人肌红蛋白基因外显子一生物信息学分析Word文档格式.docx

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核酸分析首先从pubmed核酸数据库中搜索到人的Myoglobin核酸序列，分别进行序列的基本性质分析，限制性酶谱分析及其基因在染色体上的定位分析。

具体操作方法将根据上述各个软件上“Help”文件进行，基因在染色体上的定位分析根据网页上的操作说明进行。

从pubmed蛋白质数据库中搜索到人的Myoglobin和整个前体Myoglobin蛋白质序列，分别进行蛋白序列的基本性质分析（氨基酸组成、分子量、等电点），亲疏水性分析，蛋白酶切位点分析，信号肽序列分析，二级结构和三维结构分析，同源序列和进化分析。

二级结构分析包括结构功能域、Motif、保守位点等，具体操作方法将根据上述各个软件上“Help”文件和网页上的操作说明进行。

Resluts:

1.从NCBI中可以得到一下有关Myoglobi蛋白分子的信息：

Human 

myoglobin 

gene,exon1

GenBank:

LOCUSHUMMGI12552bpDNAlinearPRI07-JAN-1995

DEFINITIONHumanmyoglobingene,exon1.

ACCESSIONM10090

VERSIONGI:

187580

KEYWORDSFokfamilyrepetitivesequence;

directrepeat;

myoglobin;

repeat

region;

tandemrepeat.

SEGMENT1of

SOURCEHomosapiens（human）

ORGANISM

Eukaryota;

Metazoa;

Chordata;

Craniata;

Vertebrata;

Euteleostomi;

Mammalia;

Eutheria;

Euarchontoglires;

Primates;

Haplorrhini;

Catarrhini;

Hominidae;

Homo.

REFERENCE1（bases1to2552）

AUTHORSAkaboshi,E.

TITLECloningofthehumanmyoglobingene

JOURNALGene33（3）,241-249（1985）

PUBMED

COMMENTOriginalsourcetext:

Human:

fetalliverDNA（libraryofLawnet

al.）,clonelambda-HMB151;

delta-thalassemialeukocyteDNA（library

ofKimuraetal.）,clonelambda-HMB159.

Draftentryandcomputer-readablecopyofsequence[1]kindly

providedby,22-OCT-1985.

Atandemrepeatsequenceisfoundatposition142-794.Positionof

themRNAcapsitewasdeducedfromthatofthesealmyoglobingene

（Blanchetotetal.1983）.

FEATURESLocation/Qualifiers

source1..2552

/organism="

Homosapiens"

/mol_type="

genomicDNA"

/db_xref="

taxon:

"

/map="

1100..1750

/note="

Fokfamilyrepetitiveelement"

1895..>

2552

myoglobinmRNAandintron"

join（1965..2552,:

1..2671,:

1..501）

/gene="

MB"

join（1965..2059,:

1415..1637,:

355..501）

myoglobin"

/codon_start=1

/protein_id="

GI:

386872"

/translation="

MGLSDGEWQLVLNVWGKVEADIPGHGQEVLIRLFKGHPETLEKF

DKFKHLKSEDEMKASEDLKKHGATVLTALGGILKKKGHHEAEIKPLAQSHATKHKIPV

KYLEFISECIIQVLQSKHPGDFGADAEGAMNKALELFRKDMASNYKELGFQG"

<

1965..2059

myoglobin;

G00-119-378"

/number=1

2060..>

myoglobinintronA"

ORIGIN2bpupstreamofRsaIsite.

1gtactgtattttcattcctcttagttatctccctaaaaagactctgagttccttgaacac

61aggaaggtgttttatttgattttgttatcctcagcatgtagcagtgtctgacacacagta

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181tagatggagggatgggtggatgatggatggatagatggatggaggggggatgatgaatgg

241agggataatgagtggatgaatgagggaatgggtggatggatggatggagggatggaggaa

301cagatagatagatggagggatgggtgggtgatggatggatagatggatggagggagggat

361gatgaatggagggataatgaatggatgaatgaggggatgggtggatggatgaatggaggg

421atgatgggtggatgaatgaattgagggatggatggatgaacacatggatggatggataga

481tggatagatggaggaactggtggattttggatggatgggtggatggatagatgaatgaat

541gcctggatagacaaagagatgatggatagatgaatagatgaattaagggatgtcggatag

601atggagggattgatagatgttggatggatgggtggtggatggatagatgagtgaatgcat

661ggatagacaaagagatgatggatggatgaattaagggatgacagatggatggatggatga

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1021atgtttccctactttctctcaattaaatagggataatgtcagtacctatcacattgggag

1081gtcttgcggggattaaatgagttaccaaatgccaagtgtttgggacagggcctggcaccc

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1321ctttgagcagggtcatgaaaacaggagttctctaagagattgtggacttgcctgggacca

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1561gcagggagcgttgggtttcaggctgctggcgtcggcttctgtggtgccctttctgtcggc

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1681ccccctgtggcctgagctgtcctgcctcgccacaatggcacctgccctaaaatagcttcc

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1861gtataaaaacgcccttgggaccaggcagcctcaaaccccagctgttggggccaggacacc

1921cagtgagcccatacttgctctttttgtcttcttcagactgcgccatggggctcagcgacg

1981gggaatggcagttggtgctgaacgtctgggggaaggtggaggctgacatcccaggccatg

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2101aagatcaagggtgttcagctgcaaggtggaaagtttgcacgtggggtaggtcagttggct

2161gcattagttaagggtgttagaacggtcacttgctttttctttgcttttaagtgtcaggga

2221ttggactcaggagagggaaaggagccatttcaggctgatgtcagcagctggaggaagcat

2281gagaatcaaacctaggatgctcagagtccaccaggaagaattttagaattatagacagtc

2341agagttaacaagggtcctgagagattttgtacagccacctctcttacaggatgaggacaa

2401aaagcgactgagaaggggaggacatttccagagtcacagctcattaaatgctcttaaagt

2461gtcaaggttaagacatgctcttcaaggggagacagatctggttctagacttggctctgcc

2521actgagccactgggtgacctttgggaaggtac

OfficialSymbolMBprovidedby 

OfficialFullNamemyoglobinprovidedby 

Primarysource:

Locustag:

Seerelated：

Genetype:

proteincoding

Refsepstatus:

REVIEWED

Organism：

Lineage：

Homo

Alsoknownas：

PVALB

Location:

Sequence:

Chromosome:

22;

（..,complement）

SeeMBin 

Chromosome22-

GenomicSequence 

Gotonucleotide 

:

36M..36M 

（22Kbp）C

FindonSequence:

- 

+ 

Tools

Configure

2.利用Primer软件对myoglobin核酸序列进行引物设计其结果如下：

Senseprimer:

5'

TACTCGTGCCTTTCGTACTAGGCTC3'

Anti-senseprimer:

ATGAGCACGGAAAGCATGATCCGAG3'

3.蛋白质序列分析

利用ExPASy软件包对该基因进行氨基酸组成统计、分子量、等电点等分析及磷酸化分析