y*sin

-

)<0.005则该点(m,n)该置为255.

代码如下:

BOOLCCTEmulate:

:

ShowEmulate(CDC*pDC,intm)

{

//本函数模拟CT采样模型,用一块新的空间来保存原图像中的像素区,

//然后用新的像素区刷新显示,最后恢复原图像的像素区

//math文件中三角函数中角度的单位是弧度

//直线的法线方程为xcosr+ysinr=R

//旋转角度m

…….预备工作的代码略

//坐标转换工作

//在Sheeplogan模型中,坐标系参见高上凯《医学成像系统》附录II

//在此坐标系中,第(ij)个点的坐标(xy)为:

//x=(j-X)/Xy=(Y-i)/Y

//其中X=m_nWidth/2Y=m_nHeight/2

floatX=nWidth/2;

floatY=nHeight/2;

//检查xy是否在模拟的直线上

//下面是一次模拟,完成之后需要显示一次,然后进行下一次

for(floatk=0;k<0.7;k=k+0.1)//法线方程中的长度,

{

floatr1=m/180.0*3.1415;//将角度转换为弧度

floatr2=(m+180)/180.0*3.1415;//将角度转换为弧度

for(inti=0;i

{

for(intj=0;j

{

floatx=(j-X)/X;

floaty=(Y-i)/Y;

if(fabs(x*cos(r1)+y*sin(r1)-k)<0.005||fabs(x*cos(r2)+y*sin(r2)-k)<0.005)

{

//xy在直线上

pBits[(nHeight-1-i)*nWidthBytes+j]=255;

}

}//for(intj

}//for(inti=0

}//for(intk=0

}

产生投影数据主要解决两个问题:

每一条扫描线的投影值如何存放?

每一条扫描线上的投影值是多少?

安排数据结构如下:

扫描共计180次,角度为0~179,图像长或者宽的最大值的一半设为projectionhalflength,则每次扫描线数为projectionlength=2*projectionhalflength-1,安排数组为projectiondata[180*projectionlength].根据直线的法线方程

,则在第r个角度的、法线为

的数据存放的位置为projectiondata[r*projectionlength+k],其中

或者

其中当

时,

,当

是,

,他们对应不同的直线。

中间的一条直线标号为[projectionhalflength-1],对应过原点的直线。

对于特定的角度r,则一排扫描线从0~projectionlength-1,存放了从

的投影值。

根据r和

与数组projectiondata之间的关系,可以确定在角度r和法线

确定的直线的投影值存放的位置。

根据角度

和法线

,对所有存在的直线进行扫描。

思路是:

双重循环r=0~179,k=0~projectionlength-1,这样就确定了一条直线的参数

在双重循环中扫描整幅图像,搜寻这条直线上的像素点(坐标满足直线方程的点就认为在该条直线上),然后将该像素点的灰度值加到对应的投影值中去。

代码如下:

BOOLCCTEmulate:

:

GetProjectionData(double(*pProjDa)[180])

{

//获得图像的投影数据

//以下的坐标系仍采用高上凯《医学成像系统》附录II中坐标系

//ProjDa数组用于存放采样的数据,大小应为m*nm为360(角度),n为图像长宽最大值的一半

ASSERT(m_pimageproject!

=NULL);

//获得图像相应结构数据

intnWidthBytes;

DWORDnColorNum;

char*pBuffer=(char*)m_pimageproject->GetDIBPointer(&nWidthBytes);

if(!

pBuffer)returnFALSE;

nColorNum=m_pimageproject->GetNumColors();

unsignedchar*pBits;

pBits=(unsignedchar*)&pBuffer[sizeof(BITMAPFILEHEADER)+sizeof(BITMAPINFOHEADER)

+nColorNum*sizeof(RGBQUAD)];

intnWidth=m_pimageproject->GetWidth();

intnHeight=m_pimageproject->GetHeight();

//进行坐标转换

floatX=nWidth/2;

floatY=nHeight/2;

//为了在数组中将数据与角度和法线长度(根据直线的法线方程)联系起来

//角度从0旋转到179(整数),法线长度从0~图像长和宽的最大值的一半(整数)

//求每次法线直线方程中法线长度,决定了数组的大小,非常重要!

//数组的第二维大小为2*nProjectionHalfLength-1,从0开始存放坐标系上r+180和r的直线投影的数据

//数组第二维的中心是标号为[nProjectionHalfLength]的点,对应过原点的直线

intnProjectionHalfLength=(nWidth>nHeight)?

nWidth:

nHeight;

nProjectionHalfLength=(int)((nProjectionHalfLength+1)/2.0);

for(intk=0;k

{

for(inti=0;i<180;i++)//进行投影,每一度一次

{

//法线长度转换到对应坐标系中的数值

floatR=(float)k;

R=R/X;//法线长度,坐标转换的尺度应该相同,这里选择X进行转换,Y也一样

floatr1=i/180.0*3.1415;//把角度转换为弧度

floatr2=(i+180)/180.0*3.1415;

for(intm=0;m

{

for(intn=0;n

{

//进行坐标转换

floatx=(n-X)/X;

floaty=(Y-m)/Y;

if(fabs(x*cos(r1)+y*sin(r1)-R)<0.005)

{

//根据i与r,k与R之间的关系,可明确每一个数据对应的像素直线

pProjDa[nProjectionHalfLength-1+k][i]=pProjDa[nProjectionHalfLength+k][i]+pBits[(nHeight-1-m)*nWidthBytes+n];

}

if(R==0)continue;//过原点的直线在最中间,并且只算一次

if(fabs(x*cos(r2)+y*sin(r2)-R)<0.005)

{

//根据i与r,k与R之间的关系,可明确每一个数据对应的像素直线

pProjDa[nProjectionHalfLength-1-k][i]=pProjDa[nProjectionHalfLength-k][i]+pBits[(nHeight-1-m)*nWidthBytes+n];

}

}//for(intn=

}//for(intm=0

}//for(floati=0;

}//for(intk

}

这种思路的优点在于,思路简单,比较精确,用阈值0.005可以让计算机相对准确找到在对应直线上的像素。

缺点在于,四重循环,计算量太大,测试发现,该函数在调试状态下的运行时间大约是10分钟。

换一种思路,不必让计算机通过遍历整个图像来计算哪些点在该条直线上,根据直线方程,我们能够通过遍历x轴(相当于得到列的信息)来计算y轴(对应的行的信息),则可以得到在原图像坐标系下对应像素的坐标,这样计算一条直线就可以只需要三重循环,速度大大加快。

值得注意的是,如果我们要在像素区中操作某一个像素的灰度值,在需要得到在图像坐标系下的该像素的坐标,如果我们要计算判断直线,则应该在空间坐标系下进行。

代码如下:

BOOLCCTEmulate:

:

GetProjectionData(double*pProjDa)

{

//获得图像的投影数据

//以下的坐标系仍采用高上凯《医学成像系统》附录II中坐标系

//ProjDa数组用于存放采样的数据,大小应为m*nm为360(角度),n为图像长宽最大值的一半

ASSERT(m_pimageproject!

=NULL);

//获得图像相应结构数据

intnWidthBytes;

DWORDnColorNum;

char*pBuffer=(char*)m_pimageproject->GetDIBPointer(&nWidthBytes);

if(!

pBuffer)returnFALSE;

nColorNum=m_pimageproject->GetNumColors();

unsignedchar*pBits;

pBits=(unsignedchar*)&pBuffer[sizeof(BITMAPFILEHEADER)+sizeof(BITMAPINFOHEADER)

+nColorNum*sizeof(RGBQUAD)];

intnWidth=m_pimageproject->GetWidth();

intnHeight=m_pimageproject->GetHeight();

//进行坐标转换

floatX=nWidth/2.0;

floatY=nHeight/2.0;

//为了在数组中将数据与角度和法线长度(根据直线的法线方程)联系起来

//角度从0旋转到179(整数),法线长度从0~图像长和宽的最大值的一半(整数)

//求每次法线直线方程中法线长度,决定了数组的大小,非常重要!

//数组的第二维大小为2*nProjectionHalfLength-1,从0开始存放坐标系上r+180和r的直线投影的数据

//数组第二维的中心是标号为[nProjectionHalfLength-1]的点,对应过原点的直线

intnProjectionHalfLength=(nWidth>nHeight)?

nWidth:

nHeight;

nProjectionHalfLength=(int)((nProjectionHalfLength+1)/2.0);

intnProjectionLength=2*nProjectionHalfLength-1;

for(inti=0;i<180;i++)//进行投影,每一度一次

{

floatr1=i/180.0*3.1415;//把角度转换为弧度

floatr2=(i+180)/180.0*3.1415;

for(intk=0;k

{

floatL=float(k-nProjectionHalfLength+1);//法线长度

intn=0;//原图像的列,从0开始计算

while(k

{

floatx=n-X;

floaty=(L-x*cos(r2))/sin(r2);/由方程和图像列的信息推算行的信息

intm=int(Y-y);//取整有一定误差,原图像的行,也从0开始计算

n++;

if(m<0||m>=nHeight)continue;//如果m超出图像范围,则跳过

pProjDa[i*nProjectionLength+k]=pProjDa[i*nProjectionLength+k]+pBits[(nHeight-1-m)*nWidthBytes+n];

}

n=0;//对每一条直线x轴都要扫描一次

while(k>=nProjectionHalfLength-1&&n

{

floatx=n-X;

flo

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