RT-PCR全过程步骤Word文档格式.docx

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RT-PCR全过程步骤Word文档格式.docx

泡酸过夜,冲洗干净,蒙锡纸烤干备用(DEPC水泡)(洗净后先泡1‰DEPC过夜,再烤干)

3、匀浆器:

(包括剪刀、镊子)先洗净后,再高压(不需要泡DEPC)

三、试剂配制:

1、DEPC水:

吸出1ml放在1000ml双蒸水中配成1‰DEPC水,放在1000ml容量瓶中静置4小时备用。

2、75%乙醇:

用无水乙醇DEPC水配,然后放-20℃保存(其中DEPC水需先高压)

3、异丙醇:

放入棕色瓶中

4、氯仿:

5、琼脂糖

二.总RNA提取

1.取100mg组织,放到1.5mlEP管中,加入1mlTrizol剪碎。

(1)液氮研磨,组织块直接放入研钵中,加入少量液氮,迅速研磨,待组织变软,再加少量液氮,再研磨,如此三次,按50-100mg组织/mlTrizol加入Trizol,转入离心管进行第2步操作。

(2)匀浆:

组织样品按50-100mg/mlTrizol加入Trizol。

另外,组织体积不能超过Trizol体积的10%,否则匀浆效果会不好,用电动匀浆器充分匀浆约需1-2分钟。

2.震荡30s,室温放置5min,使其充分裂解。

12,000rpm离心5min,弃沉淀。

3.加0.2ml氯仿,摇动30s,室温5-10min。

注:

禁用漩涡振荡器,以免基因组DNA断裂。

4.12000×

g,4℃离心,15min。

5.吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。

6.加等体积异丙醇,室温放置5-10min。

7.12000×

g,4℃离心,10min。

在管底部可见微量RNA沉淀

8.弃上清,加冰预冷75%乙醇1ml,温和振荡,悬浮沉淀。

9.8000×

10.弃上清,用滤纸小心吸取残留液体,室温干燥5-10min。

11.沉淀溶于20μlDEPC水(可用20ulH2O,TEbuffer或0.5%SDS溶解RNA样品,55-60℃,5-10min。

H2O、TE或0.5%SDS均须用DEPC处理并高压。

),取1μl加入79μlDEPC水测OD260/OD280

12.计算浓度与纯度,-70℃保存。

三、逆转录合成cDNA第一链

反应体系如下

总体系20μl

约3μgRNA量+1μlOligodT+water=12μl

5*RTbuffer4μl

dNTP2μl

RNaseinhibitor1μl

AMVReverseTranspase1μl

温度42℃1小时

冰上配制混匀快速离心一次

反应条件如下

-20℃冰箱冻存

四、PCR反应

混匀快速离心一次

PCR产物-20℃冰箱保存

取PCR产物8μl加5×

LoadingBuffer2μl2%琼脂糖凝胶电泳120V。

100mA30min溴化乙锭染色,凝胶成象仪成象并保存结果。

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