表达载体的构建方法及步骤Word格式.docx

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(6)加poly(A)信号可以起到稳定mRNA作用

选择载体主要依据构建的目的,同时要考虑载体中应有合适的限制酶切位点。

如果构建的目

的是要表达一个特定的基因,则要选择合适的表达载体。

载体选择主要考虑下述3点:

【1】构建DNA重组体的目的,克隆扩增/基因表达,选择合适的克隆载体/表达载体。

【2】.载体的类型:

(1)克隆载体的克隆能力-据克隆片段大小(大选大,小选小)。

如<

10kb选质粒。

(2)表达载体据受体细胞类型-原核/真核/穿梭,E.coli/哺乳类细胞表达载体。

(3)对原核表达载体应该注意:

选择合适的启动子及相应的受体菌,用于表达真核蛋白质时注意克服4个困难和阅读框错位;

表达天然蛋白质或融合蛋白作为相应载体的参考。

【3】载体MCS中的酶切位点数与组成方向因载体不同而异,适应目的基因与载体易于链接,不能产生阅读框架错位。

综上所述,选用质粒(最常用)做载体的5点要求:

(1)选分子量小的质粒,即小载体(1-1.5kb)→不易损坏,在细菌里面拷贝数也多(也有大载

体);

(2)一般使用松弛型质粒在细菌里扩增不受约束,一般10个以上的拷贝,而严谨型质粒<

10个。

(3)必需具备一个以上的酶切位点,有选择的余地;

(4)必需有易检测的标记,多是抗生素的抗性基因,不特指多位Ampr(试一试)。

(5)满足自己的实验需求,是否需要包装病毒,是否需要加入荧光标记,是否需要加入标签蛋白,是否需要真核抗性(如Puro、G418)等等。

无论选用哪种载体,首先都要获得载体分子,然后采用适当的限制酶将载体DNA进行切割,获得线性载体分子,以便于与目的基因片段进行连接。

如何阅读质粒图谱

第一步:

首先看Ori的位置,了解质粒的类型(原核/真核/穿梭质粒)

第二步:

再看筛选标记,如抗性,决定使用什么筛选标记。

(1)Ampr水解β-内酰胺环,解除氨苄的毒性。

(2)tetr可以阻止四环素进入细胞。

(3)camr生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。

(4)neor(kanr)氨基糖苷磷酸转移酶使G418(长那霉素衍生物)失活

(5)hygr使潮霉素β失活。

第三步:

看多克隆位点(MCS)。

它具有多个限制酶的单一切点。

便于外源基因的插入。

如果在这些酶切位点以外有外源基因的插入,会导致某种标志基因的失活,而便于筛选。

决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。

第四步:

再看外源DNA插入片段大小。

质粒一般只能容纳小于10Kb的外源DNA片段。

一般来说,外源DNA片段越长,越难插入,越不稳定,转化效率越低。

第五步:

是否含有表达系统元件,即启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号。

这是用来区别克隆载体与表达载体。

克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体。

选用那种载体,还是要以实验目的为准绳。

第六步:

启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号

(1)启动子-促进DNA转录的DNA序列,这个DNA区域常在基因或操纵子编码序列的上游,是DNA分子上可以与RNApol特异性结合并使之开始转录的部位,但启动子本身不被转录。

(2)增强子/沉默子-为真核基因组(包括真核病毒基因组)中的一种具有增强邻近基因转录过程的调控顺序。

其作用与增强子所在的位置或方向无关。

即在所调控基因上游或下游均可发挥作用。

/沉默子-负增强子,负调控序列。

(3)核糖体结合位点/起始密码/SD序列(Rbs/AGU/SDs):

mRNA有核糖体的两个结合位点,对于原核而言是AUG(起始密码)和SD序列。

(4)转录终止序列(终止子)/翻译终止密码子:

结构基因的最后一个外显子中有一个AATAAA的保守序列,此位点down-stream有一段GT或T富丰区,这2部分共同构成poly(A)加尾信号。

结构基因的最后一个外显子中有一个AATAAA的保守序列,此位点down-stream有一段GT或T富丰区,这2部分共同构成poly(A)加尾信号。

质粒图谱上有的箭头顺时针有的箭头逆时针,那其实是代表两条DNA链,即质粒是环状双链DNA,它的启动子等在其中一条链上,而它的抗性基因在另一条链上.根据表达宿主不同,构建时所选择的载体也会不同。

二、目的基因的获得

一般来说,目的基因的获得有三种途径:

调取基因:

根据目的基因的序列,设计引物从含有目的基因的cDNA中通过PCR的方法调取目的基因,链接到克隆载体挑取单克隆进行测序,以获得想要的基因片段,这种方法相对成本较低,但是调取到的基因往往含有突变,还有不同基因的表达丰度不同,转录本比较复杂,或是基因片段很长,这些情况都很难调取到目的基因。

全基因合成:

根据目的基因的DNA序列,直接设计合成目的基因。

此方法准确性高,相对成本会高一些,个人操作比较困难,需要专业的合成公司完成。

优点是可以合成难调取及人工改造的任何基因序列,同时可以进行密码子优化,提高目的基因在宿主内的表达量。

三、克隆构建

目前,克隆构建的方法多种多样,除了应用广泛的酶切链接以外,现在还有很多不依赖酶切位点的克隆构建方式。

下面具体说一下双酶切方法构建载体的步骤。

实验材料

实验试剂

试剂名称

生产厂家

载体pCDNA3.1

Transheep

大肠杆菌菌株DH5α

Tiangen

限制性内切酶

Fermentas

T4连接酶

质粒DNA小,大量抽提试剂盒

Axygen

凝胶回收试剂盒

Axygen

琼脂糖

Biowest

DNAladder

(2)X基因慢病毒载体的构建

X基因基因由Transheep全基因合成,构建于载体PUC57中。

PUC57-X基因EcoRI/BamHI酶切结果:

酶切完成后进行胶回收

2.载体用pCDNA3.1双酶切,酶切体系如下。

20ul酶切体系37度3小时

4ulpCDNA3.1载体(500ng/ul)

1ulBamHI

1ulEcoRI

2ul10×

buffer

12ulH2O

酶切完成后胶回收(见附录)

处理好的目的片段与载体连接反应体系:

6ulPCR酶切回收片段(约50ng/ul)

1ul酶切好的载体(约50ng/ul)

2ulligasebuffer

1ulT4ligase

10ulH2O

以上连接液在16℃过夜。

转化(感受态细胞:

DH5a),具体步骤见附录转化部分。

抗性:

Amp;

37℃,培养过夜

转化后X基因分别平板挑菌,37℃250转/分钟摇菌14小时,PCR鉴定后,将阳性菌液送上海权阳生物技术有限公司测序。

X基因慢病毒载体单克隆菌落PCR鉴定(使用载体通用引物,PCR条带大小应比实际大200bp左右):

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