初学vaspWord格式文档下载.docx

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ok那么实际上VASP的计算就是利用以上定理,通过T算符的变换,将实空间(r空间)和动

量空间(k空间)联系起来,利用晶格的周期性简化计算,所以在后面的讨论中将常出现

band,k-points,projectorsinrealspace等概念。

[Lasteditedbyzzgybon2008-1-27at14:

39]

POSCAR=position+CAR

第1行:

任意文字注释

第2行:

晶格常数,单位A,后面所有的长度值得自原值除以此值

a=b=c时取a即可,否则个人习惯取三者最大

若取负值,则为晶胞体积,单位A3

第3-5行:

定义晶矢参见《固体量子化学——材料化学的理论基础》赵成大

如对于正交晶体a=20.022b=19.899c=13.383α=β=γ=90

可以这样定义

20.022

1.000000.000000.00000

0.000000.993860.00000

0.000000.000000.66841

又如对于面心立方晶体a=b=c=3.57α=β=γ=90

可以定义如下

3.57

0.00.50.5 

 

(1/2(b+c))

0.50.00.5 

(1/2(a+c))

0.50.50.0 

(1/2(a+b))

第6行:

每种元素的原子数,特别注意顺序,要与下面的坐标顺序以及POTCAR中

的顺序一致

第7行:

可省略,无需空行。

做动力学时,是否需要固定部分离子的坐标。

若是,此行以'

S'

或者'

s'

首字即可。

第8行开始为离子的坐标,格式为

optionline

coordinate1ofelement1

coordinate2ofelement1

...

coordinateNofelement1

coordinate1ofelement2

coordinate2ofelement2

coordinateMofelement2

其中,optionline指定输入坐标的格式,除了第一个以外,如果后面的输入格式同前,

则都可以无空行省略。

optionline可指定的输入坐标格式有两种

'

D'

or'

d'

fordirectmode

C'

c'

K'

k'

forcartesianmode

顾名思义,前者是定义在三个晶矢方向上的坐标

R=R1×

x+R2×

y+R3×

zR1,R2,R3为前面的晶矢,x,y,z为输入的三个坐标,R为坐标位矢

而后者只是简单的将直角坐标除以前面第二行定义的晶胞常数

两者可以混用,但不推荐。

如果第7行设定了S(SelectiveDynamic),则可以用以下形式定义各坐标是否可以移动

Selectivedynamics

Cartesian

0.000.000.00TTF

0.250.250.25FFF

40]

如前所述

TheBlochtheoremchangestheproblemofcalculatinganinfinitenumberof

electronicwavefucntionstooneofcalculatingafinitenumberof

wavefunctionsataninfinitenumberofk-points.(参见CASTEP的帮助文档,他和

VASP是亲兄弟)。

所以呢,一般来说,k点越密越多,计算精度也越高,当然计算成本也越高。

嗯,对于k点的需求,金属>

>

半导体,绝缘体,不过呢,很多时候主要还是受硬件限制

简约化可以使k点的数目大大下降。

对于原子数较多的体系的计算,就需要谨慎的尝试 

 

k点数目,在避免或者预先评估wrap-arounderror的前提下尽量减少k点数目。

另一个问题是k空间网格(k-pointsgrid)的位置和形状,

是否包括Г点(Gamma点,也可理解为原点)?

(一般不包括的话很可能会带来误差,尤其

是使用了tetrahedron方法的时候。

暂时还不知道不包括的好处,为了减少k点?

方形?

线形?

还是长方形?

或者奇形怪状?

后文另述。

那么现在来看看KPOINTSfile的结构:

Line1:

commentline注释行noproblem

Line2:

k点总数或者'

0'

自动生成网格(Automatick-meshgeneration)

如果是前者,给出k点总数,又分两种情况

M.全手动Enteringallk-pointsexplicitly

Line3:

输入格式标识。

直角坐标(Cartesian)或者倒格坐标(Reciprocal)

同样的'

cCkK'

forCartesian,其他首字母则自动切换到Reciprocal

Line4-n:

逐个k点的描述。

格式为xyzW。

xyz是三个坐标,W是权重。

所有k点的权

重相互之间的比例对了就行,VASP会自动归一的

注意C坐标和R坐标的定义

C:

k=(2π/a)(xyz)R:

k=x*b1+y*b2+z*b3b1-3为倒格基矢

(这里我们看到xyz只是代表了坐标的顺序,与坐标轴无关)

比如一些常用的高对称性点的C和R坐标:

Point 

Cartesiancoordinates 

Reciprocalcoordinates

(unitsof2pi/a) 

(unitsofb1,b2,b3)

------------------------------------------------------

( 

) 

(1/21/2 

(1/2 

(1/23/41/4 

(3/43/4 

(3/83/83/4 

(1/21/21/2) 

(1/21/21/2 

输入示例:

Examplefile

4

0.0 

1.

0.5 

2.

4.

一般如非必要,可以先用自动模式生成k点,VASP会自动生成一个简约化后的k点矩阵,

存于IBZKPTfile,可以直接复制里面的数据到KPOINTSfile来用,其实这也是这个输入

法的主要用途,为了减少重复自动生成格点的时间。

另一个用途是为了做精确的DOS(Densityofstatus)的计算,由于这类计算所需k点数极

大,通过全手动尽可能的优化k点也就必需了。

L.半手动/线形模式Stringsofk-pointsforbandstructurecalculations

看到啦,对于能带结构的计算,同前面的理由,需要精确的选取k点,在指定的高对称性

方向上生成指定数目的k点。

指定两点间生成的k点数不同于全自动的总k点数

Line2.5:

'

L'

forLine-mode表示是线形模式

同前。

CorR

每行描述一个点格式为xyz。

每两行的点连成一线,在两点间生成指定数

目的k点。

每两行两行之间以空行区分(不空的话,VASP可能也认得出,没试过)

比如:

10 

!

10intersections

Line-mode

rec

gamma

0.50.50 

X

0.50.750.25 

W

ok,那么更常用的方法是让VASP自动生成网格

0!

numberofk-points=0->

automaticgenerationscheme

(!

后面字符为注释)

AforfullyautomaticorGforГ/GammaorMforMonkhorst-Pack

若都不是这些首字母,则自动切换为高级模式。

Amode全自动模式,可以看作以Г点为圆心以l为半径做圆,当然各晶格矢不同时,相

应的圆就拉成了椭圆,来确保三个倒格矢方向上覆盖的k点数为l

Line4:

length(l)

Usefulvaluesforthelengthvarybetween10(largegapinsulators)and

100(d-metals). 

进一步的做法是分别指定三个倒格矢方向上的格点数N1,N2,N3。

Gmode

Line4:

N1N2N3

Line5:

s1s2s3偏移原点的位矢一般设成000啦。

以及Monkhorst-Pack法,生成的格点不包括Г点,从Г点周围1/2长度处开始取点。

Mmode

s1s2s3同上

所谓的高级模式,就是用C坐标或者R坐标直接输入新的基矢

c

0.2500 

0.2500

00.250 

00.250

000.25 

000.25

0.00.00.0 

0.50.50.5

分别等价于

m

444 

444

000 

000

因为存在这种等价关系,所以一般也没有必要使用高级模式

好啦,就这些。

最后提醒一点,VASP的帮助文档特别提醒,对于六方晶系,不要用M来自

动生成格点,而要用G。

关于tetrahedra方法,帮助文档说用于全手动模式,可选。

具体设定原文如下:

Inthiscase,thenextlinemuststartwith'

T'

or'

t'

signalingthatthis

connectionlistissupplied.Onthenextlineafterthis'

controlline'

one

mustenterthenumberoftetrahedraandthevolumeweightforasingle

tetrahedron(alltetrahedramusthavethesamevolume).Thevolumeweight

issimplytheratiobetweenthetetrahedronvolumeandthevolumeofthe

(total)Brillouinzone.Thenalistwiththe(symmetrydegeneration)weight

andthefourcornerpointsofeachtetrahedronfollows(fourintegerswhich

representtheindicestothepointsinthek-pointlistgivenabove,1

correspondstothefirstentryinthelist).Warning:

Incontrasttothe

weightingfactorsforeachk-pointyoumustprovidethecorrect'

volume

weight'

and(symmetrydegeneration)weightforeachtetrahedron-no

internalrenormalizationwillbedonebyVASP!

示例:

Tetrahedra

0.183********3333

1234

具体请参见帮助文档8.4节

41]

POTCAR赝势文件

可以理解为分子力学模拟中的力场文件但包括的信息更多

VASP4.6将各元素优化的INCAR里的参数也包括在这里了,作为支持PREC的缺省选择

通常各元素的POTCAR已经包括在软件包里了

我们只需要按照POSCAR里的顺序,将各元素的POTCAR按顺序连接起来就可以了

如以下命令:

catfile1file2file3>

POTCAR

软件包自带的绝大多数赝势是超软赝势(US-PP)了,但不少元素有两个版本,如何

选取呢?

一个简单的办法是看后缀

标准的没有后缀_h硬一点_s软一点

_pv,_sv,_d就是说semi-core的p,s或者d也当做价态处理了

如果是数字的话,表示的可能是不同的半径截距

也可以参考各版本同目录下的V_RHFINfile,PSCTRfile

这两个文件告知该版本的赝势是如何生成的。

V_RHFINfile

Sc:

6pd2s1

21. 

.002000 

44.95590125. 

.25E-05.300 

200FCA12.00000

.7 

1.0 

.0 

.5-320.88472.0000

2.0 

.5 

-34.42172.0000

1.5 

-28.23666.0000

3.0 

-3.79442.0000

-2.25916.0000

2.5 

-.11132.0000

4.0 

-.26991.0000

-.1000 

.0000

第一行是注释行给出基本的信息

第二行是最重要的控制行

.002000 

200FCA12.00000

XION 

AM 

DELRVR 

PHI 

NC1|CHQCOR

|

GREEN

J-轨道数 

Z-原子序数 

XION-离子化程度一般设为0N-格点数

AM-原子质量 

H-决定格点间距 

DELRVR-自洽收敛标准

PHI-线性拟合参数NC1-最大自洽循环次数GREEN-是否存在初始的势

CH-交换相关能(XC)类型

Slater-XC

HLHedinLundquist(1971)

CACeperlyandAlderparameterizedbyJ.PerdewandZunger

WIWignerinterpolation

PBPerdew-Becke

PWPerdew-Wang86

LMLangreth-Mehl-Hu

91Perdew-Wang91

QCOR-非价键电子数(coreelectrons)

第三行开始是每个轨道的具体参数,依次为

nlj(=l±

1/2)原子轨道能占有率

PSCTRfileofLDA/H1.25

TITEL 

=USH

LULTRA= 

useultrasoftPP?

RWIGS 

0.57 

nndistance!

Wigner-Seitzradius

RCLOC 

.65

NE 

100

LCOR 

.TRUE.

QCUT 

-1

RMAX 

=3.0!

coreradiusforproj-oper

Description

TYPRCUT 

TYP 

RCUT(cutoffradius)

15 

0.80 

23 

1.25

15 

-0.2 

最重要的地方上面已经用颜色标出来啦:

说明一下,TYP是指赝势的类型,RCUT是半径截距,TYP可取的值如下:

正则

1BHS

2TM

3VAN

6XNC

7RRKJwavefunctionpossiblywithnode

15RRKJwavefunctionstrictlynonode

非正则+8

最后一个问题是LDAorGGA。

貌似没有定论目前。

这个最好是两个一起做做看啦。

或者看文献别人验证过哪个数据好。

其实据说目前最好的是PAW(P.E.Blochl,Phys.Rev.B50,17953(1994).,Phys.Rev.B59,

1758(1999).),PP已经落伍了,不过好像我们用的VASP不带这个,就不展开讨论了。

42]

INCAR是决定howtodo的文件

限于能力,只对部分最基本的一些参数(>

没有这个标志的参数都是可以不出现的)

详细说明,在这里只是简单介绍这些参数的设置,详细的问题在后文具体示例中展开。

部分可能会干扰VASP运行的参数在这里被刻意隐去了,需要的同学还是请查看VASP自带

的帮助文档原文。

参数列表如下:

SYSTEMnameofSystem

任务的名字***

NWRITEverbositywrite-flag(howmuchiswritten)

输出内容详细程度0-3缺省2

如果是做长时间动力学计算的话最好选0或1(首末步/每步核运动输出)

据说也可以结合shell的tail或grep命令手动输出

ISTARTstartjob:

restart选项0-3缺省0/1for无/有前次计算的WAVECAR(波函数)

1'

restartwithconstantenergycut-off'

2'

restartwithconstantbasiss

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