基因.docx

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基因

生物学——基因部分

核酸nucleicacid

核苷酸nucleotide

脱氧核糖核酸deoxyribonucleicacid（DNA）

核糖核酸ribonucleicacid（RNA）

寡核苷酸oligonucleotide

序列sequence

修饰modify/modification

重组recombination/recombinant

载体vector

宿主host

本发明提供了含有编码修饰细胞色素P450酶的核苷酸序列的核酸；以及含有该核酸的重组载体和宿主细胞。

ThepresentinventionprovidesnucleicacidscomprisingnucleotidesequencesencodingmodifiedcytochromeP450enzymes;aswellasrecombinantvectorsandhostcellscomprisingthenucleicacids.

构建construct

表达expression

本发明公开了制备所述酚氧化酶的方法以及构建表达宿主的方法。

Disclosedhereinaremethodsforproducingthephenoloxidizingenzymeaswellasmethodsforconstructingexpressionhosts.

调节regulate/regulation

启动子promoter

终止子terminator

本发明还涉及编码这些蛋白质的核酸序列，特别是调节相应基因表达的启动子序列。

Theinventionfurtherrelatestonucleicacidsequencesencodingtheseproteins,andespeciallytopromotersequencesregulatingtheexpressionofthecorrespondinggenes.

多核苷酸polynucleotide

鉴定identification

分离isolation

本发明涉及一种编码由致病杆菌属（Xenorhabdus）和光杆状菌属（Photorhabdus）细菌产生的对昆虫具有特异性的新型蛋白毒素的多核苷酸分子鉴定和分离。

TheinventionrelatestotheidentificationandisolationofpolynucleotidemoleculesencodinganewclassofproteininsecticidaltoxinswhichareproducedbybacteriafromthegeneraXenorhabdusandPhotorhabdus.

族family

前体precursor

编码codefor

本发明提供了一族新的肿瘤排斥抗原前体，编码它们的核酸分子。

这些肿瘤排斥抗原前体被称作ＤＡＧＥ肿瘤排斥抗原前体，编码它们的核酸分子被称作ＤＡＧＥ编码分子。

本发明还提供了所说编码序列、肿瘤排斥抗原和其前体分子的各种诊断和治疗用途。

Anewfamilyoftumorrejectionantigenprecursors,andthenucleicacidmoleculeswhichcodeforthem,aredisclosed.ThesetumorrejectionantigenprecursorsarereferredtoasDAGEtumorrejectionantigenprecursors,andthenucleicacidmoleculeswhichcodeforthemarereferredtoasGAGEcodingmolecules.Variousdiagnosticandtherapeuticusesofthecodingsequencesandthetumorrejectionantigens,andtheirprecursormoleculesaredescribed.

底物特异性substratespecificity

突变体mutant

诱变mutagenesis

本发明提供了显示出改变的底物特异性的新的突变β－内酰胺青霉素Ｇ酰基转移酶。

Newmutantbeta-lactamPenicillinGacylasesareprovided,exhibitingalteredsubstratespecificities.

本发明涉及用于引导突变进入分子的诱变方法，特别地涉及可以运用于分子群以产生或筛选涉及多个分子突变的文库的方法。

Thepresentinventionrelatestoamethodofmutagenesisforintroducingmutationsintoamoleculeand,inparticular,tomethodsthatmaybeappliedtopopulationsofmoleculesforthegenerationorscreeningoflibrariesinvolvingthemutationofmultiplemolecules.

筛选screen

AT含量ATcontent

GC含量GCcontent

表型phenotype

基因型genotype

缺陷deficient

生物合成biosynthesis

筛选在疟原虫中抑制GPI生物合成的化合物的方法

此外，本发明人揭示比编码PfGWT1蛋白的DNA具有更低AT含量的简并突变体DNA，能补偿GWT1-缺陷型酵母的表型。

MethodsofscreeningforcompoundsthatinhibitthebiosynthesisofGPIinmalariaparasites

Inaddition,theinventorsrevealedthatdegeneratemutantDNAs,withalowerATcontentthantheDNAencodingthePfGWT1protein,cancomplementthephenotypeofGWT1-deficientyeast.

体外invitro

体内invivo

克隆clone

区段segment

位点site

嵌合chimeric

基因工程geneengineering

本发明提供了用核酸、载体及体外和体内方法进行的重组克隆方法，可用来经改造过的重组位点和重组蛋白质移动或交换DNA分子区段，得到具有预期特性的嵌合DNA分子和/或DNA区段。

Recombinationalcloningisprovidedbytheuseofnucleicacids,vectorsandmethods,invitroandinvivo,formovingorexchangingsegmentsofDNAmoleculesusingengineeredrecombinationsitesandrecombinationproteinstoprovidechimericDNAmoleculesthathavethedesiredcharacteristic（s）and/orDNAsegment（s）.

转染transfect/tansfection

标记marker

所述遗传改变的细胞已用遗传物质转染，从而以组成型或受控的方式表达标记基因和至少一种治疗基因。

Thegenetically-alteredcellsaretransfectedwithgeneticmaterialforexpressingamarkergeneandatleastonetherapeuticgeneinaconstitutivelyorcontrolledmanner.

mRNA干扰mRNAinterference,RNAi

mRNA干扰酶mRNAinterferase

切割cleave/cleavage

上游upstream

下游downstream

调节剂/调节物regulator

凋亡apoptosis

促凋亡的proapoptotic

诱导induce

沉默silence

本发明提供组合物和方法，所述组合物和方法通过将包含siRNA分子的核酸-脂质颗粒传递给细胞使基因表达沉默。

Thepresentinventionprovidescompositionsandmethodsforsilencinggeneexpressionbydeliveringnucleicacid-lipidparticlescomprisingasiRNAmoleculetoacell.

外源的exogenous

内源的endogenous

靶target

基因组genome

基因失活geneinactivation

整合integration

外源核酸序列的靶向整合和表达

本发明公开了将外源序列靶向整合到基因组中预定靶位点，以（例如）用于蛋白质表达和基因失活的方法和组合物。

Targetedintegrationandexpressionofexogenousnucleicacidsequences

Disclosedhereinaremethodsandcompositionsfortargetedintegrationofanexogenoussequenceintoapredeterminedtargetsiteinagenomeforuse,forexample,inproteinexpressionandgeneinactivation.

同源的homologous

异源的heterologous

本发明涉及新的表达系统，其中用日本曲霉型种为宿主细胞表达异源蛋白质。

ThepresentinventionrelatestoanovelexpressionsysteminwhichA.japonicus-typespeciesareusedashostcellsforexpressionofheterologousproteins.

由多个嵌合pRNA分子形成的多价多聚复合物，各携带至少一个生物学活性部分、可检测标记或其他异源组件。

ApolyvalentmultimericcomplexformedfromapluralityofchimericpRNAmolecules,eachcarryingatleastonebiologicallyactivemoiety,detectablelabel,orotherheterologouscomponent.

转录transcription/transcribe

转录物/转录本transcript

顺式cis

反式trans

本发明提供了能够产生预定大小的RNA转录物的重组转录单位，其包括与含有转录区域的核苷酸序列可操作连接的调节序列，从而，所述转录区域的转录受到所述调节序列的调控。

所述转录区域包括编码病毒序列的区域和位于编码所述病毒序列的区域下游的非编码区域，其中所述非编码区域包括编码顺式作用核酶的核苷酸序列。

也提供了应用这种重组转录单位的方法和包括含有这种重组转录单位的载体的细胞。

ThepresentinventionprovidesarecombinanttranscriptionunitcapableofproducinganRNAtranscriptofapredeterminedsizecomprisingaregulatorysequenceoperablylinkedtoanucleotidesequencecomprisingatranscribedregionsuchthatthetranscriptionofsaidtranscribedregioniscontrolledbysaidregulatorysequence.Thetranscribedregioncomprisesaregionthatencodesforaviralsequence,andanon-codingregiondownstreamoftheregionencodingforsaidviralsequence,whereinthenon-codingregioncomprisesanucleotidesequenceencodingacis-actingribozyme.Methodsofusingtherecombinanttranscriptionunit,andcellscontainingvectorscomprisingtherecombinanttranscriptionunitarealsodisclosed.

试剂盒kit

还公开了其用途，尤其从水性溶液分离核酸的方法，以及用于实施这些方法的试剂盒。

Theusethereof,particularlymethodsfortheisolationofnucleicacidsfromanaqueoussolution,aswellaskitsforperformingthosemethodsaredisclosed.

本发明涉及用于从样品中纯化RNA、DNA或两者的试剂、方法和试剂盒。

Theinventionfeaturesreagents,methodsandkitsforthepurificationofRNA,orDNA,orboth,fromasample.

衔接子adaptor

cDNA文库cDNAlibrary

3’偏倚3'bias

高通量throughput

提供了使用与自动化测序系统相容的衔接子序列，用于使mRNA样品高通量加工成cDNA文库的新生物化学规程。

所提供的方法生产没有与目前cDNA文库生产方法相关的3’偏倚的cDNA文库。

NewbiochemicalprotocolsforhighthroughputprocessingofmRNAsamplesintocDNAlibrarieswithadaptorsequencescompatiblewithautomatedsequencingsystemsareprovided.TheprovidedmethodsproducescDNAlibrarieswhichdonothave3'biasassociatedwithcurrentcDNAlibraryproductionmethods.

模板template

本发明涉及利用含有作为多样性模板的序列区域的核酸分子使核酸序列多样化的方法。

因此，本发明提供了待多样化的核酸分子，以及用作模板区（TR）和与TR协同进行定向定点多样化的核酸分子。

Thisinventionrelatestothediversificationofnucleicacidsequencesbyuseofanucleicacidmoleculecontainingaregionofsequencethatactsasatemplatefordiversification.Theinventionthusprovidesnucleicacidmoleculestobediversified,aswellasthosewhichactasthetemplateregion（TR）andinconcertwiththeTRfordirectional,site-specificdiversification.

正义链sensestrand/positivestand

反义链antisensestrand/negativestrand

过表达overexpression

提供了针对Apo-B100基因的寡核苷酸来调节Apo-B100的表达。

组合物包含寡核苷酸，尤其是反义寡核苷酸，其靶向编码Apo-B100的核酸。

提供了使用这些化合物调节Apo-B100表达和治疗与Apo-B100过表达、突变Apo-B100过表达或二者相关的疾病的方法。

OligonucleotidesdirectedagainsttheApo-B100geneareprovidedformodulatingtheexpressionofApo-B100.Thecompositionscompriseoligonucleotides,particularlyantisenseoligonucleotides,targetedtonucleicacidsencodingtheApo-Bl00.MethodsofusingthesecompoundsformodulationofApo-Bl00expressionandforthetreatmentofdiseasesassociatedwitheitheroverexpressionofApo-Bl00,expressionofmutatedApo-Bl00orbothareprovided.

101273142A

用于癌症治疗的调节SMYD3转移酶的化合物的鉴定

优先权信息:

US20050695957P/pr

本发明涉及利用测定多肽的甲基转移酶活性以及筛选甲基转移酶活性调节剂，更具体为SMYD3对视网膜母细胞瘤的甲基化的调节剂的方法。

本发明进一步提供了利用如此鉴定的调节剂预防或治疗癌症的方法或药物组合物，所述癌症包括结肠直肠癌、肝细胞癌、膀胱癌和/或乳腺癌。

SMYD3（又称ZNFN3A1）具有更高的甲基化活性。

Lys824是RB1蛋白上优选的SMYD3甲基化位点。

Thepresentinventionfeaturesamethodfordeterminingthemethyltransferaseactivityofapolypeptideandscreeningformodulatorsofmethyltransferaseactivity,moreparticularlyformodulatorsofthemethylationofretinoblastomabySMYD3.Theinventionfurtherprovidesamethodorpharmaceuticalcompositionforpreventionortreatingofcolorectalcancer,hepatocellularcarcinoma,bladdercancerand/orbreastcancerusingamodulatorsoidentified.N-terminaltruncatedformsofSMYD3（aliasZNFN3A1）havehighermethylatingactivity.Lys824isapreferredmethylationsiteontheRB1proteinforSMYD3.

101273143A

用于遗传序列分析的多重聚合酶链式反应

优先权信息:

US20050691768P/pr

本发明涉及PCR方法，其包括：

提供怀疑含有一种或多种病原体核酸的生物样品；添加多种与病原体内找得到的基因相对应的PCR引物；以及在样品上进行聚合酶链式反应以扩增与基因相对应的核酸的亚群。

所述引物包括用于每种病原体的至少一种引物对，并且引物含有与任何病原体DNA或与样品内任何背景DNA不同源的尾随序列。

聚合酶链式反应内至少一种引物的浓度不大于约100nM。

APCRmethodinvolving:

providingabiologicalsamplesuspectedofcontainingoneormorepathogennucleicacids;addingapluralityofPCRprimerscorrespondingtogenesfoundinthepathogens;andperformingapolymerasechainreactiononthesampletoamplifyasubsetofthenucleicacidsthatcorrespondtothegenes.Theprimersincludeatleastoneprimerpairforeachpathogen,andtheprimerscontainatailsequencethatisnothomologousanypathogenDNAortoanybackgroundDNAinthesample.Theconcentrationofatleastoneprimerinthepolymerasechainreactionisnomorethanabout100nM.

101273144A

诊断食道癌的方法

优先权信息:

US20050703263P/pr

为了鉴定涉及食道癌发生的分子和可用作诊断标志物及新药及免疫疗法的靶标的分子，构建了代表32,256个基因的cDNA微阵列，用来分析了通过激光捕获显微解剖纯化的19个食道鳞状细胞癌（ESSCCS）的表达模式。

本文公开了在食道癌中显著上调或下调的基因群的详细全基因组数据。

这些基因可用于开发治疗药物或免疫疗法以及肿瘤标志物。

另外，本文公开了与淋巴结转移和手术后复发相关的基因。

在候选的分子靶标基因中，进一步表征了人上皮细胞转化序列2癌基因（ECT2）和细胞分裂周期蛋白45，酿酒酵母类同源物