引物设计

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2、PCR引物流程设计详解PCR引物设计流程详解本文目的:复制出IL4基因片段一查找基因序列1进入NCBI主页,下拉选框选择Nucleotide,在搜索栏输入要查找的目的基因,即IL4,点击搜索2 在搜索结果选择灵长类Homo sapiens2。

3、 产物不能形成二级结构。
引物长度一般在1530碱基之间。
G+C含量在40%60%之间。
碱基要随机分布。
引物自身不能有连续4个碱基的互补。
引物之间不能有连续4个碱基的互补。
引物5端可以修。

4、G(ACGG)G(AC)G(CG)G(GG)(1.33.63.1)8.0 kcal/mol此计算方法特别适用于测定其3末端会形成双链的引物的相容性。
也可以用来计算发夹环结构的G。
不过,这时需要根据环。

5、C.需注意:对于同一基因的mRNA可能具有不同长度的剪切异构体,选择模板时不同物种应尽量选择同一异构体(一般选择最长的异构体)。
D.如需得到该基因所在基因组的序列信息(如扩增启动子区域时),在基因报告页面上部Genomic regi。

6、在Primer5窗口中,若觉得某一对引物合适,可以在搜索结果窗口中,点击该引物,然后在菜单栏,选择File-Print-Current pair,使用PDF虚拟打印机,即可转换为Pdf文档,里面有该引物的详细信息。
3、用Oligo验证。

7、荧光定量PCR引物设计荧光定量PCR引物设计专业的定量PCR设计软件:beacon Designer有时一对100分的引物扩增效率特别低,换了一对貌似很烂的引物,结果溶解曲线却长得很漂亮扩增效率也蛮高.个人认为这个跟你选择的位置有关看引物T。

8、PCR引物设计原则总结PCR引物设计原则总结PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列.因此,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否.要设计引物首先要找到DNA序列的保守区.同时应预测将要扩增的。

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