MEGA使用说明书复习进程Word文件下载.docx

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1.2系统发育树定义

系统发育树（英文：

Phylogenetictree）又称为演化树（evolutionarytree），是表明被认为具有共同祖先的各物种间演化关系的树。

是一种亲缘分支分类方法（cladogram）。

在树中，每个节点代表其各分支的最近共同祖先，而节点间的线段长度对应演化距离（如估计的演化时间）

1.3系统发育树的分类

根据有根和无根来区分：

树可分为有根树和无根树两类。

有根树是具有方向的树，根据系统发生树可推断出物种的起源包含唯一的节点，将其作为树中所有物种的最近共同祖先。

最常用的确定树根的方法是使用一个或多个无可争议的同源物种作为外群（英文outgroup），这个外群要足够近，以提供足够的信息，但又不能太近以至于和树中的种类相混。

把有根树去掉根即成为无根树。

一棵无根树在没有其他信息（外群）或假设（如假设最大枝长为根）时不能确定其树根。

无根树是没有方向的，其中线段的两个演化方向都有可能。

　　基于单个同源基因差异构建的系统发生数应称之为基因树。

因为这种树代表的仅仅是单个基因的进化历史。

而不是它所在物种的进化历史。

物种树一般最好是从多个基因数据的分析中得到。

例如一项关于植物进化的研究中，用了100个不同的基因来构建物种树，因为进化是发生在生物体种群水平上的，而不是发生在个体水平上的，虽然表面上不需要更多的数据，但实际上还是有必要的。

基因树和物种树之间的差异是很重要的，如果只用等位基因来构建物种数，那许多人人和大猩猩就会分到一起，而不是和其他人分到一起。

1.4构建方法

要构建一个进化树（phyligenetictree）。

构建进化树的算法主要分为两类：

独立元素法（discretecharactermethods）和距离依靠法（distancemethods）。

所谓独立元素法是指进化树的拓扑形状是由序列上的每个状态决定的，而距离依靠法是指进化树的拓扑形状由两两序列的进化距离决定的。

进化树枝条的长度代表着进化距离。

独立元素法包括最大简约性法（MaximumParsimonymethods）和最大可能性法（MaximumLikelihoodmethods）；

距离依靠法包括除权配对法（UPGMAM）和邻位相连法（Neighbor-joining）。

2蛋白质序列分析使用方法

2.1打开网址http:

//www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/，将菌名输入到protein后面的框内，点Search键，选择一个搜索结果点击进入

2.2将搜索出来的结果选择sendto下拉箭头内的选项，AnalysisTool和BLAST,选择好后点击Submit进行搜索

2.3进入BLAST页面，点击页面最下面的BLAST按钮，进行blast,如图所示：

2.4从结果中选择10个蛋白质序列，进行复制，粘贴到TXT文档内，然后将TXT文档后缀名改为FASTA

2.5将保存好的，以Fasta做后缀的序列打开，如下图

2.6点击菜单栏内的Alignment选项，选择AlignbyClustalW选项。

2.7弹出如下图对话框,选择OK键，对数据进行处理

经过一段时间的数据处理，数据处理完成如下图所示：

2.8选择菜单栏中Data选项中的SaveSession选项进行保存。

再选择ExportAlignment中的MEGAFormat和FASTAformat进行保存。

2.9选择菜单栏中的Analysis选项中的Phylogeny中的Construct/TestMaximumLikelihoodTree选项进行数据处理。

将数据按下表填写，点击Compute键

数据将按下表方式处理:

最大进化树如下所示：

2.10点击菜单栏下一行的Distance选项，选择下拉菜单中的第一个选项，进行数据处理

出现如下对话框，按下图所示，点击Compute键

即可得出最终结果：

3核酸序列分析使用方法

打开网址http:

//www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore，其余方法同上，如下列图片所示，不再详述。

（3）优惠多

关于DIY手工艺制品的消费调查

在上海，随着轨道交通的发展，地铁商铺应运而生，并且在重要的商业圈已经形成一定的气候，投资经营地铁商铺逐渐成为一大热门。

在人民广场地下“的美”购物中心，有一家DIY自制饰品店---“碧芝自制饰品店”。

人民广场地铁站有一家名为“漂亮女生”的饰品店，小店新开，10平方米不到的店堂里挤满了穿着时尚的女孩子。

不几日，在北京东路、淮海东路也发现了“漂亮女生”的踪影，生意也十分火爆。

现在上海卖饰品的小店不计其数，大家都在叫生意难做，而“漂亮女生”却用自己独特的经营方式和魅力吸引了大批的女生。

还有一点就是ｂｅａｄｗｏｒｋ公司在“碧芝自制饰品店”内设立了一个完全的弹性价格空间：

选择饰珠的种类和多少是由顾客自己掌握，所以消费者可以根据自己的消费能力进行取舍；

此外由于是顾客自己制作，所以从原料到成品的附加值就可以自己享用。

培养动手能力□学一门手艺□打发时间□兴趣爱好□

、DIY手工艺市场现状分析

2．www。

cer。

net/artide/2003082213089728。

shtml。

如果顾客在消费中受到营业员的热情，主动而周到的服务，那就会有一种受到尊重的感觉，甚至会形成一种惠顾心理，经常会再次光顾，并为你介绍新的顾客群。

而且顾客的购买动机并非全是由需求而引起的，它会随环境心情而转变。

现在是个飞速发展的时代，与时俱进的大学生当然也不会闲着，在装扮上也不俱一格，那么对作为必备道具的饰品多样性的要求也就可想而知了。