生物信息学蛋白库查询docWord文档下载推荐.docx
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首先进入www.espasy.ory点击进入ResourcesA..Z点击
如下图
点击BLAST输入蛋白质序列
搜索得到同源性分析如下3图示:
Score分值越大,相似性越高。
E值越小,匹配度越好。
所以蛋白序列应与p04626相似性高匹配度好
二、对该段序列进行基本性质分析:
蛋白质的氨基酸组成、等电点、相对分子质量、亲水性、疏水性、消光系数、信号肽、跨膜区域等。
氨基酸组成
等电点、相对分子质量
消光系数
亲水性、疏水性
打开http:
//web.expasy.org/protscale
如下图(网速慢,读图等好久都读不出来)
TMPred跨膜区结构预测,打开http:
//www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html输入已知序列
三、分析该段序列的MOTIF
四、对该段序列进行三维结构的分析
选择符合条件的一个同源建模
5、分析该序列所代表蛋白的修饰情况、所参与的代谢途径、相互作用的蛋白,以及与疾病的相关性。
蛋白质的修饰后翻译
蛋白质的相互作用
所参与的代谢途径,相关疾病