实验报告目的基因与载体的连接转化及工程菌导入表达并PCR验证Word文档格式.docx

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养,以促进细胞的愈合恢复。

4•阳性转化的培养基筛选方法。

普通的大肠杆菌难以在含有Kana的LB培养基上存活繁殖,但由于载体质粒含有Kana霉素的抗性基因,所以成功导入载体质粒的大肠杆菌能够在含有Kana的LB培养基上形成菌

落,即转化阳性,但是由于成功导入的质粒不一定携带了目的基因,所以可能会出现伪阳性,故需要进行PCF鉴定。

5.菌落PCR的原理

通过目的基因的引物进行菌落PCR如果菌体成功导入了目的基因,则能够通过PCF获取大量目的基因片段,而不含有目的基因的菌落不会扩增出目的基因片段。

从而将阳性与伪阳性菌落区分开。

3.实验材料及设备

1.实验材料:

(1)已完成酶切的载体与目的基因片段。

DNA连接酶,缓冲液等。

(2)冰冻的感受态DH5a大肠杆菌。

2.实验仪器:

(1)恒温摇床,高压灭菌锅,超净工作台,10、100、1000卩L取液器各一支,台式高速离心机,制冰机,漩涡器;

(2)电泳仪,电泳槽,样品槽模板(梳子),有机玻璃内槽,水平仪,取液器,微波炉,凝胶成像系统。

(3)PCR仪

3.实验试剂:

(1)质粒的转化与转化导入

a.DNA连接酶d.酶切后的pET28a、目的基因

片段等。

b.lOXbuffer;

c.卡那霉素;

e丄B培养液:

胰蛋白胨(Tryptone)10g,酵母提取物(Yeastextract)

5g,NaCI5g,琼脂(固体培养基)15g,用1NNaOH调pH7.5;

(2)DNA琼脂糖凝胶电泳检测

a.Goldview(DNA染料)

b.1xTAE缓冲液

c.上样缓冲液(6xbuffer)

(3)PCR

a.loadingbuffer

b.四种脱氧核糖核苷酸原料、Taq酶、上下游引物

c.ddH2O

4.实验方法及步骤

实验流程图

离心收豪就陣

TSmtco-a-CaClj

 

1.质粒的连接转化

a)在EP管中分别配置下列的体系:

0.2mlEP管

10Xbuffer

2.5yL

酶切后的pET-28a

7.5yL

酶切后的目的基因片段

13yL

T4DNA连接酶(考虑连接效率)

2yL

X:

丫=1:

10〜30,总体积25卩L

b)EP管中液体混匀后瞬时离心,放入培养箱

20C下保存备用。

2.

22C反应30min,-

转化质粒的导入

a)取出感受态细胞DH5a让其在冰上自然解冻,每100卩L解冻的感

受态细胞加入整管连接产物,混匀后冰浴30min。

b)42C热冲击45秒,立即置于冰浴5min。

c)热激法:

使用化学试剂(如CaCI2)制备的感受态细胞,细胞膜通透性发生变化,极易与外源DNA想粘附并在细胞表面形成脱氧

核糖酸酶的羟基-磷酸钙复合物。

此时,将该体系转移到420C下

做短暂的热刺激,细胞膜的液晶结构会发生剧烈运动,并随机出现许多间隙,外源DNA就可能被细胞吸收;

d)冰浴过程中不要摇动EP管;

(使破裂的菌体自然恢复)

e)再在感受态细胞混合物中加入0.8mL的LB培养基,于37C摇床

中培养1h。

目的:

使细菌恢复正常生长状态,并表达质粒编码的抗生素抗性

基因;

f)涂布于含有kana的LB固定培养基表面,37C培养过夜

3.

PCR鉴定假阳性

1.在0.2mLEP管内配制25卩LPCR反应体系1个:

的样品一定将样品加于管壁上或者液体中,防止漏样;

加样的顺序:

先加ddH2Q其次是缓冲液和菌落,最后加酶,且要把样品加到液面下,酶从-200C冰箱中拿出后放在冰中待用,加酶时枪尖不要伸进酶液过深,加样时在溶液中缓慢吹吸几次,保证足够的酶量;

2、用灭菌枪头挑单菌落(在培养皿背面做好标记)接触EP管内,

混匀瞬时离心,每组可做5个体系。

由于反应体系体积太小,引起的误差较大,可以一次配置多个(比

所需反应体系个数多一个)反应体系,然后分开;

3、放入PCR仪中,设置反应程序:

194C预变性5min;

294C变性30S;

使双链的DNA模板解旋为单链;

355C退火30S;

引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;

472C延伸60S;

Taq酶以4种dNTP为原料,引物为复制起点,按5'

一3’方向,复制模板的互补链;

5重复步骤②〜④30次;

(1)新合成的DNA分子可以作为模板,参与后续的扩增反应,使目的分子呈指数增长。

(2)一般进行30个循环,因为此时目的分子的扩增进入平台期;

672C延伸10min;

最后4C保藏。

4.跑胶验证:

胶板放入电泳槽中(样品孔位于负极),注入1XTAE缓冲液淹没过胶板5mm用取液器将PCR产物5卩L与1卩L上样缓冲液(6X)混匀,加入胶板的样品小槽内。

将电泳槽与电泳仪接通,调节电压为100V左右,直至缓冲液的

蓝色指示剂移动到距离胶板边沿约1〜2cm处,停止电泳。

将胶板小心取出,放入凝胶成像系统中,调节位置居中,波长为

254nm的紫外灯下,观察凝胶中DNA存在处显示出荧光条带。

5.实验结果

菌落生长情况:

可以看到,左侧的工程菌形成较多菌落,而右侧几乎没有生长,两组工程菌的差异主要在于热激时长(受错误实验操作步骤影响,右侧实验组2只热激了20s,而左侧为正常的45s)

菌落较小,且分布密集,说明菌液浓度过高或者没有摇匀。

图i平板工程菌生长情况(左实验组

1右实验组2)

PCR实验结果

Marker:

DL2000

A带:

2000bp

B带1000bp

C带750bp

D带500bp

F带250bp

G带100bp

图2菌落PCR凝胶电泳紫外荧光检测结果

说明:

泳道编号依次为:

1红色荧光蛋白工程菌2绿色荧光蛋白工程菌

3绿色荧光蛋白工程菌(老师提供),4DL2000Maker

所得条带较为清晰,部分呈现“U型”可能是电压过高,胶板温度过高。

泳道123都产生了长度约800bp的条带,与预期结果较为接近,且GFP组的分子量大于RFP组,与事实一致。

证明所验证的三个菌落均为阳性菌落。

老师所提供GFP工程菌由于菌体较多,可见大肠杆菌基因组条带(3条带1000bp到2000bp之间)

泳道1的下方还出现了一条约300bp的清晰条带,可能是引物因为巧合而PCR扩增出的杂带。

6.结果讨论与结论:

1.实验结论:

通过DNA连接酶,我们将目的基因片段与载体质粒混合,再通过热激发,我们成功将转化质粒导入DH5a,并用含有Kana霉素的固体

LB培养基验证,证明所检测的三个菌落都不是假阳性。

2.讨论一:

PCR一般循环重复25〜30次,重复次数过多会怎

丿羊?

答:

溶重复次数过多,虽然在一定程度上能够提高产物量,

但是由于反应时间过长,有一些非特异产物的扩增和碱基错配数

也会相应增加;

而且随着酶的扩增能力下降,合成目标片段的能

力也会随之下降,也可能引起其他的非特异性扩增;

此外还可能会导致PCR反应“平台效应”的出现

3.讨论二:

挑取单菌落的注意事项有哪些?

(1)培养皿底部朝上,在酒精灯火焰20cm内操作;

(2)操作时不要讲话,在无风处操作;

(3)挑斑器具要求无菌;

(4)挑选远离群菌落的单菌落,菌落不要过大;

4.讨论三:

2.TaqDNA聚合酶的特性和菌落PCR的原理。

TaqDNA聚合酶的特性:

TaqDNApol具有5'

—3'

聚合酶活性和3'

—5'

外切酶活性,但体外使用的Taq酶无3'

外切校正活性。

Taq酶最大的特点是耐热性;

另外还具有高的催化合成特性。

菌落PCR的原理:

直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行

PCR扩增,可以快速鉴定菌落是否为含有目的基因的阳性菌落,此

per的方法通常被用来进行筛选插入的目的基因或者DNA测序分

析。

最后的PCR产物大小是载体通用引物之间的片断大小。

5.讨论四:

BL21与DH5a等感受态细菌特点及应用的特征,用处。

(1)DH5a和BL21都可以作为表达宿主。

(2)BL21是蛋白酶缺陷株,表达出来的蛋白不会被降解,

做蛋白表达是比较适合用的,。

BL21生长要比DH5a快,这是他们的又一区别,在高密度发酵

BL21表达蛋白时,需要控制它的表达条件,使得高密度且高表达。

(3)DH5a复制稳定的特点,所以它是核酸疫苗通常使用的宿主株。

DH5a中表达时外源基因的启动子必须被大肠杆菌的RNA

POLYMERAS职别,比较好用的载体有PLPR可诱导的启动子。

而带有T7启动子的载体则不能在其中表达,因为识别T7启动子的

T7RNAPOLYMERAS在DH5a中没有。

对于BL21,已将T7RNAPOLYMERAS的编码基因整合到了菌的基因组上,能识别T7启动子,从而可容纳外源基因在此T7启

动子的带动下表达。

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