并行安装vasp步骤Word文档下载推荐.docx
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Whichofthefollowingwouldyouliketoinstall?
1.Intel（R）FortranCompilerfor32-bitapplications,Version8.0
2.LinuxApplicationDebuggerfor32-bitapplications,Version7.3.1
x.Exit
先选择1安装IntelFortranCompiler，默认安装即可，默认目录就是/opt/intel_fc_91。
安装编译器完成之后，继续可以安装LinuxApplicationDebuggerfor32-bitapplications,Version7.3.1，选择2即可，它默认安装在/opt/intel_idb_73下。
最后选择x退出安装程序。
5、现在安装完成，可以删掉安装文件l
cd/usr/src
rm–rfintel
6、退出root用户的登陆，然后以一个个人用户登陆，登陆以后修改用户根目录下的.bash_profile文件，在最后一行加入这么一行：
./opt/intel/fc/bin/ifortvars.sh
注：
其中点号之后有空格。
然后重新登陆或者：
source.bash_profile
这样一切安装与配置就完成了，可以简单的测试一下。
编辑一个简单的源文件first.f90。
（在终端输入vifirst.f90编辑源代码esc键，shift:
wq保存退出）
programfirst
print*,“HelloWorld!
print*,sin（123.4）
endprogramfirst
下来编译，编译命令与以前版本的IntelFortranCompiler不同，以前采用的是ifc命令，从这个版本开始将使用ifort命令
ifortfirst.f90–ofirst
运行./first
将显示
HelloWorld!
-0.7693915
这说明一切OK，可以正常使用该编译器了。
ifort的具体使用可以用ifort–help获得详细帮助，一般用法类似于g77和gcc。
在/opt/intel_fc_91/doc下有详细的使用文档，有pdf格式文档也有htm格式网页文档。
标题:
ifc和mpich并行编译vasp（个人经验）
（interfortran10.1.018,mpich-2,fftw3.1.12，GOTOBlas1/24,vasp4.6并行编译（parralcomplice））
我是在Redhat7.3和8.0的机器上，用ifc
6.01版本，mpich-1.2.5.2，编译vasp4.6版本。
BLAS:
采用libgoto_p4_512-r0.94.so
LAPACK:
采用vasp.4.lib中的lapack_double.o
大致步骤如下：
这里不再讲述ifc的安装，假设ifc已经安装好了。
1、下载mpich-1.2.5.2，并安装。
从http:
//www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/downloads/mpich.tar.gz下载。
使用命令tarxzvfmpich.tar.gz来解压它。
得到mpich-1.2.5.2目录。
进入该目录，以此使用下面的命令：
a）./configure--prefix=/usr/local/mpich-rsh=ssh--with-cflags=-O\
-f90="
ifc-FR-lowercase"
--with-f77flags=-O--without-romio-fc=ifc
还是：
ifort-FR-lowercase"
--with-f77flags=-O--without-romio-fc=ifort
b）make
c）改用root帐号，进入改目录进行安装。
makeinstall
则把mpich安装到/usr/local/mpich目录。
2、设置与mpich有关的环境变量
在主目录下把下面的几行加入.bash_profile文件中
exportPATH=$PATH:
/usr/local/mpich/bin
exportMPI_USEP4SSPORT=yes
exportMPI_P4SSPORT=22
exportP4_RSHCOMMAND=ssh
然后采用下面的命令更新该文件
..bash_profile或source.bash_profile
3、采用mpif90来编译vasp
这里假设把libgoto_p4_512-r0.94.so放在/usr/local/lib目录中。
a）进入vasp.4.lib目录中，
1.编辑gotoblas（GotoBLAS的安裝過程（Core2Duo）與如何加入VASP進行編譯）
把/usr/local/gotoblas/include/libgoto.alibgoto_core2p-r1.14.alibgoto_core2p-r1.14.so系統會自動依你的CPU型式來取名
將所得到的3個重要函式庫其中之一，丟進vasp.4.lib內
2.把makefile.linux_ifc_P4拷贝成makefile
修改makefile中FC=ifort
键入make命令，开始编译得到libdmy.a
b）进入vasp.4.6目录中，
1.并行编译fftw3（详见fftw安装指南）
并行编译./configure--prefix=/home/tlu--with-gcc--disable-fortran--enable-mpi
拷贝/usr/local/fftw/include/fftw3.f（fftw3.hfftw3.mpi）
把makefile.linux_ifc_P4拷贝成makefile
把第50行的FC=ifc前加上注释号，也就是#
第80行至82行的CPP有关内容加上注释号，改成下面的
#CPP=$（CPP_）-DHOST=\"
LinuxIFC\"
\
#-Dkind8-DNGXhalf-DCACHE_SIZE=12000-DPGF90-Davoidalloc\
#-DRPROMU_DGEMV-DRACCMU_DGEMV
把第136行的BLAS
BLAS=/opt/libs/libgoto/libgoto_p4_512-r0.6.so
该成如下的内容：
BLAS=/usr/local/lib/libgoto_p4_512-r0.94.so
我的为：
BLAS=/vasp/src/vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.so
把第166行和167行有关FFT3D的行前加上注释号，如下面的
#FFT3D=fft3dfurth.offt3dlib.o
#FFT3D=fftw3d.offt3dlib.o/opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a
把202行和203行的FC等改为如下的内容：
FC=mpif90
FCL=$（FC）
把212行有关CPP的行前的注释号去掉，改成如下的内容：
CPP=$（CPP_）-DMPI-DHOST=\"
-DIFC\
-Dkind8-DNGZhalf-DCACHE_SIZE=4000-DPGF90-Davoidalloc\
-DMPI_BLOCK=500\
-DRPROMU_DGEMV-DRACCMU_DGEMV
把226和227行有关SCA的行，加上注释号，改成如下的
#SCA=$（SCA_）/libscalapack.a\
#$（BLACS）/LIB/blacsF77init_MPI-LINUX-0.a
$（BLACS）/LIB/blacs_MPI-LINUX-0.a
$（BLACS）/LIB/blacsF77init_MPI-LINUX-0.a
表示不用scalapack库。
把239和243行有关FFT3D的行，改成如下的内容：
#FFT:
fftmpi.owithfft3dlibofJuergenFurthmueller
FFT3D=fftmpi.offtmpi_map.offt3dlib.o
#fftw.3.0.1isslighlyfasterandshouldbeusedifavailable
#FFT3D=fftmpiw.offtmpi_map.offt3dlib.o
/opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a
我的为
#FFT3D=fftmpi.offtmpi_map.offt3dlib.o
FFT3D=fftmpi.o（原软件为：
fftmpiw.o因vasp此处报错所以修改）fftmpi_map.offt3dlib.o/opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a
把这些都修改后，保存。
再make。
就好了。
GotoBLAS的安裝過程（Core2Duo）與如何加入VASP進行編譯
下載位置：
http:
//www.tacc.utexas.edu/resources/software/software.php?
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現在最新版本是2007.03.21釋出的GotoBLAS-1.14.tar.gz，已完全支援Core2Duo係列
其中新版安裝方式非常人性化，與在Linux的sourcecode使用configure方式略有不同
對Linux底下使用x86和x86_64CPU者，提供一個快速安裝的script，可快速簡測你的SMP和編譯器種類，至於支援的編譯器種類依此順序為依據PathScale→PGI→Intel→gfortran→g95→g77
Step1：
解壓縮
tar–zxvfGotoBLAS-1.14.tar.gz
Step2：
安裝GotoBLAS，在32bit和64bit的安裝分別如下
For32bit安裝：
./quickbuild.32bit
For64bit安裝：
./quickbuild.64bit
安裝完後，即會把函式庫建在剛剛解壓縮後的資料夾內
以Core2Duo為例，會主要產生3個檔案
libgoto.a
libgoto_core2p-r1.14.a系統會自動依你的CPU型式來取名
libgoto_core2p-r1.14.so
若為特殊機器，則需藉由改寫getarch.c和Makefile.rule，將符合本身機器的參數前面註釋拿掉，並重新編譯即可產生函式庫，主要安裝過程請詳閱Quickinstallat.txt
------------------------------------------------------
Note:
（安装完后的提示如下）
Done.Thislibraryiscompiledwithfollowingconditions.
Binary...64bit
Fortran...INTEL
SMP...Enabled.Youhavetolinklibrarywith-lpthreadoption.
-------------------------------------------------------
裝設GotoBLAS無非就是想讓vasp的執行速度加快，如何修改Makefile？
步驟如下
將所得到的3個重要函式庫其中之一，丟進vasp.4.lib內，或另設資料夾將其置入
/vasp/src/vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.so
修改Makefile的BLAS路徑，先將全部舊有的BLAS路徑以#符號注釋起來，而後加入新的BLAS路徑
BLAS=../vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.so
可參考量化網頁相關文章：
/Experience/CommonSoftwares/VASP/CompileInstallation/200512/27.html
Step3：
重新編譯Makefile即可
By阿達仔國立成功大學
FFTW安装指南
FFTW（theFastestFourierTransformintheWest）库是由MIT（MassachusettsInstituteofTechnology）的MatteoFrigo和StevenG.Johnson开发的，用于一维和多维实数或复数的离散傅里叶
变换。
1.下载fftw-2_1_3_tar.gz（www.fftw.org,or）
2.tarzxvffftw-2_1_3_tar.gz
展开压缩文件
3.在Linux中安装FFTW:
a../configure--enable-type-prefix--prefix=/usr/local/fftw--with-gcc--disable-fortran--enable-i386-hacks
其中，--enable-type-prefix参数是为了同时使用singleprecision（单精度）和doubleprecision（双精度），如果不使用它，最后只有以rfftw开头的文件被安装（realfftw）；
--prefix=参数是设定安装目录；
--with-gcc使用gcc编译器；
--disable-fortran参数为了不包含Fortran调用的机制；
--enable-i386-hacks为Pentium和
x86以后的CPU优化gcc的编译速度。
b.make
编译
c.makeinstall
安装，这一次安装完后，在安装目录中存在以dfftw和drfftw开头文件，但没有sfftw开头的文件
d.makeclean
还需要安装一次，先清除
e../configure--enable-float--enable-type-prefix--prefix=/usr/local/fftw--with-gcc--disable-fortran--enable-i386-hacks
其中，--enable-float为了生成单精度计算的头文件和库文件，即以sfftw开头的文件。
f.make
重新编译
g.makeinstall
再一次安装，安装完后，目录中便会同时存在sfftw和dfftw开头的文件（用于复数函数/complexfunction的FFT变换）和srfftw与drfftw开头的文件（用于实数函数的FFT变换）
例如，如果需要用到双精度的实数FFT变换/FFTs，那么在编译的链接命令中需要按如下顺序加入
-ldrfftw-ldfftw参数
VASP4.4.6编译过程
1、所需文件和程序
VASP源代码：
vasp.4.4.6.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz
数学库：
ATLAS（http:
//math-
Fortran编译器：
ifc_9.1.036fortran可以从网站下载到免费的版本。
2、这里已经安装好了fortran编译器，所有文件都放在/home/xxx/VASP目录下，机器
的操作系统是Linux:
Redhat9.0。
a）用如下命令解压vasp.4.6.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz：
tarxzvfvasp.4.6.tar.gz
tarxzvfvasp.4.lib.tar.gz
解压后分别得到目录vasp.4.6和vasp.4.lib，目录vasp.4.6中文件是vasp的主要源代码，
vasp.4.lib是编译vasp时需要的一些特定的数学库程序，在这两个目录中都有编译时所用的
makefile文件，针对机器和fortran编译器，选择相应的makefile。
b）从http:
如下命令解压：
tarxzvfatlas3.6.0_Linux_P4SSE2.tar.gz
解压后得到一个目录Linux_P4SSE2，在此目录下有个lib子目录，该lib子目录中的文件为
libatlas.a,libcblas.a,libf77blas.a,liblapack.a,
这些就是编译vasp时所需要的数学库文件之一,将lib复制到vasp目录下，并将其中的四个文件复制到vasp.4.lib目录下
我这里安装了fftw-3.1.2.tar这个东西，（见FFTW安装指南）
完毕后，将/usr/local/fftw/include/下的fftw3.f复制到vasp/vasp4.6.
c）进入vasp.4.lib目录，选择makefile.linux_ifc_P4，并把它拷贝成makefile，然后键入
make命令开始编译。
整个命令如下：
cdvasp.4.lib
cpmakefile.linux_ifc_P4makefile
make
编译成功后，得到libdmy.a文件。
先到安装的ifc9.1的安装目录中，找到lib目录，里面有个libsvml.a的库文件。
1、比如你的ifc9.1装在/opt/intel/fc/9.1.036的目录下。
则在.bash_profile文件中加入下面的：
exportLD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/fc/9.1.036/lib:
$LD_LIBRARY_PATH:
/usr/local/lib:
/usr/lib:
/lib
2、source.bash_profile
3、在vasp的makefile中，对BLAS或LAPACK后面加上-lvml。
比如:
BLAS=.......-lsvml
其中的.....是你用libgoto库的路径
d）
退出vasp.4.lib目录，进入vasp.4.6目录，选择makefile.linux_ifc_P4，并把它拷贝成
makefile，编辑makefile文件，通过修改LIB变量的赋值而采用基于ATLAS的数学库文件，修
改其中：
ATLASHOME=../lib
BLAS=-L$（ATLASHOME）-lf77blas-latlas-lsvml
LAPACK=../vasp.4.lib/lapack_double.o
修改后保存makefile文件，键入make命令开始编译vasp。
整个命令为：
cd..
cdvasp.4.6
cpmakefile.linux_ifc_P4makefile
编辑修改makefile文件
编译成功后，就可以得到VASP的可执行文件vasp。
e）
以root帐号登录机器，把成功编译VASP后得到的vasp放到/bin目录下，则
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