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Posphorylation,lipidation14,methylation,acetylation,SUMOylation,

lysinecrotonylation,ubiquitination

1.Changethetargetproteinactivity;

2.Changeproteintranportation;

3.Changeproteinstability;

4.Changethetargetproteincellularlocation;

5.Changethetargetproteinassociationinteractionwithotherproteins.

自噬主要过程

（1）autophagyinductionandactivation（mTORC1、ULK/Atg1）

（2）sequestrationofcytoplasmandvesicleformation

Nucleation（becline1/Atg6、Vps34）extention（Atg12、Atg8/LC3）

（3）dockingandfusion

（4）breakdown

蛋白激酶的主要类型

Serine/threoninekinase

Tyrosine-specificproteinkinases

Histidine-specificproteinkinases

Dual-specificitykinase

泛素

Ubiquitinhasamolecularweightof8451andconsistsofasinglepolypeptidechaincontaining74aminoacidresidues，presentinginalleukaryoticorganismsinahighlyconservedform,whichfunctionstolabelharmful,defective,orsuperfluousproteinsfordegradationbytheproteasome.

比较SUMO化和泛素化

相同点：

SUMO化的反应途径类似，都具有活化，结合，连接三个过程。

不同点：

二者的功能完全不同

SUMO化的生物学作用：

增强蛋白质的稳定性。

（1）SUMO的核内底物多数都是转录调节因子或是共调节因子

（2）SUMO参与维持基因组的完整性及调节染色质凝集与分离

（3）SUMO参与DNA修复过程（4）SUMO可拮抗泛素的作用

（5）SUMO可调节蛋白的核质转运及信号转导

泛素化的生物学作用：

降解蛋白质。

调节多个细胞过程：

（1）调控细胞周期的正常运行

（2）调控细胞增殖

（3）调控细胞凋亡（4）细胞信号转导（5）调控细胞免疫和炎症反应

（6）调控肿瘤的恶化（7）调控基因转录（8）DNA的复制与修复

（9）维持正常的神经元的功能

组蛋白主要修饰方式

Acetylation、methylation、phosphorylation、ubiqutination、sumoylation

Protein-ProteinInteraction

蛋白质相互作用

Protein–proteininteractions（PPIs）refertointentionalphysicalcontactsestablishedbetweentwoormoreproteins（proteincomplex）asaresultofbiochemicaleventsand/orelectrostaticforces.

结构域

Proteininteractiondomainsisastructuretoallowtheirinteractionwithandbindtospecificsequencesonotherproteins.

相互作用组

Inmolecularbiology,aninteractomeisthewholesetofmolecularinteractionsinaparticularcell.Mostcommonly,interactomereferstoprotein–proteininteraction（PPI）network（PIN）orsubsetsthereof.

蛋白质相互作用的结构基础

1.PPI界面具有特征化学结构。

蛋白质结合部位之间构象能互补，而且具有相应的化学基团产生足够的结合力。

2.蛋白质具有相互作用识别的结构域

3.衔接蛋白和支架蛋白辅助蛋白质相互作用

主要结构域的功能

1SH2domain：

recognizepY

2SH3domain:

bindtoProlin-richpeptides

3WWdomain:

4PHdomain:

bindingPI

5PDZdomain:

bindingtheC-terminusofotherspecialproteins

6FHAdomain:

recognizepThr

7MH2domain:

bindingsite:

pSer

8bromodomain:

recognizemonoacetylatedlysineresidues

9Chromodomain:

bindmethylatedhistone

衔接蛋白

Adaptorproteincontainavarietyofprotein-bindingmodulesthatlinkprotein-bindingpartnerstogetherandfacilitatethecreationoflargersignalingcomplexes.Theseproteinstendtolackanyintrinsicenzymaticactivitythemselvesbutinsteadmediatespecificprotein–proteininteractionsthatdrivetheformationofproteincomplexes.

支架蛋白

Inbiology,scaffoldproteinsarecrucialregulatorsofmanykeysignalingpathways.Althoughscaffoldsarenotstrictlydefinedinfunction,theyareknowntointeractand/orbindwithmultiplemembersofasignalingpathway,tetheringthemintocomplexes.Insuchpathways,theyregulatesignaltransductionandhelplocalizepathwaycomponentstospecificareasofthecell.

如何设计实验证明A、B蛋白质相互作用

试验方法：

酵母双转染法（Yeasttwo-hybridscreening）

表达载体1：

GAL4-BD+bait（A）

Yeasttwo-hybridsystem表达载体2：

GAL4-AD+prey（B）

含有多个reportergene的菌株

若AB两种蛋白能相互作用，GAL4-BD与GAL4-AD能结合成有活性的转录因子，从而与reportergene的UAS结合，使reportergene得以表达，若能检测到reportergene的表达产物就证明AB两种蛋白相互作用

Proteomics

蛋白质组

Proteomeistheproteinsexpressedbyacellortissue,atagiventimeunderaspecificsetofconditions.

蛋白质组学

Proteomicsiscomprehensiveknowledgeaboutalltheproteinsofacellatagiventimeunderaspecialsetofcondition.Proteomicsisthelarge-scalestudyofproteins,particularlytheirstructuresandfunctions.

proteinfoldingandlocalization

蛋白质折叠

Proteinfoldingisaprocessofnascentpeptidechainfoldingtoformcorrectspatialconformation.

分子伴侣

Chaperoneisalargegroupofunrelatedproteinfamilieswhoseroleistostabilizeunfoldedproteins,unfoldthemfortranslocationacrossmembranesorfordegradation,and/ortoassistintheircorrectfoldingandassembly.

简述参与蛋白质折叠的辅助分子及其功能

Chaperone（stress-70family、chaperonin、triggerfactor）

Stabilizeunfoldedproteins、prohibitnon-naturalpolypeptidefrommisfoldingandaggregation.unfoldunfoldedproteinfortranslocationacrossmembranesorfordegradation，and/orassistintheircorrectfoldingandassembly

PDI（proteindisulfideisomerase）

TheyusuallycontainatleastoneCys-Xaa-Xaa-Cys（CXXC）activesitethatcancatalyzedisulfideformation,reduction,andisomerization.bybindingtonon-naturalprotein,PPIcan

prohibittheerroneousbindingandpolymerizationbetweentargetproteinandsubstrateprotein.

PPI（peptidylprolylcis-transisomerase）

catalysetheconversionofconformationbetweenthecis-isomerandthetans-isomer.

Intramolecularchaperone

ClassI（alphalyticproteinase）：

Mainlyinvolvedinextendingandfoldingofthepolypeptidechain.

ClassII（somatostatinII）：

Mainlyinvolvedinintracellulartransportandlocalization,notdirectlyinvolvedinproteinfolding,theleaderpeptidecontainsproteinsortinginformationwhichcanguidepropersecretionoftheprotein.

蛋白质靶向输送

Proteintargetingorproteinsortingisthebiologicalmechanismbywhichproteinsaretransportedtotheappropriatedestinationsinthecelloroutsideofit.Proteinscanbetargetedtotheinnerspaceofanorganelle,differentintracellularmembranes,plasmamembrane,ortoexteriorofthecellviasecretion.

靶向信号

Targetingsignalsarethepiecesofinformationthatenablethecellulartransportmachinerytocorrectlypositionaproteininsideoroutsidethecell.Thisinformationiscontainedinthepolypeptidechainorinthefoldedprotein.

信号肽

Thecontinuousstretchofaminoacidresiduesinthechainthatenablestargetingarecalledsignalpeptidesortargetingpeptides.

核定位信号

Anuclearlocalizationsignal（NLE）isashortsequenceconsistingof4-8aminoacidresiduesinaproteinandrichinpositivelychargedlysine,arginineandproline,whichtargetsproteinsfromthecytoplasmtothecellnucleusthroughthenuclearporecomplexusingnucleartransport.

核输出信号

Anuclearexportsignal（NES）isashortaminoacidsequenceof4hydrophobicresiduesinaproteinthattargetsitforexportfromthecellnucleustothecytoplasmthroughthenuclearporecomplexusingnucleartransport.

跨膜蛋白

Atransmembraneprotein（TP）spanfromonesideofamembranethroughtotheothersideofthemembrane.

I型跨膜蛋白/II型跨膜蛋白

GroupItransmembraneproteinshavetheirN-terminaldomainstargetedtheextracellularspaceGroupIItransmembraneproteinshavetheirC-terminaldomainstargetedtheextracellularspace.

有哪些大分子参与了新生肽链穿越内质网膜的过程？

Ribosome、Signalpeptide、SRP/SRPreceptor、

nucleoproteincomplex/nucleoproteincomplexreceptor、peptidetranslocationcomplex

举例说明蛋白质的定位和分拣机制？

信号肽介导蛋白质分子的定位和靶向运输

举例：

Ran-GTPnucleartransportcycle

胞质合成的细胞核蛋白的NSL被importinβ所识别，并与importinαβ二聚体结合成复合物，被引导到核膜和核孔；

然后Ran-GTP水解GTP释能，胞核蛋白质-输入蛋白质复合物通过耗能机制跨核孔转位，进入核基质；

最后转位过程中，importin的αβ亚基先后解离、移出核孔而被再利用。

蛋白质在核糖体被合成后经过哪些生化事件才变成成熟的蛋白质？

蛋白质的翻译后修饰、折叠、组装形成正确的空间构想，调节蛋白质的活性，蛋白质的定位和靶向运输

Signaltransduction

信号转导

Theintracellulartransferofinformation（biologicalactivation/inhibition）isthroughasignalpathway.theprocessiscalledsignaltransduction.Ineach 

signaltransduction 

system,anactivation/inhibitionsignalfromabiologicallyactivemolecule（hormone,neurotransmitter）ismediatedviathecouplingofareceptor/enzymetoasecondmessengersystemortoanionchannel. 

Signaltransduction 

playsanimportantroleinactivatingcellularfunctions,celldifferentiation,andcellproliferation.

第二信使

Secondmessengerisasubstancewhosereleasewithinacellispromotedbyahormoneor‘firstmessenger’,andwhichbringsaboutaresponsebythemomsecondmessengerconsistofcAMP、cGMP、IP3、DAGandCa2+

RTK（Receptorprotein-tyrosinekinase）

受体酪氨酸激酶（receptortyrosinekinase，RTK），是细胞表面一大类重要的受体家族。

所有的RTK都是由3个部分组成：

含有配体结合位点的细胞外结构域、单次跨膜的疏水α螺旋区、含有酪氨酸激酶活性的细胞内结构域。

它的胞外配体是可溶性或膜结合的多肽或蛋白类激素，包括胰岛素和多种生长因子，主要有表皮细胞生长因子（EGF）、血小板生长因子（PDGF）、巨噬细胞集落刺激因子（M-CSF）、胰岛素、类胰岛素生长因子-1（IGF-1）、肝细胞生长因子（HGF）、神经生长因子（NGF）和血管内皮生长因子（VEGF）等。

自身磷酸化

当配体与单跨膜螺旋受体结合后，催化型受体大多数发生二聚化，二聚体TPK的被激活，彼此可使对方的某些氨基酸残基磷酸化，这一过程称为自身磷酸化。

主要发生在TKR.

举例说明膜受体介导的信号转导通路

EGF/EGFR介导的RPTK-Ras-MAPK通