HisTag 表达蛋白纯化原理方法和问题分析.docx

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HisTag表达蛋白纯化原理方法和问题分析

之五兆芳芳创作

组氨酸标签蛋白的纯化His-Tag融合蛋白是目前最罕有的表达方法，并且很成熟，它的优点是表达便利并且根本不影响蛋白的活性，无论是表达的蛋白是可溶性的或包涵体都可以用固定金属离子亲和色谱去（IMAC）纯化.2．1IMAC（ImmobilizedMetal-ionaffinitychromatography）是Porathetal.1975年用固定IDA作为配基的填料螯合过渡金属铜、镍、钴或锌离子，可以吸附纯化概略带组氨酸、色氨酸或半胱氨酸残基的蛋白，1987年Smithetal.发明带有几个组氨酸或色氨酸小肽和螯合金属离子的IDA-sephadexG-25作用力更强，此前在1986年他和他的协作者用Ni2+-IDA-sephadexG-25亲和纯化在氨基端带组氨酸和色氨酸的胰岛素原.同年1987年Hochulietal.发明带有相连组氨酸的多肽和Ni2+-NTA填料作用力更强于普通的肽，1988年他第一次用这样的办法纯化了带六个组氨酸标签的多肽，无论是在天然仍是变性条件下一次亲和纯化都得到很好效果，此后表达带六个组氨酸标签的蛋白配合IMAC变得很是普遍，相对而言，不带标签的蛋白纯化就很是困难，所以表达带六个组氨酸标签的蛋白配合IMAC纯化酿成最经常使用并且最有效的研究蛋白结构和功效的有力手段.1986年Porathetal.还发明Fe3+-IDA-sephadexG-25可以用于磷酸化蛋白的纯化，尔后发明Ga3+-IDA也有同样的效果，这样螯合这两种金属离子的填料就有效用于磷酸化多肽的富集和纯化，同时IMAC也可以用于纯化各类和金属离子结合的多肽，应用很是普遍.市面罕有的商品化IMAC用于带六个组氨酸标签蛋白的配基有以下几种：

2.2影响IMAC纯化结果的因素：

2.2.1填料的种类：

不合填料厂家的填料有不同，所以使用进程最好能得到厂家的技巧支持，因为不合的厂家填料不合，此外蛋白纯化特性很强，没有哪一个填料是能适合所有带六个组氨酸标签蛋白的纯化，载量高和特异性好自己就是矛盾.2.2.2填料的配基种类、密度、金属离子种类填料最复杂的判断是螯合好同样的金属离子，哪家产品的颜色越深就意味着和蛋白的作用力越强，适用规模越广，载量也越高，纯化的黑白关头看纯化的条件，仅有填料的特异性是不敷的，同样配基密度下IDA填料的亲和力要比NTA的强，所以NTA上不克不及吸附的样品可以选择IDA为配基的填料.螯合金属离子和蛋白作用强弱为铜和镍离子的强，而锌和钴离子的弱.因此如果一个蛋白作用力强，想得到好的特异性可以选择螯合钴离子，它还有一个优点是不怕复原剂，特别时候有高浓度的复原剂.相同金属离子，IDA的强于NTA.螯合金属离子的价位越低和蛋白的作用力越强.同时镍离子是最经常使用的，如果有条件可以换不合金属离子以得到更好的效果，因为不合的金属离子有不合的选择性.因此要希望填料应用规模广就选择镍琼脂糖凝胶，如果是希望特异性好并且稳定就选择镍NTA琼脂糖凝胶.

2.2.2蛋白自己的结构和样品来源IMAC原理已经说明只要是带组氨酸、色氨酸或半胱氨酸残基的蛋白都可以被吸附，所以要想得到好的纯化效果，必须选择好纯化的条件，通常带组氨酸蛋白都可以在天然情况下被镍琼脂糖凝胶或镍NTA琼脂糖凝胶吸附，但是如果标签折叠在蛋白内部不容易流露，这样就难纯化，如果镍琼脂糖凝胶都不克不及吸附，可以在样品战争衡缓冲液中加1-2M脲，这样蛋白结构相对松散，也许能吸附而蛋白不会变性，对于自己就是变性的蛋白如果8M脲不克不及吸附，改用6M盐酸胍溶解样品就可以被吸附，因为盐酸胍可以打开脲打不开的结构使得标签能流露.当然如果有二硫键最好加1-2mMDTT也可以更好解决吸附的问题.此外也可以把标签换到另外一端.2.2.3缓冲体系，pH及盐浓度对于一些作用力弱的蛋白不克不及选择带氮原子的的一些缓冲体系，如Tris-HCl等，适当提高缓冲液pH可以增加吸附效果，同样原理可以下降pH洗脱一些咪唑洗不去的杂带.为避免由于电荷作用的搅扰，平衡缓冲液中需要加0.1-1M氯化钠，而在平衡缓冲液添加00.1-0.5%吐温或triton可以下降由于疏水相互作用导致的非特异吸附.2.2.4概略活性剂及其他添加剂添加一些概略活性剂可以增加蛋白的溶解度，下降疏水相互作用，这样使纯化的结果更好，在实验标明在平衡缓冲液中加0.5-1%的吐温可以使电泳的布景更清晰，杂带削减.对一些难溶解的样品也可以加乙醇或甘油.在变性条件下有时会在样品中添加复原剂如巯基乙醇或二巯基苏木糖醇，它们如果浓度太高或上样量过大，会导致镍离子复原甚至脱落，使填料失效，如果要在这样的情况下，那最好选择螯合价位高的填料如镍NTA琼脂糖凝胶或下降复原剂的浓度，通常1-2mM是没问题的.如果一定要选择高浓度的复原剂，也可以把镍离子还成钴离子，它不怕复原，把普通的镍琼脂糖凝胶还成钴离子便可.以下是破碎及提取、纯化操纵和罕有问题解决办法：

破碎办法样品的处理对纯化是很重要的，重要的原则是破碎要温和，不克不及使蛋白断裂或降解，不然一些片段同样也带有标签，这样增加了纯化的难度.需要注意的问题是超声破碎温度，强度，时间大肠杆菌的破碎办法：

1）收集培养发酵液，4度7000-8000g离心10分钟，收集沉淀的菌体（如果不是马上破碎可以放-70度冷冻，但是最好能保管成小块或薄片，这样好用.）2）取1-2克菌体加10ml破碎缓冲液（pH7.4的50mM磷酸缓冲液含0.5MNaCl，0.5mg/ml溶菌酶，1mMPMSF，1mMMgCl2，1.7units/mlBenzonase,其中的菌酶，1mMPMSF，1.7units/mlBenzonase现加）在冰上混杂45分钟，如果pH不在7-8，需要用0.5MNaOH一边搅拌一边滴加.如果溶菌酶10mg/ml混应时间可以缩短到10分钟.3）把混杂菌体在冰水中用超声探头破碎20秒种,总共四次,中间距离要保持2分钟冷却破碎液,检测pH,如果不在7-8,仍是用0.5MNaOH一边搅拌一边滴加去调.如果菌体的为50-500克,可以高压破碎的办法,缓冲液同上,体积为1升,破碎三次,压力为800bar.4）破碎的液4度12000g离心10分钟，如果要让溶液更澄清，可以4度50000g离心30分钟，这时候可以把上清和沉淀辨别留样，跑电泳，如果只沉淀中有目标蛋白，那就用变性条件下去提取.5）破碎离心的上清加2M咪唑溶液0.12ml使终浓度为20mM，样品的总体积为10ml.过柱子的样品最好过0.45μm的滤膜，避免堵柱.2．可溶性蛋白的纯化1）平衡缓冲液：

pH7.4的50mM磷酸缓冲液含0.5MNaCl，含20mM咪唑.2）洗脱缓冲液：

pH7.4的50mM磷酸缓冲液含0.5MNaCl，含500mM咪唑.3）取1ml镍琼脂糖凝胶FF或镍NTA琼脂糖凝胶FF预装柱，用10ml平衡缓冲液平衡，然后取破碎上清10ml样品以0.5ml/min上样，然后2ml/管分担收集.4）用15ml平衡缓冲液洗去未吸附的样品，流速1-2ml/min，2ml/管收集.5）用5ml洗脱缓冲液洗去未吸附的样品，流速1-2ml/min，2ml/管收集.6）再用5ml平衡缓冲液平衡柱子，灌满20%乙醇，封锁，以备下次使用.7）此办法是通用的办法，但是未必能得到适合自己蛋白的满意效果，所以优化的办法是洗脱可以用50mM，100mM，300mM，500mM分阶段洗脱，各洗脱5个柱体积，这样配合电泳检测，得到适合自己的蛋白的条件.8）收集的部分可以用紫外分光光度法、BCA法或用考玛斯亮蓝法测定蛋白的浓度，再取有蛋白的部分电泳检测纯度.3．罕有问题及解决办法1）蛋白不溶解或沉淀在柱子上：

要留意缓冲液体的pH，此外在样品中添加一些概略活性剂甚至乙醇等有机溶剂可以增加疏水性蛋白的溶解度，避免沉淀.2）蛋白不吸附：

这是最罕有的，通常的原因有1是标签不流露，被折叠在蛋白的结构内，可以在变性的条件下去纯化，2可以选择作用力更强，配基密度更高的填料，通常镍琼脂糖凝胶作用力最强，如果蛋白份子量大可以选择手臂长的填料，如镍NTA琼脂糖凝胶，填料的黑白可以看填料的颜色，颜色越深那配基密度越高，作用力也相应要强.3样品的pH太低或沉淀导致不克不及吸附，所以样品弛缓冲液的pH要尽量一致，避免沉淀，通常再偏碱性条件下吸附更好.3）难洗脱：

如果穿透中目标蛋白明显削减，而洗脱又没有，取点填料加电泳缓冲液煮后离心跑电泳仍是有目标蛋白，可以用更强的洗脱条件如500mM咪唑，如果还不克不及洗脱，可以直接用500mM咪唑加到6M盐酸胍去洗脱.4）电泳杂带多：

因为这种亲和究竟特异性要差点，原因在蛋白中带组氨酸，色氨酸，半胱氨酸等很罕有，特别是蛋白折叠会导致几个这样的氨基酸残基临近，这样也会使它们和镍柱的作用力增加，因此可以用不合浓度的咪唑阶段洗脱，此外在咪唑洗脱前增加一步0.5MpH5的醋酸缓冲液洗脱，在平衡缓冲液中添加0.5%吐温或Triton可以避免因为疏水相互作用导致非特异吸附，这样可以电泳的杂带明显削减，但是如果用这样的办法仍是杂带多，那就地回头去看看破碎的条件是不是太剧烈或温度控制欠好导致蛋白短裂或分化导致一些蛋白片段带标签，或因为样品长时间保管导致水解等，总之纯化的黑白决定于每一个步调，不但仅是纯化的问题.还有一个不容疏忽的问题是有时候因为蛋白相互作用或因为形成聚合体导致杂带增加，而由于疏水相互作用或因为离子作用可以通过添加概略活性剂或增加离子强度得到改良，对于因为形成聚合体的可以在缓冲液和样品中加1-2mM巯基乙醇避免，如果这样的情况下最好是选择镍NTA琼脂糖凝胶，因为它在复原剂下更稳定.包涵体蛋白的纯化及复性包涵体破碎1、大肠杆菌的破碎办法：

１）收集培养发酵液，4度7000-8000g离心10分钟，收集沉淀的菌体（如果不是马上破碎可以放-70度冷冻，但是最好能保管成小块或薄片，这样好用.２）取1-2克菌体加10ml破碎缓冲液（pH8.550mMTris-HCl，2mMEDTA，100mMNaCl，0.5%TritonX-100，1mg/ml溶菌酶.）在冰上混杂45分钟.３）把混杂菌体在冰水中用超声探头破碎20秒种,总共四次,中间距离要保持2分钟冷却破碎液,检测pH,如果不在8.5,仍是用1MTris溶液一边搅拌一边滴加去调.如果菌体的为50-500克,可以高压破碎的办法,缓冲液同上,体积为1升,破碎三次,压力为800bar.４）破碎的液4度12000g离心10分钟，如果要让溶液更澄清，可以4度50000g离心30分钟，这时候可以把上清和沉淀辨别留样，跑电泳，如果只沉淀中有目标蛋白，那就用变性条件下去提取.５）破碎离心的沉淀用4M清洗包涵体，再离心得沉淀加（pH7.4的50mM磷酸缓冲液含0.5MNaCl，8M脲，20mM咪唑）.过柱子的样品最好过0.45μm的滤膜，避免堵柱.4．包涵体蛋白的纯化1）平衡缓冲液：

pH7.4的50mM磷酸缓冲液含0.5MNaCl，8M脲，20mM咪唑.2）洗脱缓冲液：

pH7.4的50mM磷酸缓冲液含0.5MNaCl，8M脲，含500mM咪唑.3）取1ml镍琼脂糖凝胶FF或镍NTA琼脂糖凝胶FF预装柱，用10ml平衡缓冲液平衡，然后取破碎上清10ml样品以0.5ml/min上样，然后2ml/管分担收集.4）用15ml平衡缓冲液洗去未吸附的样品，流速1-2ml/min，2ml/管收集.5）用5ml洗脱缓冲液洗去未吸附的样品，流速1-2ml/min，2ml/管收集.6）再用5ml平衡缓冲液平衡柱子，灌满20%乙醇，封锁，以备下次使用.7）此办法是通用的办法，但是未必能得到适合自己蛋白的满意效果，所以优化的办法是洗脱可以用50mM，100mM，300mM，500mM分阶段洗脱，各洗脱5个柱体积，这样配合电泳检测，得到适合自己的蛋白的条件.8）收集的部分可以用紫外分光光度法、BCA法或用考玛斯亮蓝法测定蛋白的浓度，再取有蛋白的部分电泳检测纯度.9）其问题息争决办法可以参考可溶性蛋白的纯化的相关内容.复性十分庞杂，所以建议参考文献和一些专门的论述.罕有问题及解决办法1）不溶解或沉淀在柱子上：

要留意缓冲液体的pH，此外在样品中添加一些概略活性剂甚至乙醇等有机溶剂可以增加疏水性蛋白的溶解度，对于带半胱氨酸多的蛋白很容易氧化聚集沉淀，所以需要加2-5mM巯基乙醇避免沉淀.2）白不吸附：

这是最罕有的，通常的原因有1是标签不流露，被折叠在蛋白的结构内，可以在变性的条件下去纯化，如果用脲变性吸附欠好，可以改用盐酸胍，团体经验是这样通常可以使吸附不上的蛋白得到改良，顺利纯化.2可以选择作用力更强，配基密度更高的填料，通常镍琼脂糖凝胶作用力最强，如果蛋白份子量大可以选择手臂长的填料，如镍NTA琼脂糖凝胶，填料的黑白可以看填料的颜色，颜色越深那配基密度越高，作用力也相应要强.3样品的pH太低或沉淀导致不克不及吸附，所以样品弛缓冲液的pH要尽量一致，避免沉淀，通常再偏碱性条件下吸附更好.3）难洗脱：

如果穿透中目标蛋白明显削减，而洗脱又没有，取点填料加电泳缓冲液煮后离心跑电泳仍是有目标蛋白，可以用更强的洗脱条件如500mM咪唑，如果还不克不及洗脱，可以直接用500mM咪唑加到6M盐酸胍去洗脱.4）电泳杂带多：

因为这种亲和究竟特异性要差点，原因在蛋白中带组氨酸，色氨酸，半胱氨酸等很罕有，特别是蛋白折叠会导致几个这样的氨基酸残基临近，这样也会使它们和镍柱的作用力增加，因此可以用不合浓度的咪唑阶段洗脱，此外在咪唑洗脱前增加一步0.5MpH5的醋酸缓冲液洗脱，在平衡缓冲液中添加0.5%吐温或Triton可以避免因为疏水相互作用导致非特异吸附，这样可以电泳的杂带明显削减，但是如果用这样的办法仍是杂带多，那就地回头去看看破碎的条件是不是太剧烈或温度控制欠好导致蛋白短裂或分化导致一些蛋白片段带标签，或因为样品长时间保管导致水解等，总之纯化的黑白决定于每一个步调，不但仅是纯化的问题.还有一个不容疏忽的问题是有时候因为蛋白相互作用或因为形成聚合体导致杂带增加，而由于疏水相互作用或因为离子作用可以通过添加概略活性剂或增加离子强度得到改良，对于因为形成聚合体的可以在缓冲液和样品中加1-2mM巯基乙醇避免，如果这样的情况下最好是选择镍NTA琼脂糖凝胶，因为它在复原剂下更稳定.