微生物学课程教学大纲文档格式.docx

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以多媒体教学为主,采取讲授、自学、课堂讨论、专题讲座等多种方式讲授课程知识,并要求学生阅读相关参考书籍,培养学生的自学能力,使学生掌握微生物学基本理论及基本操作技术。

该课程教材及PPT为英语形式,旨在提高学生专业基础知识的同时,提高学生对专业英语的掌握程度。

6.教材及主要参考书

教材:

Microbiology------Asystemsapproach,MarjorieKellyCowan,KathleenParkTalaro,McGrawHillHigherEducation,2006

主要参考书:

1.AphotographyatlasfortheMicrobiologylaboratory3rdEdition,MichaelJ.Leboffe;

BurtonE.Pierce;

MortonPublishingCompany,2005

2.Microbiology,6/e,LansingMPrescott,JohnPHarley,DonaldAKlein,McGrawHillHigherEducation,2006

3.微生物学导论(第二版)影印版,2003,科学出版社.

4.周德庆《微生物学教程》(第二版)2002,高等教育出版社.

5.沈萍《微生物学》(第五版)(中文版)2003,高教出版社.

6.郝素珍《实用医学免疫学》,2005.2,高等教育出版社.

二、正文部分

Chapter1TheMainThemesinMicrobiology

一.教学要求

要求学生熟练掌握微生物的特点

了解人类对微生物的认识史及微生物的发展史,了解巴斯德、科赫在微生物学领域的重要地位和贡献。

了解微生物的发展与人类的关系。

掌握微生物学的分类及微生物的命名规则

掌握基本的专业词汇

二.教学内容

知识要点

1.TheMicrobialWorld

2.WhatisMicrobiology?

3.WhyStudyMicrobes?

4.CharacteristicsMicroscopicOrganisms

5.HistoricalAspects

6.Taxonomy

三.本章学时数:

4

Chapter3ToolsoftheLaboratory:

TheMethodsforStudyingMicroorganisms

要求学生熟练掌握光学显微镜的原理,不同显微镜的特点,影响显微镜成像的主要因素,各种显微镜的使用范围。

掌握电子显微镜的原理及与光学显微镜的异同点。

对最新的扫描隧道显微镜,原子力显微镜有初步的了解。

掌握染色技术的原理,染色类型,染色的作用、特点及应用等。

掌握相关的专业词汇

1.Microscope

1.1HistoryoftheMicroscope

1.2ImagesProducedByCompoundLightMicroscope

1.3MeasurementsofLength

1.4RelativeSizeofDifferentGroupsofMicrobes

1.5Threefactorsinobtaininganimage

⏹Magnification

⏹Resolution(orResolvingPower)

⏹Contrast

1.6ImportantCharacteristicsoftheCompoundMicroscope

1.7TypesofMicroscopy

1.7.1Bright-fieldmicroscopy

1.7.2Dark-fieldMicroscopy

1.7.3AComparisonofBright-fieldandDark-fieldMicroscopy

1.7.4Phase-ContrastMicroscopy

1.7.5FluorescenceMicroscopy

1.7.6BasicsofElectronMicroscopy

1.7.7TransmissionElectronMicroscopy(TEM)

1.7.8ScanningElectronMicroscopy(SEM)

1.7.9ComparisonofTEMandSEM

1.7.10ScanningTunnelingMicroscope(STM)andAtomicForceMicroscope(AFM)

2.Staining

2.1PrinciplesofStaining

2.2TypesofStains

2.2.1Negativestains

2.2.2Positivestains

2.2.3SimpleStain

2.2.4Differentialstains

2.2.5Special(structural)stains–stainsusedtohighlightspecificpartsofmicrobes

5

Chapter4CharacteristicsofProkaryoticCells

一.教学要求

明确细菌是微生物学研究的主要对象。

了解原核细胞的基本结构和特殊结构,掌握化学组成、结构与功能的关系。

了解原核细胞的分裂方式和过程。

知道有关微生物的常识如基本形态、大小范围及测定方法、菌落的特征及在分类鉴定中的意义。

明确G+菌、G-菌的细胞壁组成及异同点,肽聚糖的交联方式。

掌握革兰氏染色法的原理和应用;

明确细胞壁缺陷型细菌的形成原因、特点及其应用。

知道放线菌结构的特点,尤其是抗生素生产方面具有重大的经济价值。

知道几种常见代表属及常见生产菌株和致病菌株。

掌握蓝细菌的主要生理功能是固氮作用和光合作用,了解蓝细菌特有的光合色素——藻胆色素。

知道古生菌的意义及特点,了解立克次氏体、衣原体、支原体等特点。

掌握一些关于原核微生物的常规和新的研究方法。

掌握相关专业词汇。

1.BacterialSizeandMorphology

1.1size

1.2BacterialMorphology

Bacterialshapesandarrangement

2.BacterialStructure

2.1CellWall

2.1.1CellwallofGram+

2.1.2CellwallofGram-

2.1.3Gram+andGram–CellWalls

2.1.4CellWallFunctions

2.1.5Variationsincellwall

2.2PlasmaMembrane

2.3Capsule

2.4ProjectionsFromBacteria

flagella&

fimbriae&

pili

2.5Cytoplasm

2.6Ribosomes

2.7Nucleoid

2.8CellInclusions

2.9Endospores

StructureofEndospore

ProcessesofSporeformers

Endospore,cyst,parasporalcrystal

3.UnusualGroupsofBacteria

cyanobacteria–blue-greenbacteria

mycoplasmas–havenocellwall

rickettsias–parasitcbacteriaoftentransmittedbyticksandfleas.

chlamydias–“energyparasites”thatcannotsynthesizeATP

Archaea:

ProcaryotesnowplacedinadifferentDomainfromotherbacteria

Havenopeptidoglycanincellwallandfewerphospholipidsinplasmamembrane

4.Actinomycetes

10

Chapter5CharacteristicsofFungi

了解真核细胞壁组成,清楚蜗牛酶对真核细胞壁的作用原理。

掌握真核细胞无性和有性繁殖过程及其生活史,

分辨真核细胞与原核细胞的区别所在。

了解霉菌的形态、功能与分类,营养需求,生活史,应用及危害的防治

能够比较四大类微生物菌落和细胞形态特征的异同点。

基本的专业词汇的掌握。

1.CharacteristicsofFungi

2.ThehistoryofEucaryotes

3.FungiStructure

CellWall

Glycocalyx

Flagella

4.MaingroupofEucaryoticmicroorganism

Yeasts&

Molds&

Fleshyfungis

5.TypesofHyphae

5.1StructuralTypes

5.2Functionaltypes

5.2.1SpecialformofVegetativehyphae

5.2.2SpecialformofAerialhyphae

6TypesofReproductioninFungi

6.1TypesofFungalSpores

6.1.1TypesofAsexualSpores

6.1.2StepsinProductionofSexualSpores

6.1.3TypesofSexualSpores

6.1.4Moldreproductionandlifecycle

7.DivisionsoftheFungi

8.Fleshyfungi蕈菌/伞菌

9.BeneficialEffectsofFungi

10.HarmfulEffectsofFungi

7

Chapter6Anintroductiontotheviruses

明确非细胞形生物——病毒的生物学特点,知道病毒分类的主要依据,了解病毒的形态、构造特点和组分。

掌握病毒繁殖步骤特点,了解病毒的生物合成过程特别是逆转病毒生物合成的特点与意义,明确病毒的常规培养方法。

把握温和噬菌体和裂性噬菌体侵染宿主的过程和结果。

掌握噬菌体一步生长曲线各期特点及意义,深入理解温和噬菌体的整合特性,溶源转化的生物学特性及意义。

知道噬菌体效价测定,溶源菌检定的常用方法。

明确原噬菌体、pfu、自外裂解、裂解量等概念,知道干扰素产生机理及其作用。

了解类病毒、卫星病毒、卫星RNA、朊病毒等亚病毒各自化学组成特点、寄生方式及致病性,明确其发现对于生物学基础研究、病理学研究、分子生物学研究等方面的意义。

特别注意朊病毒的发现的意义及其繁殖的特点。

掌握相关专业词汇

1.Thehistoryofresearchtheviruses

2.UniqueCharacteristicsofViruses

3.Sizecomparisonofviruses—howbigarethey

4.Viralcomponents

4.1virion-completevirusthatcaninfecthost

4.2Viralcomponents

4.2.1Virusparaticle(virion)

4.2.2Nakedviruses(nucleocapsids)

4.2.3Envelopedviruses

5.MorphologicalGroupsofViruses

6.ClassificationofViruses

6.1Characteristicsused

⏹typeofnucleicacid

⏹typeofhost

⏹morphology

7.ViralReplication

7.1replicativecircle

7.2ViralReplication

Adsorption&

Penetration&

Uncoating&

ViralReplication&

Assembly&

Release

8.CultivationofAnimalViruses

8.1.cellcultures

8.2.duckandchickembryos

8.3.livelabanimals

9.EffectsofViralInfections

10.Bacteriophage

10.1Bacteriophagemorphology

10.2BacteriophageReplication

10.3onestepgrowthcurve(一步生长曲线)

10.3TypesofBacteriophage

Lyticphage&

Lysogenic(temperate)phage

Lysogenicconversion

11.InfectiousnoncellularParticles

Prions&

Viroids&

Virusoid(viroid-like;

satellite)

Chapter7Elementsofmicrobialnutrition,Ecology,andgrowth

一.教学要求

掌握微生物的营养需求,及根据营养代谢对微生物的分类。

掌握微生物营养物质的运送方式。

掌握微生物培养基配制的要求和基本原则。

明确纯培养的意义,知道纯培养装置的要求,重点了解微生物的常规分离方法和纯培养技术,掌握实验室培养的常用方法和器皿,特别了解厌氧菌培养的除氧装置和方法。

知道大规模生产培养常用的培养器及配套装置,了解微生物培养技术的发展特点和动向。

掌握细菌纯培养的群体生长规律,重点掌握生长曲线各期的特点及其对实际生产和研究中的指导作用。

掌握连续培养的理论依据、意义、应用,明确生长限制因子、生长速率、常数R、代时G、产量常数等概念,知道连续培养器的常规装置和类型。

明确群体生长和繁殖的概念,清楚生长量和繁殖量的意义。

重点了解测定微生物生长繁殖常用的生物量、生理指标、计数的原理及方法,特别是其适用范围和优缺点,重点掌握微生物的显微镜直接计数法、平板菌落计数法,微生物细胞干重法的测定。

掌握影响微生物生长的因素。

掌握微生物之间的相互关系。

掌握专业词汇。

1.GrowthRequirementsofmicrobe

1.1ChemicalElementsofMicroorganismcell

1.2MinimalGrowthRequirements

⏹Carbonsource

⏹Nitrogensource

⏹Energysource

⏹Inorganicsalt

⏹Growthfactors

⏹Water

2TransportmechanismsforNutrientabsorption

⏹Passive

1.diffusion扩散

2.facilitateddiffusion促进扩散

⏹Active

3.activetransport主动运输

4.grouptranslocation基团转位

3MicrobiologicalMedia

3.1TypesofMediaBasedonphysicalstate

3.2TypesofMediaBasedonContent

◆Chemicallydefinedmedia(syntheticmedium):

◆Chemicallyundefinedmedia(Complexmedia)

3.3TypesofMediaBasedonUse

◆Minimummedium基础培养基

◆All-purposemedia完全培养基

◆Selectivemedia

◆Differentialmedia

4.PureCultureTechniques

4.1ThefiveI’s

4.2PureCultureTechniques

5.FactorsAffectingMicrobialGrowth

1.Temperature

2.pH

3.freeoxygen

4.osmoticpressureofenvironment

6.BacterialReproduction

6.1Binaryfission

6.2GrowthofaBacterialPopulation

6.3PhasesofPopulationGrowth

lagphase,logarithmicphase,stationaryphase,decline(death)phase

6.4MeasurementofGrowth

7.RelationshipsBetweenMicrobes

7.1Symbioticrelationships

7.2Nonsymbioticrelationships

7.3TypesofSymbioticRelationships

Parasitism&

Mutualism&

Commensalism

7.4TypesofNonsymbioticRelationships

Synergism&

Antagonism

9

Chapter8Microbialmetabolism

通过本章的课堂教学,使学生掌握分解代谢和合成代谢的概念,掌握化能异样微生物产能的几种途径,掌握脱氢、递氢、受氢的过程,理解发酵、有氧呼吸、无氧呼吸作用。

了解各发酵类型的出发点和最终产物,了解同(异)型酒精发酵和同(异)型乳酸发酵。

掌握自养微生物的生物氧化形式、产能效率,了解硝化细菌、硫细菌的能量代谢和硝化作用。

掌握光能自养微生物环式、非环式光合作用,了解嗜盐杆菌紫膜的光合作用及意义。

知道自养微生物固定CO2的方式

能够比较ATP的三种主要产生方式的特点、异同、产能效率。

1.Themetabolismofmicrobes

1.1Metabolism

1.2Biologicaloxidation

1.3Enzymes

2.Thepursuitandutilizationofenergy

2.1EnergySourcesforMicrobes

2.1.1Externalenergysources

2.1.2Oxidation–ReductionReactions

2.1.3AdenosineTriphosphate

2.1.4Phosphorylation

2.1.5TypesofPhosphorylation

1.Substratephosphorylation

2.Oxidativephosphorylation

3.Photophosphorylation

3.UseofOrganicMoleculesforEnergy

3.1Respiration:

breaksdownorganicmoleculesusinganETS

3.2Fermentation:

BreaksdownorganicmoleculeswithoutusinganETS

3.3FeaturesofETS

3.4ChemiosmoticMechanism

3.5RespirationofGlucose

3.6Anaerobicrespiration

3.6.1Anaerobicrespiration

3.6.2Nitraterespiration&

Denitrification(反硝化作用)

3.6.3Putrefaction

3.7SummaryforRespiration

3.8Fermentation

3.8.1Definition–oxidationoforganicmoleculesthatdoesnotuseanETS

3.8.2Characteristicsoffermentation

3.8.3PatternsofFermentation

3.9Summaryofoxidationwithorganicmolecules

4.OxidationofInorganicMoleculesforEnergy

4.1Nitrifyingbacteria-----ammonia-NH3oxidation

4.2sulf

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