译MATLAB代码矢量化指南.docx
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译MATLAB代码矢量化指南
(译)MATLAB代码矢量化指南
这个建议学matlab的都看看,并且要反复的看
标题:
(译)MATLAB代码矢量化指南
发信站:
BBS水木清华站(TueNov1200:
43:
162002),站内
本文节译自
1100/1109.shtml
Revison:
2.0LastDateModified:
15-October-2002
翻译:
coolor@smth
感谢:
smth2008@smth提供他的译稿。
本文多处参考或引用他的译文
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一、基本技术
--------------------------------------------------------------------------------------1)MATLAB索引或引用(MATLABIndexingorReferencing)
在MATLAB中有三种基本方法可以选取一个矩阵的子阵。
它们分别是下标法,线性法和逻辑法(subscripted,linear,andlogical)。
如果你已经熟悉这个内容,请跳过本节
1.1)下标法
非常简单,看几个例子就好。
A=6:
12;
终止下标
起始下标
A([3,5])
ans=
810
步长
A([3:
2:
end])
ans=
81012
A=
[111417;...
121518;...
131619];
A(2:
3,2)
ans=
15
16
B=A(2,3)
B=18
1.2)线性法
二维矩阵以列优先顺序可以线性展开,可以通过现行展开后的元素序号来访问元素。
A=
[111417;...
121518;...
131619];
A(6)
ans=
16
A([3,1,8])
ans=
131118
A([3;1;8])
ans=
13
11
18
C=A([2,3])
C=1213
1.3)逻辑法
用一个和原矩阵具有相同尺寸的0-1矩阵,可以索引元素。
在某个位置上为1表示选取元素,否则不选。
得到的结果是一个向量。
A=6:
10;
A(logical([00101]))
ans=
810
A=
[12
34];
B=[1001];
A(logical(B))
ans=
1 4
---------------------------------------------------------------------------------------
2)数组操作和矩阵操作(ArrayOperationsvs.MatrixOperations)
对矩阵的元素一个一个孤立进行的操作称作数组操作;而把矩阵视为一个整体进行的运算则成为矩阵操作。
MATLAB运算符*,/,\,^都是矩阵运算,而相应的数组操作则是.*,./,.\,.^
A=[10;01];
B=[01;10];
A*B%矩阵乘法
ans=
0 1
1 0
A.*B %A和B对应项相乘
ans=
0 0
0 0
---------------------------------------------------------------------------------------
3)布朗数组操作(BooleanArrayOperations)
对矩阵的比较运算是数组操作,也就是说,是对每个元素孤立进行的。
因此其结果就不是一个“真”或者“假”,而是一堆“真假”。
这个结果就是布朗数组。
D=[-0.21.01.53.0-1.04.23.14];
D>=0
ans=
0111011
如果想选出D中的正元素:
D=D(D>0)
D=
1.0000 1.5000 3.0000 4.2000 3.1400
除此之外,MATLAB运算中会出现NaN,Inf,-Inf。
对它们的比较参见下例:
Inf==Inf返回真
Inf<1返回假
NaN==NaN返回假
同时,可以用isinf,isnan判断,用法可以顾名思义。
在比较两个矩阵大小时,矩阵必须具有相同的尺寸,否则会报错。
这是你用的上size和isequal,isequalwithequalnans(R13及以后)。
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4)从向量构建矩阵(ConstructingMatricesfromVectors)
在MATLAB中创建常数矩阵非常简单,大家经常使用的是:
A=ones(5,5)*10
但你是否知道,这个乘法是不必要的?
A=10;
A=A(ones(5,5))
A=
1010101010
1010101010
1010101010
1010101010
1010101010
类似的例子还有:
v=(1:
5)';
n=3;
M=v(:
ones(n,1))
M=
111
222
333
444
555
事实上,上述过程还有一种更加容易理解的实现方法:
A=repmat(10,[55]);
M=repmat([1:
5]',[1,3]);
其中repmat的含义是把一个矩阵重复平铺,生成较大矩阵。
更多详细情况,参见函数repmat和meshgrid。
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5)相关函数列表(UtilityFunctions)
ones全1矩阵
zeros全0矩阵
reshape修改矩阵形状
repmat矩阵平铺
meshgrid3维plot需要用到的X-Y网格矩阵
ndgridn维plot需要用到的X-Y-Z...网格矩阵
filter一维数字滤波器,当数组元素前后相关时特别有用。
cumsum数组元素的逐步累计
cumprod数组元素的逐步累计
eye单位矩阵
diag生成对角矩阵或者求矩阵对角线
spdiags稀疏对角矩阵
gallery不同类型矩阵库
pascalPascal矩阵
hankelHankel矩阵
toeplitzToeplitz矩阵
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二、扩充的例子
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6)作用于两个向量的矩阵函数
假设我们要计算两个变量的函数F,F(x,y)=x*exp(-x^2-y^2)
我们有一系列x值,保存在x向量中,同时我们还有一系列y值。
我们要对向量x上的每个点和向量y上的每个点计算F值。
换句话说,我们要计算对于给定向量x和y的所确定的网格上的F值。
使用meshgrid,我们可以复制x和y来建立合适的输入向量。
然后可以使用第2节中的方法来计算这个函数。
x=(-2:
.2:
2);
y=(-1.5:
.2:
1.5)';
[X,Y]=meshgrid(x,y);
F=X.*exp(-X.^2-Y.^2);
如果函数F具有某些性质,你甚至可以不用meshgrid,比如:
F(x,y)=x*y,则可以直接用向量外积
x=(-2:
2);
y=(-1.5:
.5:
1.5);
x'*y
在用两个向量建立矩阵时,在有些情况下,稀疏矩阵可以更加有效地利用存储空间,并实现有效的算法。
我们将在第8节中以一个实例来进行更详细地讨论.
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7)排序,设置和计数(Ordering,Setting,andCountingOperatio)
在迄今为止讨论过的例子中,对向量中一个元素的计算都是独立于同一向量的其他元素的。
但是,在许多应用中,你要做的计算则可能与其它元素密切相关。
例如,假设你用一个向量x来表示一个集合。
不观察向量的其他元素,你并不知道某个元素是不是一个冗余元素,并应该被去掉。
如何在不使用循环语句的情况下删除冗余元素,至少在现在,并不是一个明显可以解决的问题。
解决这类问题需要相当的智巧。
以下介绍一些可用的基本工具
max最大元素
min最小元素
sort 递增排序
unique 寻找集合中互异元素(去掉相同元素)
diff 差分运算符[X
(2)-X
(1),X(3)-X
(2),...X(n)-X(n-1)]
find 查找非零、非NaN元素的索引值
union 集合并
intersect 集合交
setdiff 集合差
setxor 集合异或
继续我们的实例,消除向量中的多余元素。
注意:
一旦向量排序后,任何多余的元素就是相邻的了。
同时,在任何相等的相邻元素在向diff运算时变为零。
这是我们能够应用以下策略达到目的。
我们现在在已排序向量中,选取那些差分非零的元素。
%初次尝试。
不太正确!
x=sort(x(:
));
difference=diff(x);
y=x(difference~=0);
这离正确结果很近了,但是我们忘了diff函数返回向量的元素个数比输入向量少1。
在我们的初次尝试中,没有考虑到最后一个元素也可能是相异的。
为了解决这个问题,我们可以在进行差分之前给向量x加入一个元素,并且使得它与以前的元素一定不同。
一种实现的方法是增加一个NaN。
%最终的版本。
x=sort(x(:
));
difference=diff([x;NaN]);
y=x(difference~=0);
我们使用(:
)运算来保证x是一个向量。
我们使用~=0运算,而不用find函数,因为find函数不返回NaN元素的索引值,而我们操作中差分的最后元素一定是NaN。
这一实例还有另一种实现方式:
y=unique(x);
后者当然很简单,但是前者作为一个练习并非无用,它是为了练习使用矢量化技术,并示范如何编写你自己的高效代码。
此外,前者还有一个作用:
Unique函数提供了一些超出我们要求的额外功能,这可能降低代码的执行速度。
假设我们不只是要返回集合x,而且要知道在原始的矩阵里每个相异元素出现了多少个“复本”。
一旦我们对x排序并进行了差分,我们可以用find来确定差分变化的位置。
再将这个变化位置进行差分,就可以得到复本的数目。
这就是"diffoffindofdiff"的技巧。
基于以上的讨论,我们有:
%Findtheredundancyinavectorx
x=sort(x(:
));
difference=diff([x;max(x)+1]);
count=diff(find([1;difference]));
y=x(find(difference));
plot(y,count)
这个图画出了x中每个相异元素出现的复本数。
注意,在这里我们避开了NaN,因为find不返回NaN元素的索引值。
但是,作为特例,NaN和Inf的复本数可以容易地计算出来:
count_nans=sum(isnan(x(:
)));
count_infs=sum(isinf(x(:
)));
另一个用于求和或者计数运算的矢量化技巧是用类似建立稀疏矩阵的方法实现的。
这还将在第9节中作更加详细的讨论.
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8)稀疏矩阵结构(SparseMatrixStructures)
在某些情况下,你可以使用稀疏矩阵来增加计算的效率。
如果你构造一个大的中间矩阵,通常矢量化更加容易。
在某些情况下,你可以充分利用稀疏矩阵结构来矢量化代码,而对于这个中间矩阵不需要大的存储空间。
假设在上一个例子中,你事先知道集合y的域是整数的子集,
{k+1,k+2,...k+n};即,y=(1:
n)+k
例如,这样的数据可能代表一个调色板的索引值。
然后,你就可以对集合中每个元素的出现进行计数(构建色彩直方图?
译者)。
这是对上一节中"diffoffindofdiff"技巧的一种变形。
现在让我们来构造一个大的mxn矩阵A,这里m是原始x向量中的元素数,
n是集合y中的元素数。
A(i,j)=1ifx(i)=y(j)
0otherwise
回想一下第3节和第4节,你可能认为我们需要从x和y来构造矩阵A。
如果
当然可以,但要消耗许多存储空间。
我们可以做得更好,因为我们知道,
矩阵A中的多数元素为0,x中的每个元素对应的行上只有一个值为1。
以下就是构造矩阵的方法(注意到y(j)=k+j,根据以上的公式):
x=sort(x(:
));
A=sparse(1:
length(x),x+k,1,length(x),n);
现在我们对A的列进行求和,得到出现次数。
count=sum(A);
在这种情况下,我们不必明确地形成排序向量y,因为我们事先知道
y=1:
n+k.
这里的关键是使用数据,(也就是说,用x控制矩阵A的结构)。
由于x在
一个已知范围内取整数值,我们可以更加有效地构造矩阵。
假设你要给一个很大矩阵的每一列乘以相同的向量。
使用稀疏矩阵,不仅
可以节省空间,并且要比在第5节介绍的方法更加快速.下面是它的工作
方式:
F=rand(1024,1024);
x=rand(1024,1);
%对F的所有行进行点型乘法.
Y=F*diag(sparse(x));
%对F的所有列进行点型乘法.
Y=diag(sparse(x))*F;
我们充分利用矩阵乘法算符来执行大规模运算,并使用稀疏矩阵以防止临
时变量变得太大。
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9)附加的例子(AdditionalExamples)
下面的例子使用一些在本技术手册中讨论过的方法,以及其它一些相关方
法。
请尝试使用tic和toc(或t=cputime和cputime-t),看一下速度加快
的效果。
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用于计算数组的双重for循环。
使用的工具:
数组乘法
优化前:
A=magic(100);
B=pascal(100);
forj=1:
100
fork=1:
100;
X(j,k)=sqrt(A(j,k))*(B(j,k)-1);
end
end
优化后:
A=magic(100);
B=pascal(100);
X=sqrt(A).*(B-1);
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
用一个循环建立一个向量,其元素依赖于前一个元素
使用的工具:
FILTER,CUMSUM,CUMPROD
优化前:
A=1;
L=1000;
fori=1:
L
A(i+1)=2*A(i)+1;
end
优化后:
L=1000;
A=filter([1],[1-2],ones(1,L+1));
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
如果你的向量构造只使用加法或乘法,你可使用cumsum或cumprod函数。
优化前:
n=10000;
V_B=100*ones(1,n);
V_B2=100*ones(1,n);
ScaleFactor=rand(1,n-1);
fori=2:
n
V_B(i)=V_B(i-1)*(1+ScaleFactor(i-1));
end
fori=2:
n
V_B2(i)=V_B2(i-1)+3;
end
优化后:
n=10000;
V_A=100*ones(1,n);
V_A2=100*ones(1,n);
ScaleFactor=rand(1,n-1);
V_A=cumprod([1001+ScaleFactor]);
V_A2=cumsum([1003*ones(1,n-1)]);
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
向量累加,每5个元素进行一次:
工具:
CUMSUM,向量索引
优化前:
%Useanarbitraryvector,x
x=1:
10000;
y=[];
forn=5:
5:
length(x)
y=[ysum(x(1:
n))];
end
优化后(使用预分配):
x=1:
10000;
ylength=(length(x)-mod(length(x),5))/5;
%AvoidusingZEROScommandduringpreallocation
y(1:
ylength)=0;
forn=5:
5:
length(x)
y(n/5)=sum(x(1:
n));
end
优化后(使用矢量化,不再需要预分配):
x=1:
10000;
cums=cumsum(x);
y=cums(5:
5:
length(x));
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操作一个向量,当某个元素的后继元素为0时,重复这个元素:
工具:
FIND,CUMSUM,DIFF
任务:
我们要操作一个由非零数值和零组成的向量,要求把零替换成为
它前面的非零数值。
例如,我们要转换下面的向量:
a=2;b=3;c=5;d=15;e=11;
x=[a000b00c0000d0e00000];
为:
x=[aaaabbbcccccddeeeeee];
解(diff和cumsum是反函数):
valind=find(x);
x(valind(2:
end))=diff(x(valind));
x=cumsum(x);
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
将向量的元素累加到特定位置上
工具:
SPARSE
优化前:
%Thevalueswearesummingatdesignatedindices
values=[2015455075101515354010];
%Theindicesassociatedwiththevaluesaresummedcumulatively
indices=[244134