碱基符号.docx
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碱基符号
碱基符号
生物信息学中常用的18个碱基字母
字母
碱基
全称
说明
单碱基
A
A
Adenine
腺嘌呤
C
C
Cytosine
胞嘧啶
G
G
Guanine
鸟嘌呤
I
I
Isosine
次黄嘌呤
T
T
Thymine
胸腺嘧啶
U
U
Uracil
尿嘧啶
二碱基
K
G/T
Keto
含酮基
M
A/C
aMino
含氨基
R
A/G
puRine
嘌呤
S
G/C
Strongpair
强配对
W
A/T
Weakpair
弱配对
Y
C/T
pYrimidine
嘧啶
三碱基
B
C/G/T
NotA
非A
D
A/G/T
NotC
非C
H
A/C/T
NotG
非G
V
A/C/G
NotU（orT）
非U（T）
四碱基
N
A/C/G/T
Any
任一碱基
X
A/C/G/T
Unknown
未知碱基
氨基酸
名称
Name
简写
密码子
分子量
残基
A3
A2
ml/g
丰度
pI
pKa
亲水
疏水
侧链
A
丙氨酸
'alanine
Ala
GCX
89.09
71.08
88.6
115
748
7.55
6.0
0.45
0.5
-CH3
C
半胱氨酸
cy'stine
Cys
TGM
121.15
103.14
108.5
135
631
1.69
5.0
9.3
3.63
-2.8
-CH2SH
D
天冬氨酸
'asparicacid
Asp
AAM
132.12
114.11
117.7
160
619
4.52
5.4
13.31
-7.4
-CH2CONH2
E
谷氨酸
glu'tamicacid
Glu
GAP
147.13
129.12
138.4
190
643
6.32
12.58
-9.9
-CH2CH2COO-
F
苯丙氨酸
pheny'lalanine
Phe
TTM
165.19
147.18
189.9
210
774
4.07
5.5
3.15
2.5
CH2（C6H5）
G
甘氨酸
'glycine
Gly
GGX
75.07
57.06
60.1
75
632
6.84
6.0
0
0
-H
H
组氨酸
'histidine
His
CAM
155.16
137.15
153.2
195
670
2.24
12.62
0.5
-CH2（C3N2H4）+
I
异亮氨酸
iso'luecine
Ile
ATM,ATA
131.17
113.17
166.7
175
884
5.72
6.2
0.24
2.5
-CH（CH3）CH2CH3
K
赖氨酸
'lysine
Lys
AAP
146.19
128.18
168.6
200
789
5.93
11.91
-4.2
-（CH2）4NH3+
L
亮氨酸
'luecine
Leu
CTX,TTP
131.17
113.17
166.7
170
885
9.33
6.0
0.11
1.8
-CH2CH（CH3）2
M
蛋氨酸
me'thionine
Met
ATG
149.21
131.21
162.9
185
745
2.35
5.8
10.4
3.87
1.3
-（CH2）2SCH3
N
天冬酰胺
a'sparagine
Asn
GAM
133.10
115.09
111.1
150
579
5.30
4.5
12.07
-0.2
-CH2COO-
P
脯氨酸
'proline
Pro
CCX
115.13
97.12
122.7
145
758
4.92
6.3
-3.3
-（CH2）3-
Q
谷氨酰胺
'glutamine
Gln
CAP
146.15
128.14
143.9
180
674
4.02
5.7
4.6
11.77
-0.3
-CH2CH2CONH2
R
精氨酸
'arginine
Arg
CGX,AGP
174.20
156.20
173.4
225
666
5.15
~12
22.31
-11.2
-（CH2）3CH（NH2）+NH2
S
丝氨酸
'serine
Ser
TCX,AGM
105.09
87.08
89.0
115
613
7.22
5.7
7.45
-0.3
-CH2OH
T
苏氨酸
'threonine
Thr
ACX
119.12
101.11
116.1
140
689
5.74
6.5
7.27
0.4
-CH（OH）CH3
V
缬氨酸
'valine
Val
GTX
117.15
99.14
140.0
155
847
6.52
6.0
0.40
1.5
CH（CH3）2
W
色氨酸
'tryptophan
Trp
TGG
204.23
186.21
227.8
255
734
1.25
8.28
3.4
-CH2（C8N1H6）
Y
酪氨酸
'tyrosine
Tyr
TAM
181.19
163.18
193.6
230
712
3.19
9.7
8.50
2.3
CH2（C6H4）OH
注：
密码子说明见碱基符号；A3和A2分别是埃为单位的体积和面积；ml/g为溶解1g所需水量；丰度为SwissProt蛋白质数据库中的氨基酸丰度。
张闻制作2009.6
希腊字母
24个希腊字母的拼写、读音和含义
Greek
English
Spell
Read
Chinese
Usage
Α
α
A
alpha
alfa
阿耳法
1st,closest,best,letter,α-ray
Β
β
B
beta
bet'a
贝塔
2nd,β-ray
Γ
γ
G
gamma
gamma
伽马
3rd,γ-ray
Δ
δ
D
delta
delt'a
德耳塔
4th,Δ-shape,variableincrement
Ε
ε
E
epsilon
ep'silon
艾普西隆
5th,mathsmallresidue
Ζ
ζ
Z
zeta
zet'a
截塔
6th
Η
η
H
eta
et'a
艾塔
7th,mathysubstitutive
Θ
θ
Q
theta
θit'a
西塔
8th,mathtarget
Ι
ι
I
iota
iot'a
约塔
9th,few
Κ
κ
K
kappa
k'app'a
卡帕
10th,oftenreplacedbycinEnglish
Λ
λ
L
lambda
lambda
兰姆达
11th,λ-particle,λ-phage
Μ
μ
M
mu
miu
缪
12th,10-6,average
Ν
ν
N
nu
niu
纽
13th,nameunknown,error,speed
Ξ
ξ
X
xi
ksi
克赛
14th,mathxsubstitutive
Ο
ο
O
omicron
omik'ron
奥密克戎
15th
Π
π
P
pi
p'ai
派
16th,3.1415926,chaos
Ρ
ρ
R
rho
rou
柔
17th
Σ
σ（ς）
S
sigma
sigma
西格马
18th,standarddeviation
Τ
τ
T
tau
t'au
套
19th,T-shape,300,time
Υ
υ
U
upsilon
jup'silon
衣普西隆
20th
Φ
Φ（φ）
F
phi
fai
弗艾
21th
Χ
χ
C
chi
khai
忾
22th
Ψ
ψ
Y
psi
p'sai
普西
23th,pseudo
Ω
ω
W
omega
omiga
欧米伽
24th,end,all
张闻制作2009.6
生物分子的功能基团
中文
英文
基团
举例
备注
烃基
甲基
methyl
-CH3
丙氨酸
乙基
ethyl
-C2H5
亮氨酸
苯基
phenyl
-C6H5
苯丙氨酸
含氧基
羟基（醇）
hydroxyl（alcohol）
-OH
糖丝氨酸甘油
酰基（酯）
actyl（ester）
-COO-
脂类，乙酰胆碱
羧基（酸）
carboxyl
-COO
氨基酸脂肪酸柠檬酸
羰基（酮）
carboxyl（ketone）
-CO-
丙酮酸
醛
aldehyde
-CHO
葡萄糖
醚
ether
-O-
乙醚
酐
anhydride
-COOCO-
碳酸酐
含氮基
氨基
amino
-NH2
氨基酸
碱性
酰胺
amido
-CONH2
谷氨酰胺
胍
guanidine
-CN3H4
精氨酸
碱性
咪唑
imidazole
-C3N2H3
色氨酸嘌呤
含硫基
巯基
sulfhydryl
-SH
半胱氨酸
还原性
二硫键
disulfide
-SS-
胱氨酸
硫酯
thioester
-COS-
乙酰辅酶A
含磷基
磷酸根
phosphoryl
-PO4H
核苷酸
激活作用
磷酸酐
phosphoanhydride
-PO4PO3-
ATP
能量利用
酰基磷酸
acylphosphate
-COPO4H
磷酸化蛋白
化学元素周期表
化学元素周期表的原子序号、符号、原子量和生物含量
1
H氢
1.008
2
He氦
4.003
3
Li锂
6.941
4
Be铍
9.012
5
B硼
10.81
6
C碳
12.011
7
N氮
14.007
8
O氧
15.999
9
F氟
18.998
10
Ne氖
20.180
11
Na钠
22.990
12
Mg镁
24.305
13
Al铝
26.982
14
Si硅
28.086
15
P磷
30.974
16
S硫
32.065
17
Cl氯
35.453
18
Ar氩
39.948
19
K钾
39.098
20
Ca钙
40.078
21
Sc钪
44.956
22
Ti钛
47.867
23
V钒
50.942
24
Cr铬
51.996
25
Mn锰
54.938
26
Fe铁
55.845
27
Co钴
58.933
28
Ni镍
58.693
29
Cu铜
63.546
30
Zn锌
65.409
31
Ga镓
69.723
32
Ge锗
72.640
33
As砷
74.922
34
Se硒
78.960
35
Br溴
79.904
36
Kr氪
83.798
37
Rb铷
85.468
38
Sr锶
87.620
39
Y镱
88.906
40
Zr锆
91.224
41
Nb铌
92.906
42
Mo钼
95.940
43
Tc锝
97.907
44
Ru钌
101.070
45
Rh铑
102.906
46
Pd钯
106.420
47
Ag银
107.868
48
Cd镉
112.411
49
In铟
114.818
50
Sn锡
118.710
51
Sb锑
121.760
52
Te碲
127.600
53
I碘
126.904
54
Xe氙
131.293
55
Cs铯
132.905
56
Ba钡
137.327
57-71
镧系
72
Hf铪
178.490
73
Ta钽
180.948
74
W钨
183.840
75
Re铼
186.207
76
Os锇
190.230
77
Ir铱
192.217
78
Pt铂
195.078
79
Au金
196.967
80
Hg汞
200.590
81
Tl铊
204.383
82
Pb铅
207.190
83
Bi铋
208.980
84
Po钋
208.980
85
At砹
209.990
86
Rn氡
222.020
87
Fr钫
223.020
88
Ra镭
226.025
89-103
锕系
104
Rf卢
261.110
105
Db杜
262.110
106
Sg喜
263.120
107
Bh波
264.12
108
Hs黑
265.13
109
Mt麦
266.13
110
Ds达
（269）
111
Rg仑
（272）
112
Uub
（277）
113
Uut
（278）
114
Uuq
（289）
115
Uup
（288）
116
Uuh
（289）
117
118
（293）
57
La镧
138.906
58
Ce铈
140.116
59
Pr镨
140.908
60
Nd钕
144.240
61
Pm钷
144.910
62
Sm钐
150.363
63
Eu铕
151.964
64
Gd轨
157.250
65
Tb铽
158.925
66
Dy镝
162.500
67
Ho钬
164.930
68
Er铒
167.259
69
Tm丢
168.934
70
Yb镱
173.040
71
Lu镥
174.967
89
Ac锕
227.028
90
Th钍
232.038
91
Pa镤
231.036
92
U铀
238.029
93
Np镎
237.048
94
Pu钚
244.070
95
Am镅
243.060
96
Cm锔
247.070
97
Bk锫
247.070
98
Cf锎
251.080
99
Es锿
252.080
100
Fm镄
257.100
101
Md钔
258.100
102
No锘
259.100
103
Lr铹
260.110
注：
绿－生物宏量元素；淡绿－生物常量元素；黄－生物微量元素；淡蓝－人造元素；原子量加括号－不稳定元素。
张闻制作2009.6
人的分类地位
根据NCBITaxonomy翻译的人的分类等级及旁类
级别
英文学名
中文学名
同级生物类群
1
cellularorganisms
细胞生物
病毒、类病毒
2
Eukaryota
真核生物域
细菌域、古生菌域
3
Fungi/Metazoa
真菌/后生动物
植物界、低等真核生物
4
Metazoa
后生动物界
真菌界、领鞭虫目
5
Eumetazoa
真后生动物
中生动物总门、扁盘动物门、海绵动物门
6
Bilateria
两侧对称动物
腔肠动物门、栉水母动物门
7
Coelomata
体腔动物
无体腔动物、假体腔动物
8
Deuterostomia
后口动物
原口动物
9
Chordata
脊索动物门
毛颚动物门、棘皮动物门、半索动物门、尾索动物门
10
Craniata
有头动物亚门
头索动物亚门、被囊动物亚门
11
Vertebrata
脊椎动物
穿腭动物
12
Gnathostomata
颚口动物总纲
圆口动物
13
Teleostomi
硬骨动物
软骨鱼纲
14
Euteleostomi
真硬骨动物
假硬骨鱼
15
Sarcopterygii
总鳍动物
条鳍鱼纲
16
Tetrapoda
四足动物
腔棘鱼亚纲、肺鱼下纲
17
Amniota
羊膜动物
两栖纲
18
Mammalia
哺乳纲
蜥形动物
19
Theria
兽
原兽（卵生）
20
Eutheria
真兽
后兽（无胎盘）
21
Euarchontoglires
真祖兽总目
非洲兽总目、劳亚兽总目、异兽目
22
Primates
灵长目
飞狐猴目、啮齿动物、树鼩目
23
Haplorrhini
干鼻猴亚目
原猴亚目
24
Simiiformes
简鼻猿下目
跗猴下目
25
Catarrhini
狭鼻猿子目
阔鼻猿子目
26
Hominoidea
人形总科
长尾猴总科
27
Hominidae
人形科
长臂猿科
28
Homininae
人形猿
猩猩属
29
Homo
人属
黑猩猩属、大猩猩属
30
Homosapiens
人（种）
包含尼安德特人亚种
张闻制作2009.6
同位素
原子序号
元素
中文
同位素1
%
同位素2
%
同位素3
%
同位素4
%
平均原子量
1
H
氢
1.00783
99.9844
2.01410
0.0156
1.00794
6
C
碳
12.00000
98.8922
13.00335
1.1078
12.01070
7
N
氮
14.00307
99.6337
15.00011
0.3663
14.00670
8
O
氧
15.99491
99.7628
16.99913
0.0372
17.99916
0.2000
15.99940
9
F
氟
18.99840
100.0000
18.99840
11
Na
钠
22.98977
100.0000
22.98977
12
Mg
镁
23.98504
78.9920
24.98584
10.0030
25.98259
11.0050
24.30500
13
Al
铝
26.98154
100.0000
26.98154
14
Si
硅
27.97693
92.2297
28.97649
4.6832
29.97377
3.0872
28.08550
15
P
磷
30.97376
100.0000
30.97376
16
S
硫
31.97207
95.0180
32.97146
0.7500
33.96787
4.2150
35.96708
0.0170
32.06500
17
Cl
氯
34.96885
75.7710
36.96590
24.2290
35.45300
19
K
钾
38.96371
93.2581
39.96400
0.0117
40.96183
6.7302
39.09830
20
Ca
钙
39.96259
96.9410
41.95862
0.6470
42.95877
0.1350
43.95548
2.0860
40.07800
24
Cr
铬
49.94605
4.3452
51.94051
83.7895
52.94065
9.5006
53.93888
2.3647
51.99610
25
Mn
锰
54.93805
100.0000
54.93805
26
Fe
铁
53.93961
5.8450
55.93494
91.7540
56.93540
2.1191
57.93328
0.2819
55.84500
27
Co
钴
58.93320
100.0000
58.93320
28
Ni
镍
57.93535
68.0769
59.93079
26.2231
60.93106
1.1399
61.92835
3.6345
58.69340
29
Cu
铜
62.92960
69.1740
64.92779
30.8260
63.54600
30
Zn
锌
63.92915
48.6300
65.92604
27.9000
66.92713
4.1000
67.92485
18.7500
65.39000
33
As
砷
74.92160
100.0000
74.92160
35
Br
溴
78.91834
50.6860
80.91629
49.3140
79.90400
47
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